ASCC3L1

СНРНП200
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2Q0Z, 4F91, 4F92, 4F93, 4KIT, 3JCR
Идентификаторы
Псевдонимы	SNRNP200 , ASCC3L1, BRR2, HELIC2, RP33, U5-200KD, малый ядерный рибонуклеопротеин U5, субъединица 200
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 601664 ; МГИ : 2444401 ; Гомологен : 5859 ; Генные карты : SNRNP200 ; OMA : SNRNP200 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	96,321,271 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	127,082,371 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ventricular zone; ; embryo; ; epithelium of nasopharynx; ; ganglionic eminence; ; nasal epithelium; ; urethra; ; parotid gland; ; pylorus; ; nipple; ; tibia;
	Top expressed in
	hand; ; otic vesicle; ; mandibular prominence; ; maxillary prominence; ; primitive streak; ; condyle; ; abdominal wall; ; Paneth cell; ; Gonadal ridge; ; otolith organ;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	nucleotide binding; helicase activity; protein binding; identical protein binding; nucleic acid binding; hydrolase activity; ATP binding; RNA binding;
Cellular component	catalytic step 2 spliceosome; membrane; U5 snRNP; nucleoplasm; spliceosomal complex; nucleus; U4/U6 x U5 tri-snRNP complex; post-mRNA release spliceosomal complex;
Biological process	mRNA splicing, via spliceosome; mRNA processing; osteoblast differentiation; cis assembly of pre-catalytic spliceosome; RNA splicing; spliceosome conformational change to release U4 (or U4atac) and U1 (or U11);
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	23020
	320632
	ENSG00000144028
	ENSMUSG00000003660
	О75643
	Q6P4T2
	НМ_014014
	НМ_177214
	НП_054733
	НП_796188
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Малый ядерный рибонуклеопротеин U5 хеликаза 200 кДа представляет собой фермент , который у человека кодируется SNRNP200 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000144028 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000003660 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (апрель 1999 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XI. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . ДНК Рез . 5 (5): 277–86. дои : 10.1093/dnares/5.5.277 . ПМИД 9872452 .
^ Лаубер Дж., Фабрицио П., Тейгелькамп С., Лейн В.С., Хартманн Э., Лурманн Р. (октябрь 1996 г.). «Белок HeLa 200 кДа U5 snRNP и его гомолог в Saccharomyces cerevisiae являются членами семейства белков DEXH-бокса предполагаемых РНК-хеликаз» . ЭМБО Дж . 15 (15): 4001–15. дои : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00774.x . ПМК 452120 . ПМИД 8670905 .
^ Аксель Т., Аренс К., Брамс Х., Тейгелькамп С., Лурманн Р. (ноябрь 1998 г.). «Человеческий белок U5-220kD (hPrp8) образует стабильный не содержащий РНК комплекс с несколькими U5-специфичными белками, включая РНК-унвиндазу, гомолог рибосомального фактора элонгации EF-2 и новый белок WD-40» . Мол Клеточная Биол . 18 (11): 6756–66. дои : 10.1128/mcb.18.11.6756 . ПМК 109259 . ПМИД 9774689 .
^ Лаггербауэр Б., Аксель Т., Лурманн Р. (май 1998 г.). «Человеческий белок DEXH-бокс U5-200 кДа раскручивает дубликаты РНК U4/U6 in vitro» . Proc Natl Acad Sci США . 95 (8): 4188–92. Бибкод : 1998PNAS...95.4188L . дои : 10.1073/pnas.95.8.4188 . ПМК 22463 . ПМИД 9539711 .
^ «Ген Энтреза: ASCC3L1, активирующий сигнал коинтегратора 1, комплексная субъединица 3, подобная 1» .

Внешние ссылки

человека Расположение генома SNRNP200 и SNRNP200 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

Накадзима Д., Оказаки Н., Ямакава Х. и др. (2003). «Создание готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное курирование 330 клонов кДНК KIAA» . ДНК Рез . 9 (3): 99–106. дои : 10.1093/dnares/9.3.99 . ПМИД 12168954 .
Лаггербауэр Б., Лаубер Дж., Люрманн Р. (1996). «Идентификация РНК-зависимой АТФазной активности в мяРНП U5 млекопитающих» . Нуклеиновые кислоты Рез . 24 (5): 868–75. дои : 10.1093/нар/24.5.868 . ПМК 145735 . ПМИД 8600454 .
Мейстер Г., Ханнус С., Плоттнер О. и др. (2001). «SMNrp является важным фактором сплайсинга пре-мРНК, необходимым для образования зрелой сплайсосомы» . ЭМБО Дж . 20 (9): 2304–14. дои : 10.1093/emboj/20.9.2304 . ПМК 125440 . ПМИД 11331595 .
Андерсен Дж.С., Лион К.Э., Фокс А.Х. и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека» . Курс. Биол . 12 (1): 1–11. Бибкод : 2002CBio...12....1A . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . ПМИД 11790298 . S2CID 14132033 .
Юрица М.С., Ликлайдер Л.Дж., Гиги С.Р. и др. (2002). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, подходящих для трехмерного структурного анализа» . РНК . 8 (4): 426–39. дои : 10.1017/S1355838202021088 . ПМК 1370266 . ПМИД 11991638 .
Пэн Р., Дай Б.Т., Перес И. и др. (2002). «PSF и p54nrb связывают консервативный стебель мяРНК U5» . РНК . 8 (10): 1334–47. дои : 10.1017/S1355838202022070 . ПМЦ 1370341 . ПМИД 12403470 .
Накаяма М., Кикуно Р., Охара О (2003). «Белко-белковые взаимодействия между большими белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК» . Геном Рез . 12 (11): 1773–84. дои : 10.1101/гр.406902 . ПМК 187542 . ПМИД 12421765 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Уилл С.Л., Шнайдер С., Хоссбах М. и др. (2004). «Человеческий 18S U11/U12 snRNP содержит набор новых белков, не обнаруженных в U2-зависимой сплайсосоме» . РНК . 10 (6): 929–41. дои : 10.1261/rna.7320604 . ПМЦ 1370585 . ПМИД 15146077 .
Vertegaal AC, Ogg SC, Jaffray E и др. (2004). «Протеомное исследование белков-мишеней SUMO-2» . Ж. Биол. Хим . 279 (32): 33791–8. дои : 10.1074/jbc.M404201200 . ПМИД 15175327 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .
Джин Дж., Смит Ф.Д., Старк С. и др. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3-связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации» . Курс. Биол . 14 (16): 1436–50. Бибкод : 2004CBio...14.1436J . дои : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . ПМИД 15324660 . S2CID 2371325 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К. и др. (2005). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД 15635413 . S2CID 4344740 .

Эта ферментам статья, посвященная , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000144028 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000003660 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9872452-5] Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (апрель 1999 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XI. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . ДНК Рез . 5 (5): 277–86. дои : 10.1093/dnares/5.5.277 . ПМИД 9872452 .

[pmid8670905-6] Лаубер Дж., Фабрицио П., Тейгелькамп С., Лейн В.С., Хартманн Э., Лурманн Р. (октябрь 1996 г.). «Белок HeLa 200 кДа U5 snRNP и его гомолог в Saccharomyces cerevisiae являются членами семейства белков DEXH-бокса предполагаемых РНК-хеликаз» . ЭМБО Дж . 15 (15): 4001–15. дои : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00774.x . ПМК 452120 . ПМИД 8670905 .

[pmid9774689-7] Аксель Т., Аренс К., Брамс Х., Тейгелькамп С., Лурманн Р. (ноябрь 1998 г.). «Человеческий белок U5-220kD (hPrp8) образует стабильный не содержащий РНК комплекс с несколькими U5-специфичными белками, включая РНК-унвиндазу, гомолог рибосомального фактора элонгации EF-2 и новый белок WD-40» . Мол Клеточная Биол . 18 (11): 6756–66. дои : 10.1128/mcb.18.11.6756 . ПМК 109259 . ПМИД 9774689 .

[pmid9539711-8] Лаггербауэр Б., Аксель Т., Лурманн Р. (май 1998 г.). «Человеческий белок DEXH-бокс U5-200 кДа раскручивает дубликаты РНК U4/U6 in vitro» . Proc Natl Acad Sci США . 95 (8): 4188–92. Бибкод : 1998PNAS...95.4188L . дои : 10.1073/pnas.95.8.4188 . ПМК 22463 . ПМИД 9539711 .

[entrez-9] «Ген Энтреза: ASCC3L1, активирующий сигнал коинтегратора 1, комплексная субъединица 3, подобная 1» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

v т и РНК-связывающий белок : рибонуклеопротеины.
snRNP	A A1 B B2 C D1 D2 D3 E F G N 70K/U1 spliceosomal RNA SNRNP200
hnRNP	A0 C L R
Other transcription	Telomerase
Translation	Ribosome
Vault ribonucleoprotein particles	Major vault protein
Other	Signal recognition particle