Protein-coding gene in the species Homo sapiens
Малый ядерный рибонуклеопротеин Sm D1 — белок , который у человека кодируется SNRPD1 геном . [ 5 ] [ 6 ]
Этот ген кодирует небольшой ядерный рибонуклеопротеин, принадлежащий к семейству ядерных белков SNRNP. Белок может действовать как заряженный белковый каркас, способствуя сборке SNRNP или усиливая взаимодействия SNRNP-SNRNP посредством неспецифических электростатических контактов с РНК. [ 7 ]
Было показано, что малый ядерный рибонуклеопротеин D1 взаимодействует с:
^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000167088 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000002477 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Лемайер Т., Рейкер В., Герман Х., Люрманн Р. (декабрь 1994 г.). «Клонирование кДНК белков Sm D2 и D3 из малых ядерных рибонуклеопротеинов человека: доказательства прямого взаимодействия D1-D2» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (25): 12317–21. Бибкод : 1994PNAS...9112317L . дои : 10.1073/pnas.91.25.12317 . ПМК 45428 . ПМИД 7527560 .
^ Лемайер Т., Фулаки К., Люрманн Р. (ноябрь 1990 г.). «Доказательства существования трех различных белков D, которые по-разному реагируют с аутоантителами против Sm, в ядрах основных мяРНП U1, U2, U4/U6 и U5» . Исследования нуклеиновых кислот . 18 (22): 6475–84. дои : 10.1093/нар/18.22.6475 . ПМЦ 332598 . ПМИД 1701240 .
^ «Ген Энтрез: малый ядерный рибонуклеопротеин D1 SNRPD1, полипептид 16 кДа» .
^ Аджух П., Кастер Б., Панов К., Зомердейк Дж.К., Манн М., Ламонд А.И. (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса CDC5L человека и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии» . Журнал ЭМБО . 19 (23): 6569–81. дои : 10.1093/emboj/19.23.6569 . ПМК 305846 . ПМИД 11101529 .
^ Фризен В.Дж., Паушкин С., Вайс А., Массне С., Песиридис Г.С., Ван Дуйн Г., Раппсилбер Дж., Манн М., Дрейфус Г. (декабрь 2001 г.). «Метилосома, 20S-комплекс, содержащий JBP1 и pICln, продуцирует модифицированные диметиларгинином белки Sm» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (24): 8289–300. дои : 10.1128/MCB.21.24.8289-8300.2001 . ПМК 99994 . ПМИД 11713266 .
^ Шарру Б., Пеллицони Л., Перкинсон Р.А., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (декабрь 1999 г.). «Gemin3: новый белок DEAD box, который взаимодействует с SMN, продуктом гена спинальной мышечной атрофии, и является компонентом драгоценных камней» . Журнал клеточной биологии . 147 (6): 1181–94. дои : 10.1083/jcb.147.6.1181 . ПМК 2168095 . ПМИД 10601333 .
^ Мейстер Г., Бюлер Д., Лаггербауэр Б., Зобава М., Лотспайх Ф., Фишер У. (август 2000 г.). «Характеристика ядерного комплекса 20S, содержащего белок выживания двигательных нейронов (SMN) и определенное подмножество сплайсосомных белков Sm» . Молекулярная генетика человека . 9 (13): 1977–86. дои : 10.1093/hmg/13.09.1977 . ПМИД 10942426 .
^ Лю Ц, Фишер Ю, Ван Ф, Дрейфусс Г (сентябрь 1997 г.). «Продукт гена заболевания спинальной мышечной атрофией, SMN, и связанный с ним белок SIP1 находятся в комплексе со сплайсосомными белками snRNP» . Клетка . 90 (6): 1013–21. дои : 10.1016/s0092-8674(00)80367-0 . ПМИД 9323129 . S2CID 10855404 .
^ Фризен В.Дж., Дрейфусс Дж. (август 2000 г.). «Специфические последовательности Sm и Sm-подобных (Lsm) белков опосредуют их взаимодействие с генным продуктом спинальной мышечной атрофии (SMN)» . Журнал биологической химии . 275 (34): 26370–5. дои : 10.1074/jbc.M003299200 . ПМИД 10851237 .
^ Фьюри М.Г., Чжан В., Христодулопулос I, Зиве Г.В. (ноябрь 1997 г.). «Множественный белок: белковые взаимодействия между общими коровыми белками мяРНП». Экспериментальные исследования клеток . 237 (1): 63–9. дои : 10.1006/excr.1997.3750 . ПМИД 9417867 .
^ Камбах С., Уок С., Янг Р., Авис Дж. М., де ла Фортель Э., Рейкер В. А., Люрманн Р., Ли Дж., Нагай К. (февраль 1999 г.). «Кристаллические структуры двух белковых комплексов Sm и их значение для сборки сплайсосомных мяРНП» . Клетка . 96 (3): 375–87. дои : 10.1016/s0092-8674(00)80550-4 . ПМИД 10025403 . S2CID 17379935 .
Ренц М., Хайм К., Браунлинг О., Чихос А., Виланд К., Зеелиг Х.П. (сентябрь 1989 г.). «Экспрессия основных аутоантигенов рибонуклеопротеина человека (РНП) в Escherichia coli и их использование в ИФА для скрининга сывороток пациентов с аутоиммунными заболеваниями» . Клиническая химия . 35 (9): 1861–3. дои : 10.1093/clinchem/35.9.1861 . ПМИД 2528429 .
Рокич Л.А., Хаселби Дж.А., Хох С.О. (июль 1988 г.). «Молекулярное клонирование кДНК, кодирующей аутоантиген Sm-D человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 85 (13): 4832–6. Бибкод : 1988PNAS...85.4832R . дои : 10.1073/pnas.85.13.4832 . ПМК 280530 . ПМИД 3260384 .
Сан Д., Оу Ю.К., Хох С.О. (апрель 1997 г.). «Анализ генов белка мяРНП человека Sm-D1 и идентификация последовательности промотора, которая показывает сегментарную гомологию с промоторами генов мяРНК Sm-E и U1». Джин . 189 (2): 245–54. дои : 10.1016/S0378-1119(96)00858-X . ПМИД 9168134 .
Лю Ц, Фишер Ю, Ван Ф, Дрейфусс Г (сентябрь 1997 г.). «Продукт гена заболевания спинальной мышечной атрофией, SMN, и связанный с ним белок SIP1 находятся в комплексе со сплайсосомными белками snRNP» . Клетка . 90 (6): 1013–21. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80367-0 . ПМИД 9323129 . S2CID 10855404 .
Фьюри М.Г., Чжан В., Христодулопулос I, Зиве Г.В. (ноябрь 1997 г.). «Множественный белок: белковые взаимодействия между общими коровыми белками мяРНП». Экспериментальные исследования клеток . 237 (1): 63–9. дои : 10.1006/excr.1997.3750 . ПМИД 9417867 .
Камбах С., Уок С., Янг Р., Авис Дж. М., де ла Фортель Э., Рейкер В. А., Люрманн Р., Ли Дж., Нагай К. (февраль 1999 г.). «Кристаллические структуры двух белковых комплексов Sm и их значение для сборки сплайсосомных мяРНП» . Клетка . 96 (3): 375–87. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80550-4 . ПМИД 10025403 . S2CID 17379935 .
Шарру Б., Пеллицони Л., Перкинсон Р.А., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (декабрь 1999 г.). «Gemin3: новый белок DEAD box, который взаимодействует с SMN, продуктом гена спинальной мышечной атрофии, и является компонентом драгоценных камней» . Журнал клеточной биологии . 147 (6): 1181–94. дои : 10.1083/jcb.147.6.1181 . ПМК 2168095 . ПМИД 10601333 .
Шарру Б., Пелиццони Л., Перкинсон Р.А., Йонг Дж., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (март 2000 г.). «Gemin4. Новый компонент комплекса SMN, который содержится как в драгоценных камнях, так и в ядрышках» . Журнал клеточной биологии . 148 (6): 1177–86. дои : 10.1083/jcb.148.6.1177 . ПМК 2174312 . ПМИД 10725331 .
Маммото А., Сасаки Т., Ким Ю., Такай Ю. (май 2000 г.). «Физическое и функциональное взаимодействие рабфилина-11 с белком Sec13 млекопитающих. Участие в торговле везикулами» . Журнал биологической химии . 275 (18): 13167–70. дои : 10.1074/jbc.C000096200 . ПМИД 10747849 .
Брамс Х., Реймакерс Дж., Юнион А., де Кейзер Ф., Мехеус Л., Люрманн Р. (июнь 2000 г.). «С-концевые дипептидные повторы RG сплайсосомальных белков Sm D1 и D3 содержат симметричные диметиларгинины, которые образуют основной B-клеточный эпитоп для аутоантител против Sm» . Журнал биологической химии . 275 (22): 17122–9. дои : 10.1074/jbc.M000300200 . hdl : 11858/00-001M-0000-0012-F7F0-E . ПМИД 10747894 .
Мейстер Г., Бюлер Д., Лаггербауэр Б., Зобава М., Лотспайх Ф., Фишер У. (август 2000 г.). «Характеристика ядерного комплекса 20S, содержащего белок выживания двигательных нейронов (SMN) и определенное подмножество сплайсосомных белков Sm» . Молекулярная генетика человека . 9 (13): 1977–86. дои : 10.1093/hmg/13.09.1977 . ПМИД 10942426 .
Аджух П., Кастер Б., Панов К., Зомердейк Дж.К., Манн М., Ламонд А.И. (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса CDC5L человека и идентификация его компонентов методом масс-спектрометрии» . Журнал ЭМБО . 19 (23): 6569–81. дои : 10.1093/emboj/19.23.6569 . ПМК 305846 . ПМИД 11101529 .
Урлауб Х., Рейкер В.А., Костка С., Люрманн Р. (январь 2001 г.). «Взаимодействие белка Sm и сайта Sm РНК внутри внутреннего кольца основной структуры сплайсосомного мяРНП» . Журнал ЭМБО . 20 (1–2): 187–96. дои : 10.1093/emboj/20.1.187 . ПМК 140196 . ПМИД 11226169 .
Фризен В.Дж., Массне С., Паушкин С., Вайс А., Дрейфус Г. (май 2001 г.). «SMN, продукт гена спинальной мышечной атрофии, преимущественно связывается с белками-мишенями, содержащими диметиларгинин» . Молекулярная клетка . 7 (5): 1111–7. дои : 10.1016/S1097-2765(01)00244-1 . ПМИД 11389857 .
Пак Дж.В., Восс П.Г., Грабски С., Ван Дж.Л., Паттерсон Р.Дж. (сентябрь 2001 г.). «Ассоциация галектина-1 и галектина-3 с Gemin4 в комплексах, содержащих белок SMN» . Исследования нуклеиновых кислот . 29 (17): 3595–602. дои : 10.1093/нар/29.17.3595 . ПМК 55878 . ПМИД 11522829 .
Фризен В.Дж., Паушкин С., Вайс А., Массне С., Песиридис Г.С., Ван Дуйн Г., Раппсилбер Дж., Манн М., Дрейфус Г. (декабрь 2001 г.). «Метилосома, 20S-комплекс, содержащий JBP1 и pICln, продуцирует модифицированные диметиларгинином белки Sm» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (24): 8289–300. дои : 10.1128/MCB.21.24.8289-8300.2001 . ПМК 99994 . ПМИД 11713266 .
Губиц А.К., Мурелатос З., Абель Л., Раппсилбер Дж., Манн М., Дрейфусс Г. (февраль 2002 г.). «Gemin5, новый белковый компонент повторов WD комплекса SMN, который связывает белки Sm» . Журнал биологической химии . 277 (7): 5631–6. дои : 10.1074/jbc.M109448200 . ПМИД 11714716 .