СНРПА1

СНРПА1
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 1A9N
Идентификаторы
Псевдонимы	SNRPA1 , Lea1, малый ядерный рибонуклеопротеидный полипептид А', U2A'
Внешние идентификаторы	Опустить : 603521 ; МГИ : 1916231 ; Гомологен : 2325 ; Генные карты : SNRPA1 ; OMA : SNRPA1 — ортологи
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 7 (mouse) Band 7|7 C Start 65,708,751 bp End 65,724,335 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in skin of abdomen lymph node thymus bone marrow spleen monocyte appendix tibial nerve right lung rectum Top expressed in primitive streak Paneth cell condyle fossa abdominal wall epiblast superior cervical ganglion motor neuron medullary collecting duct embryo More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function U2 snRNA binding protein binding RNA binding Cellular component catalytic step 2 spliceosome spliceosomal complex small nuclear ribonucleoprotein complex nucleus U2 snRNP nucleoplasm nuclear speck nuclear body U2-type precatalytic spliceosome U2-type catalytic step 2 spliceosome viral nucleocapsid Biological process mRNA splicing, via spliceosome mRNA processing RNA splicing interleukin-12-mediated signaling pathway spermatogenesis Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 6627 68981 Вместе н/д ENSMUSG00000030512 ЮниПрот P09661 P57784 RefSeq (мРНК) НМ_003090 НМ_021336 RefSeq (белок) НП_003081 НП_067311 Местоположение (UCSC) н/д Chr 7: 65,71 – 65,72 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Малый ядерный рибонуклеопротеин А' U2 представляет собой белок , который у человека кодируется SNRPA1 геном .

Взаимодействия

Было показано, что SNRPA1 взаимодействует с CDC5L .

Дальнейшее чтение

• Оно М., Катаока Н., Шимура Ю. (декабрь 1990 г.). «Белок, связывающий ядерный колпачок из клеток HeLa» . Исследования нуклеиновых кислот . 18 (23): 6989–95. дои : 10.1093/нар/18.23.6989 . ПМК   332760 . ПМИД   2148205 .
• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД   8125298 .
• Кджемс Дж., Шарп, Пенсильвания (август 1993 г.). «Основной домен Rev вируса иммунодефицита человека типа 1 специфически блокирует вход малого ядерного рибонуклеопротеина U4/U6.U5 в сборку сплайсосом» . Журнал вирусологии . 67 (8): 4769–76. doi : 10.1128/JVI.67.8.4769-4776.1993 . ПМК   237863 . ПМИД   8331728 .
• Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД   9373149 .
• Бленкоу Б.Дж., Исснер Р., Никерсон Дж.А., Шарп П.А. (апрель 1998 г.). «Коактиватор сплайсинга пре-мРНК» . Гены и развитие . 12 (7): 996–1009. дои : 10.1101/gad.12.7.996 . ПМК   316672 . ПМИД   9531537 .
• Прайс С.Р., Эванс П.Р., Нагай К. (август 1998 г.). «Кристаллическая структура сплайсосомного белкового комплекса U2B»-U2A', связанного с фрагментом малой ядерной РНК U2». Nature . 394 (6694): 645–50. Bibcode : 1998Natur.394..645P . doi : 10.1038/29234 . ПМИД   9716128 . S2CID   204999419 .
• Нойбауэр Г., Кинг А., Раппсилбер Дж., Кальвио С., Уотсон М., Аджух П. и др. (сентябрь 1998 г.). «Масс-спектрометрия и поиск в базе данных EST позволяют охарактеризовать мультибелковый сплайсосомный комплекс». Природная генетика . 20 (1): 46–50. дои : 10.1038/1700 . ПМИД   9731529 . S2CID   585778 .
• Элдридж А.Г., Ли Ю., Шарп П.А., Бленкоу Б.Дж. (май 1999 г.). «Коактиватор сплайсинга SRm160/300 необходим для функции экзона-энхансера» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (11): 6125–30. Бибкод : 1999PNAS...96.6125E . дои : 10.1073/pnas.96.11.6125 . ПМК   26846 . ПМИД   10339552 .
• Лундин М., Миккельсен Б., Гудим М., Сайед М. (март 2000 г.). «Геновая структура гена белка А', специфичного для U2 snRNP, из Salmo salar: наблюдаются альтернативные транскрипты». Морская биотехнология . 2 (2): 204–211. дои : 10.1007/s101269900015 . ПМИД   10811961 . S2CID   20060370 .
• Фонг Ю.В., Чжоу Ц (2002). «Стимулирующее влияние факторов сплайсинга на элонгацию транскрипции». Природа . 414 (6866): 929–33. дои : 10.1038/414929а . ПМИД   11780068 . S2CID   1518837 .
• Андерсен Дж.С., Лион К.Э., Фокс А.Х., Люнг А.К., Лам Ю.В., Стин Х. и др. (январь 2002 г.). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека» . Современная биология . 12 (1): 1–11. дои : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . ПМИД   11790298 .
• Юрица М.С., Ликлайдер Л.Дж., Гиги С.Р., Григорьев Н., Мур М.Дж. (апрель 2002 г.). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, подходящих для трехмерного структурного анализа» . РНК . 8 (4): 426–39. дои : 10.1017/S1355838202021088 . ПМК   1370266 . ПМИД   11991638 .
• Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К., Онг С.Е., Лион К.Э., Ламонд А.И., Манн М. (январь 2005 г.). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД   15635413 . S2CID   4344740 .
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (октябрь 2006 г.). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Природная биотехнология . 24 (10): 1285–92. дои : 10.1038/nbt1240 . ПМИД   16964243 . S2CID   14294292 .
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ   1847948 . ПМИД   17353931 .