Бета-актин

АКТБ
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3BYH, 3D2U, 3J82, 3LUE
Идентификаторы
Псевдонимы	ACTB , BRWS1, PS1TP5BP1, Бета-актин, актин, бета, бета-актин
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 102630 ; МГИ : 87904 ; Гомологен : 110648 ; GeneCards : ACTB ; ОМА : ACTB – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 7 (human)
End	5,563,902 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	142,892,509 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	saphenous vein; ; urethra; ; postcentral gyrus; ; synovial joint; ; orbitofrontal cortex; ; mucosa of ileum; ; Brodmann area 46; ; nipple; ; vena cava; ; olfactory bulb;
	Top expressed in
	human fetus; ; vas deferens; ; lateral septal nucleus; ; Gonadal ridge; ; mandibular prominence; ; migratory enteric neural crest cell; ; maxillary prominence; ; ventromedial nucleus; ; abdominal wall; ; medial ganglionic eminence;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; nucleotide binding; nitric-oxide synthase binding; Tat protein binding; structural constituent of cytoskeleton; protein binding; kinesin binding; identical protein binding; nucleosomal DNA binding; ATP binding;
Cellular component	cytoplasm; blood microparticle; membrane; focal adhesion; NuA4 histone acetyltransferase complex; plasma membrane; nucleoplasm; cytoplasmic ribonucleoprotein granule; extracellular exosome; cytoskeleton; dense body; cortical cytoskeleton; cytosol; myelin sheath; extracellular space;
Biological process	epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation; substantia nigra development; Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis; ephrin receptor signaling pathway; retina homeostasis; vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway; platelet aggregation; cell junction assembly; cytoskeleton organization; protein deubiquitination; membrane organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	60
	11461
	ENSG00000075624
	ENSMUSG00000029580
	P60709
	P60710
	НМ_001101
	НМ_007393
	НП_001092
	НП_031419
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Актин бета (аббревиатура ACTB / ACTB Комитета по номенклатуре генов HUGO ) представляет собой одну из шести различных изоформ актина , которые были идентифицированы у людей. Это один из двух немышечных цитоскелетных актинов. Актины — высококонсервативные белки. ^[5]^[6] которые участвуют в подвижности, структуре и целостности клеток. Альфа-актины являются основным компонентом сократительного аппарата. ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что актин бета взаимодействует с SPTBN2 . ^[8]^[9] Кроме того, было обнаружено, что РНК-связывающий белок Sam68 взаимодействует с мРНК, кодирующей актин бета, который регулирует синаптическое образование дендритных шипиков с его цитоскелетными компонентами.

Было показано, что актин бета активирует eNOS , тем самым увеличивая выработку NO. Было показано, что мотив из восьми аминокислот (326–333) в eNOS опосредует взаимодействие между актином и eNOS. ^[10]

Клиническая значимость

Рецидивирующие мутации в этом гене связаны со случаями диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфомы . ^[11]

Приложения

Актин бета часто используется в вестерн-блоттинге в качестве контроля нагрузки , чтобы нормализовать общее количество белка и проверить возможную деградацию белка в образцах. Его транскрипт также широко используется в качестве стандарта гена домашнего хозяйства в кПЦР . Его молекулярная масса составляет примерно 42 кДа. ^{[ нужна ссылка ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000075624 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029580 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ганнинг П.В., Гошдастидер Ю., Уитакер С., Попп Д., Робинсон Р.К. (июнь 2015 г.). «Эволюция композиционно и функционально различных актиновых нитей» . Журнал клеточной науки . 128 (11): 2009–2019. дои : 10.1242/jcs.165563 . ПМИД 25788699 .
^ Ханукоглу И., Танезе Н., Фукс Э. (февраль 1983 г.). «Комплементарная последовательность ДНК цитоплазматического актина человека. Межвидовое расхождение 3'-некодирующих областей». Журнал молекулярной биологии . 163 (4): 673–8. дои : 10.1016/0022-2836(83)90117-1 . ПМИД 6842590 .
^ «Ген Энтрез: актин ACTB, бета» .
^ Мао Б., Ву В., Ли Ю., Хоппе Д., Станнек П., Глинка А., Ньерс С. (май 2001 г.). «Белок 6, родственный рецептору ЛПНП, является рецептором белков Диккопфа». Природа . 411 (6835): 321–5. Бибкод : 2001Natur.411..321M . дои : 10.1038/35077108 . ПМИД 11357136 . S2CID 4323027 .
^ Холлеран Э.А., Лигон Л.А., Токито М., Станкевич М.С., Морроу Дж.С., Хольцбаур Э.Л. (сентябрь 2001 г.). «бета III-спектрин связывается с субъединицей Arp1 динактина» . Журнал биологической химии . 276 (39): 36598–605. дои : 10.1074/jbc.M104838200 . ПМИД 11461920 .
^ Кондриков Д., Фонсека Ф.В., Элмс С., Фултон Д., Блэк С.М., Блок ЭР, Су Ю (февраль 2010 г.). «Ассоциация бета-актина с эндотелиальной синтазой оксида азота модулирует выработку оксида азота и супероксида ферментом» . Журнал биологической химии . 285 (7): 4319–27. дои : 10.1074/jbc.M109.063172 . ПМК 2836036 . ПМИД 19946124 .
^ Лор Дж.Г., Стоянов П., Лоуренс М.С., Оклер Д., Чапуи Б., Суньез С., Круз-Гордилло П., Кночел Б., Асманн Ю.В., Слагер С.Л., Новак А.Дж., Доган А., Анселл С.М., Линк Б.К., Зоу Л., Гулд Дж., Саксена Г, Странский Н, Ранхель-Эскареньо С, Фернандес-Лопес Х.К., Идальго-Миранда А., Мелендес-Зайгла Дж., Эрнандес-Лемус Е., Шварц-Круз и Селис А., Имаз-Росшандлер И., Охесина А.И., Юнг Дж., Педамаллу CS, Ландер Э.С., Хаберманн Т.М., Серхан Дж.Р., Шипп М.А., Гетц Г., Голуб Т.Р. (март 2012 г.). «Обнаружение и определение приоритетности соматических мутаций при диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфоме (DLBCL) путем секвенирования всего экзома» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 109 (10): 3879–84. Бибкод : 2012PNAS..109.3879L . дои : 10.1073/pnas.1121343109 . ПМК 3309757 . ПМИД 22343534 .

Внешние ссылки

человека Местоположение генома ACTB и ACTB страница сведений о гене в браузере генома UCSC .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P60709 (Актин, цитоплазматический 1) в PDBe-KB .

Дальнейшее чтение

Вандекеркхове Дж., Ливитт Дж., Какунага Т., Вебер К. (1980). «Коэкспрессия мутантного бета-актина и двух нормальных бета- и гамма-цитоплазматических актинов в стабильно трансформированной линии клеток человека». Клетка . 22 (3): 893–9. дои : 10.1016/0092-8674(80)90566-8 . ПМИД 6893954 . S2CID 54299848 .
Ливитт Дж., Ганнинг П., Поррека П., Нг С.И., Лин К.С., Кедес Л. (1984). «Молекулярное клонирование и характеристика мутантных генов человеческого бета-актина дикого типа» . Молекулярная и клеточная биология . 4 (10): 1961–9. дои : 10.1128/mcb.4.10.1961 . ПМК 369012 . ПМИД 6095033 .
Нг С.Ю., Ганнинг П., Эдди Р., Понте П., Ливитт Дж., Шоу Т., Кедес Л. (1985). «Эволюция функционального гена бета-актина человека и его мультипсевдогенного семейства: консервация некодирующих областей и хромосомная дисперсия псевдогенов» . Молекулярная и клеточная биология . 5 (10): 2720–32. дои : 10.1128/mcb.5.10.2720 . ПМК 367010 . ПМИД 3837182 .
Снасель Й, Пихова I (1997). «Расщепление белков клетки-хозяина протеазой ВИЧ-1». Фолиа биологическая . 42 (5): 227–30. дои : 10.1007/BF02818986 . ПМИД 8997639 . S2CID 7617882 .
Ганнинг П., Вайнбергер Р., Джеффри П. (апрель 1997 г.). «Изоформы актина и тропомиозина в морфогенезе». Анатомия и эмбриология . 195 (4): 311–5. дои : 10.1007/s004290050050 . ПМИД 9108196 . S2CID 9692297 .
Кимура Т., Хашимото И., Нисикава М., Фудзисава Дзи (1997). «Роль Rev в ассоциации мРНК gag ВИЧ-1 с экспрессией цитоскелетного бета-актина и вирусного белка». Биохимия . 78 (11–12): 1075–80. дои : 10.1016/S0300-9084(97)86732-6 . ПМИД 9150887 .
Сентирмай М.Н., Савадого М. (май 2000 г.). «Пространственная организация транскрипции РНК-полимеразы II в ядре» . Исследования нуклеиновых кислот . 28 (10): 2019–25. дои : 10.1093/нар/28.10.2019 . ПМЦ 105382 . ПМИД 10773068 .
Андерсон Дж.Л., Хоуп Т.Дж. (апрель 2004 г.). «Аксессуарные белки ВИЧ и выживание в клетке-хозяине». Текущие отчеты о ВИЧ/СПИДе . 1 (1): 47–53. дои : 10.1007/s11904-004-0007-x . ПМИД 16091223 . S2CID 34731265 .
Педерсон Т., Эби У (ноябрь 2005 г.). «Ядерный актин растягивается, сокращения не наблюдается» . Молекулярная биология клетки . 16 (11): 5055–60. doi : 10.1091/mbc.E05-07-0656 . ПМК 1266405 . ПМИД 16148048 .
Перрин Б.Дж., Эрвасти Дж.М. (октябрь 2010 г.). «Семейство генов актина: функция соответствует изоформе» . Цитоскелет . 67 (10): 630–4. дои : 10.1002/см.20475 . ПМЦ 2949686 . ПМИД 20737541 .

См. также

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 7 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000075624 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029580 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[gunning-5] Ганнинг П.В., Гошдастидер Ю., Уитакер С., Попп Д., Робинсон Р.К. (июнь 2015 г.). «Эволюция композиционно и функционально различных актиновых нитей» . Журнал клеточной науки . 128 (11): 2009–2019. дои : 10.1242/jcs.165563 . ПМИД 25788699 .

[pmid6842590-6] Ханукоглу И., Танезе Н., Фукс Э. (февраль 1983 г.). «Комплементарная последовательность ДНК цитоплазматического актина человека. Межвидовое расхождение 3'-некодирующих областей». Журнал молекулярной биологии . 163 (4): 673–8. дои : 10.1016/0022-2836(83)90117-1 . ПМИД 6842590 .

[7] «Ген Энтрез: актин ACTB, бета» .

[pmid11357136-8] Мао Б., Ву В., Ли Ю., Хоппе Д., Станнек П., Глинка А., Ньерс С. (май 2001 г.). «Белок 6, родственный рецептору ЛПНП, является рецептором белков Диккопфа». Природа . 411 (6835): 321–5. Бибкод : 2001Natur.411..321M . дои : 10.1038/35077108 . ПМИД 11357136 . S2CID 4323027 .

[pmid11461920-9] Холлеран Э.А., Лигон Л.А., Токито М., Станкевич М.С., Морроу Дж.С., Хольцбаур Э.Л. (сентябрь 2001 г.). «бета III-спектрин связывается с субъединицей Arp1 динактина» . Журнал биологической химии . 276 (39): 36598–605. дои : 10.1074/jbc.M104838200 . ПМИД 11461920 .

[Actin_Enos-10] Кондриков Д., Фонсека Ф.В., Элмс С., Фултон Д., Блэк С.М., Блок ЭР, Су Ю (февраль 2010 г.). «Ассоциация бета-актина с эндотелиальной синтазой оксида азота модулирует выработку оксида азота и супероксида ферментом» . Журнал биологической химии . 285 (7): 4319–27. дои : 10.1074/jbc.M109.063172 . ПМК 2836036 . ПМИД 19946124 .

[pmid22343534-11] Лор Дж.Г., Стоянов П., Лоуренс М.С., Оклер Д., Чапуи Б., Суньез С., Круз-Гордилло П., Кночел Б., Асманн Ю.В., Слагер С.Л., Новак А.Дж., Доган А., Анселл С.М., Линк Б.К., Зоу Л., Гулд Дж., Саксена Г, Странский Н, Ранхель-Эскареньо С, Фернандес-Лопес Х.К., Идальго-Миранда А., Мелендес-Зайгла Дж., Эрнандес-Лемус Е., Шварц-Круз и Селис А., Имаз-Росшандлер И., Охесина А.И., Юнг Дж., Педамаллу CS, Ландер Э.С., Хаберманн Т.М., Серхан Дж.Р., Шипп М.А., Гетц Г., Голуб Т.Р. (март 2012 г.). «Обнаружение и определение приоритетности соматических мутаций при диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфоме (DLBCL) путем секвенирования всего экзома» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 109 (10): 3879–84. Бибкод : 2012PNAS..109.3879L . дои : 10.1073/pnas.1121343109 . ПМК 3309757 . ПМИД 22343534 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]