Jump to content

ФЛНА

ФЛНА
Доступные структуры
ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы FLNA , ABP-280, ABPX, CSBS, CVD1, FLN, FLN-A, FLN1, FMD, MNS, NHBP, OPD, OPD1, OPD2, XLVD, XMVD, филамин А, FGS2
Внешние идентификаторы Опустить : 300017 ; МГИ : 95556 ; Гомологен : 1119 ; GeneCards : FLNA ; ОМА : FLNA – ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_001110556
НМ_001456

НМ_001290421
НМ_010227

RefSeq (белок)

НП_001104026
НП_001447

НП_001277350
НП_034357
НП_001390993

Местоположение (UCSC) Chr X: 154,35 – 154,37 Мб Chr X: 73,27 – 73,29 Мб
в PubMed Поиск [3] [4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Филамин А, альфа ( FLNA ) — белок , который у человека кодируется FLNA геном . [5] [6]

Актин-связывающий белок, или филамин , представляет собой белок массой 280 кДа, который сшивает актиновые нити в ортогональные сети в кортикальной цитоплазме и участвует в закреплении мембранных белков актинового цитоскелета . Ремоделирование цитоскелета играет центральную роль в модуляции формы и миграции клеток. Филамин А, кодируемый геном FLNA, представляет собой широко экспрессируемый филамин, который регулирует реорганизацию актинового цитоскелета путем взаимодействия с интегринами , трансмембранными рецепторными комплексами и вторичными мессенджерами . [7] Обнаружена по меньшей мере 31 мутация этого гена, вызывающая заболевание. [8]

Структура

[ редактировать ]

Структура белка включает актинсвязывающий N-концевой домен, 24 внутренних повтора и 2 шарнирных участка. [9] [10]

Взаимодействия

[ редактировать ]

Было показано, что филамин взаимодействует с:

Редактирование РНК

[ редактировать ]

Отредактированный остаток был ранее записан как однонуклеотидный полиморфизм (SNP) в dbSNP .

от A до I Редактирование РНК катализируется семейством аденозиндезаминаз, действующих на РНК (ADAR), которые специфически распознают аденозины в двухцепочечных областях пре-мРНК и дезаминируют их до инозина. Инозины распознаются как гуанозин механизмом трансляции клеток . В семействе ADAR есть три члена ADAR 1-3, причем ADAR 1 и ADAR 2 являются единственными ферментативно активными членами. Считается, что ADAR3 играет регуляторную роль в мозге. ADAR1 и ADAR 2 широко экспрессируются в тканях, тогда как ADAR 3 ограничен мозгом. Двухцепочечные участки РНК образуются путем спаривания оснований между остатками в участке, комплементарном участку сайта редактирования. Эта комплементарная область обычно находится в соседнем интроне , но может также располагаться в экзонной последовательности. Область, которая образует пары оснований с областью редактирования, известна как редактируемая дополнительная последовательность (ECS).

Один сайт редактирования пре-мРНК FLNA расположен в аминокислоте 2341 конечного белка. ( Кодон глутамина Q) изменяется из-за сайт-специфического дезаминирования аденозина в месте редактирования до кодона аргинина (R). Предполагается, что область редактирования образует двухцепочечную область длиной 32 пары оснований с комплементарной последовательностью примерно на 200 нуклеотидов ниже сайта редактирования. Эта ECS находится в интронной последовательности. [25] Редактирование на сайте Q/R, вероятно, будет включать в себя как ADAR1, так и ADAR2. Нокаут ADAR2 на мышах показывает уменьшение редактирования на сайте Q/R. Двойное нокаут ADAR1 не влияет на редактирование. [26]

Структура

[ редактировать ]

Отредактированный аденозин находится в 22 иммуноглоулиновом комплексе. [ проверьте орфографию ] как повторение белка. Эта область представляет собой интегрина β. связывающий домен [27] и связывающий домен RAC1 . [20] Замена аминокислоты, вероятно, повлияет на электростатический потенциал связывающих доменов. [25] Сайт редактирования FLNA находится на расстоянии 2 нуклеотидов от сайта сплайсинга, такого как сайт R/G GluR-2. Оба транскрипта имеют 7/8 идентичных нуклеотидов вокруг сайтов редактирования. Поскольку широко распространено мнение, что редактирование сайта Q/R GLUR-2 влияет на сплайсинг, сходство последовательности и сайта редактирования может означать, что редактирование сайта FLNA может также регулировать сплайсинг. Эксперименты с gluR-2 in vitro показали, что присутствие ADAR2 приводит к ингибированию сплайсинга. [28] Анализ данных EST для FLNA показывает, что существует связь между редактированием кодона последнего экзона и сохранением следующего интрона. [25]

Изменение электростатического потенциала, вероятно, повлияет на связывание FLNA со многими белками, с которыми он взаимодействует. [29]

восстановление ДНК

[ редактировать ]

Взаимодействие FLNA с белком BRCA1 необходимо для эффективной регуляции ранних стадий процессов репарации ДНК . [30] FLNA участвует в контроле процесса репарации ДНК гомологичной рекомбинации и негомологичного соединения концов . [30]

  1. ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000196924 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031328 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Горлин Дж.Б., Хенске Э., Уоррен С.Т., Кунст CB, Д'Урсо М., Палмиери Дж., Хартвиг ​​Дж.Х., Брунс Г., Квятковски DJ (октябрь 1993 г.). «Ген филамина (FLN) актин-связывающего белка (ABP-280) отображает теломерную часть локуса цветового зрения (R/GCP), а центромерную — G6PD в Xq28». Геномика . 17 (2): 496–8. дои : 10.1006/geno.1993.1354 . ПМИД   8406501 .
  6. ^ Робертсон С.П., Твигг С.Р., Сазерленд-Смит А.Дж., Бьянкалана В., Горлин Р.Дж., Хорн Д., Кенрик С.Дж., Ким К.А., Морава Е., Ньюбери-Экоб Р., Орставик К.Х., Куоррелл О.В., Шварц К.Э., Ширс DJ, Сури М., Кендрик -Джонс Дж., Уилки А.О. (март 2003 г.). «Локальные мутации в гене, кодирующем цитоскелетный белок филамин А, вызывают у человека разнообразные пороки развития» . Нат Жене . 33 (4): 487–91. дои : 10.1038/ng1119 . ПМИД   12612583 .
  7. ^ «Ген Энтреза: FLNA филамин А, альфа (актин-связывающий белок 280)» .
  8. ^ Шимчикова Д., Хенеберг П. (декабрь 2019 г.). «Уточнение прогнозов эволюционной медицины на основе клинических данных о проявлениях менделевских болезней» . Научные отчеты . 9 (1): 18577. Бибкод : 2019NatSR...918577S . дои : 10.1038/s41598-019-54976-4 . ПМК   6901466 . ПМИД   31819097 .
  9. ^ Гребер П., Витт Х.Т. (февраль 1976 г.). «Связь между электрическим потенциалом, градиентом pH, потоком протонов и фосфорилированием в фотосинтетической мембране». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) — Биоэнергетика . 423 (2): 141–63. дои : 10.1016/0005-2728(76)90174-2 . ПМИД   2316 .
  10. ^ «P21333 (FLNA_HUMAN): Филамин-А» . ЮниПрот .
  11. ^ Юань Ю, Шэнь Цзи (декабрь 2001 г.). «Взаимодействие с BRCA2 предполагает роль филамина-1 (hsFLNa) в реакции на повреждение ДНК» . Ж. Биол. Хим . 276 (51): 48318–24. дои : 10.1074/jbc.M102557200 . ПМИД   11602572 .
  12. ^ ван дер Флиер А., Куйкман И., Крамер Д., Гертс Д., Крефт М., Такафута Т., Шапиро С.С., Зонненберг А. (январь 2002 г.). «Различные варианты сплайсинга филамина-B влияют на миогенез, внутриклеточное распределение и определяют связывание с субъединицами интегрина [бета]» . Дж. Клеточная Биол . 156 (2): 361–76. дои : 10.1083/jcb.200103037 . ПМК   2199218 . ПМИД   11807098 .
  13. ^ Лоо Д.Т., Каннер С.Б., Аруффо А. (сентябрь 1998 г.). «Филамин связывается с цитоплазматическим доменом бета1-интегрина. Идентификация аминокислот, ответственных за это взаимодействие» . Ж. Биол. Хим . 273 (36): 23304–12. дои : 10.1074/jbc.273.36.23304 . ПМИД   9722563 .
  14. ^ Хьялм Г., Маклеод Р.Дж., Кифор О., Чаттопадхай Н., Браун Э.М. (сентябрь 2001 г.). «Филамин-А связывается с карбоксильным концом кальций-чувствительного рецептора, взаимодействие, которое участвует в CaR-опосредованной активации митоген-активируемой протеинкиназы» . Ж. Биол. Хим . 276 (37): 34880–7. дои : 10.1074/jbc.M100784200 . ПМИД   11390380 .
  15. ^ Авата Х., Хуанг С., Хандлогтен М.Э., Миллер Р.Т. (сентябрь 2001 г.). «Взаимодействие кальций-чувствительного рецептора и филамина, потенциального каркасного белка» . Ж. Биол. Хим . 276 (37): 34871–9. дои : 10.1074/jbc.M100775200 . ПМИД   11390379 .
  16. ^ Ту Й, Ву С, Ши Х, Чен К, Ву С (апрель 2003 г.). «Мигфилин и Миг-2 связывают фокальные адгезии с филамином и актиновым цитоскелетом и участвуют в модуляции формы клеток» . Клетка . 113 (1): 37–47. дои : 10.1016/s0092-8674(03)00163-6 . ПМИД   12679033 .
  17. ^ Нагано Т., Йонеда Т., Хатанака Ю., Кубота С., Мураками Ф., Сато М. (июль 2002 г.). «Белок, взаимодействующий с филамином А (FILIP), регулирует миграцию кортикальных клеток из зоны желудочков». Нат. Клеточная Биол . 4 (7): 495–501. дои : 10.1038/ncb808 . ПМИД   12055638 . S2CID   4795393 .
  18. ^ Шин В.Л., Фэн Ю., Грэм Д., Такафута Т., Шапиро С.С., Уолш Калифорния (ноябрь 2002 г.). «Филамин А и филамин B совместно экспрессируются внутри нейронов в периоды миграции нейронов и могут физически взаимодействовать» . Хм. Мол. Жене . 11 (23): 2845–54. дои : 10.1093/hmg/11.23.2845 . ПМИД   12393796 .
  19. ^ Дональдсон Дж.К., Дайс Р.С., Ритчи М.Д., Хэнкс С.К. (август 2002 г.). «Нефроцистин-консервативные домены участвуют в нацеливании на межклеточные соединения эпителия, взаимодействии с филаминами и установлении полярности клеток» . Ж. Биол. Хим . 277 (32): 29028–35. дои : 10.1074/jbc.M111697200 . ПМИД   12006559 .
  20. ^ Jump up to: а б Охта Ю., Сузуки Н., Накамура С., Хартвиг ​​Дж. Х., Штоссель Т. П. (март 1999 г.). «Маленькая ГТФаза RalA нацелена на филамин, вызывая филоподии» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 96 (5): 2122–8. Бибкод : 1999PNAS...96.2122O . дои : 10.1073/pnas.96.5.2122 . ПМК   26747 . ПМИД   10051605 .
  21. ^ Хэ Х, Ли Ю, Шембри-Кинг Дж, Джейкс С, Хаяши Дж (август 2000 г.). «Идентификация актинсвязывающего белка ABP-280 как партнера по связыванию человеческого адаптерного белка Lnk». Мол. Иммунол . 37 (10): 603–12. дои : 10.1016/s0161-5890(00)00070-5 . ПМИД   11163396 .
  22. ^ Белланджер Дж. М., Астье С., Сардет С., Ота Ю., Штоссель Т.П., Дебант А. (декабрь 2000 г.). «Rac1- и RhoG-специфичный домен GEF Trio нацелен на филамин, ремоделируя цитоскелетный актин». Нат. Клеточная Биол . 2 (12): 888–92. дои : 10.1038/35046533 . ПМИД   11146652 . S2CID   10182923 .
  23. ^ Цучия Х., Иседа Т., Хино О. (июль 1996 г.). «Идентификация нового белка (VBP-1), связывающегося с продуктом гена-супрессора опухоли фон Хиппеля-Линдау (VHL)». Рак Рез . 56 (13): 2881–5. ПМИД   8674032 .
  24. ^ Чжоу М.И., Ван Х., Росс Дж.Дж., Кузьмин И., Сюй С., Коэн Х.Т. (октябрь 2002 г.). «Супрессор опухоли фон Хиппель-Линдау стабилизирует новый растительный гомеодоменовый белок Jade-1» . Ж. Биол. Хим . 277 (42): 39887–98. дои : 10.1074/jbc.M205040200 . ПМИД   12169691 .
  25. ^ Jump up to: а б с Леванон Э.Ю., Халлеггер М., Кинар Ю., Шемеш Р., Джинович-Каруго К., Рехави Г., Янч М.Ф., Айзенберг Э. (2005). «Эволюционно консервативные человеческие мишени редактирования РНК от аденозина до инозина» . Нуклеиновые кислоты Рез . 33 (4): 1162–8. arXiv : q-bio/0502045 . Бибкод : 2005q.bio.....2045L . дои : 10.1093/nar/gki239 . ПМК   549564 . ПМИД   15731336 .
  26. ^ Ридманн Э.М., Шопофф С., Хартнер Дж.К., Янч М.Ф. (июнь 2008 г.). «Специфика ADAR-опосредованного редактирования РНК в вновь идентифицированных мишенях» . РНК . 14 (6): 1110–8. дои : 10.1261/rna.923308 . ПМК   2390793 . ПМИД   18430892 .
  27. ^ Трэвис М.А., ван дер Флиер А., Каммерер Р.А., Молд А.П., Зонненберг А., Хамфрис М.Дж. (июль 2004 г.). «Взаимодействие филамина А с цитоплазматическим доменом интегрина бета 7: роль альтернативного сплайсинга и фосфорилирования» . ФЭБС Летт . 569 (1–3): 185–90. дои : 10.1016/j.febslet.2004.04.099 . ПМИД   15225631 .
  28. ^ Брэтт Э., Оман М. (март 2003 г.). «Координация редактирования и сплайсинга пре-мРНК глутаматного рецептора» . РНК . 9 (3): 309–18. дои : 10.1261/rna.2750803 . ПМЦ   1370398 . ПМИД   12592005 .
  29. ^ Попович Г.М., Мюллер Р., Ногель А.А., Шлейхер М., Хубер Р., Холак Т.А. (октябрь 2004 г.). «Молекулярная структура стержневого домена филамина диктиостелия». Дж. Мол. Биол . 342 (5): 1637–46. дои : 10.1016/j.jmb.2004.08.017 . ПМИД   15364587 .
  30. ^ Jump up to: а б Велкова А, Карвалью М.А., Джонсон Ж.О., Тавтигян С.В., Монтейро А.Н. Идентификация филамина А как белка, взаимодействующего с BRCA1, необходимого для эффективной репарации ДНК. Клеточный цикл. 1 апреля 2010 г.;9(7):1421-33. дои: 10.4161/cc.9.7.11256. Электронная публикация, 1 апреля 2010 г. PMID 20305393; PMCID: PMC3040726

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 5430485de604b2ca9b1334ccf74a8704__1718662140
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/54/04/5430485de604b2ca9b1334ccf74a8704.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
FLNA - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)