ФЛНА
ФЛНА | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | FLNA , ABP-280, ABPX, CSBS, CVD1, FLN, FLN-A, FLN1, FMD, MNS, NHBP, OPD, OPD1, OPD2, XLVD, XMVD, филамин А, FGS2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | Опустить : 300017 ; МГИ : 95556 ; Гомологен : 1119 ; GeneCards : FLNA ; ОМА : FLNA – ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Филамин А, альфа ( FLNA ) — белок , который у человека кодируется FLNA геном . [5] [6]
Функция
[ редактировать ]Актин-связывающий белок, или филамин , представляет собой белок массой 280 кДа, который сшивает актиновые нити в ортогональные сети в кортикальной цитоплазме и участвует в закреплении мембранных белков актинового цитоскелета . Ремоделирование цитоскелета играет центральную роль в модуляции формы и миграции клеток. Филамин А, кодируемый геном FLNA, представляет собой широко экспрессируемый филамин, который регулирует реорганизацию актинового цитоскелета путем взаимодействия с интегринами , трансмембранными рецепторными комплексами и вторичными мессенджерами . [7] Обнаружена по меньшей мере 31 мутация этого гена, вызывающая заболевание. [8]
Структура
[ редактировать ]Структура белка включает актинсвязывающий N-концевой домен, 24 внутренних повтора и 2 шарнирных участка. [9] [10]
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что филамин взаимодействует с:
Редактирование РНК
[ редактировать ]Отредактированный остаток был ранее записан как однонуклеотидный полиморфизм (SNP) в dbSNP .
Тип
[ редактировать ]от A до I Редактирование РНК катализируется семейством аденозиндезаминаз, действующих на РНК (ADAR), которые специфически распознают аденозины в двухцепочечных областях пре-мРНК и дезаминируют их до инозина. Инозины распознаются как гуанозин механизмом трансляции клеток . В семействе ADAR есть три члена ADAR 1-3, причем ADAR 1 и ADAR 2 являются единственными ферментативно активными членами. Считается, что ADAR3 играет регуляторную роль в мозге. ADAR1 и ADAR 2 широко экспрессируются в тканях, тогда как ADAR 3 ограничен мозгом. Двухцепочечные участки РНК образуются путем спаривания оснований между остатками в участке, комплементарном участку сайта редактирования. Эта комплементарная область обычно находится в соседнем интроне , но может также располагаться в экзонной последовательности. Область, которая образует пары оснований с областью редактирования, известна как редактируемая дополнительная последовательность (ECS).
Сайт
[ редактировать ]Один сайт редактирования пре-мРНК FLNA расположен в аминокислоте 2341 конечного белка. ( Кодон глутамина Q) изменяется из-за сайт-специфического дезаминирования аденозина в месте редактирования до кодона аргинина (R). Предполагается, что область редактирования образует двухцепочечную область длиной 32 пары оснований с комплементарной последовательностью примерно на 200 нуклеотидов ниже сайта редактирования. Эта ECS находится в интронной последовательности. [25] Редактирование на сайте Q/R, вероятно, будет включать в себя как ADAR1, так и ADAR2. Нокаут ADAR2 на мышах показывает уменьшение редактирования на сайте Q/R. Двойное нокаут ADAR1 не влияет на редактирование. [26]
Структура
[ редактировать ]Отредактированный аденозин находится в 22 иммуноглоулиновом комплексе. [ проверьте орфографию ] как повторение белка. Эта область представляет собой интегрина β. связывающий домен [27] и связывающий домен RAC1 . [20] Замена аминокислоты, вероятно, повлияет на электростатический потенциал связывающих доменов. [25] Сайт редактирования FLNA находится на расстоянии 2 нуклеотидов от сайта сплайсинга, такого как сайт R/G GluR-2. Оба транскрипта имеют 7/8 идентичных нуклеотидов вокруг сайтов редактирования. Поскольку широко распространено мнение, что редактирование сайта Q/R GLUR-2 влияет на сплайсинг, сходство последовательности и сайта редактирования может означать, что редактирование сайта FLNA может также регулировать сплайсинг. Эксперименты с gluR-2 in vitro показали, что присутствие ADAR2 приводит к ингибированию сплайсинга. [28] Анализ данных EST для FLNA показывает, что существует связь между редактированием кодона последнего экзона и сохранением следующего интрона. [25]
Функция
[ редактировать ]Изменение электростатического потенциала, вероятно, повлияет на связывание FLNA со многими белками, с которыми он взаимодействует. [29]
восстановление ДНК
[ редактировать ]Взаимодействие FLNA с белком BRCA1 необходимо для эффективной регуляции ранних стадий процессов репарации ДНК . [30] FLNA участвует в контроле процесса репарации ДНК гомологичной рекомбинации и негомологичного соединения концов . [30]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000196924 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031328 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Горлин Дж.Б., Хенске Э., Уоррен С.Т., Кунст CB, Д'Урсо М., Палмиери Дж., Хартвиг Дж.Х., Брунс Г., Квятковски DJ (октябрь 1993 г.). «Ген филамина (FLN) актин-связывающего белка (ABP-280) отображает теломерную часть локуса цветового зрения (R/GCP), а центромерную — G6PD в Xq28». Геномика . 17 (2): 496–8. дои : 10.1006/geno.1993.1354 . ПМИД 8406501 .
- ^ Робертсон С.П., Твигг С.Р., Сазерленд-Смит А.Дж., Бьянкалана В., Горлин Р.Дж., Хорн Д., Кенрик С.Дж., Ким К.А., Морава Е., Ньюбери-Экоб Р., Орставик К.Х., Куоррелл О.В., Шварц К.Э., Ширс DJ, Сури М., Кендрик -Джонс Дж., Уилки А.О. (март 2003 г.). «Локальные мутации в гене, кодирующем цитоскелетный белок филамин А, вызывают у человека разнообразные пороки развития» . Нат Жене . 33 (4): 487–91. дои : 10.1038/ng1119 . ПМИД 12612583 .
- ^ «Ген Энтреза: FLNA филамин А, альфа (актин-связывающий белок 280)» .
- ^ Шимчикова Д., Хенеберг П. (декабрь 2019 г.). «Уточнение прогнозов эволюционной медицины на основе клинических данных о проявлениях менделевских болезней» . Научные отчеты . 9 (1): 18577. Бибкод : 2019NatSR...918577S . дои : 10.1038/s41598-019-54976-4 . ПМК 6901466 . ПМИД 31819097 .
- ^ Гребер П., Витт Х.Т. (февраль 1976 г.). «Связь между электрическим потенциалом, градиентом pH, потоком протонов и фосфорилированием в фотосинтетической мембране». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) — Биоэнергетика . 423 (2): 141–63. дои : 10.1016/0005-2728(76)90174-2 . ПМИД 2316 .
- ^ «P21333 (FLNA_HUMAN): Филамин-А» . ЮниПрот .
- ^ Юань Ю, Шэнь Цзи (декабрь 2001 г.). «Взаимодействие с BRCA2 предполагает роль филамина-1 (hsFLNa) в реакции на повреждение ДНК» . Ж. Биол. Хим . 276 (51): 48318–24. дои : 10.1074/jbc.M102557200 . ПМИД 11602572 .
- ^ ван дер Флиер А., Куйкман И., Крамер Д., Гертс Д., Крефт М., Такафута Т., Шапиро С.С., Зонненберг А. (январь 2002 г.). «Различные варианты сплайсинга филамина-B влияют на миогенез, внутриклеточное распределение и определяют связывание с субъединицами интегрина [бета]» . Дж. Клеточная Биол . 156 (2): 361–76. дои : 10.1083/jcb.200103037 . ПМК 2199218 . ПМИД 11807098 .
- ^ Лоо Д.Т., Каннер С.Б., Аруффо А. (сентябрь 1998 г.). «Филамин связывается с цитоплазматическим доменом бета1-интегрина. Идентификация аминокислот, ответственных за это взаимодействие» . Ж. Биол. Хим . 273 (36): 23304–12. дои : 10.1074/jbc.273.36.23304 . ПМИД 9722563 .
- ^ Хьялм Г., Маклеод Р.Дж., Кифор О., Чаттопадхай Н., Браун Э.М. (сентябрь 2001 г.). «Филамин-А связывается с карбоксильным концом кальций-чувствительного рецептора, взаимодействие, которое участвует в CaR-опосредованной активации митоген-активируемой протеинкиназы» . Ж. Биол. Хим . 276 (37): 34880–7. дои : 10.1074/jbc.M100784200 . ПМИД 11390380 .
- ^ Авата Х., Хуанг С., Хандлогтен М.Э., Миллер Р.Т. (сентябрь 2001 г.). «Взаимодействие кальций-чувствительного рецептора и филамина, потенциального каркасного белка» . Ж. Биол. Хим . 276 (37): 34871–9. дои : 10.1074/jbc.M100775200 . ПМИД 11390379 .
- ^ Ту Й, Ву С, Ши Х, Чен К, Ву С (апрель 2003 г.). «Мигфилин и Миг-2 связывают фокальные адгезии с филамином и актиновым цитоскелетом и участвуют в модуляции формы клеток» . Клетка . 113 (1): 37–47. дои : 10.1016/s0092-8674(03)00163-6 . ПМИД 12679033 .
- ^ Нагано Т., Йонеда Т., Хатанака Ю., Кубота С., Мураками Ф., Сато М. (июль 2002 г.). «Белок, взаимодействующий с филамином А (FILIP), регулирует миграцию кортикальных клеток из зоны желудочков». Нат. Клеточная Биол . 4 (7): 495–501. дои : 10.1038/ncb808 . ПМИД 12055638 . S2CID 4795393 .
- ^ Шин В.Л., Фэн Ю., Грэм Д., Такафута Т., Шапиро С.С., Уолш Калифорния (ноябрь 2002 г.). «Филамин А и филамин B совместно экспрессируются внутри нейронов в периоды миграции нейронов и могут физически взаимодействовать» . Хм. Мол. Жене . 11 (23): 2845–54. дои : 10.1093/hmg/11.23.2845 . ПМИД 12393796 .
- ^ Дональдсон Дж.К., Дайс Р.С., Ритчи М.Д., Хэнкс С.К. (август 2002 г.). «Нефроцистин-консервативные домены участвуют в нацеливании на межклеточные соединения эпителия, взаимодействии с филаминами и установлении полярности клеток» . Ж. Биол. Хим . 277 (32): 29028–35. дои : 10.1074/jbc.M111697200 . ПМИД 12006559 .
- ^ Jump up to: а б Охта Ю., Сузуки Н., Накамура С., Хартвиг Дж. Х., Штоссель Т. П. (март 1999 г.). «Маленькая ГТФаза RalA нацелена на филамин, вызывая филоподии» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 96 (5): 2122–8. Бибкод : 1999PNAS...96.2122O . дои : 10.1073/pnas.96.5.2122 . ПМК 26747 . ПМИД 10051605 .
- ^ Хэ Х, Ли Ю, Шембри-Кинг Дж, Джейкс С, Хаяши Дж (август 2000 г.). «Идентификация актинсвязывающего белка ABP-280 как партнера по связыванию человеческого адаптерного белка Lnk». Мол. Иммунол . 37 (10): 603–12. дои : 10.1016/s0161-5890(00)00070-5 . ПМИД 11163396 .
- ^ Белланджер Дж. М., Астье С., Сардет С., Ота Ю., Штоссель Т.П., Дебант А. (декабрь 2000 г.). «Rac1- и RhoG-специфичный домен GEF Trio нацелен на филамин, ремоделируя цитоскелетный актин». Нат. Клеточная Биол . 2 (12): 888–92. дои : 10.1038/35046533 . ПМИД 11146652 . S2CID 10182923 .
- ^ Цучия Х., Иседа Т., Хино О. (июль 1996 г.). «Идентификация нового белка (VBP-1), связывающегося с продуктом гена-супрессора опухоли фон Хиппеля-Линдау (VHL)». Рак Рез . 56 (13): 2881–5. ПМИД 8674032 .
- ^ Чжоу М.И., Ван Х., Росс Дж.Дж., Кузьмин И., Сюй С., Коэн Х.Т. (октябрь 2002 г.). «Супрессор опухоли фон Хиппель-Линдау стабилизирует новый растительный гомеодоменовый белок Jade-1» . Ж. Биол. Хим . 277 (42): 39887–98. дои : 10.1074/jbc.M205040200 . ПМИД 12169691 .
- ^ Jump up to: а б с Леванон Э.Ю., Халлеггер М., Кинар Ю., Шемеш Р., Джинович-Каруго К., Рехави Г., Янч М.Ф., Айзенберг Э. (2005). «Эволюционно консервативные человеческие мишени редактирования РНК от аденозина до инозина» . Нуклеиновые кислоты Рез . 33 (4): 1162–8. arXiv : q-bio/0502045 . Бибкод : 2005q.bio.....2045L . дои : 10.1093/nar/gki239 . ПМК 549564 . ПМИД 15731336 .
- ^ Ридманн Э.М., Шопофф С., Хартнер Дж.К., Янч М.Ф. (июнь 2008 г.). «Специфика ADAR-опосредованного редактирования РНК в вновь идентифицированных мишенях» . РНК . 14 (6): 1110–8. дои : 10.1261/rna.923308 . ПМК 2390793 . ПМИД 18430892 .
- ^ Трэвис М.А., ван дер Флиер А., Каммерер Р.А., Молд А.П., Зонненберг А., Хамфрис М.Дж. (июль 2004 г.). «Взаимодействие филамина А с цитоплазматическим доменом интегрина бета 7: роль альтернативного сплайсинга и фосфорилирования» . ФЭБС Летт . 569 (1–3): 185–90. дои : 10.1016/j.febslet.2004.04.099 . ПМИД 15225631 .
- ^ Брэтт Э., Оман М. (март 2003 г.). «Координация редактирования и сплайсинга пре-мРНК глутаматного рецептора» . РНК . 9 (3): 309–18. дои : 10.1261/rna.2750803 . ПМЦ 1370398 . ПМИД 12592005 .
- ^ Попович Г.М., Мюллер Р., Ногель А.А., Шлейхер М., Хубер Р., Холак Т.А. (октябрь 2004 г.). «Молекулярная структура стержневого домена филамина диктиостелия». Дж. Мол. Биол . 342 (5): 1637–46. дои : 10.1016/j.jmb.2004.08.017 . ПМИД 15364587 .
- ^ Jump up to: а б Велкова А, Карвалью М.А., Джонсон Ж.О., Тавтигян С.В., Монтейро А.Н. Идентификация филамина А как белка, взаимодействующего с BRCA1, необходимого для эффективной репарации ДНК. Клеточный цикл. 1 апреля 2010 г.;9(7):1421-33. дои: 10.4161/cc.9.7.11256. Электронная публикация, 1 апреля 2010 г. PMID 20305393; PMCID: PMC3040726
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Лайт С., Сагит Р., Итиханда С.С., Цинь Дж., Элофссон А. (сентябрь 2012 г.). «Эволюция филамина - перспектива повторения белкового домена» . Журнал структурной биологии . 179 (3): 289–98. дои : 10.1016/j.jsb.2012.02.010 . ПМЦ 3728663 . ПМИД 22414427 .
- Штоссель Т.П., Кондилис Дж., Кули Л., Хартвиг Дж.Х., Ногель А., Шлейхер М., Шапиро С.С. (2001). «Филамины как интеграторы клеточной механики и передачи сигналов». Нат. Преподобный мол. Клеточная Биол . 2 (2): 138–45. дои : 10.1038/35052082 . ПМИД 11252955 . S2CID 5203942 .
- ван дер Флиер А, Зонненберг А (2001). «Структурные и функциональные аспекты филаминов» . Биохим. Биофиз. Акта . 1538 (2–3): 99–117. дои : 10.1016/S0167-4889(01)00072-6 . ПМИД 11336782 .