ПКМ1
| ПКМ1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | PCM1 , PTC4, RET/PCM-1, перицентриолярный материал 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Опустить : 600299 ; МГИ : 1277958 ; Гомологен : 4518 ; Генные карты : PCM1 ; ОМА : PCM1 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Перицентриолярный материал 1 , также известный как PCM1 , представляет собой белок , который у человека кодируется PCM1 геном . [4] [5] [6]
Функция
[ редактировать ]Белок PCM1 был первоначально идентифицирован благодаря его четкой, зависимой от клеточного цикла ассоциации с центросомным комплексом и микротрубочками . Белок, по-видимому, связывается с центросомным комплексом во время клеточного цикла. Диссоциация происходит во время митоза, когда PCM1 распределяется по клетке. Проведенные исследования иммуномаркирования показали, что PCM1 присутствует в центриолярных сателлитах и в электронно-плотных гранулах диаметром от 70 до 100 нм. Первоначально считалось, что они разбросаны только вокруг центросом, но дальнейшие исследования показали, что PCM1 также обнаруживается по всей цитоплазме.
Было показано, что PCM1 необходим для деления клеток, поскольку антитела PCM1 вызывают остановку клеточного цикла при микроинъекциях в оплодотворенные мышиные яйцеклетки. Нацеливание на центрин , перицентрин и нинин также резко снижалось после истощения PCM1 с использованием siRNA, сверхэкспрессии мутантов с делецией PCM1 и микроинъекции антител PCM1. [7] Было обнаружено, что в результате этого истощения радиальная организация микротрубочек нарушается, но, по-видимому, не влияет на нуклеацию микротрубочек.
Генная структура
[ редактировать ]PCM1 имеет четыре известных транскрипта, самый длинный из которых имеет 39 экзонов. Открытая рамка считывания PCM1 кодирует белок, состоящий из 2024 аминокислот. Белок содержит области спиральной спирали между областями низкой сложности, а также домен аденозинтрифосфата ( АТФ ) / ГТФазы , домен ядерной локализации и эукариотический домен молибдоптерина. Эукариотический молибдоптеринсвязывающий домен в настоящее время обнаружен только в пяти других генах человека: ксантиндегидрогеназе , сульфитоксидазе (митохондриальном предшественнике), альдегидоксидазе , предшественнике рецептора эритропоэтина и АТФ-связывающей кассете, подсемействе А, член 2 ( ABCA2 ).
Распределение тканей
[ редактировать ]экспрессия мРНК PCM1 в мозге мышей Было обнаружено, что является самой высокой в гиппокампе . [8] У людей он экспрессируется выше среднего уровня экспрессии центральной нервной системы (ЦНС) в большинстве частей мозга. [9]
Клиническое значение
[ редактировать ]мутации в гене PCM1 Было показано, что вызывают генетическую предрасположенность к шизофрении . Если изменение аминокислоты изолейцин в PCM1 унаследовано, риск развития шизофрении составил 68% в двух независимых образцах из южной Англии и Шотландии. Это означает, что теперь возможно предложить очень ограниченное генетическое консультирование небольшой части людей с шизофренией, которые также являются носителями этой мутации. [10] [11]
PCM1 образует комплекс на центросоме с нарушенным при шизофрении 1 ( DISC1 ) и белком синдрома Бардета-Бидля 4 ( BBS4 ), который обеспечивает связь между аберрантным PCM1 и аномальным корковым развитием, связанным с патологией шизофрении. [12]
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что PCM1 взаимодействует с PCNT . [13]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031592 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ген Энтрез: перицентриолярный материал PCM1 1» .
- ^ Бальчон Р., Бао Л., Циммер В.Е. (март 1994 г.). «PCM-1, центросомный аутоантиген массой 228 кДа с отчетливым распределением клеточного цикла» . Дж. Клеточная Биол . 124 (5): 783–93. дои : 10.1083/jcb.124.5.783 . ПМК 2119948 . ПМИД 8120099 .
- ^ Хамес Р.С., Крукс Р.Э., Страатман К.Р., Мердес А., Хейс М.Дж., Фарагер А.Дж., Фрай А.М. (апрель 2005 г.). «Динамическое привлечение киназы Nek2 в центросому включает микротрубочки, PCM-1 и локализованную протеасомную деградацию» . Мол. Биол. Клетка . 16 (4): 1711–24. doi : 10.1091/mbc.E04-08-0688 . ПМЦ 1073654 . ПМИД 15659651 .
- ^ Даммерманн, А.; Мердес, А. (2002). «Сборка центросомальных белков и организация микротрубочек зависит от PCM-1» . Журнал клеточной биологии . 159 (2): 255–266. дои : 10.1083/jcb.200204023 . ПМК 2173044 . ПМИД 12403812 .
- ^ «Сводка экспрессии генов для Pcm1; перицентриолярный материал 1» . Алленовский институт исследований мозга . Проверено 30 апреля 2009 г.
- ^ «PCM1, Набор датчиков 202174_s_at» . BioGPS — ваша система генных порталов . Проверено 30 апреля 2009 г.
- ^ Датта С.Р., Маккуиллин А., Ризиг М., Блавери Э., Тирумалай С., Калси Дж., Лоуренс Дж., Басс Н.Дж., Пури В., Чоудхури К., Пимм Дж., Кромби С., Фрейзер Г., Уокер Н., Кертис Д., Звелебил М., Перейра А. , Кандасвами Р., Сент-Клер Д., Гёрлинг Х.М. (декабрь 2008 г.). «Миссенс-мутация треонина в изолейцин в гене перицентриолярного материала 1 тесно связана с шизофренией» . Мол. Психиатрия . 15 (6): 615–28. дои : 10.1038/mp.2008.128 . ПМИД 19048012 .
- ^ Гурлинг Х.М., Кричли Х., Датта С.Р., Маккуиллин А., Блавери Э., Тирумалай С., Пимм Дж., Красуки Р., Калси Г., Квестед Д., Лоуренс Дж., Басс Н., Чоудри К., Пури В., О'Дэйли О., Кертис Д., Блэквуд Д., Мьюир В., Малхотра А.К., Бьюкенен Р.В., Гуд КД, Фраковяк Р.С., Долан Р.Дж. (август 2006 г.). «Генетические ассоциации и исследования морфологии мозга и ген хромосомного 8p22 перицентриолярного материала 1 (PCM1) в предрасположенности к шизофрении» . Арх. Общая психиатрия . 63 (8): 844–54. дои : 10.1001/archpsyc.63.8.844 . ПМЦ 2634866 . ПМИД 16894060 .
- ^ Камия А., Тан П.Л., Кубо К., Энгельхард С., Исидзука К., Кубо А., Цукита С., Пулвер А.Е., Накаджима К., Каселла Н.Г., Кацанис Н., Сава А. (сентябрь 2008 г.). «PCM1 рекрутируется в центросому в результате совместного действия DISC1 и BBS4 и является кандидатом на психиатрическое заболевание» . Арх. Общая психиатрия . 65 (9): 996–1006. дои : 10.1001/archpsyc.65.9.996 . ПМЦ 2727928 . ПМИД 18762586 .
- ^ Ли, Кью; Хансен Д; Киллилеа А; Джоши ХК; Палаццо РЕ; Бальчон Р. (февраль 2001 г.). «Кендрин/перицентрин-B, центросомный белок, гомологичный перицентрину, который образует комплекс с PCM-1». Дж. Клеточная наука . 114 (Часть 4): 797–809. дои : 10.1242/jcs.114.4.797 . ISSN 0021-9533 . ПМИД 11171385 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Толленэр МАКС; Мейланд Н; Беккер-Йенсен С (2014). «Центриолярные сателлиты: ключевые медиаторы функций центросом» . Клетка. Мол. Наука о жизни . 72 (1): 11–23. дои : 10.1007/s00018-014-1711-3 . ПМЦ 11114028 . ПМИД 25173771 . S2CID 2243856 .
- Охата Х., Фудзивара Ю., Кояма К., Накамура Ю. (1995). «Картирование гена перицентриолярного материала 1 аутоантигена человека (PCM1) с хромосомой 8p21.3-p22». Геномика . 24 (2): 404–6. дои : 10.1006/geno.1994.1640 . ПМИД 7698772 .
- Бальчон Р., Бао Л., Циммер В.Е. (1994). «PCM-1, центросомный аутоантиген массой 228 кДа с отчетливым распределением клеточного цикла» . Дж. Клеточная Биол . 124 (5): 783–93. дои : 10.1083/jcb.124.5.783 . ПМК 2119948 . ПМИД 8120099 .
- Энгелендер С., Шарп А.Х., Коломер В. и др. (1998). «Связанный с хантингтином белок 1 (HAP1) взаимодействует с p150Glued-субъединицей динактина» . Хм. Мол. Жене . 6 (13): 2205–12. дои : 10.1093/hmg/6.13.2205 . ПМИД 9361024 .
- Диас Нето Э., Корреа Р.Г., Верёвски-Алмейда С. и др. (2000). «Секвенирование транскриптома человека с помощью меток последовательности, экспрессируемых ORF» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (7): 3491–6. Бибкод : 2000PNAS...97.3491D . дои : 10.1073/pnas.97.7.3491 . ПМК 16267 . ПМИД 10737800 .
- Корви Р., Бергер Н., Бальчон Р., Ромео Г. (2000). «RET/PCM-1: новый слитый ген при папиллярной карциноме щитовидной железы» . Онкоген . 19 (37): 4236–42. дои : 10.1038/sj.onc.1203772 . ПМИД 10980597 .
- Ли Кью, Хансен Д., Киллилеа А. и др. (2001). «Кендрин/перицентрин-B, центросомный белок, гомологичный перицентрину, который образует комплекс с PCM-1». Дж. Клеточная наука . 114 (Часть 4): 797–809. дои : 10.1242/jcs.114.4.797 . ПМИД 11171385 .
- Кумар С., Коннор Дж.Р., Доддс Р.А. и др. (2001). «Идентификация и первоначальная характеристика 5000 экспрессируемых секвенированных меток (EST), каждая из библиотек кДНК нормального хряща взрослого человека и хряща, страдающего остеоартритом» . Остеоартр. Картиль . 9 (7): 641–53. дои : 10.1053/joca.2001.0421 . ПМИД 11597177 .
- Даммерманн А, Мердес А (2002). «Сборка центросомальных белков и организация микротрубочек зависит от PCM-1» . Дж. Клеточная Биол . 159 (2): 255–66. дои : 10.1083/jcb.200204023 . ПМК 2173044 . ПМИД 12403812 .
- Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
- Ансли С.Дж., Бадано Дж.Л., Блак О.Э. и др. (2003). «Дисфункция базального отдела тела является вероятной причиной плейотропного синдрома Барде-Бидля». Природа . 425 (6958): 628–33. Бибкод : 2003Natur.425..628A . дои : 10.1038/nature02030 . ПМИД 14520415 . S2CID 4310157 .
- Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
- Ким Дж.К., Бадано Дж.Л., Сиболд С. и др. (2004). «Белок Барде-Бидля BBS4 направляет груз в перицентриолярную область и необходим для закрепления микротрубочек и развития клеточного цикла» . Нат. Жене . 36 (5): 462–70. дои : 10.1038/ng1352 . ПМИД 15107855 .
- Брилл Л.М., Саломон А.Р., Фикарро С.Б. и др. (2004). «Надежное фосфопротеомное профилирование сайтов фосфорилирования тирозина из Т-клеток человека с использованием аффинной хроматографии с иммобилизованными металлами и тандемной масс-спектрометрии». Анальный. Хим . 76 (10): 2763–72. дои : 10.1021/ac035352d . ПМИД 15144186 .
- Армс Дж.Э., Хаммет Ф., де Сильва М. и др. (2004). «Гены-кандидаты-супрессоры опухолей на плече хромосомы 8p при раке молочной железы с ранним началом и высокой степенью злокачественности» . Онкоген . 23 (33): 5697–702. дои : 10.1038/sj.onc.1207740 . PMID 15184884 .
- Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .
- Баллиф Б.А., Виллен Дж., Босолей С.А. и др. (2005). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши» . Мол. Клетка. Протеомика . 3 (11): 1093–101. дои : 10.1074/mcp.M400085-MCP200 . ПМИД 15345747 .
- Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
- Хамес Р.С., Крукс Р.Э., Страатман К.Р. и др. (2005). «Динамическое привлечение киназы Nek2 в центросому включает микротрубочки, PCM-1 и локализованную протеасомную деградацию» . Мол. Биол. Клетка . 16 (4): 1711–24. doi : 10.1091/mbc.E04-08-0688 . ПМЦ 1073654 . ПМИД 15659651 .
- Рейтер А., Уолц С., Уотмор А. и др. (2005). «t(8;9)(p22;p24) представляет собой рецидивирующую аномалию при хроническом и остром лейкозе, которая объединяет PCM1 с JAK2» . Рак Рез . 65 (7): 2662–7. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-04-4263 . ПМИД 15805263 .
- Мурати А., Гелси-Бойер В., Аделаида Дж. и др. (2005). «Слияние PCM1-JAK2 при миелопролиферативных заболеваниях и остром эритроидном лейкозе с транслокацией t (8;9)» . Лейкемия . 19 (9): 1692–6. дои : 10.1038/sj.leu.2403879 . ПМИД 16034466 .