CDK5RAP2

CDK5RAP2
Идентификаторы
Псевдонимы	CDK5RAP2 , C48, Cep215, MCPH3, белок 2, связанный с регуляторной субъединицей CDK5
Внешние идентификаторы	Опустить : 608201 ; МГИ : 2384875 ; Гомологен : 49533 ; Генные карты : CDK5RAP2 ; OMA : CDK5RAP2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 9 (human)
End	120,580,170 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	70,328,680 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	sural nerve; ; ventricular zone; ; right coronary artery; ; ganglionic eminence; ; muscle of thigh; ; gastrocnemius muscle; ; tendon of biceps brachii; ; minor salivary glands; ; ascending aorta; ; epithelium of colon;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; seminiferous tubule; ; spermatid; ; vestibular membrane of cochlear duct; ; genital tubercle; ; zygote; ; spermatocyte; ; ventricular zone; ; secondary oocyte; ; vestibular sensory epithelium;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	microtubule binding; tubulin binding; protein binding; protein kinase binding; calmodulin binding; gamma-tubulin binding;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; mitotic spindle pole; centrosome; Golgi apparatus; spindle pole; pericentriolar material; microtubule organizing center; microtubule plus-end; cell junction; perinuclear region of cytoplasm; cytoskeleton; microtubule; extracellular exosome;
Biological process	regulation of neuron differentiation; negative regulation of centriole replication; neurogenesis; negative regulation of neuron differentiation; chromosome segregation; positive regulation of transcription, DNA-templated; brain development; G2/M transition of mitotic cell cycle; microtubule bundle formation; regulation of spindle checkpoint; establishment of mitotic spindle orientation; centriole replication; microtubule organizing center organization; microtubule cytoskeleton organization; ciliary basal body-plasma membrane docking; centrosome cycle; regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle; positive regulation of microtubule polymerization; regulation of mitotic cell cycle spindle assembly checkpoint;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	55755
	214444
	ENSG00000136861
	ENSMUSG00000039298
	Q96SN8
	P68254 ; Q8K389
	НМ_001011649 ; НМ_001272039 ; НМ_018249
	НМ_145990 ; НМ_001313762
	НП_001011649 ; НП_001258968 ; НП_060719
	НП_035869 ; НП_001300691 ; НП_666102
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 2, связанный с регуляторной субъединицей CDK5, представляет собой белок , который у человека кодируется CDK5RAP2 геном . Он играет необходимую роль в формировании и стабильности микротрубочек из центросомы. ^{[ 5 ]} Было обнаружено, что это связано с изменением размера человеческого мозга у мужчин. ^{[ 6 ]} Для этого гена существует множество вариантов транскриптов, но полноразмерная природа только двух определена. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

CDK5RAP2 гомологичен белку дрозофилы . центросомину (cnn) ^{[ 9 ]} и паралогичен миомегалину . , который у млекопитающих содержит домен Олдувай , домен, участвующий в эволюции размера человеческого мозга ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}

Функция

CDK5RAP2 необходим для правильного формирования , закрепления и ориентации микротрубочек из центросомы . Он связывается с γ-тубулина кольцевым комплексом (γTuRC), и это необходимо для прикрепления γTuRC к центросоме. ^{[ 5 ]} CDK5RAP2 также связывается с p25, формой CDK5R1 , которая служит активирующей субъединицей CDK5 , которая участвует в регуляции дифференцировки нейронов . CDK5RAP2, следовательно, играет роль в дифференцировке нейронов. ^{[ 8 ]} CDK5RAP2 также необходим в качестве каркасного белка в центросом короне Dictyostelium . ^{[ 12 ]}

Клиническое значение

Изменение размера человеческого мозга

Исследование МРТ продемонстрировало связь между распространенными у человека вариациями гена CDK5RAP2 и структурой мозга. Более конкретно, были обнаружены ассоциации между несколькими однонуклеотидными полиморфизмами (SNP) и коры площадью поверхности головного мозга и общим объемом мозга. Эти ассоциации были обнаружены исключительно у мужчин, и все SNP были расположены либо в последних 7 интронах , либо ниже гена. Функциональное значение этих локусов пока не известно. Однако, учитывая их расположение близко к регуляторным элементам , вполне возможно, что они участвуют в регуляции генов , что позволяет предположить, что общие различия в структуре мозга могут быть связаны с различиями в регуляции генов, а не со структурой белков, что согласуется с данными о других сложных чертах человека. . ^{[ 6 ]} является паралогом миомегалина CDK5RAP2 , который у млекопитающих содержит домен Olduvai , домен со специфичными для человека дупликациями, которые участвуют в эволюции размера человеческого мозга. ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}

Аутосомно-рецессивная первичная микроцефалия

Мутации CDK5RAP2 вызывают аутосомно-рецессивную первичную микроцефалию 3 типа. ^{[ 13 ]}^{[ 5 ]}

Взаимодействия

Было показано, что CDK5RAP2 взаимодействует с CDK5R1. ^{[ 14 ]} и перицентрин (PCTN). ^{[ 8 ]}

История

Ген был открыт в 2000 году. ^{[ 15 ]} и впервые был охарактеризован в 2007 году. ^{[ 5 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000136861 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039298 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Фонг К.В., Чой Ю.К., Раттнер Дж.Б., Ци Р.З. (январь 2008 г.). «CDK5RAP2 представляет собой перицентриолярный белок, который участвует в центросомальном прикреплении комплекса гамма-тубулинового кольца» . Молекулярная биология клетки . 19 (1): 115–25. doi : 10.1091/mbc.E07-04-0371 . ПМК 2174194 . ПМИД 17959831 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Римоль Л.М., Агарц И., Джурович С., Браун А.А., Родди Дж.К., Келер А.К. и др. (январь 2010 г.). «Полозависимая ассоциация распространенных вариантов генов микроцефалии со структурой мозга» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (1): 384–8. Бибкод : 2010PNAS..107..384R . дои : 10.1073/pnas.0908454107 . ПМК 2806758 . ПМИД 20080800 .
^ Чинг Ю.П., Ци Цзы, Ван Дж.Х. (январь 2000 г.). «Клонирование трех новых нейрональных белков, связывающих активатор Cdk5». Джин . 242 (1–2): 285–94. дои : 10.1016/S0378-1119(99)00499-0 . ПМИД 10721722 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с «Ген Энтрез: CDK5RAP2, белок 2, связанный с регуляторной субъединицей CDK5» .
^ Барр А.Р., Килмартин Дж.В., Гергели Ф. (апрель 2010 г.). «CDK5RAP2 функционирует в центросоме, обеспечивая прикрепление полюса веретена и реакцию на повреждение ДНК» . Журнал клеточной биологии . 189 (1): 23–39. дои : 10.1083/jcb.200912163 . ПМЦ 2854379 . ПМИД 20368616 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Дюма Л., Ким Ю.Х., Каримпур-Фард А., Кокс М., Хопкинс Дж., Поллак Дж.Р., Сикела Дж.М. (сентябрь 2007 г.). «Изменение числа копий гена, охватывающее 60 миллионов лет эволюции человека и приматов» . Геномные исследования . 17 (9): 1266–77. дои : 10.1101/гр.6557307 . ПМЦ 1950895 . ПМИД 17666543 .
^ Перейти обратно: ^а ^б О'Бленесс М.С., Диккенс К.М., Дюма Л.Дж., Керер-Савацки Х., Вайкофф Г.Дж., Сикела Дж.М. (сентябрь 2012 г.). «Эволюционная история и организация генома белковых доменов DUF1220» . Г3 . 2 (9): 977–86. дои : 10.1534/g3.112.003061 . ПМЦ 3429928 . ПМИД 22973535 .
^ Питцен В., Аскарзада С., Греф Р., Мейер И. (апрель 2018 г.). «CDK5RAP2 является важным каркасным белком короны центросомы диктиостелия» . Клетки . 7 (4): 32. doi : 10.3390/cells7040032 . ПМЦ 5946109 . ПМИД 29690637 .
^ «Запись OMIM - # 604804 - МИКРОЦЕФАЛИЯ 3, ПЕРВИЧНАЯ, АУТОСОМНО-РЕЦЕССИВНАЯ; MCPH3» . www.omim.org . Проверено 6 января 2020 г.
^ Ван X, Чинг Ю.П., Лам WH, Ци Z, Чжан М., Ван Дж. Х. (октябрь 2000 г.). «Идентификация общей области ассоциации белков в нейрональном активаторе Cdk5» . Журнал биологической химии . 275 (41): 31763–9. дои : 10.1074/jbc.M004358200 . ПМИД 10915792 .
^ Чинг Ю.П., Ци Цзы, Ван Дж.Х. (январь 2000 г.). «Клонирование трех новых нейрональных белков, связывающих активатор Cdk5». Джин . 242 (1–2): 285–94. дои : 10.1016/S0378-1119(99)00499-0 . ПМИД 10721722 .

Дальнейшее чтение

Мойнихан Л., Джексон А.П., Робертс Э., Карбани Дж., Льюис И., Корри П. и др. (февраль 2000 г.). «Третий новый локус первичной аутосомно-рецессивной микроцефалии картируется на хромосоме 9q34» . Американский журнал генетики человека . 66 (2): 724–7. дои : 10.1086/302777 . ПМЦ 1288125 . ПМИД 10677332 .
Ван X, Чинг Ю.П., Лам WH, Ци Z, Чжан М., Ван Дж. Х. (октябрь 2000 г.). «Идентификация общей области ассоциации белков в нейрональном активаторе Cdk5» . Журнал биологической химии . 275 (41): 31763–9. дои : 10.1074/jbc.M004358200 . ПМИД 10915792 .
Нагасе Т., Кикуно Р., Накаяма М., Хиросава М., Охара О. (август 2000 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XVIII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют крупные белки in vitro» . Исследование ДНК . 7 (4): 273–81. дои : 10.1093/dnares/7.4.271 . ПМИД 10997877 .
Чинг Ю.П., Панг А.С., Лам В.Х., Ци Р.З., Ван Дж.Х. (май 2002 г.). «Идентификация нейронального активатора Cdk5-связывающего белка как ингибитора Cdk5» . Журнал биологической химии . 277 (18): 15237–40. дои : 10.1074/jbc.C200032200 . ПМИД 11882646 .
Накаяма М., Кикуно Р., Охара О (ноябрь 2002 г.). «Белко-белковые взаимодействия между крупными белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК» . Геномные исследования . 12 (11): 1773–84. дои : 10.1101/гр.406902 . ПМК 187542 . ПМИД 12421765 .
Андерсен Дж.С., Уилкинсон С.Дж., Мэр Т., Мортенсен П., Нигг Э.А., Манн М. (декабрь 2003 г.). «Протеомная характеристика центросомы человека путем корреляционного профилирования белков». Природа . 426 (6966): 570–4. Бибкод : 2003Natur.426..570A . дои : 10.1038/nature02166 . ПМИД 14654843 . S2CID 4427303 .
Бонд Дж., Робертс Э., Спрингелл К., Лизаррага С.Б., Лизаррага С., Скотт С. и др. (апрель 2005 г.). «Центросомный механизм, включающий CDK5RAP2 и CENPJ, контролирует размер мозга». Природная генетика . 37 (4): 353–5. дои : 10.1038/ng1539 . ПМИД 15793586 . S2CID 1763877 .
Ноусиайнен М., Силье Х.Х., Зауэр Г., Нигг Э.А., Кернер Р. (апрель 2006 г.). «Фосфопротеомный анализ митотического веретена человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (14): 5391–6. Бибкод : 2006PNAS..103.5391N . дои : 10.1073/pnas.0507066103 . ПМК 1459365 . ПМИД 16565220 .
Эванс П.Д., Валлендер Э.Дж., Лан Б.Т. (июнь 2006 г.). «Молекулярная эволюция генов-регуляторов размера мозга CDK5RAP2 и CENPJ». Джин . 375 : 75–9. дои : 10.1016/j.gene.2006.02.019 . ПМИД 16631324 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф., Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .

Внешние ссылки

человека Расположение генома CDK5RAP2 и CDK5RAP2 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000136861 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039298 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[Fong_2008-5] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Фонг К.В., Чой Ю.К., Раттнер Дж.Б., Ци Р.З. (январь 2008 г.). «CDK5RAP2 представляет собой перицентриолярный белок, который участвует в центросомальном прикреплении комплекса гамма-тубулинового кольца» . Молекулярная биология клетки . 19 (1): 115–25. doi : 10.1091/mbc.E07-04-0371 . ПМК 2174194 . ПМИД 17959831 .

[pmid20080800-6] Перейти обратно: ^а ^б Римоль Л.М., Агарц И., Джурович С., Браун А.А., Родди Дж.К., Келер А.К. и др. (январь 2010 г.). «Полозависимая ассоциация распространенных вариантов генов микроцефалии со структурой мозга» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (1): 384–8. Бибкод : 2010PNAS..107..384R . дои : 10.1073/pnas.0908454107 . ПМК 2806758 . ПМИД 20080800 .

[pmid10721722-7] Чинг Ю.П., Ци Цзы, Ван Дж.Х. (январь 2000 г.). «Клонирование трех новых нейрональных белков, связывающих активатор Cdk5». Джин . 242 (1–2): 285–94. дои : 10.1016/S0378-1119(99)00499-0 . ПМИД 10721722 .

[entrez-8] Перейти обратно: ^а ^б ^с «Ген Энтрез: CDK5RAP2, белок 2, связанный с регуляторной субъединицей CDK5» .

[9] Барр А.Р., Килмартин Дж.В., Гергели Ф. (апрель 2010 г.). «CDK5RAP2 функционирует в центросоме, обеспечивая прикрепление полюса веретена и реакцию на повреждение ДНК» . Журнал клеточной биологии . 189 (1): 23–39. дои : 10.1083/jcb.200912163 . ПМЦ 2854379 . ПМИД 20368616 .

[pmid17666543-10] Перейти обратно: ^а ^б Дюма Л., Ким Ю.Х., Каримпур-Фард А., Кокс М., Хопкинс Дж., Поллак Дж.Р., Сикела Дж.М. (сентябрь 2007 г.). «Изменение числа копий гена, охватывающее 60 миллионов лет эволюции человека и приматов» . Геномные исследования . 17 (9): 1266–77. дои : 10.1101/гр.6557307 . ПМЦ 1950895 . ПМИД 17666543 .

[O'Bleness_20122-11] Перейти обратно: ^а ^б О'Бленесс М.С., Диккенс К.М., Дюма Л.Дж., Керер-Савацки Х., Вайкофф Г.Дж., Сикела Дж.М. (сентябрь 2012 г.). «Эволюционная история и организация генома белковых доменов DUF1220» . Г3 . 2 (9): 977–86. дои : 10.1534/g3.112.003061 . ПМЦ 3429928 . ПМИД 22973535 .

[pmid29690637-12] Питцен В., Аскарзада С., Греф Р., Мейер И. (апрель 2018 г.). «CDK5RAP2 является важным каркасным белком короны центросомы диктиостелия» . Клетки . 7 (4): 32. doi : 10.3390/cells7040032 . ПМЦ 5946109 . ПМИД 29690637 .

[13] «Запись OMIM - # 604804 - МИКРОЦЕФАЛИЯ 3, ПЕРВИЧНАЯ, АУТОСОМНО-РЕЦЕССИВНАЯ; MCPH3» . www.omim.org . Проверено 6 января 2020 г.

[pmid10915792-14] Ван X, Чинг Ю.П., Лам WH, Ци Z, Чжан М., Ван Дж. Х. (октябрь 2000 г.). «Идентификация общей области ассоциации белков в нейрональном активаторе Cdk5» . Журнал биологической химии . 275 (41): 31763–9. дои : 10.1074/jbc.M004358200 . ПМИД 10915792 .

[15] Чинг Ю.П., Ци Цзы, Ван Дж.Х. (январь 2000 г.). «Клонирование трех новых нейрональных белков, связывающих активатор Cdk5». Джин . 242 (1–2): 285–94. дои : 10.1016/S0378-1119(99)00499-0 . ПМИД 10721722 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]