Ксантиндегидрогеназа

XDH
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB показывать Список идентификационных кодов PDB 2CKJ, 2E1Q
Идентификаторы
Псевдонимы	XDH , XO, XOR, ксантиндегидрогеназа, XAN1
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 607633 ; МГИ : 98973 ; Гомологен : 324 ; Генные карты : XDH ; OMA : XDH — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 2 (human) Band 2p23.1 Start 31,334,321 bp End 31,414,742 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 17 (mouse) Band 17 E2|17 45.25 cM Start 74,190,890 bp End 74,257,191 bp
показывать экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in jejunal mucosa mucosa of ileum palpebral conjunctiva mucosa of colon mucosa of sigmoid colon duodenum liver right lobe of liver nasal epithelium tail of epididymis Top expressed in granulocyte duodenum stroma of bone marrow jejunum decidua ankle joint white adipose tissue gastrula esophagus left lobe of liver More reference expression data BioGPS More reference expression data
показывать Генная онтология Molecular function iron ion binding protein homodimerization activity xanthine oxidase activity flavin adenine dinucleotide binding oxidoreductase activity, acting on CH-OH group of donors iron-sulfur cluster binding metal ion binding catalytic activity molybdopterin cofactor binding electron transfer activity xanthine dehydrogenase activity oxidoreductase activity 2 iron, 2 sulfur cluster binding oxidoreductase activity, acting on the aldehyde or oxo group of donors FAD binding Cellular component cytoplasm cytosol peroxisome sarcoplasmic reticulum extracellular region extracellular space Biological process positive regulation of p38MAPK cascade negative regulation of protein phosphorylation negative regulation of protein kinase B signaling purine nucleotide catabolic process negative regulation of endothelial cell differentiation negative regulation of gene expression negative regulation of endothelial cell proliferation positive regulation of reactive oxygen species metabolic process negative regulation of vasculogenesis negative regulation of vascular endothelial growth factor signaling pathway lactation regulation of epithelial cell differentiation xanthine catabolic process activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process electron transport chain Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи Разновидность Человек Мышь Входить 7498 22436 Вместе ENSG00000158125 ENSMUSG00000024066 ЮниПрот P47989 Q00519 RefSeq (мРНК) НМ_000379 НМ_011723 RefSeq (белок) НП_000370 НП_035853 Местоположение (UCSC) Чр 2: 31,33 – 31,41 Мб Чр 17: 74,19 – 74,26 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

ксантиндегидрогеназа
Босс Телец
Идентификаторы
Номер ЕС.	1.17.1.4
Номер CAS.	9054-84-6
Базы данных
ИнтЭнк	вид IntEnz
БРЕНДА	БРЕНДА запись
Экспаси	Просмотр NiceZyme
КЕГГ	КЕГГ запись
МетаЦик	метаболический путь
ПРЯМОЙ	профиль
PDB Структуры	RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтология	АмиГО / QuickGO
показывать Поиск PMC articles PubMed articles NCBI proteins

Ксантиндегидрогеназа , также известная как XDH , представляет собой белок , который у человека кодируется XDH геном .

Функция

Ксантиндегидрогеназа относится к группе молибденсодержащих участвующих гидроксилаз, в окислительном метаболизме пуринов . Фермент представляет собой гомодимер. Ксантиндегидрогеназа может быть преобразована в ксантиноксидазу путем обратимого сульфгидрильного окисления или необратимой протеолитической модификации.

Ксантиндегидрогеназа катализирует следующую химическую реакцию :

ксантин + НАД ⁺ + Н ₂ О $\rightleftharpoons$ ураты + НАДН + Н ⁺

Тремя субстратами этого фермента являются ксантин и НАД. ⁺ и H ₂ O , тогда как тремя его продуктами являются ураты , НАДН и H ⁺ .

Этот фермент участвует в пуриновом обмене .

Номенклатура

Этот фермент принадлежит к семейству оксидоредуктаз , а точнее тех, которые действуют на группы CH или CH ₂ с НАД. ⁺ или НАДФ ⁺ как акцептор. Систематическое название этого класса ферментов — ксантин:НАД. ⁺ оксидоредуктаза . Другие широко используемые имена включают НАД. ⁺ -ксантиндегидрогеназа , ксантин-НАД ⁺ оксидоредуктаза , ксантин/НАД ⁺ оксидоредуктаза и ксантиноксидоредуктаза .

Клиническое значение

Дефекты ксантиндегидрогеназы вызывают ксантинурию , могут способствовать синдрому респираторного стресса у взрослых и могут потенцировать инфекцию гриппа через механизм, зависящий от метаболитов кислорода. Было показано, что пациенты с опухолями аденокарциномы легких , которые имеют высокий уровень экспрессии гена XDH, имеют более низкую выживаемость. Пристрастие к белку XDH использовалось для воздействия на опухоли и клеточные линии НМРЛ точными онкологическими методами.

См. также

• Альдегидоксидаза и ксантиндегидрогеназа, молоточковый домен a/b
• БОТИНКИ
• Ксантиноксидаза

Дальнейшее чтение

• Баттелли М.Г., Лоренцони Э. (октябрь 1982 г.). «Очистка и свойства новой глутатион-зависимой тиол:дисульфидоксидоредуктазы из печени крыс» . Биохимический журнал . 207 (1): 133–8. дои : 10.1042/bj2070133 . ПМЦ   1153833 . ПМИД   6960894 .
• Корте ЭД, Стирп Ф (февраль 1972 г.). «Регуляция ксантиноксидазы печени крыс. Участие тиоловых групп в преобразовании активности фермента из дегидрогеназы (тип D) в оксидазу (тип О) и очистке фермента» . Биохимический журнал . 126 (3): 739–45. дои : 10.1042/bj1260739 . ПМЦ   1178433 . ПМИД   4342395 .
• Парзен С.Д., Фокс А.С. (декабрь 1964 г.). «Очистка ксантиндегидрогеназы Drosophila melanogaster». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) — Специализированный отдел по энзимологическим вопросам . 92 (3): 465–71. дои : 10.1016/0926-6569(64)90006-9 . PMID   14264879 .
• Раджагопалан К.В., Хэндлер П. (сентябрь 1967 г.). «Очистка и свойства ксантиндегидрогеназы куриной печени» . Журнал биологической химии . 242 (18): 4097–107. дои : 10.1016/S0021-9258(18)95784-4 . ПМИД   4294045 .
• Смит С.Т., Раджагопалан К.В., Хэндлер П. (сентябрь 1967 г.). «Очистка и свойства ксантиндегидроганазы Micrococcus Lactilyticus» . Журнал биологической химии . 242 (18): 4108–17. дои : 10.1016/S0021-9258(18)95785-6 . ПМИД   6061702 .
• Паршат К., Канн С., Хюттерманн Дж., Каппль Р., Фетцнер С. (январь 2001 г.). «Ксантиндегидрогеназа из Pseudomonas putida 86: специфичность, окислительно-восстановительный потенциал ее окислительно-восстановительных центров и первая характеристика ЭПР». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Структура белка и молекулярная энзимология . 1544 (1–2): 151–65. дои : 10.1016/S0167-4838(00)00214-4 . ПМИД   11341925 .
• Ичида К., Амайя Ю., Нода К., Миношима С., Хосоя Т., Сакаи О., Симидзу Н., Нишино Т. (ноябрь 1993 г.). «Клонирование кДНК, кодирующей ксантиндегидрогеназу (оксидазу) человека: структурный анализ белка и хромосомное расположение гена». Джин . 133 (2): 279–84. дои : 10.1016/0378-1119(93)90652-J . ПМИД   8224915 .
• Энрот С., Эгер Б.Т., Окамото К., Нишино Т., Нишино Т., Пай Э.Ф. (сентябрь 2000 г.). «Кристаллические структуры ксантиндегидрогеназы и ксантиноксидазы коровьего молока: структурный механизм преобразования» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (20): 10723–8. Бибкод : 2000PNAS...9710723E . дои : 10.1073/pnas.97.20.10723 . ПМК   27090 . ПМИД   11005854 .
• Трульо Дж.Дж., Тайс К., Леймкюлер С., Раппа Р., Раджагопалан К.В., Кискер С. (январь 2002 г.). «Кристаллические структуры активной и аллоксантин-ингибированной форм ксантиндегидрогеназы Rhodobacter capsulatus» . Структура . 10 (1): 115–25. дои : 10.1016/S0969-2126(01)00697-9 . ПМИД   11796116 .
• Хилле Р. (ноябрь 1996 г.). «Моноядерные молибденовые ферменты». Химические обзоры . 96 (7): 2757–2816. дои : 10.1021/cr950061t . ПМИД   11848841 .
• Менешян А., Балкли ГБ (июль 2002 г.). «Физиология эндотелиальной ксантиноксидазы: от катаболизма уратов до реперфузионного повреждения и передачи воспалительного сигнала». Микроциркуляция . 9 (3): 161–75. дои : 10.1038/sj.mn.7800136 . ПМИД   12080414 . S2CID   40739497 .
• Сюй П., Хюкстедт Т.П., Харрисон Р., Хойдал Дж.Р. (октябрь 1995 г.). «Молекулярное клонирование, тканевая экспрессия ксантиндегидрогеназы человека» . Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 215 (1): 429. doi : 10.1006/bbrc.1995.2482 . ПМИД   7575623 .
• Сюй П., Чжу XL, Хюкстедт Т.П., Бротман А.Р., Хойдал-младший (сентябрь 1994 г.). «Присвоение гена ксантиндегидрогеназы человека хромосоме 2p22». Геномика . 23 (1): 289–91. дои : 10.1006/geno.1994.1498 . ПМИД   7829092 .
• Миношима С., Ван Й., Ичида К., Нишино Т., Симидзу Н. (1994). «Картирование гена ксантиндегидрогеназы (оксидазы) человека (XDH) с полосой p23 хромосомы 2». Цитогенетика и клеточная генетика . 68 (1–2): 52–3. дои : 10.1159/000133887 . ПМИД   7956358 .
• Ритконен Э.М., Халила Р., Лаан М., Саксела М., Каллиониеми О.П., Палотие А., Райвио КО (1994). «Человеческий ген ксантиндегидрогеназы (XDH) локализован на участке хромосомы 2q22». Цитогенетика и клеточная генетика . 68 (1–2): 61–3. дои : 10.1159/000133890 . ПМИД   7956361 .
• Сюй П., Хюкстедт Т.П., Харрисон Р., Хойдал Дж.Р. (март 1994 г.). «Молекулярное клонирование, тканевая экспрессия ксантиндегидрогеназы человека». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 199 (2): 998–1004. дои : 10.1006/bbrc.1994.1328 . ПМИД   8135849 .
• Ичида К., Амайя Ю., Нода К., Миношима С., Хосоя Т., Сакаи О., Симидзу Н., Нишино Т. (ноябрь 1993 г.). «Клонирование кДНК, кодирующей ксантиндегидрогеназу (оксидазу) человека: структурный анализ белка и хромосомное расположение гена». Джин . 133 (2): 279–84. дои : 10.1016/0378-1119(93)90652-J . ПМИД   8224915 .
• Сато А., Сасаго С., Такахаши С., Като Н. (сентябрь 1993 г.). «Регуляция ксантиндегидрогеназы в печени крыс в ответ на пролифераторы пероксисом». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 195 (2): 751–7. дои : 10.1006/bbrc.1993.2109 . ПМИД   8373410 .
• Сюй П., Хюкстедт Т.П., Хойдал-младший (июнь 1996 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика гена ксантиндегидрогеназы человека (XDH)». Геномика . 34 (2): 173–80. дои : 10.1006/geno.1996.0262 . ПМИД   8661045 .
• Саксела М., Райвио КО (апрель 1996 г.). «Клонирование и экспрессия in vitro ксантиндегидрогеназы/оксидазы человека» . Биохимический журнал . 315 (Часть 1): 235–9. дои : 10.1042/bj3150235 . ПМЦ   1217176 . ПМИД   8670112 .
• Многие А, Вестерхаузен-Ларсон А, Канбур-Шакир А, Робертс Дж. М. (1996). «Ксантиноксидаза/дегидрогеназа присутствует в плаценте человека». Плацента . 17 (5–6): 361–5. дои : 10.1016/S0143-4004(96)90061-2 . ПМИД   8829220 .
• Хеллстен Ю, Франдсен У, Ортенблад Н, Сьёдин Б, Рихтер Э.А. (январь 1997 г.). «Ксантиноксидаза в скелетных мышцах человека после эксцентрических упражнений: роль в воспалении» . Журнал физиологии . 498 (Часть 1): 239–48. doi : 10.1113/jphysicalol.1997.sp021855 . ПМЦ   1159248 . ПМИД   9023782 .
• Ичида К., Амайя Ю., Каматани Н., Нишино Т., Хосоя Т., Сакаи О. (май 1997 г.). «Идентификация двух мутаций в гене ксантиндегидрогеназы человека, ответственного за классическую ксантинурию I типа» . Журнал клинических исследований . 99 (10): 2391–7. дои : 10.1172/JCI119421 . ПМК   508078 . ПМИД   9153281 .
• Рукетт М., Стивенс С., Блейк Д.Р., Харрисон Р., Виш Дж., Уиш В.Д. (август 1997 г.). «Выражение активности ксантиноксидазы в эндотелиальных клетках человека в зависимости от плотности клеток». Труды Биохимического общества . 25 (3): 532С. дои : 10.1042/bst025532s . ПМИД   9388748 .
• Неваз М.А., Адиб Н.Н. (март 1998 г.). «Обнаружение ксантиноксидазы в плазме человека». Медицинский журнал Малайзии . 53 (1): 70–5. ПМИД   10968141 .
• Мартелин Э., Палвимо Дж. Дж., Лапатто Р., Райвио КО (сентябрь 2000 г.). «Ядерный фактор Y активирует промотор гена ксантиноксидоредуктазы человека». Письма ФЭБС . 480 (2–3): 84–8. дои : 10.1016/S0014-5793(00)01909-8 . ПМИД   11034305 . S2CID   34293318 .
• Стиборова М., Фрей Э., Сопко Б., Висслер М., Шмайзер Х.Х. (апрель 2002 г.). «Канцерогенные аристолохиевые кислоты при активации ДТ-диафоразой образуют аддукты, обнаруженные в ДНК больных нефропатией китайских трав» . Канцерогенез . 23 (4): 617–25. дои : 10.1093/carcin/23.4.617 . ПМИД   11960915 .
• Фредерикс В.М., Врилинг-Синделарова Х (2002). «Ультраструктурная локализация активности ксантиноксидоредуктазы в изолированных клетках печени крыс». Акта гистохимика . 104 (1): 29–37. дои : 10.1078/0065-1281-00629 . ПМИД   11993848 .
• Чейкова Ю., Ардан Т., Филипец М., Мидельфарт А. (2003). «Ксантиноксидоредуктаза и ксантиноксидаза в роговице человека». Гистология и гистопатология . 17 (3): 755–60. дои : 10.14670/HH-17.755 . ПМИД   12168784 .

Внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P47989 (ксантиндегидрогеназа/оксидаза) в PDBe-KB .