ТРМ1

ТРМ1
Идентификаторы
Псевдонимы	TPM1 , C15orf13, CMD1Y, CMH3, HTM-альфа, LVNC9, TMSA, HEL-S-265, тропомиозин 1 (альфа), тропомиозин 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 191010 ; МГИ : 98809 ; Гомологен : 121635 ; GeneCards : TPM1 ; ОМА : TPM1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 15 (human)
End	63,071,915 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 9 (mouse)
End	66,956,688 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	myocardium of left ventricle; ; right ventricle; ; atrium; ; right auricle; ; seminal vesicula; ; apex of heart; ; cardiac muscle tissue of right atrium; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis; ; saphenous vein; ; muscle layer of sigmoid colon;
	Top expressed in
	ankle; ; aortic valve; ; medial head of gastrocnemius muscle; ; tail of embryo; ; ascending aorta; ; masseter muscle; ; muscle of thigh; ; triceps brachii muscle; ; temporal muscle; ; sternocleidomastoid muscle;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	cytoskeletal protein binding; structural constituent of cytoskeleton; protein binding; actin binding; structural constituent of muscle; identical protein binding; protein homodimerization activity; protein heterodimerization activity; actin filament binding;
Cellular component	cytoplasm; muscle thin filament tropomyosin; sarcomere; stress fiber; ruffle membrane; bleb; cytoskeleton; cytosol; actin filament; actin cytoskeleton; myofibril; filamentous actin;
Biological process	regulation of muscle contraction; muscle contraction; regulation of heart contraction; positive regulation of ATP-dependent activity; negative regulation of vascular associated smooth muscle cell migration; negative regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation; ruffle organization; wound healing; cellular response to reactive oxygen species; negative regulation of cell migration; cytoskeleton organization; regulation of cell shape; muscle filament sliding; sarcomere organization; positive regulation of stress fiber assembly; positive regulation of cell adhesion; actin filament organization; in utero embryonic development; positive regulation of heart rate by epinephrine; ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis; cardiac muscle contraction;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	7168
	22003
	ENSG00000140416
	ENSMUSG00000032366
	P09493
	P58771
showНМ_000366 ; НМ_001018004 ; НМ_001018005 ; НМ_001018006 ; НМ_001018007 ;
	NM_001018008; NM_001018020; NM_001301244; NM_001301289; NM_001330344; NM_001330346; NM_001330351; NM_001365776; NM_001365777; NM_001365778; NM_001365779; NM_001365780; NM_001365781; NM_001365782
showНМ_001164248 ; НМ_001164249 ; НМ_001164250 ; НМ_001164251 ; НМ_001164252 ;
	NM_001164253; NM_001164254; NM_001164255; NM_001164256; NM_024427
showНП_000357 ; НП_001018004 ; НП_001018005 ; НП_001018006 ; НП_001018007 ;
	NP_001018008; NP_001018020; NP_001288173; NP_001288218; NP_001317273; NP_001317275; NP_001317280; NP_001352705; NP_001352706; NP_001352707; NP_001352708; NP_001352709; NP_001352710; NP_001352711; NP_001018006.1
showНП_001157720 ; НП_001157721 ; НП_001157722 ; НП_001157723 ; НП_001157724 ;
	NP_001157725; NP_001157726; NP_001157727; NP_001157728; NP_077745
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Цепь тропомиозина альфа-1 представляет собой белок , который у человека кодируется TPM1 геном . ^[5] Этот ген является членом семейства тропомиозинов (Tm) высококонсервативных, широко распространенных актин-связывающих белков, участвующих в сократительной системе поперечно-полосатых и гладких мышц, а также в цитоскелете немышечных клеток.

Структура

Tm представляет собой белок массой 32,7 кДа, состоящий из 284 аминокислот. ^[6] Tm представляет собой гибкий белковый гомодимер или гетеродимер, состоящий из двух альфа-спиральных цепей, которые принимают конформацию изогнутой спиральной спирали, чтобы обернуться вокруг семи молекул актина в функциональной единице мышцы. ^[7] Он полимеризуется вплотную вдоль двух канавок актиновых нитей и обеспечивает стабильность нитей. Поперечно-полосатые мышцы человека экспрессируют белок из генов TPM1 (α-Tm), TPM2 (β-Tm) и TPM3 (γ-Tm), причем α-Tm является преобладающей изоформой в поперечнополосатых мышцах. В сердечной мышце человека соотношение α-Tm и β-Tm составляет примерно 5:1. ^[8]

Функция

Tm функционирует совместно с тропониновым комплексом, регулируя кальций-зависимое взаимодействие актина и миозина во время мышечного сокращения. Молекулы ТМ расположены «голова к хвосту» вдоль тонких актиновых нитей и являются ключевым компонентом совместной активации мышц. Модель трех штатов была предложена МакКиллопом и Гивзом. ^[9] который описывает положение Tm во время сердечного цикла. Состояние блокировки (B) возникает в диастолу, когда внутриклеточный кальций низкий и Tm блокирует сайт связывания миозина на актине. Закрытое состояние (C) — это когда Tm расположен на внутренней бороздке актина ; в этом состоянии миозин находится в «взведенном» положении, когда головки слабо связаны и не создают силы. Состояние связывания миозина (M) – это когда Tm далее вытесняется из актина с помощью миозиновых поперечных мостиков, которые прочно связаны и активно генерируют силу. Помимо актина, Тм связывает тропонин Т (ТнТ). TnT привязывает область перекрытия «голова-хвост» последующих молекул Tm к актину .

Клиническое значение

Мутации в TPM1 были связаны с гипертрофической кардиомиопатией (ГКМП), дилатационной кардиомиопатией и некомпактной кардиомиопатией левого желудочка (LVNC). Мутации HCM имеют тенденцию группироваться вокруг N-концевой области и первичной актин-связывающей области, известной как период 5. ^[10]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000140416 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032366 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Могенсен Дж., Крузе Т.А., Борглум А.Д. (июнь 1999 г.). «Уточненная локализация гена альфа-тропомиозина человека (TPM1) путем генетического картирования». Цитогенетический клеточный генетик . 84 (1–2): 35–6. дои : 10.1159/000015207 . ПМИД 10343096 . S2CID 84901339 .
^ «Информация о белках» . Архивировано из оригинала 24 сентября 2015 года . Проверено 25 мая 2023 г. {{cite web}}: CS1 maint: неподходящий URL ( ссылка )
^ Браун, Дж. Х.; Ким, К.Х.; Джун, Г; Гринфилд, Нью-Джерси; Домингес, Р; Фолькманн, Н; Хичкок-Дегрегори, SE; Коэн, К. (2001). «Расшифровка конструкции молекулы тропомиозина» . Труды Национальной академии наук . 98 (15): 8496–501. Бибкод : 2001PNAS...98.8496B . дои : 10.1073/pnas.131219198 . ПМК 37464 . ПМИД 11438684 .
^ Инь, З; Рен, Дж; Го, В. (2015). «Переходы изоформ саркомерного белка в сердечной мышце: путь к сердечной недостаточности» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярные основы болезней . 1852 (1): 47–52. дои : 10.1016/j.bbadis.2014.11.003 . ПМК 4268308 . ПМИД 25446994 .
^ Маккиллоп, DF; Дживс, Массачусетс (1993). «Регуляция взаимодействия между актином и субфрагментом 1 миозина: доказательства трех состояний тонкой нити» . Биофизический журнал . 65 (2): 693–701. Бибкод : 1993BpJ....65..693M . дои : 10.1016/S0006-3495(93)81110-X . ПМЦ 1225772 . ПМИД 8218897 .
^ Тардифф, Дж.К. (2011). «Мутации тонких нитей: разработка интегративного подхода к сложному расстройству» . Исследование кровообращения . 108 (6): 765–82. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.110.224170 . ПМК 3075069 . ПМИД 21415410 .

Дальнейшее чтение

Лис-Миллер Дж. П., Хелфман Д. М. (1992). «Молекулярная основа разнообразия изоформ тропомиозина». Биоэссе . 13 (9): 429–37. дои : 10.1002/bies.950130902 . ПМИД 1796905 . S2CID 7958541 .
Балвей Л., Фишман М.Ю. (1995). «[Анализ разнообразия изоформ тропомиозина]». CR Séances Soc. Биол. Фил . 188 (5–6): 527–40. ПМИД 7780795 .
Ганнинг П., Вайнбергер Р., Джеффри П. (1997). «Изоформы актина и тропомиозина в морфогенезе». Анат. Эмбриол . 195 (4): 311–5. дои : 10.1007/s004290050050 . ПМИД 9108196 . S2CID 9692297 .
Перри С.В. (2002). «Тропомиозин позвоночных: распространение, свойства и функции». Дж. Мышцы Res. Клетка. Мотиль . 22 (1): 5–49. дои : 10.1023/A:1010303732441 . ПМИД 11563548 . S2CID 12346005 .
Перри С.В. (2004). «Какова роль тропомиозина в регуляции мышечного сокращения?». Дж. Мышцы Res. Клетка. Мотиль . 24 (8): 593–6. дои : 10.1023/B:JURE.0000009811.95652.68 . ПМИД 14870975 . S2CID 32621707 .
Яаскеляйнен П., Миеттинен Р., Кярккяйнен П. и др. (2004). «Генетика гипертрофической кардиомиопатии в восточной Финляндии: несколько мутаций-основателей с доброкачественными или промежуточными фенотипами» . Энн. Мед . 36 (1): 23–32. дои : 10.1080/07853890310017161 . ПМИД 15000344 . S2CID 29985750 .
Мак А., Смилли Л.Б., Барань М. (1978). «Специфическое фосфорилирование серина-283 альфа-тропомиозина из скелетных и сердечных мышц лягушки, кролика» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 75 (8): 3588–92. Бибкод : 1978PNAS...75.3588M . дои : 10.1073/pnas.75.8.3588 . ПМК 392830 . ПМИД 278975 .
Хенер Б., Шуман Р.Л., Трауб П. (1992). «Деградация белков цитоскелета протеазой вируса иммунодефицита человека типа 1». Клеточная Биол. Межд. Представитель . 16 (7): 603–12. дои : 10.1016/S0309-1651(06)80002-0 . ПМИД 1516138 .
Шеврей П.М., Натанс Д. (1992). «Клонирование белкового взаимодействия в дрожжах: идентификация белков млекопитающих, которые реагируют с лейциновой застежкой Джуна» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 89 (13): 5789–93. Бибкод : 1992PNAS...89.5789C . дои : 10.1073/pnas.89.13.5789 . ПМК 402103 . ПМИД 1631061 .
Шуман Р.Л., Кессельмиер С., Мотес Е. и др. (1991). «Невирусные клеточные субстраты для протеазы вируса иммунодефицита человека типа 1» . ФЭБС Летт . 278 (2): 199–203. дои : 10.1016/0014-5793(91)80116-К . ПМИД 1991513 .
Чо Ю.Дж., Лю Дж., Хичкок-ДеГрегори С.Е. (1990). «Аминоконец мышечного тропомиозина является основным фактором, определяющим функцию» . Ж. Биол. Хим . 265 (1): 538–45. дои : 10.1016/S0021-9258(19)40264-0 . ПМИД 2136742 .
Колоте С., Видада Дж.С., Ферраз С. и др. (1988). «Эволюция функциональных доменов тропомиозина: дифференциальный сплайсинг и геномные ограничения». Дж. Мол. Эвол . 27 (3): 228–35. Бибкод : 1988JMolE..27..228C . дои : 10.1007/BF02100079 . ПМИД 3138425 . S2CID 24795087 .
Лин К.С., Ливитт Дж. (1988). «Клонирование и характеристика кДНК, кодирующей чувствительную к трансформации изоформу 3 тропомиозина из онкогенных фибробластов человека» . Мол. Клетка. Биол . 8 (1): 160–8. дои : 10.1128/mcb.8.1.160 . ПМК 363096 . ПМИД 3336357 .
Маклеод А.Р., Гудинг С. (1988). «Ген hTM альфа человека: экспрессия в мышечной и немышечной ткани» . Мол. Клетка. Биол . 8 (1): 433–40. дои : 10.1128/mcb.8.1.433 . ПМЦ 363144 . ПМИД 3336363 .
Мише С.М., Манджула Б.Н., Фишетти В.А. (1987). «Связь стрептококкового белка М с тропомиозином человека и кролика: полная аминокислотная последовательность сердечного альфа-тропомиозина человека, высококонсервативного сократительного белка». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 142 (3): 813–8. дои : 10.1016/0006-291X(87)91486-0 . ПМИД 3548719 .
Хили Д.Х., Голосинска К., Смилли Л.Б. (1987). «Влияние фрагментов тропонина Т Т1 и Т2 на связывание неполимеризующегося тропомиозина с F-актином в присутствии и отсутствии тропонина I и тропонина С». Ж. Биол. Хим . 262 (21): 9971–8. дои : 10.1016/S0021-9258(18)61061-0 . ПМИД 3611073 .
Браун Х.Р., Шачат Ф.Х. (1985). «Ренатурация тропомиозина скелетных мышц: значение для сборки in vivo» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 82 (8): 2359–63. Бибкод : 1985PNAS...82.2359B . дои : 10.1073/pnas.82.8.2359 . ПМЦ 397557 . ПМИД 3857586 .
Танокура М, Оцуки I (1984). «Взаимодействие между химотриптическим субфрагментами тропонина Т, тропомиозином, тропонином I и тропонином С». Дж. Биохим . 95 (5): 1417–21. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a134749 . ПМИД 6746613 .
Перлстоун-младший, Смилли Л.Б. (1983). «Влияние тропонина-I плюс-C на связывание тропонина-Т и его фрагментов с альфа-тропомиозином. Чувствительность к Ca2+ и кооперативность» . Ж. Биол. Хим . 258 (4): 2534–42. дои : 10.1016/S0021-9258(18)32959-4 . ПМИД 6822572 .

Внешние ссылки

Масс-спектрометрическая характеристика человеческого TPM1 в COPaKB ^[1]
Запись GeneReviews/NIH/NCBI/UW об обзоре семейной гипертрофической кардиомиопатии
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P09493 (цепь тропомиозина альфа-1) в PDBe-KB .

^ Зонг, Северная Каролина; Ли, Х; Ли, Х; Лам, член парламента; Хименес, RC; Ким, CS; Дэн, Н; Ким, АК; Чой, Дж. Х.; Селайя, я; Лием, Д; Мейер, Д; Одеберг, Дж; Фанг, С; Лу, HJ; Сюй, Т; Вайс, Дж; Дуань, Х; Улен, М; Йейтс-младший, 3-й; Апвейлер, Р.; Ге, Дж; Хермякоб, Х; Пинг, П. (2013). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний» . Исследование кровообращения . 113 (9): 1043–53. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . ПМК 4076475 . ПМИД 23965338 . {{cite journal}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000140416 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032366 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10343096-5] Могенсен Дж., Крузе Т.А., Борглум А.Д. (июнь 1999 г.). «Уточненная локализация гена альфа-тропомиозина человека (TPM1) путем генетического картирования». Цитогенетический клеточный генетик . 84 (1–2): 35–6. дои : 10.1159/000015207 . ПМИД 10343096 . S2CID 84901339 .

[6] «Информация о белках» . Архивировано из оригинала 24 сентября 2015 года . Проверено 25 мая 2023 г. {{cite web}}: CS1 maint: неподходящий URL ( ссылка )

[7] Браун, Дж. Х.; Ким, К.Х.; Джун, Г; Гринфилд, Нью-Джерси; Домингес, Р; Фолькманн, Н; Хичкок-Дегрегори, SE; Коэн, К. (2001). «Расшифровка конструкции молекулы тропомиозина» . Труды Национальной академии наук . 98 (15): 8496–501. Бибкод : 2001PNAS...98.8496B . дои : 10.1073/pnas.131219198 . ПМК 37464 . ПМИД 11438684 .

[8] Инь, З; Рен, Дж; Го, В. (2015). «Переходы изоформ саркомерного белка в сердечной мышце: путь к сердечной недостаточности» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярные основы болезней . 1852 (1): 47–52. дои : 10.1016/j.bbadis.2014.11.003 . ПМК 4268308 . ПМИД 25446994 .

[9] Маккиллоп, DF; Дживс, Массачусетс (1993). «Регуляция взаимодействия между актином и субфрагментом 1 миозина: доказательства трех состояний тонкой нити» . Биофизический журнал . 65 (2): 693–701. Бибкод : 1993BpJ....65..693M . дои : 10.1016/S0006-3495(93)81110-X . ПМЦ 1225772 . ПМИД 8218897 .

[10] Тардифф, Дж.К. (2011). «Мутации тонких нитей: разработка интегративного подхода к сложному расстройству» . Исследование кровообращения . 108 (6): 765–82. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.110.224170 . ПМК 3075069 . ПМИД 21415410 .

[11] Зонг, Северная Каролина; Ли, Х; Ли, Х; Лам, член парламента; Хименес, RC; Ким, CS; Дэн, Н; Ким, АК; Чой, Дж. Х.; Селайя, я; Лием, Д; Мейер, Д; Одеберг, Дж; Фанг, С; Лу, HJ; Сюй, Т; Вайс, Дж; Дуань, Х; Улен, М; Йейтс-младший, 3-й; Апвейлер, Р.; Ге, Дж; Хермякоб, Х; Пинг, П. (2013). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний» . Исследование кровообращения . 113 (9): 1043–53. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . ПМК 4076475 . ПМИД 23965338 . {{cite journal}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[1]