СПТБН4

СПТБН4
Идентификаторы
Псевдонимы	SPTBN4 , QV, SPNB4, SPTBN3, спектрин бета, неэритроцитарный 4, CMND, NEDHND
Внешние идентификаторы	Опустить : 606214 ; МГИ : 1890574 ; Гомологен : 11879 ; GeneCards : SPTBN4 ; ОМА : SPTBN4 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	40,576,464 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	27,147,111 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right hemisphere of cerebellum; ; right frontal lobe; ; Brodmann area 9; ; anterior cingulate cortex; ; prefrontal cortex; ; nucleus accumbens; ; caudate nucleus; ; putamen; ; amygdala; ; pituitary gland;
	Top expressed in
	superior frontal gyrus; ; primary visual cortex; ; cerebellar cortex; ; nucleus of stria terminalis; ; central gray substance of midbrain; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; subiculum; ; piriform cortex; ; nucleus accumbens; ; cerebellar vermis;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	phosphatase binding; spectrin binding; structural constituent of cytoskeleton; protein binding; ankyrin binding; actin binding; phospholipid binding;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; PML body; spectrin; membrane; cell body fiber; nuclear matrix; adherens junction; plasma membrane; node of Ranvier; axon; neuronal cell body; cell cortex; axon hillock; axon initial segment; paranode region of axon; extracellular exosome; cytoskeleton; intercalated disc;
Biological process	clustering of voltage-gated sodium channels; axonogenesis; regulation of sodium ion transport; transmission of nerve impulse; hearing; negative regulation of heart rate; MAPK cascade; axon guidance; endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport; reproductive process; adult behavior; cardiac conduction; regulation of peptidyl-serine phosphorylation; actin filament capping; positive regulation of multicellular organism growth; fertilization; central nervous system projection neuron axonogenesis; vesicle-mediated transport; adult walking behavior; protein localization to plasma membrane; regulation of molecular function; cytoskeleton organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	57731
	80297
	ENSG00000160460
	ENSMUSG00000011751
	Q9H254
	н/д
	НМ_020971 ; НМ_025213
	НМ_001199234 ; НМ_001199235 ; НМ_001199236 ; НМ_032610
	НП_066022 ; НП_079489
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Спектрин, бета, неэритроцитарный 4 , также известный как SPTBN4 , представляет собой белок , который у человека кодируется SPTBN4 геном . ^[5]^[6]

Спектрин представляет собой сшивающий актин и молекулярный каркасный белок, который связывает клеточную мембрану с актиновым цитоскелетом и участвует в определении формы клетки, расположении трансмембранных белков и организации органелл . Он состоит из двух антипараллельных димеров альфа- и бета-субъединиц. Этот ген является одним из членов семейства генов бета-спектрина. Кодируемый белок локализуется в ядерном матриксе , ядерных тельцах ПМЛ и цитоплазматических везикулах . Очень похожий ген у мышей необходим для локализации специфических мембранных белков в поляризованных областях нейронов. Для этого гена обнаружено множество вариантов транскрипта, кодирующих разные изоформы. ^[5]

Взаимодействия

Было показано, что SPTBN4 взаимодействует с PTPRN. ^[6] и ДИСК1 . ^[7]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000160460 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000011751 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: спектрин SPTBN4, бета, неэритроцитарный 4» .
^ Jump up to: ^а ^б Бергс С., Аггуджаро Д., Дирккс Р., Максимова Е., Стабах П., Хермель Дж.М., Чжан Дж.П., Филбрик В., Слепнев В., Орт Т., Солимена М. (ноябрь 2000 г.). «бетаIV-спектрин, новый спектрин, локализованный в начальных сегментах аксонов и узлах Ранвье в центральной и периферической нервной системе» . Дж. Клеточная Биол . 151 (5): 985–1002. дои : 10.1083/jcb.151.5.985 . ПМЦ 2174349 . ПМИД 11086001 .
^ Моррис Дж. А., Кандпал Г., Ма Л., Остин С. П. (июль 2003 г.). «DISC1 (Disrupted-In-Schizophrenia 1) представляет собой ассоциированный с центросомой белок, который взаимодействует с MAP1A, MIPT3, ATF4/5 и NUDEL: регуляция и потеря взаимодействия с мутацией» . Хм. Мол. Жене . 12 (13): 1591–608. дои : 10.1093/hmg/ddg162 . ПМИД 12812986 .

Дальнейшее чтение

Нагасе Т., Кикуно Р., Накаяма М., Хиросава М., Охара О. (2001). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XVIII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . ДНК Рез . 7 (4): 273–81. дои : 10.1093/dnares/7.4.271 . ПМИД 10997877 .
Бергс С., Аггуджаро Д., Дирккс Р., Максимова Е., Стабах П., Хермель Дж.М., Чжан Дж.П., Филбрик В., Слепнев В., Орт Т., Солимена М. (2001). «бетаIV-спектрин, новый спектрин, локализованный в начальных сегментах аксонов и узлах Ранвье в центральной и периферической нервной системе» . Дж. Клеточная Биол . 151 (5): 985–1002. дои : 10.1083/jcb.151.5.985 . ПМЦ 2174349 . ПМИД 11086001 .
Це В.Т., Тан Дж., Джин О, Корсгрен С., Джон К.М., Кунг А.Л., Гвинн Б., Питерс Л.Л., Люкс С.Э. (2001). «Новый спектрин, бета IV, имеет основную укороченную изоформу, которая связана с ядерными тельцами белка промиелоцитарного лейкоза и ядерным матриксом» . Ж. Биол. Хим . 276 (26): 23974–85. дои : 10.1074/jbc.M009307200 . ПМИД 11294830 .
Комада М., Сориано П. (2002). «[Бета]IV-спектрин регулирует кластеризацию натриевых каналов через анкирин-G в начальных сегментах аксонов и узлах Ранвье» . Дж. Клеточная Биол . 156 (2): 337–48. дои : 10.1083/jcb.200110003 . ПМК 2199236 . ПМИД 11807096 .
Шуман Р.Л., Хартиг Р., Хаусс К., Трауб П. (2003). «Организация бляшек фокальной адгезии нарушается под действием протеазы ВИЧ-1». Клеточная Биол. Межд . 26 (6): 529–39. дои : 10.1006/cbir.2002.0895 . ПМИД 12119179 . S2CID 39778155 .
Накаяма М., Кикуно Р., Охара О (2003). «Белко-белковые взаимодействия между крупными белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК» . Геном Рез . 12 (11): 1773–84. дои : 10.1101/гр.406902 . ПМК 187542 . ПМИД 12421765 .
Озеки Ю, Томода Т, Клайдерляйн Дж, Камия А, Борд Л, Фуджи К, Окава М, Ямада Н, Хаттен М.Э., Снайдер Ш., Росс К.А., Сава А (2003). «Нарушение в шизофрении-1 (DISC-1): усечение мутанта предотвращает связывание с NudE-подобным (NUDEL) и подавляет рост нейритов» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (1): 289–94. Бибкод : 2003PNAS..100..289O . дои : 10.1073/pnas.0136913100 . ПМК 140954 . ПМИД 12506198 .
Моррис Дж. А., Кандпал Г., Ма Л., Остин С. П. (2004). «DISC1 (Disrupted-In-Schizophrenia 1) представляет собой ассоциированный с центросомой белок, который взаимодействует с MAP1A, MIPT3, ATF4/5 и NUDEL: регуляция и потеря взаимодействия с мутацией» . Хм. Мол. Жене . 12 (13): 1591–608. дои : 10.1093/hmg/ddg162 . ПМИД 12812986 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф., Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 19 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000160460 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000011751 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: спектрин SPTBN4, бета, неэритроцитарный 4» .

[pmid11086001-6] Jump up to: ^а ^б Бергс С., Аггуджаро Д., Дирккс Р., Максимова Е., Стабах П., Хермель Дж.М., Чжан Дж.П., Филбрик В., Слепнев В., Орт Т., Солимена М. (ноябрь 2000 г.). «бетаIV-спектрин, новый спектрин, локализованный в начальных сегментах аксонов и узлах Ранвье в центральной и периферической нервной системе» . Дж. Клеточная Биол . 151 (5): 985–1002. дои : 10.1083/jcb.151.5.985 . ПМЦ 2174349 . ПМИД 11086001 .

[pmid12812986-7] Моррис Дж. А., Кандпал Г., Ма Л., Остин С. П. (июль 2003 г.). «DISC1 (Disrupted-In-Schizophrenia 1) представляет собой ассоциированный с центросомой белок, который взаимодействует с MAP1A, MIPT3, ATF4/5 и NUDEL: регуляция и потеря взаимодействия с мутацией» . Хм. Мол. Жене . 12 (13): 1591–608. дои : 10.1093/hmg/ddg162 . ПМИД 12812986 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]