ТРИОБП

ТРИОБП
Идентификаторы
Псевдонимы	TRIOBP , DFNB28, TAP68, TARA, dJ37E16.4, HRIHFB2122, TRIO и F-актин-связывающий белок
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 609761 ; МГИ : 1349410 ; Гомологен : 5104 ; GeneCards : ТРИОБП ; ОМА : ТРИОБП - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 22 (human)
End	37,776,556 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 15 (mouse)
End	78,890,069 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	lower lobe of lung; ; apex of heart; ; right ventricle; ; stromal cell of endometrium; ; tail of epididymis; ; tendon of biceps brachii; ; left uterine tube; ; ectocervix; ; canal of the cervix; ; right coronary artery;
	Top expressed in
	zygote; ; granulocyte; ; genital tubercle; ; tail of embryo; ; tibiofemoral joint; ; secondary oocyte; ; triceps brachii muscle; ; external carotid artery; ; lip; ; ventricular zone;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	actin filament binding; actin binding; ubiquitin protein ligase binding; myosin II binding;
Cellular component	focal adhesion; microtubule organizing center; nucleus; cytoskeleton; midbody; actin cytoskeleton; cytoplasm;
Biological process	barbed-end actin filament capping; regulation of actin cytoskeleton organization; cell cycle; cell division; positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading; actin modification; hearing; auditory receptor cell stereocilium organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	11078
	110253
	ENSG00000100106
	ENSMUSG00000033088
	Q9H2D6
	Q99KW3
	НМ_138632 ; НМ_001039141 ; НМ_007032
	НМ_001024716 ; НМ_001039155 ; НМ_001039156 ; НМ_138579
	НП_001034230 ; НП_008963 ; НП_619538
	НП_001019887 ; НП_001034244 ; НП_001034245 ; НП_613045
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

TRIO и F-актин-связывающий белок — это белок , который у человека кодируется TRIOBP геном . ^[5]^[6]^[7]^[8]

Этот ген кодирует белок, который взаимодействует с Trio, который участвует в развитии нервной ткани и в контроле актинового цитоскелета организации , подвижности и роста клеток . Этот триосвязывающий белок также связывается с F-актином и стабилизирует структуры F-актина. Домены, содержащиеся в этом кодируемом белке, представляют собой N-концевой гомологичный домен плекстрина и С-концевую спирально-спиральную область. Мутации в этом гене связаны с формой аутосомно-рецессивной несиндромальной глухоты . альтернативного сплайсинга Для этого гена было обнаружено множество вариантов транскриптов , которые кодируют разные изоформы , хотя некоторые транскрипты могут подвергаться нонсенс-опосредованному распаду (NMD). ^[8]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000100106 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033088 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Зайпель К., О'Брайен С.П., Яннотти Э., Медли К.Г., Стреули М. (январь 2001 г.). «Тара, новый белок, связывающий F-актин, связывается с фактором обмена триогуаниновых нуклеотидов и регулирует организацию цитоскелета актина». J Cell Sci . 114 (Часть 2): 389–99. дои : 10.1242/jcs.114.2.389 . ПМИД 11148140 .
^ Риазуддин С., Хан С.Н., Ахмед З.М., Гош М., Осторожно К., Назли С., Кабра М., Зафар А.У., Чен К., Наз С., Антонеллис А., Паван У.Дж., Грин Э.Д., Уилкокс Э.Р., Фридман П.Л., Морелл Р.Дж., Риазуддин С. , Фридман Т.Б. (декабрь 2005 г.). «Мутации в TRIOBP, который кодирует предполагаемый белок, организующий цитоскелет, связаны с несиндромальной рецессивной глухотой» . Ам Джей Хум Жене . 78 (1): 137–43. дои : 10.1086/499164 . ПМК 1380211 . ПМИД 16385457 .
^ Шахин Х., Уолш Т., Собе Т., Абу Саед Дж., Абу Райан А., Линч Э.Д., Ли М.К., Авраам К.Б., Кинг М.К., Канаан М. (декабрь 2005 г.). «Мутации в новой изоформе TRIOBP, которая кодирует белок, связывающий нитевидный актин, ответственны за рецессивную несиндромальную потерю слуха DFNB28» . Ам Джей Хум Жене . 78 (1): 144–52. дои : 10.1086/499495 . ПМК 1380212 . ПМИД 16385458 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: TRIOBP TRIO и белок, связывающий F-актин» .

Дальнейшее чтение

Накадзима Д., Оказаки Н., Ямакава Х. и др. (2003). «Создание готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное курирование 330 клонов кДНК KIAA» . ДНК Рез . 9 (3): 99–106. дои : 10.1093/dnares/9.3.99 . ПМИД 12168954 .
Майер Б.Дж., Рен Р., Кларк К.Л., Балтимор Д. (1993). «Предполагаемый модульный домен присутствует в различных сигнальных белках». Клетка . 73 (4): 629–30. дои : 10.1016/0092-8674(93)90244-К . ПМИД 8500161 . S2CID 44282241 .
Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геном Рез . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД 8889548 .
Уэки Н., Ода Т., Кондо М. и др. (1999). «Система отбора генов, кодирующих ядерно-направленные белки». Нат. Биотехнология . 16 (13): 1338–42. дои : 10.1038/4315 . ПМИД 9853615 . S2CID 20001769 .
Данэм И., Симидзу Н., Роу Б.А. и др. (1999). «Последовательность ДНК 22 хромосомы человека» . Природа . 402 (6761): 489–95. Бибкод : 1999Natur.402..489D . дои : 10.1038/990031 . ПМИД 10591208 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геном Рез . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Хиросава М., Нагасе Т., Мурахаши Ю. и др. (2001). «Идентификация новых транскрибируемых последовательностей на хромосоме 22 человека путем картирования экспрессируемых последовательностей» . ДНК Рез . 8 (1): 1–9. дои : 10.1093/dnares/8.1.1 . ПМИД 11258795 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Виман С., Арлт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геном Рез . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК 528930 . ПМИД 15489336 .
Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (Проблема с базой данных): D415–8. дои : 10.1093/nar/gkj139 . ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 .
Ли X, Лан Дж, Чжу Ю и др. (2007). «Экспрессия, очистка и характеристика Тары, нового белка, связывающего фактор 1 теломерных повторов (TRF1)». Экспр. белка Пуриф . 55 (1): 84–92. дои : 10.1016/j.pep.2007.05.004 . ПМИД 17629495 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 22 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000100106 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033088 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11148140-5] Зайпель К., О'Брайен С.П., Яннотти Э., Медли К.Г., Стреули М. (январь 2001 г.). «Тара, новый белок, связывающий F-актин, связывается с фактором обмена триогуаниновых нуклеотидов и регулирует организацию цитоскелета актина». J Cell Sci . 114 (Часть 2): 389–99. дои : 10.1242/jcs.114.2.389 . ПМИД 11148140 .

[pmid16385457-6] Риазуддин С., Хан С.Н., Ахмед З.М., Гош М., Осторожно К., Назли С., Кабра М., Зафар А.У., Чен К., Наз С., Антонеллис А., Паван У.Дж., Грин Э.Д., Уилкокс Э.Р., Фридман П.Л., Морелл Р.Дж., Риазуддин С. , Фридман Т.Б. (декабрь 2005 г.). «Мутации в TRIOBP, который кодирует предполагаемый белок, организующий цитоскелет, связаны с несиндромальной рецессивной глухотой» . Ам Джей Хум Жене . 78 (1): 137–43. дои : 10.1086/499164 . ПМК 1380211 . ПМИД 16385457 .

[pmid16385458-7] Шахин Х., Уолш Т., Собе Т., Абу Саед Дж., Абу Райан А., Линч Э.Д., Ли М.К., Авраам К.Б., Кинг М.К., Канаан М. (декабрь 2005 г.). «Мутации в новой изоформе TRIOBP, которая кодирует белок, связывающий нитевидный актин, ответственны за рецессивную несиндромальную потерю слуха DFNB28» . Ам Джей Хум Жене . 78 (1): 144–52. дои : 10.1086/499495 . ПМК 1380212 . ПМИД 16385458 .

[entrez-8] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: TRIOBP TRIO и белок, связывающий F-актин» .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]