Кератин 19

КРТ19
Идентификаторы
Псевдонимы	KRT19 , CK19, K19, K1CS, кератин 19
Внешние идентификаторы	Опустить : 148020 ; МГИ : 96693 ; Гомологен : 1713 ; Генные карты : KRT19 ; ОМА : KRT19 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 17 (human)
End	41,528,308 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	100,039,491 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	palpebral conjunctiva; ; mucosa of transverse colon; ; nasal epithelium; ; mucosa of sigmoid colon; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; amniotic fluid; ; epithelium of nasopharynx; ; epithelium of bronchus; ; gallbladder; ; bronchial epithelial cell;
	Top expressed in
	epithelium of stomach; ; crypt of lieberkuhn of small intestine; ; mucous cell of stomach; ; transitional epithelium of urinary bladder; ; pyloric antrum; ; left colon; ; duodenum; ; conjunctival fornix; ; ileum; ; lactiferous gland;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein-containing complex binding; structural constituent of muscle; structural constituent of cytoskeleton; protein binding; structural molecule activity;
Cellular component	terminal web; plasma membrane; sarcolemma; costamere; dystrophin-associated glycoprotein complex; Z discdkac; extracellular exosome; intermediate filament; cell periphery; cytosol; apicolateral plasma membrane;
Biological process	Notch signaling pathway; viral process; sarcomere organization; cell differentiation involved in embryonic placenta development; response to estrogen; keratinization; cornification;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	3880
	16669
	ENSG00000171345
	ENSMUSG00000020911
	P08727
	P19001
	НМ_002276
	НМ_008471 ; НМ_001313963
	НП_002267
	НП_001300892 ; НП_032497
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Кератин, цитоскелет I типа 19 ( Кератин-19) ), также известный как цитокератин-19 ( CK-19 40 кДа ), представляет собой белок массой , который у человека кодируется KRT19 геном . ^[5]^[6] Кератин-19 — это кератин I типа .

Функция

Кератин-19 является членом семейства кератинов . Кератины представляют собой белки промежуточных нитей, ответственные за структурную целостность эпителиальных клеток, и подразделяются на цитокератины и кератины волос .

Кератин-19 — это кератин I типа . Цитокератины I типа состоят из кислых белков, которые расположены парами гетеротипических кератиновых цепей. В отличие от родственных ему членов семейства, этот наименьший известный кислый цитокератин не связан с основным цитокератином в эпителиальных клетках . Он особенно обнаружен в эмбриональной перидерме , временном поверхностном слое, который окутывает развивающийся эпидермис . Цитокератины типа I группируются в области хромосомы 17 (q12-q21). ^[6]

Использовать в качестве биомаркера

KRT19 также известен как Cyfra 21-1. ^[7]
Благодаря своей высокой чувствительности KRT19 является наиболее используемым маркером для RT-PCR -опосредованного обнаружения опухолевых клеток, диссеминированных в лимфатических узлах , периферической крови и костном мозге больных раком молочной железы . Было показано, что в зависимости от анализов KRT19 является как специфическим, так и неспецифическим маркером. Ложноположительные результаты в таких исследованиях KRT19 RT-PCR включают: незаконную транскрипцию (экспрессия небольших количеств мРНК KRT19 тканями, в которых она не играет реальной физиологической роли), гематологические нарушения (индукция KRT19 в клетках периферической крови цитокинами и факторами роста , которые циркулируют в крови). при более высоких концентрациях при воспалительных состояниях и нейтропении) выявлено наличие псевдогенов (два псевдогена KRT19, KRT19a и KRT19b, которые имеют значительную гомологию последовательностей с мРНК KRT19. Впоследствии попытки обнаружить экспрессию аутентичного KRT19 могут привести к обнаружение одного или обоих этих псевдогенов), контаминация пробы (внесение контаминирующих эпителиальных клеток во время отбора проб периферической крови для последующего анализа RT-PCR). ^[8] Более того, Ck-19 широко применяется в качестве послеоперационного диагностического маркера папиллярного рака щитовидной железы. ^[9]

Кератин-19 часто используется вместе с кератином 8 и кератином 18 для дифференциации клеток эпителиального происхождения от гемопоэтических клеток в тестах, которые подсчитывают циркулирующие опухолевые клетки в крови. ^[10]

Взаимодействия

Было показано, что кератин-19 взаимодействует с пинином . ^[11]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000171345 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020911 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Швейцер Дж., Боуден П.Е., Куломб П.А., Лангбейн Л., Лейн Э.Б., Магин Т.М., Малтаис Л., Омари М.Б., Парри Д.А., Роджерс М.А., Райт М.В. (июль 2006 г.). «Новая консенсусная номенклатура кератинов млекопитающих» . Журнал клеточной биологии . 174 (2): 169–74. дои : 10.1083/jcb.200603161 . ПМК 2064177 . ПМИД 16831889 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: KRT19 кератин 19» .
^ Наката Б., Такашима Т., Огава Ю., Исикава Т., Хиракава К. (2004). «Сыворотка CYFRA 21-1 (фрагменты цитокератина-19) является полезным онкомаркером для выявления рецидива заболевания и оценки эффективности лечения рака молочной железы» . Бр Джей Рак . 91 (5): 873–8. дои : 10.1038/sj.bjc.6602074 . ПМК 2409884 . ПМИД 15280913 .
^ Лакруа М. (декабрь 2006 г.). «Значение, обнаружение и маркеры диссеминированных клеток рака молочной железы» (PDF) . Эндокринный рак . 13 (4): 1033–67. дои : 10.1677/ERC-06-0001 . ПМИД 17158753 . S2CID 10708900 .
^ Динец А., Пернемальм М., Челлин Х., Святоха В., Софиадис А., Юлин К.С., Зедениус Дж., Ларссон С., Лехтиё Дж., Хёог А. (май 2015 г.). «Дифференциальные профили экспрессии белка в кистозной жидкости папиллярной карциномы щитовидной железы и доброкачественных поражений щитовидной железы» . ПЛОС ОДИН . 10 (5): e0126472. Бибкод : 2015PLoSO..1026472D . дои : 10.1371/journal.pone.0126472 . ПМЦ 4433121 . ПМИД 25978681 .
^ Аллард У.Дж., Матера Дж., Миллер М.К., Реполлет М., Коннелли М.К., Рао С., Тиббе А.Г., Ур Дж.В., Терстаппен Л.В. (октябрь 2004 г.). «Опухолевые клетки циркулируют в периферической крови всех основных карцином, но не у здоровых людей или пациентов с доброкачественными заболеваниями» (PDF) . Клинические исследования рака . 10 (20): 6897–904. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-04-0378 . ПМИД 15501967 .
^ Ши Дж., Сугру С.П. (май 2000 г.). «Рассечение белковой связи между кератинами и пинином, белком с двойным расположением в комплексе десмосома-промежуточные филаменты и в ядре» . Журнал биологической химии . 275 (20): 14910–5. дои : 10.1074/jbc.275.20.14910 . ПМИД 10809736 .

Дальнейшее чтение

Оцука Ю, Итикава Ю, Кунисаки С, Мацуда Г, Акияма Х, Номура М, Того С, Хаяшизаки Ю, Симада Х (2007). «Корреляция чистоты путем микродиссекции с экспрессией генов в ткани рака желудка». Скандинавский журнал клинических и лабораторных исследований . 67 (4): 367–79. дои : 10.1080/00365510601046334 . ПМИД 17558891 . S2CID 36635804 .
Расмуссен Х.Х., Ван Дамм Дж., Пуйпе М., Гессер Б., Селис Дж.Э., Вандекеркхове Дж. (декабрь 1992 г.). «Микропоследовательности 145 белков, записанные в базе данных двумерных гелевых белков нормальных эпидермальных кератиноцитов человека». Электрофорез . 13 (12): 960–9. дои : 10.1002/elps.11501301199 . ПМИД 1286667 . S2CID 41855774 .
Бадер Б.Л., Магин Т.М., Хацфельд М., Франке В.В. (август 1986 г.). «Аминокислотная последовательность и организация генов цитокератина № 19, исключительного бесхвостого белка промежуточных филаментов» . Журнал ЭМБО . 5 (8): 1865–75. дои : 10.1002/j.1460-2075.1986.tb04438.x . ПМК 1167052 . ПМИД 2428612 .
Стасяк П.С., Лейн Э.Б. (декабрь 1987 г.). «Последовательность кДНК, кодирующая кератин человека 19» . Исследования нуклеиновых кислот . 15 (23): 10058. doi : 10.1093/nar/15.23.10058 . ПМК 306562 . ПМИД 2447559 .
Эккерт Р.Л. (февраль 1988 г.). «Последовательность человеческого кератина массой 40 кДа обнаруживает необычную структуру с очень высокой идентичностью последовательности соответствующего бычьего кератина» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 85 (4): 1114–8. Бибкод : 1988PNAS...85.1114E . дои : 10.1073/pnas.85.4.1114 . ПМК 279716 . ПМИД 2448790 .
Блюменберг М (1988). «Согласованные дупликации генов в двух семействах генов кератина». Журнал молекулярной эволюции . 27 (3): 203–11. Бибкод : 1988JMolE..27..203B . дои : 10.1007/BF02100075 . ПМИД 2458477 . S2CID 5606956 .
Бадер Б.Л., Ян Л., Франке В.В. (декабрь 1988 г.). «Низкий уровень экспрессии цитокератинов 8, 18 и 19 в сосудистых гладкомышечных клетках пуповины человека и в культивируемых клетках, полученных из них, с анализом хромосомного локуса, содержащего ген цитокератина 19». Европейский журнал клеточной биологии . 47 (2): 300–19. ПМИД 2468493 .
Стасяк ПК, Пуркис П.Е., Ли И.М., Лейн Э.Б. (май 1989 г.). «Кератин 19: предсказанная аминокислотная последовательность и широкое распространение в тканях позволяют предположить, что он произошел от кератинов кератиноцитов». Журнал исследовательской дерматологии . 92 (5): 707–16. doi : 10.1111/1523-1747.ep12721500 (неактивен 25 марта 2024 г.). ПМИД 2469734 . {{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на март 2024 г. ( ссылка )
Шезен Э, Окон Э, Бен-Гур Х, Абрамский О (январь 1995 г.). «Экспрессия цитокератина в тимусе человека: иммуногистохимическое картирование». Исследования клеток и тканей . 279 (1): 221–31. дои : 10.1007/BF00300707 . ПМИД 7534649 . S2CID 23434233 .
Милисавлевич В., Фридберг И.М., Блюменберг М. (май 1996 г.). «Тесная связь двух кластеров генов кератина в геноме человека» . Геномика . 34 (1): 134–8. дои : 10.1006/geno.1996.0252 . ПМИД 8661035 .
Чератто Н., Добкин С., Картер М., Дженкинс Э., Яо С.Л., Кассиман Дж.Дж., Али М.С., Боско П., Леубе Р., Лангбейн Л., Фео С., Романо В. (1997). «Гены цитокератина человека I типа представляют собой компактный кластер». Цитогенетика и клеточная генетика . 77 (3–4): 169–74. дои : 10.1159/000134566 . ПМИД 9284906 .
Кухарзик Т., Люгеринг Н., Шмид К.В., Шмидт М.А., Столл Р., Домшке В. (январь 1998 г.). «М-клетки кишечника человека имеют промежуточные филаменты, подобные энтероцитам» . Гут . 42 (1): 54–62. дои : 10.1136/gut.42.1.54 . ПМК 1726964 . ПМИД 9505886 .
Ян Г.П., Росс Д.Т., Куанг В.В., Браун П.О., Вейгель Р.Дж. (март 1999 г.). «Объединение микрочипов SSH и кДНК для быстрой идентификации дифференциально экспрессируемых генов» . Исследования нуклеиновых кислот . 27 (6): 1517–23. дои : 10.1093/нар/27.6.1517 . ПМК 148347 . ПМИД 10037815 .
Чжоу X, Ляо Дж, Ху Л, Фэн Л, Омари МБ (апрель 1999 г.). «Характеристика основного физиологического сайта фосфорилирования человеческого кератина 19 и его роли в организации филаментов» . Журнал биологической химии . 274 (18): 12861–6. дои : 10.1074/jbc.274.18.12861 . ПМИД 10212274 .
Салас П.Дж. (август 1999 г.). «Нерастворимые структуры, содержащие гамма-тубулин, прикреплены к апикальной сети промежуточных филаментов в поляризованных эпителиальных клетках CACO-2» . Журнал клеточной биологии . 146 (3): 645–58. дои : 10.1083/jcb.146.3.645 . ПМК 2150552 . ПМИД 10444072 .
Уитток Н.В., Иди Р.А., МакГрат Дж.А. (январь 2000 г.). «Геномная организация и амплификация генов кератина 15 и кератина 19 человека». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 267 (1): 462–5. дои : 10.1006/bbrc.1999.1966 . ПМИД 10623642 .
Ши Дж., Сугру С.П. (май 2000 г.). «Рассечение белковой связи между кератинами и пинином, белком с двойным расположением в комплексе десмосома-промежуточные филаменты и в ядре» . Журнал биологической химии . 275 (20): 14910–5. дои : 10.1074/jbc.275.20.14910 . ПМИД 10809736 .
Брембек Ф.Х., Рустги АК (сентябрь 2000 г.). «Тканезависимая транскрипция гена кератина 19 регулируется GKLF/KLF4 и Sp1» . Журнал биологической химии . 275 (36): 28230–9. дои : 10.1074/jbc.M004013200 . ПМИД 10859317 .
Кагая М., Канеко С., Оно Х., Инамура К., Кобаяши К. (октябрь 2001 г.). «Клонирование и характеристика 5'-фланкирующей области гена цитокератина 19 человека в клеточной линии холангиокарциномы человека» . Журнал гепатологии . 35 (4): 504–11. дои : 10.1016/S0168-8278(01)00167-2 . hdl : 2297/15681 . ПМИД 11682035 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000171345 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020911 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid16831889-5] Швейцер Дж., Боуден П.Е., Куломб П.А., Лангбейн Л., Лейн Э.Б., Магин Т.М., Малтаис Л., Омари М.Б., Парри Д.А., Роджерс М.А., Райт М.В. (июль 2006 г.). «Новая консенсусная номенклатура кератинов млекопитающих» . Журнал клеточной биологии . 174 (2): 169–74. дои : 10.1083/jcb.200603161 . ПМК 2064177 . ПМИД 16831889 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: KRT19 кератин 19» .

[7] Наката Б., Такашима Т., Огава Ю., Исикава Т., Хиракава К. (2004). «Сыворотка CYFRA 21-1 (фрагменты цитокератина-19) является полезным онкомаркером для выявления рецидива заболевания и оценки эффективности лечения рака молочной железы» . Бр Джей Рак . 91 (5): 873–8. дои : 10.1038/sj.bjc.6602074 . ПМК 2409884 . ПМИД 15280913 .

[Lacroix06-8] Лакруа М. (декабрь 2006 г.). «Значение, обнаружение и маркеры диссеминированных клеток рака молочной железы» (PDF) . Эндокринный рак . 13 (4): 1033–67. дои : 10.1677/ERC-06-0001 . ПМИД 17158753 . S2CID 10708900 .

[pmid25978681-9] Динец А., Пернемальм М., Челлин Х., Святоха В., Софиадис А., Юлин К.С., Зедениус Дж., Ларссон С., Лехтиё Дж., Хёог А. (май 2015 г.). «Дифференциальные профили экспрессии белка в кистозной жидкости папиллярной карциномы щитовидной железы и доброкачественных поражений щитовидной железы» . ПЛОС ОДИН . 10 (5): e0126472. Бибкод : 2015PLoSO..1026472D . дои : 10.1371/journal.pone.0126472 . ПМЦ 4433121 . ПМИД 25978681 .

[10] Аллард У.Дж., Матера Дж., Миллер М.К., Реполлет М., Коннелли М.К., Рао С., Тиббе А.Г., Ур Дж.В., Терстаппен Л.В. (октябрь 2004 г.). «Опухолевые клетки циркулируют в периферической крови всех основных карцином, но не у здоровых людей или пациентов с доброкачественными заболеваниями» (PDF) . Клинические исследования рака . 10 (20): 6897–904. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-04-0378 . ПМИД 15501967 .

[pmid10809736-11] Ши Дж., Сугру С.П. (май 2000 г.). «Рассечение белковой связи между кератинами и пинином, белком с двойным расположением в комплексе десмосома-промежуточные филаменты и в ядре» . Журнал биологической химии . 275 (20): 14910–5. дои : 10.1074/jbc.275.20.14910 . ПМИД 10809736 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]