КИФ1А
КИФ1А | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | KIF1A , ATSV, C2orf20, HSN2C, MRD9, SPG30, UNC104, член семейства кинезинов 1А | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | Опустить : 601255 ; МГИ : 108391 ; Гомологен : 99729 ; Генные карты : KIF1A ; ОМА : KIF1A – ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Кинезинподобный белок KIF1A , также известный как аксональный транспортер синаптических везикул или мотор KIF1A на основе микротрубочек , представляет собой белок , который у человека кодируется KIF1A геном . [5] [6] [7]
KIF1A является нейрон-специфичным членом семейства кинезина-3 и представляет собой микротрубочку плюс направленный на конец моторный белок, участвующий в антероградном транспорте везикул и органелл на большие расстояния. Подобно другим белкам -кинезинам , KIF1A использует химическую энергию, выделяемую в результате гидролиза аденозинтрифосфата (АТФ), для создания механической силы, позволяя ему «ходить» по нитям микротрубочек и транспортировать груз от тела нейронной клетки к ее периферии. Функция KIF1A, играющая важную роль в мозге, необходима для физиологических процессов, таких как выживание нейронов и высшая функция мозга. [8]
История
[ редактировать ]KIF1A был первоначально обнаружен у C. elegans как UNC-104 в 1991 году как возможный новый паралог кинезина, действующий как двигатель в нервной системе. [9] В 1995 году человеческий KIF1A был впервые идентифицирован как мономерный глобулярный моторный белок, который, как было показано в то время, обладал самой быстрой антероградной двигательной активностью. Также было обнаружено, что KIF1A обильно экспрессируется в нейронах, что указывает на его роль в аксонах как мотора аксонального транспорта. [10] Для дальнейшего выяснения функции KIF1A были проведены исследования in vivo на мышах. У мышей, нокаутных по KIF1A, наблюдался дефицит транспорта синаптических везикул и ранняя смерть вскоре после рождения, что указывает на критическую роль KIF1A в жизнеспособности нейронов и транспортировке предшественников синаптических везикул. [11]
В 1999 году новая модель подвижности KIF1A, в отличие от широко распространенной димерной двуглавой «модели ходьбы», показала, что KIF1A может процессивно перемещаться по микротрубочкам в виде мономера в экспериментах с одной молекулой. [12] По мере того как разгорались дебаты о том, функционирует ли KIF1A как мономер или димер, дальнейшие исследования в области крио-ЭМ определили структуру KIF1A и идентифицировали K-петлю, вставку из 12 аминокислот в области L12, которая, как предполагается, увеличивает сродство KIF1A к микротрубочки. [13] В других попытках раскрыть функцию важных структур KIF1A сообщалось, что связывание домена гомологии плекстрина (PH) KIF1A с липидами (PtdIns(4,5)P2) необходимо и достаточно для связывания и транспортировки везикул. Дальнейшие исследования того, как липидный субдомен PtdIns(4,5)P2 облегчает везикулярный транспорт KIF1A, привели к идее, что этот мембранный субдомен может вызывать кластеризацию или димеризацию мономеров KIF1A, что затем активирует двигательную активность. [14] Продолжая дискуссию о мономере и димере KIF1A, предположение о том, что KIF1A функционирует как мономерный мотор, было подвергнуто сомнению с помощью механизма, аналогичного тому, который обнаружен в обычном кинезине. Затем было высказано предположение, что KIF1A может димеризоваться, действуя как двуглавый мотор, и что подвижность может регулироваться посредством моторной димеризации, что привело к выводу, что KIF1A является мономерным в неактивном состоянии и димерным в активном состоянии. [15] Что касается того, где сейчас ведутся дебаты, более поздние исследования показали, что KIF1A является димерным как в активном, так и в неактивном состояниях, и что вместо этого двигательная активность регулируется посредством аутоингибирования. [16]
Функция
[ редактировать ]KIF1A принадлежит к подсемейству кинезина-3 и характеризуется очень высокой скоростью связывания микротрубочек и способностью перемещаться дальше и быстрее по микротрубочкам по сравнению с другими группами семейства кинезинов. [17] Имея длину пробега порядка 10 мкм, что почти в 10 раз больше, чем у хорошо изученного мотора кинезина-1, KIF1A несет разнообразный набор грузов, который должен быть доставлен точным пространственно-временным образом, чтобы обеспечить правильную функцию и жизнеспособность нейронов. [17] Поскольку KIF1A преимущественно экспрессируется в нейронах головного мозга, а низкие уровни наблюдаются в тканях сердца, семенников, поджелудочной железы, надпочечников и гипофиза, он играет решающую роль в аксонах (от тела клетки до окончания аксона) и дендритах. тело клетки к дендритам) транспорт груза. [18] [19]
Основная функция KIF1A — транспортировка на большие расстояния мембранных грузов, таких как предшественники синаптических везикул (SVP) и везикулы с плотным ядром (DCV), которые необходимы для поддержания и жизнеспособности нейронов. [9] [20] KIF1A является одним из многих моторов, которые помогают осуществлять транспорт органелл внутри клетки посредством аксонального антероградного транспорта грузов и, как показано, переносят груз, содержащий белки SV, такие как синаптофизин, синаптотагмин и Rab3A, которые необходимы для биогенеза SV и мембраны. слияние. [9] Другой основной ролью KIF1A является аксональный транспорт DCV к соответствующим субклеточным сайтам, которые синтезируются в теле клетки, а затем транспортируются KIF1A к местам пре- и постсинаптического высвобождения. DCV играют важную роль в транспортировке, обработке и секреции нейропептидных грузов, которые опосредуют ряд биологических процессов, таких как развитие нейронов, выживание, обучение и память, что делает роль KIF1A в отношении DCV абсолютно важной для нормальных нейронов. функция. [20] Кроме того, KIF1A важен для функции и выживания сенсорных нейронов, транспортируя рецептор нейротрофина TrkA, критически участвующий в сигнальном пути NGF/TrkA/Ras/PI3K, который играет роль в ощущении боли. [21]
Структура
[ редактировать ]У H. sapiens KIF1A представляет собой моторный белок, состоящий из 1791 аминокислоты в длину. Как и другие кинезины, структура KIF1A состоит из шейки, хвоста и моторного домена. На N-конце находится моторный домен, за которым следует шейная катушка (NC). Далее следует серия спиральных спиралей (CC) и домена, связанного с вилкой (FHA), в следующем порядке: CC1, домен FHA, CC2 и CC3. Затем С-конец заканчивается доменом гомологии плекстрина (PH), который связывается с грузом. Уникальностью KIF1A является его K-петля, организация области шеи и домен FHA, расположенный в хвосте. [16]
Двигательная область
[ редактировать ]Моторный домен, состоящий из глобулярного каталитического ядра и шейного линкера, расположен на N-конце молекулы и сочетает в себе связывание микротрубочек и активность АТФазы для питания плюс-концов микротрубочек. [22] [23] Каталитическое ядро содержит реакционный центр АТФазы и поверхность связывания микротрубочек, в то время как шейный линкер выполняет функцию соединения каталитического ядра с оставшейся молекулой. [23] Внутри моторного домена находится слой β-листов, расположенный между двумя слоями α-спиралей. В N-концевой половине каталитического ядра находится каталитический центр гидролиза АТФ и фосфатсвязывающая петля (P-петля), которая образует нуклеотидсвязывающий карман на вершине каталитического ядра. [23] На С-конце каталитического ядра расположены пять структурных элементов (петля L11, спираль α4, петля L12, спираль α5, петля L13), которые составляют область, называемую переключателем II, которая отвечает за формирование поверхности связывания микротрубочек. [23] Комбинированные функции переключателя II и шейного соединителя вместе выполняют механическую работу. Переключатель I, связующее звено между P-петлей и переключателем II, катализирует гидролиз АТФ и меняет конформацию в зависимости от состояния нуклеотидов нуклеотидсвязывающего кармана. [23] Эти конформационные изменения сопровождаются перегруппировкой солевых мостиков между переключателем I и переключателем II, что приводит к более крупномасштабным изменениям положения и конформационным изменениям в переключателе II. [23] В целом, переключатель I связывает химическое состояние реакционного центра с поверхностью связывания микротрубочек переключателя II. [23]
KIF1A использует цикл гидролиза АТФ, который связан с конформационными изменениями в двигательном и шейном доменах, для преобразования химической энергии в механическую работу, что позволяет двигателю двигаться вперед. В результате обмена АТФ на протяжении всего цикла аффинность связывания микротрубочек моторных доменов изменяется, что позволяет совершать ходьбу «рука за рукой», наблюдаемую при большей части подвижности кинезинов. [22]
Области хвоста и шеи
[ редактировать ]Внутри хвостовой области находится несколько коротких спиральных спиралей и множество доменов белково-липидного взаимодействия, которые помогают связывать грузы и регуляторы. Эти спиральные катушки опосредуют, а иногда и мешают моторной димеризации. [22] Что касается организации области шеи, то она состоит из спирали и β-листа. Было показано, что шейная катушка, α-спиральная область, помогает димеризовать моторные домены и может эффективно димеризоваться сама по себе. [22] [24] Шейный линкер используется для соединения моторного домена с грузом и головками партнеров-кинезинов. [23] Эти элементы работают вместе, поскольку шейная катушка связывает конформационные изменения моторного домена, регулируемые гидролизом АТФ, с шейным линкером, который управляет механизмом ходьбы «рука над рукой» KIF1A. [24]
К-петля
[ редактировать ]KIF1A также обладает участком из 12 остатков лизина, известным как K-петля, расположенным в петле 12 моторного домена, который отвечает за большую часть характерного поведения KIF1A, особенно за его подвижность и регуляцию. [22] Было показано, что взаимодействие между положительно заряженной, богатой лизином поверхностью и отрицательно заряженным, богатым глутаматом (E-крючком) С-концевым хвостом β-тубулина увеличивает аффинность KIF1A к микротрубочкам. [12] [22] Хотя наблюдается увеличение сродства к микротрубочкам, увеличение процессивности KIF1A не связано непосредственно с K-петлей. Скорее, повышенная скорость связывания микротрубочек благодаря K-петле позволяет множеству сайтов KIF1A (остаткам в петлях L2, L7, L8, L11, L12 и спиралях α4 и α6) взаимодействовать с поверхностью микротрубочек. [22] Эти взаимодействия увеличивают сродство, что, в свою очередь, увеличивает процессивность димерного KIF1A. K-петля также необходима нескольким белкам, связанным с микротрубочками (MAP), таким как септин-9 и MAP9, для оказания воздействия на KIF1A. [19] [25] Кроме того, K-петля облегчает взаимодействие KIF1A между положительно заряженной, богатой лизином областью и отрицательно заряженными полиглутамилированными C-концевыми хвостами нейронального тубулина. [19]
Домен PH и FHA
[ редактировать ]Домен гомологии плекстрина (PH) KIF1A, расположенный в хвостовой области, функционирует для связывания грузовых везикул посредством взаимодействия с фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфатом (PtdIns(4,5)P2). [22] Домен, связанный с вилкой (FHA), небольшой белковый модуль, расположенный среди спиральных спиралей в хвостовом домене, играет структурную роль и функционирует, опосредуя специфические взаимодействия грузов посредством белок-белковых взаимодействий и распознавания эпитопа фосфотреонина. [22]
Регулирование
[ редактировать ]KIF1A имеет множество механизмов для регуляции активации, деактивации, сохранения энергии и специфического контроля направленной двигательной активности. Эти механизмы включают аутоингибирование, связывание груза, Rab GTPases, белковые взаимодействия.
Аутоторможение
[ редактировать ]KIF1A существует в двух формах: расширенном активном состоянии и свернутом неактивном состоянии. В неактивном состоянии он принимает компактную форму со сложенным хвостом, чтобы предотвратить скопление микротрубочек и ненужную трату энергии, которые затем можно расширить в активном состоянии. [22] Хотя особенности, лежащие в основе причин и регуляции аутоингибирования KIF1A, требуют дальнейшего изучения, в настоящее время существуют две модели, объясняющие этот процесс. Модель переключения мономер-димер утверждает, что внутримолекулярные взаимодействия в области шеи и хвоста удерживают моторы кинезина-3 в неактивном мономерном состоянии. [22] При активации двигатели димеризуются в результате взаимодействия между областями катушек хвоста и шеи. Альтернативно, в модели хвостового блока моторы действуют как стабильные димеры и инактивируются хвостовой областью, взаимодействующей с моторным или шейным доменом. Было высказано предположение, что аутоингибированное состояние KIF1A включает CC2 и домен FHA, где CC2 сворачивается для взаимодействия с доменом FHA и вызывает нарушение двигательной активности. [22] Это состояние аутоингибирования устраняется за счет связывания груза, фосфорилирования или других регуляторных механизмов. [16] Поскольку недавние исследования показали, что KIF1A является димерным как в активном, так и в неактивном состояниях, модель хвостового блока с большей готовностью принимается для объяснения процесса аутоингибирования. Благодаря этим предложенным моделям можно лучше понять механизм автоингибирования; однако необходимы дальнейшие исследования, чтобы подтвердить и раскрыть специфику этого процесса у KIF1A.
Обвязка груза
[ редактировать ]Автоингибированный или неактивный KIF1A можно активировать от привязки груза непосредственно к двигателю. Часто белки-адаптеры груза используются для опосредования двигательной активации и рекрутирования груза. [22] В UNC-104, гомологе C. elegans KIF1A, связывание адаптерных белков, таких как UNC-16 (JIP3), DNC-1 (DCTN-1/Glued) и SYD-2 (Liprin-α), с UNC -104 приводят к перемещению мотора в различные субклеточные области нейрональных клеток. [22] Эти наблюдения позволяют предположить, что адаптеры могут использовать UNC-104/KIF1A для перевозки своего груза и управления транспортом. [22] Кроме того, исследования показали, что LIN-2 (CASK) и SYD-2 положительно регулируют UNC-104, увеличивая его скорость. LIN-2 также увеличивает длину пробега и, как предполагается, является активатором UNC-104. [22]
Раб-ГТФазы
[ редактировать ]Известно, что Rab-ГТФазы опосредуют локализацию везикул за счет регуляции GEF и GAP, которые изменяют его нуклеотидное состояние (GTP или GDP). [22] Известно, что KIF1A транспортирует везикулы, покрытые Rab3, в аксон. Rab3 функционирует как белок синаптических везикул, который контролирует экзоцитоз синаптических везикул. [22] Исследования показали, что GEF для Rab3, DENN/MAD, связывается с Rab3 и хвостовым доменом KIF1A, опосредуя транспорт мотора к окончанию аксона. [22]
Другие белковые взаимодействия
[ редактировать ]Белки, ассоциированные с микротрубочками (MAP), опосредуют кинетику сборки и разборки микротрубочек и регулируют взаимодействие моторов с микротрубочками. [22] Некоторые MAP являются известными регуляторами KIF1A. И тау, и MAP2, и MAP7 действуют как общий ингибитор KIF1A, предотвращая его доступ к решетке микротрубочек. [25] Три MAP, которые локализуются внутри дендритов, даблкортин (DCX), даблкортин-подобная киназа-1 (DCLK1) и MAP9, регулируют активность моторных белков в более широком смысле путем дифференцированного доступа к нитям микротрубочек. В частности, DCX, DCLK1 и MAP9 обеспечивают доступ KIF1A к микротрубочкам, тем самым обеспечивая «MAP-код» регуляции кинезина в нейронах. [25] Показано, что DCLK1 опосредует транспорт KIF1A связывания DCV с микротрубочками в дендритах. [22] Известно, что MAP9 облегчает транслокацию KIF1A. [25] Кроме того, было показано, что септин, связанный с микротрубочками (SEPT9), который локализуется специфически в дендритах, усиливает подвижность кинезина-3 далее в дендриты нейронов посредством распознавания K-петли. [19]
Посттрансляционные модификации тубулина
[ редактировать ]Другая форма регуляции KIF1A осуществляется посредством посттрансляционных модификаций тубулина (PTM), которые обычно происходят на C-концевых хвостах дорожек микротрубочек. [26] Эти молекулярные «сигналы движения» включают полиглутамилирование C-концевого хвоста и помогают направлять доставку моторного груза KIF1A посредством взаимодействия между K-петлей KIF1A и C-концевыми хвостами микротрубочек. Исследования показали, что полиглутамилирование С-концевого хвоста тубулина регулирует KIF1A за счет уменьшения пауз KIF1A, а также длины пробега, что указывает на механизм, который опосредует поведение и подвижность KIF1A. [26] Кроме того, сообщалось, что полиглутамилирование α-тубулина действует как сигнал молекулярного движения для грузового транспорта KIF1A, направляя мотор к его правильному месту назначения, тем самым обеспечивая непрерывную синаптическую передачу. [27]
Патология
[ редактировать ]KIF1A-опосредованный антероградный аксональный транспорт имеет решающее значение для развития и поддержания нервной системы. Поскольку KIF1A функционирует для транспортировки предшественников синаптических везикул (SVP) и везикул с плотным ядром (DCV) вдоль нейронов, дефекты в этом моторном белке могут привести к неправильной доставке груза и привести к ухудшению состояния нейрональных клеток, что может привести к патологиям. Исследования, проведенные с UNC-104, показали, что мутанты UNC-104 с потерей функции не способны должным образом транспортировать SVP к синапсам, что приводит к аномальному накоплению SV в телах клеток и дендритах. [28] Другие исследования показали, что низкие уровни SVP у мышей из-за нарушения транспорта, опосредованного KIF1A, вредны для развития и выживания. У мышей с гомозиготной инактивацией KIF1A наблюдались серьезные двигательные и сенсорные нарушения; большинство умерло в течение 24 часов после рождения, и все умерли в течение 72 часов. [11] У гомозиготных мышей также наблюдались сниженные уровни SVP, а также значительная нейродегенерация и смерть. [11] DCV также необходимы для правильного функционирования нейронов, поскольку они содержат белки, такие как BDNF, которые необходимы для выживания. [20] BDNF тесно связан с KIF1A и может объяснить клиническую картину фенотипа нокдауна KIF1A. [29] Потеря KIF1A-опосредованного транспорта BDNF приводит к снижению синаптогенеза и улучшению обучения, тогда как усиление KIF1A приводит к образованию пресинаптических кнопок. [30]
В 2011 году было обнаружено, что первые ассоциированные с заболеванием аллели KIF1A связаны с наследственной спастической параплегией (HSP), заболеванием, характеризующимся аномальной походкой и спастичностью нижних конечностей. [31] С использованием секвенирования всего экзома и картирования гомозиготности исследования обнаружили причинную мутацию в моторном домене KIF1A, которая привела к поведению, характерному для HSP. [31] Дополнительные исследования показали, что миссенс-мутации de novo в KIF1A влияют на функцию белка в системах клеточных культур, что предполагает патогенность. Об этих же мутациях также сообщалось у пациентов с умственной отсталостью и аутизмом, что позволяет предположить, что гетерозиготное нарушение KIF1A может быть связано с несиндромальной умственной отсталостью (NID). [32] Исследования наследственной сенсорной и автономной невропатии типа II (HSAN II), редкого аутосомно-рецессивного заболевания, характеризующегося дегенерацией периферических нервов, приводящей к тяжелой дистальной сенсорной потере, показали, что мутации KIF1A в альтернативно сплайсированном экзоне являются редкой причиной HSAN II. [33] В совокупности эти исследования, опубликованные в 2011 году, сообщают о взаимосвязи между KIF1A и наследственными заболеваниями человека. В отличие от сообщений о мутациях KIF1A, приводящих к потере функционального поведения и снижению антероградного аксонального транспорта, недавнее исследование показало, что некоторые мутации KIF1A приводят к гиперактивности мотора KIF1A и усилению аксонального транспорта SVP, что также может быть патологическим. [28] Кроме того, самые последние данные показывают, что варианты KIF1A, большинство из которых расположены в моторном домене, приводят к дефектам транспорта белка, таким как снижение связывания микротрубочек, снижение скорости и процессивности, а также увеличение неподвижного строгого связывания микротрубочек. [34]
Клиническое значение
[ редактировать ]С KIF1A связаны различные заболевания и расстройства, включая KIF1A-ассоциированное неврологическое расстройство (KAND), наследственную спастическую параплегию и атаксию . Эти расстройства в первую очередь поражают нервную систему и имеют разнообразный набор клинических проявлений.
KIF1A-ассоциированное неврологическое расстройство
[ редактировать ]KAND — нейродегенеративное заболевание, вызванное одной или несколькими вариациями (мутациями) гена KIF1A, которое может привести к целому ряду симптомов, таких как задержка нервного развития , умственная отсталость , аутизм , микроцефалия , прогрессирующая спастическая параплегия, периферическая невропатия , атрофия зрительного нерва, церебральная и мозжечковая атрофия, судороги . [34] [35] KAND был диагностирован у более чем 200 пациентов во всем мире, причем подавляющее большинство из них — дети, вероятно, по той причине, что достижения в области генетического тестирования только недавно стали более доступными. На данный момент идентифицировано 119 различных вариантов, но вполне вероятно, что еще предстоит открыть множество вариантов. [35] В зависимости от типа возникающей вариации и места ее расположения в гене у пациентов с KAND наблюдается широкий спектр симптомов, прогрессирования и тяжести заболевания. [35] KAND может наследоваться по аутосомно-рецессивному или доминантному типу и характеризуется как расстройство спектра с диапазоном симптомов от легких до опасных для жизни. [35] Поскольку существует множество мутаций, вызывающих KAND, преимущественно гетерозиготных миссенс-мутаций в моторном домене KIF1A, диагностика этого заболевания затруднена. [34] Стремясь расширить понимание фенотипического спектра вариантов KIF1A, исследователи обнаружили новые варианты KIF1A de novo у пациентов с синдромом Ретта (RTT) и тяжелыми нарушениями развития нервной системы, которые имеют общие клинические особенности, схожие с KAND. [36] Анализы скольжения микротрубочек и анализы накопления кончиков нейритов показали, что эти новые варианты KIF1A снижают скорость KIF1A и связывание микротрубочек, а также уменьшают способность моторного домена KIF1A накапливаться вдоль нейритов. Результаты этого исследования расширили фенотипические характеристики, наблюдаемые у людей KAND с вариантами KIF1A в двигательной области, поскольку общие клинические особенности наблюдались и у людей с RTT. [36] Кроме того, недавно была разработана первая шкала тяжести заболевания для KAND, при этом тяжесть заболевания тесно связана с вариантами, которые встречаются в областях белка, участвующих в связывании АТФ и микротрубочек, точнее, в P-петле, переключателе I и переключателе II. [34] Наиболее тяжелые проявления KAND наблюдаются при мутациях в моторном домене KIF1A, обычно возникающих de novo, а менее тяжелые вариации наблюдаются в области ножки KIF1A и обычно наследуются. [34]
Согласно недавним исследованиям, варианты KIF1A демонстрируют такие дефекты, как снижение связывания микротрубочек (МТ), снижение скорости и процессивности, а также повышенное неподвижное строгое связывание МТ, все из которых могут способствовать появлению признаков и симптомов, наблюдаемых у пациентов с KAND. [35] Благодаря текущему исследованию естественной истории и установленной эвристической шкале тяжести KAND, исследовательские усилия продвигаются к выяснению неизвестных особенностей расстройства и продвигаются вперед в поиске лечения. Поскольку KAND можно точно диагностировать только с помощью генетического тестирования, а его симптомы схожи с церебральным параличом (ДЦП), многим пациентам изначально ставят неверный диагноз. Совпадение между CP и KAND в сочетании с непомерно высокой стоимостью генетического тестирования приводит к убеждению, что большинству пациентов с KAND еще не поставлен правильный диагноз, что приводит к значительно недопредставленному количеству зарегистрированных случаев.
Общество и культура
[ редактировать ]KIF1A.org, некоммерческая организация, призванная помогать пострадавшим от KAND и финансировать исследования по поиску лекарства, была основана Люком Розеном и Салли Джексон. [37] В 2020 году KIF1A.org был выбран для присоединения к проекту Rare As One, запущенному Инициативой Чана Цукерберга (CZI). [38] Инициатором этих доклинических исследований по поиску лечения KAND является доктор Венди Чанг , доктор медицинских наук, которая возглавляет программу KIF1A в Колумбийском университете, руководит исследованием естественной истории KIF1A и играет огромную роль в поддержке сообщества KAND и организация.
7 апреля 2020 года первой части фильма «Ген: интимная история» на канале PBS состоялась премьера — документального фильма Кена Бернса , основанного на одноименной книге Сиддхартхи Мукерджи. [37] В документальном фильме основное внимание уделяется усилиям Розена и Джексона, KIF1A.org и исследователей по поиску лечения пациентов с KAND. [37]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000130294 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000014602 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ген Энтрез: член семейства кинезинов 1А» .
- ^ Окада Ю., Ямадзаки Х., Секине-Айзава Ю., Хирокава Н. (июнь 1995 г.). «Нейрон-специфический белок суперсемейства кинезинов KIF1A является уникальным мономерным двигателем антероградного аксонального транспорта предшественников синаптических везикул» . Клетка . 81 (5): 769–80. дои : 10.1016/0092-8674(95)90538-3 . ПМИД 7539720 . S2CID 16772001 .
- ^ Келлер, член парламента, Зейфрид Б.А., Рабин Б.А., Шанс П.Ф. (март 1999 г.). «Картирование связанного с кинезином гена ATSV с хромосомой 2q37». Хм. Жене . 104 (3): 254–6. дои : 10.1007/s004390050944 . ПМИД 10323250 . S2CID 10375316 .
- ^ Сиддики Н., Штраубе А. (июль 2017 г.). «Внутриклеточный транспорт грузов с помощью двигателей кинезин-3» (PDF) . Биохимия. Биохимия . 82 (7): 803–815. дои : 10.1134/S0006297917070057 . ПМЦ 7612238 . ПМИД 28918744 . S2CID 20811770 .
- ^ Jump up to: а б с Холл Д.Х., Хеджкок Э.М. (май 1991 г.). «Связанный с кинезином ген unc-104 необходим для аксонального транспорта синаптических везикул у C. elegans». Клетка . 65 (5): 837–47. дои : 10.1016/0092-8674(91)90391-Б . ПМИД 1710172 . S2CID 11532651 .
- ^ Окада Ю., Ямадзаки Х., Секине-Айзава Ю., Хирокава Н. (июнь 1995 г.). «Нейрон-специфический белок суперсемейства кинезинов KIF1A является уникальным мономерным двигателем антероградного аксонального транспорта предшественников синаптических везикул» . Клетка . 81 (5): 769–80. дои : 10.1016/0092-8674(95)90538-3 . ПМИД 7539720 .
- ^ Jump up to: а б с Ёнекава Ю., Харада А., Окада Ю., Фунакоши Т., Канаи Ю., Такей Ю. и др. (апрель 1998 г.). «Дефект транспорта предшественников синаптических пузырьков и гибель нейрональных клеток у мышей с дефицитом моторного белка KIF1A» . Журнал клеточной биологии . 141 (2): 431–41. дои : 10.1083/jcb.141.2.431 . ПМК 2148442 . ПМИД 9548721 .
- ^ Jump up to: а б Окада Ю., Хирокава Н. (февраль 1999 г.). «Процессивный одноголовый мотор: белок суперсемейства кинезинов KIF1A». Наука . 283 (5405): 1152–7. Бибкод : 1999Sci...283.1152O . дои : 10.1126/science.283.5405.1152 . ПМИД 10024239 .
- ^ Киккава М., Окада Ю., Хирокава Н. (январь 2000 г.). «15 Разрешающая модель мономерного кинезинового мотора KIF1A» . Клетка . 100 (2): 241–52. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81562-7 . ПМИД 10660047 .
- ^ Клопфенштайн Д.Р., Томишиге М., Стурман Н., Вейл Р.Д. (май 2002 г.). «Роль организации фосфатидилинозитол(4,5)бисфосфата в мембранном транспорте с помощью кинезинового мотора Unc104» . Клетка . 109 (3): 347–58. дои : 10.1016/S0092-8674(02)00708-0 . ПМЦ 2851634 . ПМИД 12015984 .
- ^ Томишиге М., Клопфенштайн Д.Р., Вейл Р.Д. (сентябрь 2002 г.). «Превращение кинезина Unc104/KIF1A в процессивный мотор после димеризации». Наука . 297 (5590): 2263–7. Бибкод : 2002Sci...297.2263T . дои : 10.1126/science.1073386 . ПМИД 12351789 . S2CID 13048573 .
- ^ Jump up to: а б с Хаммонд Дж.В., Цай Д., Блазиус Т.Л., Ли З., Цзян Ю., Джих Г.Т. и др. (март 2009 г.). Шлива М. (ред.). «Моторы кинезина-3 млекопитающих являются димерными in vivo и движутся за счет процессивной подвижности после снятия аутоингибирования» . ПЛОС Биология . 7 (3): е72. дои : 10.1371/journal.pbio.1000072 . ПМК 2661964 . ПМИД 19338388 .
- ^ Jump up to: а б Соппина В., Норрис С.Р., Дизаджи А.С., Кортус М., Витч С., Пекхэм М., Верхей К.Дж. (апрель 2014 г.). «Димеризация моторов кинезина-3 млекопитающих приводит к сверхпроцессивному движению» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (15): 5562–7. Бибкод : 2014PNAS..111.5562S . дои : 10.1073/pnas.1400759111 . ПМЦ 3992690 . ПМИД 24706892 .
- ^ Улен М., Фагерберг Л., Халльстрем Б.М., Линдског С., Оксволд П., Мардиноглу А. и др. (январь 2015 г.). «Протеомика. Тканевая карта протеома человека». Наука . 347 (6220): 1260419. doi : 10.1126/science.1260419 . ПМИД 25613900 . S2CID 802377 .
- ^ Jump up to: а б с д Карасманис Е.П., Фан К.Т., Анжелис Д., Кесисова И.А., Хугенраад К.С. , Маккенни Р.Дж., Спилиотис Э.Т. (июль 2018 г.). «Полярность нейронального мембранного трафика требует сортировки кинезинового моторного груза во время входа в дендриты септина, связанного с микротрубочками» . Развивающая клетка . 46 (2): 204–218.e7. дои : 10.1016/j.devcel.2018.06.013 . ПМК 6396981 . ПМИД 30016622 .
- ^ Jump up to: а б с Ло К.Ю., Кузьмин А., Унгер С.М., Петерсен Дж.Д., Сильверман М.А. (март 2011 г.). «KIF1A является основным антероградным моторным белком, необходимым для аксонального транспорта везикул с плотным ядром в культивируемых нейронах гиппокампа». Письма по неврологии . 491 (3): 168–73. дои : 10.1016/j.neulet.2011.01.018 . ПМИД 21256924 . S2CID 36273386 .
- ^ Танака Ю., Нива С., Донг М., Фарконде А., Ван Л., Чжоу Р., Хирокава Н. (июнь 2016 г.). «Молекулярный мотор KIF1A транспортирует рецептор нейротрофина TrkA и необходим для выживания и функционирования сенсорных нейронов» . Нейрон . 90 (6): 1215–1229. дои : 10.1016/j.neuron.2016.05.002 . ПМИД 27263974 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час я дж к л м н тот п д р с т в Сиддики Н., Штраубе А. (июль 2017 г.). «Внутриклеточный транспорт грузов с помощью двигателей кинезин-3» (PDF) . Биохимия. Биохимия . 82 (7): 803–815. дои : 10.1134/S0006297917070057 . ПМЦ 7612238 . ПМИД 28918744 . S2CID 20811770 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час Хирокава Н., Нитта Р., Окада Ю. (декабрь 2009 г.). «Механизмы моторной подвижности кинезина: уроки мономерного мотора KIF1A». Обзоры природы. Молекулярно-клеточная биология . 10 (12): 877–84. дои : 10.1038/nrm2807 . ПМИД 19935670 . S2CID 27303652 .
- ^ Jump up to: а б Аль-Басам Дж., Нитианантам С. (декабрь 2018 г.). «Податливое сворачивание спиральных спиралей регулирует димеризацию кинезина-3» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 115 (51): 12845–12847. Бибкод : 2018PNAS..11512845A . дои : 10.1073/pnas.1818758115 . ПМК 6304974 . ПМИД 30530652 .
- ^ Jump up to: а б с д Монрой Б.И., Тан Т.К., Окламан Дж.М., Хан Дж.С., Симо С., Нива С. и др. (апрель 2020 г.). «Комбинаторный код MAP диктует транспорт поляризованных микротрубочек» . Развивающая клетка . 53 (1): 60–72.e4. дои : 10.1016/j.devcel.2020.01.029 . ПМК 7181406 . ПМИД 32109385 .
- ^ Jump up to: а б Лессард Д.В., Зиндер О.Дж., Хотта Т., Верхей К.Дж., Охи Р., Бергер К.Л. (апрель 2019 г.). «Полиглутамилирование С-концевого хвоста тубулина контролирует паузу и подвижность члена семейства кинезина-3 KIF1A» . Журнал биологической химии . 294 (16): 6353–6363. дои : 10.1074/jbc.RA118.005765 . ПМК 6484136 . ПМИД 30770469 .
- ^ Икегами К., Хейер Р.Л., Таруиси М., Такаги Х., Мукаи М., Шимма С. и др. (февраль 2007 г.). «Потеря полиглутамилирования альфа-тубулина у мышей ROSA22 связана с аномальным нацеливанием на KIF1A и модулированной синаптической функцией» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (9): 3213–8. Бибкод : 2007PNAS..104.3213I . дои : 10.1073/pnas.0611547104 . ПМК 1802010 . ПМИД 17360631 .
- ^ Jump up to: а б Чиба К., Такахаси Х., Чен М., Обината Х., Араи С., Хасимото К. и др. (сентябрь 2019 г.). «Связанные с заболеванием мутации гиперактивируют подвижность KIF1A и антероградный аксональный транспорт предшественников синаптических везикул» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 116 (37): 18429–18434. Бибкод : 2019PNAS..11618429C . дои : 10.1073/pnas.1905690116 . ПМК 6744892 . ПМИД 31455732 .
- ^ Карабалона А., Ху DJ, Валле РБ (февраль 2016 г.). «Ингибирование KIF1A увековечивает стволовые клетки мозга, но блокирует BDNF-опосредованную миграцию нейронов» . Природная неврология . 19 (2): 253–62. дои : 10.1038/nn.4213 . ПМЦ 4731285 . ПМИД 26752160 .
- ^ Кондо М., Такей Ю., Хирокава Н. (февраль 2012 г.). «Моторный белок KIF1A необходим для синаптогенеза гиппокампа и улучшения обучения в обогащенной среде» . Нейрон . 73 (4): 743–57. дои : 10.1016/j.neuron.2011.12.020 . ПМИД 22365548 .
- ^ Jump up to: а б Эрлих Ю., Эдвардсон С., Ходжес Э., Зенвирт С., Теккат П., Шааг А. и др. (май 2011 г.). «Секвенирование экзома и анализ сети заболеваний в одной семье указывают на мутацию KIF1A в наследственном спастическом парапарезе» . Геномные исследования . 21 (5): 658–64. дои : 10.1101/гр.117143.110 . ПМК 3083082 . ПМИД 21487076 .
- ^ Хамдан Ф.Ф., Готье Дж., Араки Ю., Лин Д.Т., Ёсизава Ю., Хигаси К. и др. (март 2011 г.). «Избыток вредных мутаций de novo в генах, связанных с глутаматергическими системами, при несиндромальной умственной отсталости» . Американский журнал генетики человека . 88 (3): 306–16. дои : 10.1016/j.ajhg.2011.02.001 . ПМК 3059427 . ПМИД 21376300 .
- ^ Ривьер Ж.Б., Рамалингам С., Лавастр В., Шекараби М., Холберт С., Лафонтен Дж. и др. (август 2011 г.). «KIF1A, аксональный транспортер синаптических везикул, мутирует при наследственной сенсорной и автономной нейропатии 2 типа» . Американский журнал генетики человека . 89 (2): 219–30. дои : 10.1016/j.ajhg.2011.06.013 . ПМК 3155159 . ПМИД 21820098 .
- ^ Jump up to: а б с д и Бойл Л., Рао Л., Каур С., Фан Х, Мебан С., Хэмм Л., Торнтон А., Арендсен Дж.Т., Андерсон М.П., Христодулу Дж., Геннерих А. (апрель 2021 г.). «Генотип и дефекты подвижности микротрубочек коррелируют с клинической тяжестью неврологического расстройства, связанного с KIF1A» . Достижения генетики человека и геномики . 2 (2): 100026. doi : 10.1016/j.xhgg.2021.100026 . ПМК 8054982 . ПМИД 33880452 .
- ^ Jump up to: а б с д и «Расстройство, связанное с KIF1A» . НОРД (Национальная организация по редким заболеваниям) . Проверено 14 апреля 2021 г.
- ^ Jump up to: а б Каур С., Ван Берген, Нью-Джерси, Верхей К.Дж., Ноуэлл С.Дж., Будайтис Б., Юэ Ю. и др. (июль 2020 г.). «Расширение фенотипического спектра миссенс-вариантов de novo члена семейства кинезинов 1А (KIF1A)» . Человеческая мутация . 41 (10): 1761–1774. дои : 10.1002/humu.24079 . ПМЦ 7908811 . ПМИД 32652677 .
- ^ Jump up to: а б с «KIF1A.ORG | Связанное с KIF1A неврологическое расстройство» . КИФ1А . Проверено 14 апреля 2021 г.
- ^ "КИФ1А.ОРГ" . Инициатива Чана Цукерберга .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Демокан С., Чанг Х, Чуанг А., Мидларц В.К., Каур Дж., Хуанг П. и др. (ноябрь 2010 г.). «KIF1A и EDNRB по-разному метилируются при первичном HNSCC и полоскании слюны» . Международный журнал рака . 127 (10): 2351–9. дои : 10.1002/ijc.25248 . ПМЦ 2946472 . ПМИД 20162572 .
- Смит М., Эскамилла Дж.Р., Филипек П., Боциан М.Е., Модал С., Флодман П., Спенс М.А. (2001). «Молекулярно-генетическое определение делеции 2q37.3 при аутизме и остеодистрофии: отчет о случае и новых маркерах для скрининга делеции с помощью ПЦР» . Цитогенетика и клеточная генетика . 94 (1–2): 15–22. дои : 10.1159/000048775 . ПМИД 11701947 . S2CID 22441097 .
- Киккава М., Хирокава Н. (сентябрь 2006 г.). «Крио-ЭМ-карты высокого разрешения показывают карман связывания нуклеотидов KIF1A в открытой и закрытой конформациях» . Журнал ЭМБО . 25 (18): 4187–94. дои : 10.1038/sj.emboj.7601299 . ПМК 1570440 . ПМИД 16946706 .
- Ю В., Андерссон Б., Уорли К.С., Музный Д.М., Дин Ю., Лю В. и др. (апрель 1997 г.). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК» . Геномные исследования . 7 (4): 353–8. дои : 10.1101/гр.7.4.353 . ПМК 139146 . ПМИД 9110174 .
- Альберс М., Кранц Х., Кобер И., Кайзер С., Клинк М., Сукоу Дж. и др. (февраль 2005 г.). «Автоматизированный двухгибридный скрининг дрожжей на наличие белков, взаимодействующих с ядерными рецепторами» . Молекулярная и клеточная протеомика . 4 (2): 205–13. дои : 10.1074/mcp.M400169-MCP200 . ПМИД 15604093 .
- Барбе Л., Лундберг Э., Оксволд П., Стениус А., Левин Э., Бьёрлинг Э. и др. (март 2008 г.). «К конфокальному субклеточному атласу протеома человека» . Молекулярная и клеточная протеомика . 7 (3): 499–508. дои : 10.1074/mcp.M700325-MCP200 . ПМИД 18029348 .
- Ферлонг Р.А., Чжоу С.И., Фергюсон-Смит М.А., Аффара Н.А. (май 1996 г.). «Характеристика связанного с кинезином гена ATSV в кандидатной области локуса туберозного склероза (TSC1) на хромосоме 9Q34». Геномика . 33 (3): 421–9. дои : 10.1006/geno.1996.0217 . ПМИД 8661001 .
- Кошизука Т., Кавагути Ю., Нисияма Ю. (март 2005 г.). «Мембранный белок UL56 вируса простого герпеса типа 2 ассоциируется с моторным белком кинезина KIF1A» . Журнал общей вирусологии . 86 (Часть 3): 527–533. дои : 10.1099/vir.0.80633-0 . ПМИД 15722511 .
- Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД 8889548 .
- Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Дж.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (апрель 1996 г.). «Метод «двойного адаптера» для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Аналитическая биохимия . 236 (1): 107–13. дои : 10.1006/abio.1996.0138 . ПМИД 8619474 .
- Шин Х., Вышински М., Ха К.Х., Вальшанов Дж.Г., Ли Дж.Р., Ко Дж. и др. (март 2003 г.). «Ассоциация кинезинового мотора KIF1A с мультимодульным белком липрином-альфа» . Журнал биологической химии . 278 (13): 11393–401. дои : 10.1074/jbc.M211874200 . ПМИД 12522103 .
- Ли Дж.Р., Шин Х., Чой Дж., Ко Дж., Ким С., Ли Х.В. и др. (апрель 2004 г.). «Внутримолекулярное взаимодействие между доменом FHA и спиральной спиралью отрицательно регулирует кинезиновый мотор KIF1A» . Журнал ЭМБО . 23 (7): 1506–15. дои : 10.1038/sj.emboj.7600164 . ПМК 391070 . ПМИД 15014437 .
- Диас Нето Э., Корреа Р.Г., Верёвски-Алмейда С., Брионес М.Р., Нагаи М.А., да Силва В. и др. (март 2000 г.). «Секвенирование транскриптома человека с помощью меток последовательности, экспрессируемых ORF» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (7): 3491–6. Бибкод : 2000PNAS...97.3491D . дои : 10.1073/pnas.97.7.3491 . ПМК 16267 . ПМИД 10737800 .
- Ли-младший, Шин Х, Ко Джей, Чой Джей, Ли Х, Ким Э (январь 2003 г.). «Характеристика движения кинезинового мотора KIF1A в живых культивируемых нейронах» . Журнал биологической химии . 278 (4): 2624–9. дои : 10.1074/jbc.M211152200 . ПМИД 12435738 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- KIF1A.org - KIF1A-ассоциированное неврологическое расстройство
- Ген KIF1A - Домашний справочник генетики - NIH
- NORD – расстройство, связанное с KIF1A
- База данных OMIM для KIF1A
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q12756 (кинезинподобный белок KIF1A) в PDBe-KB .
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .