ТРИО (ген)

ТРИО
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1NTY, 2NZ8
Идентификаторы
Псевдонимы	TRIO , ARHGEF23, tgat, трио фактор обмена гуаниновых нуклеотидов Rho, MEBAS, MRD44, MRD63, ген TRIO
Внешние идентификаторы	Опустить : 601893 ; МГИ : 1927230 ; Гомологен : 20847 ; GeneCards : ТРИО ; ОМА : ТРИО – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	14,532,128 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 15 (mouse)
End	28,025,934 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	sural nerve; ; stromal cell of endometrium; ; gastric mucosa; ; ganglionic eminence; ; right hemisphere of cerebellum; ; right ovary; ; left ovary; ; Achilles tendon; ; epithelium of colon; ; body of uterus;
	Top expressed in
	lateral septal nucleus; ; superior frontal gyrus; ; neural layer of retina; ; cerebellar cortex; ; internal carotid artery; ; human fetus; ; Rostral migratory stream; ; lateral geniculate nucleus; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; ventromedial nucleus;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	transferase activity; nucleotide binding; protein kinase activity; guanyl-nucleotide exchange factor activity; kinase activity; protein serine/threonine kinase activity; protein binding; ATP binding;
Cellular component	cytoplasm; cytosol;
Biological process	phosphorylation; protein phosphorylation; transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase signaling pathway; positive regulation of apoptotic process; regulation of Rho protein signal transduction; regulation of small GTPase mediated signal transduction; negative regulation of fat cell differentiation; G protein-coupled receptor signaling pathway; axon guidance; central nervous system development;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	7204
	223435
	ENSG00000038382
	ENSMUSG00000022263
	О75962
	Q0KL02
	НМ_007118
	НМ_001081302
	НП_009049
	НП_001074771
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок с тройным функциональным доменом — это белок , который у человека кодируется TRIO геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что TRIO (ген) взаимодействует с филамином. ^{[ 7 ]} и РОА . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000038382 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022263 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Дебант А., Серра-Пажес С., Зайпель К., О'Брайен С., Тан М., Парк Ш., Стреули М. (май 1996 г.). «Многодоменный белок Trio связывает трансмембранную тирозинфосфатазу LAR, содержит домен протеинкиназы и имеет отдельные домены фактора обмена гуаниновых нуклеотидов, специфичные для rac и rho» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (11): 5466–71. Бибкод : 1996PNAS...93.5466D . дои : 10.1073/pnas.93.11.5466 . ПМК 39269 . ПМИД 8643598 .
^ «Ген Энтрез: тройной функциональный домен TRIO (взаимодействие PPTRF)» .
^ Белланджер Дж. М., Астье С., Сардет Дж., Ота Ю., Штоссель Т.П., Дебант А. (декабрь 2000 г.). «Rac1- и RhoG-специфичный домен GEF Trio нацелен на филамин, ремоделируя цитоскелетный актин». Природная клеточная биология . 2 (12): 888–92. дои : 10.1038/35046533 . ПМИД 11146652 . S2CID 10182923 .
^ Медли QG, Серра-Пажес С, Яннотти Э, Зайпель К, Тан М, О'Брайен С.П., Стреули М (ноябрь 2000 г.). «Фактор обмена триогуаниновых нуклеотидов является мишенью RhoA. Связывание RhoA с трио-иммуноглобулиноподобным доменом» . Журнал биологической химии . 275 (46): 36116–23. дои : 10.1074/jbc.M003775200 . ПМИД 10948190 .

Дальнейшее чтение

Тавио С., Дирионг С., Беллангер Дж. М., Стреули М., Дебант А. (1997). «Присвоение TRIO, гена Trio (взаимодействующего с PPRRF) полосам хромосом человека 5p 15.1 → p 14 путем гибридизации in situ». Цитогенетика и клеточная генетика . 76 (1–2): 107–8. дои : 10.1159/000134524 . ПМИД 9154137 .
Лю X, Ван Х, Эберштадт М, Шнухель А, Олейничак Е.Т., Медоуз Р.П., Шкерьянц Дж.М., Яновик Д.А., Харлан Дж.Е., Харрис Э.А., Стонтон Д.Е., Фесик С.В. (октябрь 1998 г.). «Структура ЯМР и мутагенез N-концевого домена гомологии Dbl фактора нуклеотидного обмена Trio» . Клетка . 95 (2): 269–77. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81757-2 . ПМИД 9790533 . S2CID 18146575 .
Зайпель К., Медли К.Г., Кедерша Н.Л., Чжан К.А., О'Брайен С.П., Серра-Пейджс С., Хемлер М.Е., Стреули М. (июнь 1999 г.). «Экспрессия домена фактора обмена трио-амино-концевых гуаниновых нуклеотидов способствует реорганизации актинового цитоскелета, миграции клеток и независимому от прикрепления росту клеток». Журнал клеточной науки . 112 (Пт 12) (12): 1825–34. дои : 10.1242/jcs.112.12.1825 . ПМИД 10341202 .
Медли QG, Серра-Пажес С, Яннотти Э, Зайпель К, Тан М, О'Брайен С.П., Стреули М (ноябрь 2000 г.). «Фактор обмена триогуаниновых нуклеотидов является мишенью RhoA. Связывание RhoA с трио-иммуноглобулиноподобным доменом» . Журнал биологической химии . 275 (46): 36116–23. дои : 10.1074/jbc.M003775200 . ПМИД 10948190 .
Белланджер Дж. М., Астье С., Сардет Дж., Ота Ю., Штоссель Т.П., Дебант А. (декабрь 2000 г.). «Rac1- и RhoG-специфичный домен GEF Trio нацелен на филамин, ремоделируя цитоскелетный актин». Природная клеточная биология . 2 (12): 888–92. дои : 10.1038/35046533 . ПМИД 11146652 . S2CID 10182923 .
Гао Ю, Син Дж, Стреули М, Лето ТЛ, Чжэн Ю (декабрь 2001 г.). «Trp(56) rac1 определяет взаимодействие с подмножеством факторов обмена гуаниновых нуклеотидов» . Журнал биологической химии . 276 (50): 47530–41. дои : 10.1074/jbc.M108865200 . ПМИД 11595749 .
Сковронек К.Р., Го Ф, Чжэн Ю, Нассар Н (сентябрь 2004 г.). «С-концевой основной хвост RhoG помогает трио факторов обмена гуаниновых нуклеотидов связываться с фосфолипидами» . Журнал биологической химии . 279 (36): 37895–907. дои : 10.1074/jbc.M312677200 . ПМИД 15199069 .
Чжэн М., Саймон Р., Мирлахер М., Маурер Р., Гассер Т., Форстер Т., Динер П.А., Михатч М.Дж., Заутер Г., Шрамл П. (июль 2004 г.). «Амплификация TRIO и обильная экспрессия мРНК связаны с инвазивным ростом опухоли и быстрой пролиферацией опухолевых клеток при раке мочевого пузыря» . Американский журнал патологии . 165 (1): 63–9. дои : 10.1016/S0002-9440(10)63275-0 . ПМЦ 1618551 . ПМИД 15215162 .
Ёсидзука Н., Мориучи Р., Мори Т., Ямада К., Хасегава С., Маэда Т., Симада Т., Ямада Ю., Камихира С., Томонага М., Катамин С. (октябрь 2004 г.). «Альтернативный транскрипт, полученный из локуса trio, кодирует фактор обмена гуанозиновых нуклеотидов с потенциалом трансформации клеток мыши» . Журнал биологической химии . 279 (42): 43998–4004. дои : 10.1074/jbc.M406082200 . ПМИД 15308664 .
Порталес-Касамар Э., Бриансон-Маржолле А., Фромон С., Трибуле Р., Дебант А. (март 2006 г.). «Идентификация новых нейрональных изоформ трио Rho-GEF» . Биология клетки . 98 (3): 183–93. дои : 10.1042/BC20050009 . ПМИД 16033331 . S2CID 24166861 .
Тао В.А., Воллшайд Б., О'Брайен Р., Энг Дж.К., Ли XJ, Боденмиллер Б., Уоттс Дж.Д., Худ Л., Эберсолд Р. (август 2005 г.). «Количественный анализ фосфопротеома с использованием химии конъюгации дендримеров и тандемной масс-спектрометрии». Природные методы . 2 (8): 591–8. дои : 10.1038/nmeth776 . ПМИД 16094384 . S2CID 20475874 .
Адамович М., Радльвиммер Б., Рикер Р.Дж., Мертенс Д., Шварцбах М., Шрамл П., Беннер А., Лихтер П., Мехтершаймер Г., Йоос С. (сентябрь 2006 г.). «Частые амплификации и обильная экспрессия TRIO, NKD2 и IRX2 при саркомах мягких тканей». Гены, хромосомы и рак . 45 (9): 829–38. дои : 10.1002/gcc.20343 . ПМИД 16752383 . S2CID 24491021 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф., Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .
Чхатривала М.К., Беттс Л., Уортилак Д.К., Сондек Дж. (май 2007 г.). «Домены DH и PH Trio координально задействуют Rho GTPases для их эффективной активации» . Журнал молекулярной биологии . 368 (5): 1307–20. дои : 10.1016/j.jmb.2007.02.060 . ПМК 1890047 . ПМИД 17391702 .
Рохас Р.Дж., Йохе М.Э., Гершбург С., Кавано Т., Козаса Т., Сондек Дж. (октябрь 2007 г.). «Galphaq напрямую активирует p63RhoGEF и Trio посредством консервативного расширения домена гомологичности плекстрина, связанного с Dbl-гомологией» . Журнал биологической химии . 282 (40): 29201–10. дои : 10.1074/jbc.M703458200 . ПМЦ 2655113 . ПМИД 17606614 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O75962 (белок с тройным функциональным доменом) на PDBe-KB .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 5 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000038382 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022263 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8643598-5] Дебант А., Серра-Пажес С., Зайпель К., О'Брайен С., Тан М., Парк Ш., Стреули М. (май 1996 г.). «Многодоменный белок Trio связывает трансмембранную тирозинфосфатазу LAR, содержит домен протеинкиназы и имеет отдельные домены фактора обмена гуаниновых нуклеотидов, специфичные для rac и rho» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (11): 5466–71. Бибкод : 1996PNAS...93.5466D . дои : 10.1073/pnas.93.11.5466 . ПМК 39269 . ПМИД 8643598 .

[entrez-6] «Ген Энтрез: тройной функциональный домен TRIO (взаимодействие PPTRF)» .

[pmid11146652-7] Белланджер Дж. М., Астье С., Сардет Дж., Ота Ю., Штоссель Т.П., Дебант А. (декабрь 2000 г.). «Rac1- и RhoG-специфичный домен GEF Trio нацелен на филамин, ремоделируя цитоскелетный актин». Природная клеточная биология . 2 (12): 888–92. дои : 10.1038/35046533 . ПМИД 11146652 . S2CID 10182923 .

[pmid10948190-8] Медли QG, Серра-Пажес С, Яннотти Э, Зайпель К, Тан М, О'Брайен С.П., Стреули М (ноябрь 2000 г.). «Фактор обмена триогуаниновых нуклеотидов является мишенью RhoA. Связывание RhoA с трио-иммуноглобулиноподобным доменом» . Журнал биологической химии . 275 (46): 36116–23. дои : 10.1074/jbc.M003775200 . ПМИД 10948190 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)