ТРИБ1

ТРИБ1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	5CEM, 5CEK, 5IGO, 5IGQ
Идентификаторы
Псевдонимы	TRIB1 , C8FW, GIG-2, GIG2, SKIP1, TRB-1, TRB1, псевдокиназа триббла 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 609461 ; МГИ : 2443397 ; Гомологен : 75216 ; GeneCards : TRIB1 ; OMA : TRIB1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 8 (human)
End	125,438,403 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 15 (mouse)
End	59,528,948 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	mucosa of urinary bladder; ; mucosa of sigmoid colon; ; visceral pleura; ; gallbladder; ; mucosa of paranasal sinus; ; tail of epididymis; ; parotid gland; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis; ; kidney tubule; ; thyroid gland;
	Top expressed in
	granulocyte; ; retinal pigment epithelium; ; parotid gland; ; lacrimal gland; ; tail of embryo; ; genital tubercle; ; islet of Langerhans; ; left colon; ; lens; ; lip;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein kinase activity; ubiquitin-protein transferase regulator activity; protein kinase inhibitor activity; transcription factor binding; protein binding; mitogen-activated protein kinase kinase binding; ATP binding; ubiquitin protein ligase binding;
Cellular component	cytoplasm; nucleus;
Biological process	negative regulation of smooth muscle cell proliferation; negative regulation of protein kinase activity; positive regulation of macrophage differentiation; negative regulation of smooth muscle cell migration; negative regulation of DNA-binding transcription factor activity; negative regulation of neutrophil differentiation; negative regulation of lipopolysaccharide-mediated signaling pathway; protein phosphorylation; JNK cascade; response to lipopolysaccharide; positive regulation of eosinophil differentiation; regulation of MAP kinase activity; positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10221
	211770
	ENSG00000173334
	ENSMUSG00000032501
	Q96RU8
	Q8K4K4
	НМ_001282985 ; НМ_025195
	НМ_144549
	НП_001269914 ; НП_079471
	НП_653132
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гомолог 1 Tribbles представляет собой протеинкиназу , которая у человека кодируется TRIB1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Ортологи этой белковой псевдокиназы ( псевдофермента ) можно встретить практически повсеместно во всем животном мире. ^{[ 8 ]} Он осуществляет свои биологические функции посредством связывания с сигнальными белками уровня МАРКК пути МАРК, тем самым выполняя регуляторную роль в функции этого пути, который опосредует пролиферацию, апоптоз и дифференцировку в клетках. Tribbles-1 кодируется геном trib1, который у человека находится на хромосоме 8 в положении 24,13 на самом длинном плече (q). Недавние кристаллические структуры показывают, что Tribbles 1 имеет необычную трехмерную структуру, содержащую «сломанную» область C-спирали, сайт связывания для убиквитинированных субстратов, таких как C/EBPalpha, и ключевую регуляторную область C-хвоста. ^{[ 9 ]} Подобно TRIB2 и TRIB3 , TRIB1 недавно рассматривался как потенциальная мишень для аллостерических лекарств. ^{[ 10 ]}

Функция

Tribbles-1 является одним из трех членов подсемейства Tribbles, которое является частью семейства протеинкиназ CAMK Ser/Thr суперсемейства протеинкиназ. Подсемейство Tribbles является одной из псевдокиназ, а это означает, что, несмотря на экспрессию предполагаемых киназных областей в своей структуре, оно не является каталитическим. У подсемейства Tribbles отсутствует функциональный карман для связывания АТФ, и поэтому они не могут фосфорилировать свои субстраты; вместо этого белки Tribbles действуют как каркасные белки, которые связывают свои субстраты, чтобы локализовать их в соответствии с их функцией или от нее. ^{[ 8 ]}

Экспрессия Tribbles-1 сильно варьирует, постоянно меняется в зависимости от времени и типа клеток. ^{[ 11 ]} что предполагает наличие большого количества регуляции, существующей в клетке. Первичная структура белка содержит область PEST, что указывает на белки, которые очень чувствительны к деградации в клетке; Tribbles-1 играет роль в регулировании собственной экспрессии путем связывания со своим субстратом, который не только выполняет свою функцию на пути MAPK, но также защищает его от деградации во время связывания. Частично это создает петлю положительной обратной связи в функции Триббла-1, поскольку функция Триббла-1 напрямую способствует увеличению его количества. Поскольку петли положительной обратной связи часто наблюдаются в биологии в обстоятельствах, требующих смягчения внешнего стимула, петля положительной обратной связи, демонстрируемая Трибблсом-1, предполагает, что она играет функциональную роль в клеточном ответе.

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000173334 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032501 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Уилкин Ф., Суарес-Уэрта Н., Робай Б., Петерманс Дж., Либерт Ф., Дюмон Х.Е., Мено К. (сентябрь 1997 г.). «Характеристика фосфопротеина, мРНК которого регулируется митогенными путями в клетках щитовидной железы собаки» . Европейский журнал биохимии . 248 (3): 660–8. дои : 10.1111/j.1432-1033.1997.t01-1-00660.x . ПМИД 9342215 .
^ Хегедус З., Цибула А., Кисс-Тот Е. (июль 2006 г.). «Трибблс: новые регуляторы клеточных функций; эволюционные аспекты» . Клеточные и молекулярные науки о жизни . 63 (14): 1632–41. дои : 10.1007/s00018-006-6007-9 . ПМЦ 11136108 . ПМИД 16715410 . S2CID 24556931 .
^ «Ген Энтрез: TRIB1 триблирует гомолог 1 (дрозофила)» .
^ Jump up to: ^а ^б Эйерс П.А., Кишан К., Каннан Н. (апрель 2017 г.). «Трибблс в 21 веке: развивающаяся роль псевдокиназ Трибблс в биологии и заболеваниях» . Тенденции в клеточной биологии . 27 (4): 284–298. дои : 10.1016/j.tcb.2016.11.002 . ПМЦ 5382568 . ПМИД 27908682 .
^ Мерфи Дж.М., Накатани Ю., Джеймисон С.А., Дай В., Люсет И.С., Мейс П.Д. (ноябрь 2015 г.). «Молекулярный механизм рекрутирования белка, связывающего CCAAT-энхансер, с помощью псевдокиназы TRIB1» . Структура 23 (11): 2111–21. дои : 10.1016/j.str.2015.08.017 . ПМИД 26455797 .
^ Фулкс Д.М., Бирн Д.П., Бэйли Ф.П., Эйерс, Пенсильвания (октябрь 2015 г.). «Псевдокиназы Триббла: новые цели для химической биологии и открытия лекарств?». Труды Биохимического общества . 43 (5): 1095–103. дои : 10.1042/BST20150109 . ПМИД 26517930 .
^ Сунг ХИ, Фрэнсис С.Е., Кроссман, округ Колумбия, Кисс-Тот Э. (апрель 2006 г.). «Регуляция экспрессии и модуляторная функция сигнальной системы трибблов млекопитающих зависит от типа клеток». Письма по иммунологии . 104 (1–2): 171–7. дои : 10.1016/j.imlet.2005.11.010 . ПМИД 16364454 .

Дальнейшее чтение

Тан К., Финли Р.Л., Не Д., Хонн К.В. (март 2000 г.). «Идентификация взаимодействия 12-липоксигеназы с клеточными белками методом двухгибридного скрининга дрожжей». Биохимия . 39 (12): 3185–91. дои : 10.1021/bi992664v . ПМИД 10727209 .
Ву М, Сюй Л.Г., Чжай З, Шу Х.Б. (июль 2003 г.). «SINK представляет собой взаимодействующий с p65 негативный регулятор NF-kappaB-зависимой транскрипции» . Журнал биологической химии . 278 (29): 27072–9. дои : 10.1074/jbc.M209814200 . ПМИД 12736262 .
Кисс-Тот Э., Бэгстафф С.М., Сунг Х.И., Джожа В., Демпси С., Каунт Дж.К. и др. (октябрь 2004 г.). «Человеческие трибблы, семейство белков, контролирующих митоген-активируемые протеинкиназные каскады» . Журнал биологической химии . 279 (41): 42703–8. дои : 10.1074/jbc.M407732200 . hdl : 2262/33449 . ПМИД 15299019 .
Сюй С, Чжан Дж, Хуан X, Сунь Дж, Сюй Ю, Тан Ю и др. (июнь 2006 г.). «Структура раствора белка 1, подобного пептидилпролилизомеразе человека, и понимание его взаимодействия со SKIP» . Журнал биологической химии . 281 (23): 15900–8. дои : 10.1074/jbc.M511155200 . ПМИД 16595688 .
Сун Х.И., Гуан Х., Цибула А., Кинг А.Р., Эдер К., Хит Э. и др. (июнь 2007 г.). «Человеческий триббл-1 контролирует пролиферацию и хемотаксис гладкомышечных клеток через сигнальные пути МАРК» . Журнал биологической химии . 282 (25): 18379–87. дои : 10.1074/jbc.M610792200 . ПМК 2366084 . ПМИД 17452330 .

Внешние ссылки

TRIB1 Расположение гена человека в браузере генома UCSC .
Подробности о гене человека TRIB1 в браузере генома UCSC .

Эта статья о гене человека й хромосомы незавершена 8 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000173334 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032501 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9342215-5] Уилкин Ф., Суарес-Уэрта Н., Робай Б., Петерманс Дж., Либерт Ф., Дюмон Х.Е., Мено К. (сентябрь 1997 г.). «Характеристика фосфопротеина, мРНК которого регулируется митогенными путями в клетках щитовидной железы собаки» . Европейский журнал биохимии . 248 (3): 660–8. дои : 10.1111/j.1432-1033.1997.t01-1-00660.x . ПМИД 9342215 .

[pmid16715410-6] Хегедус З., Цибула А., Кисс-Тот Е. (июль 2006 г.). «Трибблс: новые регуляторы клеточных функций; эволюционные аспекты» . Клеточные и молекулярные науки о жизни . 63 (14): 1632–41. дои : 10.1007/s00018-006-6007-9 . ПМЦ 11136108 . ПМИД 16715410 . S2CID 24556931 .

[entrez-7] «Ген Энтрез: TRIB1 триблирует гомолог 1 (дрозофила)» .

[pmid27908682-8] Jump up to: ^а ^б Эйерс П.А., Кишан К., Каннан Н. (апрель 2017 г.). «Трибблс в 21 веке: развивающаяся роль псевдокиназ Трибблс в биологии и заболеваниях» . Тенденции в клеточной биологии . 27 (4): 284–298. дои : 10.1016/j.tcb.2016.11.002 . ПМЦ 5382568 . ПМИД 27908682 .

[pmid26455797-9] Мерфи Дж.М., Накатани Ю., Джеймисон С.А., Дай В., Люсет И.С., Мейс П.Д. (ноябрь 2015 г.). «Молекулярный механизм рекрутирования белка, связывающего CCAAT-энхансер, с помощью псевдокиназы TRIB1» . Структура 23 (11): 2111–21. дои : 10.1016/j.str.2015.08.017 . ПМИД 26455797 .

[pmid26517930-10] Фулкс Д.М., Бирн Д.П., Бэйли Ф.П., Эйерс, Пенсильвания (октябрь 2015 г.). «Псевдокиназы Триббла: новые цели для химической биологии и открытия лекарств?». Труды Биохимического общества . 43 (5): 1095–103. дои : 10.1042/BST20150109 . ПМИД 26517930 .

[pmid16364454-11] Сунг ХИ, Фрэнсис С.Е., Кроссман, округ Колумбия, Кисс-Тот Э. (апрель 2006 г.). «Регуляция экспрессии и модуляторная функция сигнальной системы трибблов млекопитающих зависит от типа клеток». Письма по иммунологии . 104 (1–2): 171–7. дои : 10.1016/j.imlet.2005.11.010 . ПМИД 16364454 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

v т и Ферменты
Активность	Активный сайт Связывающий сайт Каталитическая триада Оксианионная дырка Ферментная распущенность Фермент, ограниченный диффузией Кофактор Ферментативный катализ
Регулирование	Аллостерическая регуляция Кооперативность Ингибитор ферментов Активатор ферментов
Классификация	Номер ЕС Суперсемейство ферментов Семейство ферментов Список ферментов
Кинетика	Кинетика ферментов Диаграмма Иди – Хофсти Заговор Хейнса – Вульфа График Лайнуивера – Берка Кинетика Михаэлиса – Ментен
Типы	EC1 Оксидоредуктазы ( список ) EC2 Трансферазы ( список ) EC3 Гидролазы ( список ) EC4- лиазы ( список ) EC5 Изомеразы ( список ) EC6- лигазы ( список ) EC7 Транслоказы ( список )