ПДК4

ПДК4
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2E0A, 2ZDX, 2ZDY, 2ZKJ, 3D2R
Идентификаторы
Псевдонимы	PDK4 , киназа 4 пируватдегидрогеназы
Внешние идентификаторы	Опустить : 602527 ; МГИ : 1351481 ; Гомологен : 129720 ; Генные карты : PDK4 ; ОМА : PDK4 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 7 (human)
End	95,596,516 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 6 (mouse)
End	5,496,309 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	seminal vesicula; ; gastric mucosa; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis; ; muscle of thigh; ; pericardium; ; right ventricle; ; right lung; ; thoracic diaphragm; ; left adrenal cortex; ; tibialis anterior muscle;
	Top expressed in
	muscle of thigh; ; intercostal muscle; ; soleus muscle; ; sternocleidomastoid muscle; ; digastric muscle; ; myocardium of ventricle; ; plantaris muscle; ; temporal muscle; ; triceps brachii muscle; ; thoracic diaphragm;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	transferase activity; nucleotide binding; protein kinase activity; kinase activity; ATP binding; pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) kinase activity;
Cellular component	mitochondrial matrix; mitochondrion;
Biological process	insulin receptor signaling pathway; glucose homeostasis; regulation of fatty acid oxidation; phosphorylation; cellular response to starvation; regulation of acetyl-CoA biosynthetic process from pyruvate; regulation of fatty acid biosynthetic process; reactive oxygen species metabolic process; regulation of cellular ketone metabolic process; regulation of glucose metabolic process; cellular response to fatty acid; glucose metabolic process; response to starvation; regulation of bone resorption; negative regulation of anoikis; regulation of pH; protein phosphorylation; carbohydrate metabolic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5166
	27273
	ENSG00000004799
	ENSMUSG00000019577
	Q16654
	О70571
	НМ_002612
	НМ_013743
	НП_002603
	НП_038771
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Пируватдегидрогеназа, изозим 4 липоамидкиназы, митохондриальная (PDK4) представляет собой фермент , который у человека кодируется PDK4 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Он кодирует изофермент пируватдегидрогеназы киназы .

Этот ген является членом семейства протеинкиназ PDK/BCKDK и кодирует митохондриальный белок с гистидинкиназным доменом. Этот белок расположен в матриксе митохондрий и ингибирует комплекс пируватдегидрогеназы путем фосфорилирования одной из его субъединиц, уменьшая превращение пирувата , образующегося в результате окисления глюкозы и аминокислот , в ацетил-КоА и способствуя регуляции. метаболизма глюкозы . Экспрессия этого гена регулируется глюкокортикоидами , ретиноевой кислотой и инсулином . ^{[ 6 ]} Уровень PDK4 увеличивается во время спячки и помогает снизить метаболизм и сохранить глюкозу за счет уменьшения ее превращения в ацетил-КоА, который входит в цикл лимонной кислоты и превращается в АТФ . ^{[ 7 ]}

Структура

Зрелый белок, кодируемый геном PDK4 , содержит в своей последовательности 294 аминокислоты. Для образования активного белка две полипептидные цепи объединяются, образуя открытую конформацию. ^{[ 6 ]} В частности, две субъединицы собираются вместе, образуя нуклеотидсвязывающий карман; этот карман чаще всего подвергается воздействию ингибиторов. ^{[ 8 ]}

Функция

Комплекс пируватдегидрогеназы (ПДГ) должен строго регулироваться из-за его центральной роли в общем метаболизме. Внутри комплекса имеются три остатка серина на компоненте Е1, которые являются сайтами фосфорилирования; это фосфорилирование инактивирует комплекс. Было показано , что у людей существует четыре изозима киназы пируватдегидрогеназы, которые фосфорилируют эти три сайта: PDK1 , PDK2 , PDK3 и PDK4. PDK4 не включает наибольшее количество фосфатных групп на каталитическое событие, поскольку он может фосфорилировать только сайт 1 и сайт 2; его скорость фосфорилирования меньше, чем у PDK1, равна PDK3 и больше, чем у PDK2. Когда тиаминпирофосфата (TPP) связывается кофермент , скорость фосфорилирования всеми четырьмя изоферментами резко изменяется. Участок 1 пострадал больше всего, при этом уровень заболеваемости значительно снизился. Однако на общую активность PDK4 это не влияет. ^{[ 9 ]}

Регулирование

Семейство пируватдегидрогеназ, являющееся первичными регуляторами решающего этапа центрального метаболического пути, жестко регулируется множеством факторов, включая факторы транскрипции Sp1 и фактор связывания бокса CCAAT (CBF). Ретиноевая кислота усиливает транскрипцию PDK4 , позволяя членам семейства рецепторов ретиноевой кислоты рекрутировать коактиваторы транскрипции к элементам ответа на ретиноевую кислоту (RARE) в промоторе PDK4 . Транскрипция также увеличивается за счет ингибирования ингибирующей деацетилазы гистонов (HDAC) с помощью трихостатина А (TSA). ^{[ 10 ]} Росиглитазон , тиазолидиндион, который, как известно, активирует путь биогенеза глицерина , увеличивает PDK4 транскрипцию мРНК в белой жировой ткани , но не в печени или мышечной ткани. ^{[ 11 ]} Рецептор фарнезоида X , или FXR, подавляет гликолиз и усиливает окисление жирных кислот за счет увеличения экспрессии PDK4 и инактивации комплекса PDH. ^{[ 12 ]} Другие факторы, такие как инсулин , напрямую подавляют транскрипцию мРНК PDK2 и PDK4 . Это осуществляется посредством предполагаемого пути, зависимого от фосфатидилинозитол-3-киназы (PI3K). Фактически, даже когда клетки подвергаются воздействию дексаметазона для увеличения экспрессии мРНК, инсулин блокирует этот эффект. ^{[ 13 ]} Рецепторы, активируемые пролифератором пероксисом, также регулируют экспрессию; Было обнаружено, что PPAR альфа и дельта повышают регуляцию мРНК PDK4 , но активация гамма-PPAR подавляет экспрессию. ^{[ 14 ]}

Клиническое значение

PDK4 актуален при различных клинических состояниях. Кратковременное голодание вызывает увеличение транскрипции PDK4 примерно в 10 раз. ^{[ 15 ]} После возобновления питания транскрипция PDK4 еще больше увеличилась, что является удивительной перспективой, примерно в 50 раз по сравнению с уровнями, существовавшими до начала голодания. ^{[ 16 ]} Этот эффект можно наблюдать и в долгосрочной перспективе. PDK4 сверхэкспрессируется в скелетных мышцах при диабете 2 типа , что приводит к нарушению утилизации глюкозы. ^{[ 17 ]} У пациентов с ожирением наблюдается значительное снижение экспрессии мРНК PDK4 в сочетании с повышенным поглощением глюкозы; вероятно, это связано с подавлением инсулином PDK4. Это подтверждает концепцию о том, что пониженная доступность свободных жирных кислот влияет на метаболизм глюкозы посредством регуляции комплекса ПДГ. ^{[ 18 ]} Фактически было показано, что недостаточное подавление мРНК PDK у инсулинорезистентных людей может быть причиной повышенной экспрессии PDK, приводящей к нарушению окисления глюкозы с последующим усилением окисления жирных кислот. ^{[ 19 ]}

Было доказано, что физические упражнения также вызывают изменения в этом гене, и что временные изменения могут иметь кумулятивный эффект на протяжении многих тренировок. МРНК PDK4 вместе с PPARGC1A увеличивается в обоих типах мышечной ткани после тренировки. ^{[ 20 ]}^{[ 21 ]}

Эти метаболические эффекты можно увидеть и в других условиях. гипоксия Показано, что индуцирует экспрессию гена PDK4 посредством гамма-механизма ERR . ^{[ 22 ]} И наоборот, во время сердечной недостаточности уровень PDK4 снижается в ткани сердечной мышцы. ^{[ 23 ]}

Рак

Повсеместная роль этого гена позволяет участвовать в различных патологиях, включая рак. Один метаболит, бутират , индуцирует гиперацетилирование гистонов вокруг гена PDK4 . Это связано с более высоким уровнем транскрипции мРНК PDK4 , тем самым обращая вспять подавление PDK4 в клетках карциномы толстой кишки. В клетках рака толстой кишки человека нацеливание и инактивация комплекса ПДГ ограничивает скорость метаболизма и регулирует глутамина , тем самым частично ингибируя рост клеток. метаболизм ^{[ 24 ]} Однако также было показано, что PDK4 способствует генезу и пролиферации опухолей через другой путь: сигнальный каскад CREB - RHEB - mTORC1 . ^{[ 25 ]}

Интерактивная карта маршрутов

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы перейти к соответствующим статьям. ^{[ § 1 ]}

[[Файл:

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

|alt=TCACycle_WP78 редактировать ]]

TCACycle_WP78 редактировать

^ Интерактивную карту маршрутов можно редактировать на WikiPathways: «TCACycle_WP78» .

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000004799 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019577 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Гуди Р., Боукер-Кинли М.М., Кедишвили Н.Ю., Чжао Ю., Попов К.М. (декабрь 1995 г.). «Разнообразие семейства генов киназы пируватдегидрогеназы у человека» . Журнал биологической химии . 270 (48): 28989–94. дои : 10.1074/jbc.270.48.28989 . ПМИД 7499431 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с «Ген Энтрез: киназа пируватдегидрогеназы PDK4, изофермент 4» .
^ Эндрюс М.Т., Сквайр Т.Л., Боуэн К.М., Роллинз М.Б. (июль 1998 г.). «Утилизация углерода при низких температурах регулируется новой активностью генов в сердце спящего млекопитающего» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (14): 8392–7. Бибкод : 1998PNAS...95.8392A . дои : 10.1073/pnas.95.14.8392 . ЧВК 20986 . ПМИД 9653197 .
^ Кукимото-Ниино М., Токмаков А., Терада Т., Обаяси Н., Фудзимото Т., Гоми С., Широмидзу И., Кавамото М., Мацусуэ Т., Ширузу М., Ёкояма С. (сентябрь 2011 г.). «Ингибитор-связанные структуры киназы 4 пируватдегидрогеназы человека». Acta Crystallographica Раздел D. 67 (Часть 9): 763–73. дои : 10.1107/S090744491102405X . ПМИД 21904029 .
^ Колобова Е., Туганова А., Булатников И., Попов К.М. (август 2001 г.). «Регуляция активности пируватдегидрогеназы посредством фосфорилирования во многих сайтах» . Биохимический журнал . 358 (Часть 1): 69–77. дои : 10.1042/0264-6021:3580069 . ПМК 1222033 . ПМИД 11485553 .
^ Квон Х.С., Хуан Б., Хо Чжон Н., Ву П., Стейсси К.Н., Харрис Р.А. (2006). «Ретиноевые кислоты и трихостатин А (TSA), ингибитор гистондеацетилазы, индуцируют экспрессию гена киназы 4 пируватдегидрогеназы человека (PDK4)». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1759 (3–4): 141–51. дои : 10.1016/j.bbaexp.2006.04.005 . ПМИД 16757381 .
^ Кадудал Т., Дистел Э., Дюрант С., Фуке Ф., Блуэн Ж.М., Коллине М., Бортоли С., Форест К., Бенелли К. (сентябрь 2008 г.). «Киназа пируватдегидрогеназы 4: регуляция тиазолидиндионами и участие в глицеронеогенезе в жировой ткани» . Диабет . 57 (9): 2272–9. дои : 10.2337/db08-0477 . ПМК 2518477 . ПМИД 18519799 .
^ Савкур Р.С., Брамлетт К.С., Майкл Л.Ф., Беррис Т.П. (апрель 2005 г.). «Регуляция экспрессии киназы пируватдегидрогеназы с помощью рецептора фарнезоида X». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 329 (1): 391–6. дои : 10.1016/j.bbrc.2005.01.141 . ПМИД 15721319 .
^ Квон Х.С., Хуан Б., Унтерман Т.Г., Харрис Р.А. (апрель 2004 г.). «Протеинкиназа B-альфа ингибирует индукцию гена киназы-4 пируватдегидрогеназы человека дексаметазоном посредством инактивации факторов транскрипции FOXO» . Диабет . 53 (4): 899–910. дои : 10.2337/диабет.53.4.899 . ПМИД 15047604 .
^ Эббот Э.Л., МакКормак Дж.Г., Рейнет С., Хассал Д.Г., Бьюкен К.В., Йеман С.Дж. (июнь 2005 г.). «Различная регуляция экспрессии гена изоформы киназы пируватдегидрогеназы в культивируемых мышечных клетках человека» . Журнал ФЭБС . 272 (12): 3004–14. дои : 10.1111/j.1742-4658.2005.04713.x . ПМИД 15955060 . S2CID 21366281 .
^ Сприет Л.Л., Танстолл Р.Дж., Уотт М.Дж., Механ К.А., Харгривз М., Кэмерон-Смит Д. (июнь 2004 г.). «Активация пируватдегидрогеназы и экспрессия киназы в скелетных мышцах человека во время голодания». Журнал прикладной физиологии . 96 (6): 2082–7. doi : 10.1152/japplphysicalol.01318.2003 . ПМИД 14966024 . S2CID 13601849 .
^ Пилегаард Х., Салтин Б., Нойфер П.Д. (март 2003 г.). «Влияние кратковременного голодания и возобновления питания на регуляцию транскрипции метаболических генов в скелетных мышцах человека» . Диабет . 52 (3): 657–62. дои : 10.2337/диабет.52.3.657 . ПМИД 12606505 .
^ Винн Р.М., Като М., Чуанг Дж.Л., Цо С.К., Ли Дж., Чуанг Д.Т. (сентябрь 2008 г.). «Структуры киназы-4 пируватдегидрогеназы обнаруживают метастабильную открытую конформацию, способствующую устойчивой базальной активности без ядра» . Журнал биологической химии . 283 (37): 25305–15. дои : 10.1074/jbc.M802249200 . ПМЦ 2533096 . ПМИД 18658136 .
^ Роза Дж., Ди Рокко П., Манко М., Греко А.В., Кастаньето М., Видал Х., Мингроне Дж. (февраль 2003 г.). «Снижение экспрессии PDK4 связано с повышенной чувствительностью к инсулину у пациентов с ожирением» . Исследования ожирения . 11 (2): 176–82. дои : 10.1038/oby.2003.28 . ПМИД 12582211 .
^ Майер М., Попов К.М., Харрис Р.А., Богардус С., Прохазка М. (октябрь 1998 г.). «Инсулин подавляет мРНК киназы пируватдегидрогеназы (PDK): потенциальный механизм, способствующий усилению окисления липидов у инсулинорезистентных субъектов» . Молекулярная генетика и обмен веществ . 65 (2): 181–6. дои : 10.1006/mgme.1998.2748 . ПМИД 9787110 .
^ Пилегаард Х., Ордуэй Г.А., Салтин Б., Нойфер П.Д. (октябрь 2000 г.). «Транкрипционная регуляция экспрессии генов в скелетных мышцах человека во время восстановления после тренировки». Американский журнал физиологии. Эндокринология и обмен веществ . 279 (4): Е806-14. дои : 10.1152/ajpendo.2000.279.4.e806 . ПМИД 11001762 . S2CID 1008940 .
^ Ван Л., Сахлин К. (апрель 2012 г.). «Влияние непрерывных и интервальных упражнений на мРНК PGC-1α и PDK4 в волокнах типа I и типа II скелетных мышц человека». Акта Физиологика . 204 (4): 525–32. дои : 10.1111/j.1748-1716.2011.02354.x . ПМИД 21883960 . S2CID 13208033 .
^ Ли Дж.Х., Ким Э.Дж., Ким Д.К., Ли Дж.М., Пак С.Б., Ли И.К., Харрис Р.А., Ли МО, Чой Х.С. (2012). «Гипоксия индуцирует экспрессию гена PDK4 посредством индукции сиротского ядерного рецептора ERRγ» . ПЛОС ОДИН . 7 (9): e46324. Бибкод : 2012PLoSO...746324L . дои : 10.1371/journal.pone.0046324 . ПМЦ 3457976 . ПМИД 23050013 .
^ Разеги П., Янг М.Э., Инь Дж., Депре С., Урай И.П., Колесар Дж., Шипли Г.Л., Моравец К.С., Дэвис П.Дж., Фрейзер О.Г., Тэгтмейер Х. (2002). «Понижение экспрессии метаболических генов при недостаточности человеческого сердца до и после механической разгрузки». Кардиология . 97 (4): 203–9. дои : 10.1159/000063122 . ПМИД 12145475 . S2CID 46861699 .
^ Блуэн Ж.М., Пено Дж., Коллине М., Накфер М., Форест С., Лоран-Пуч П., Кумуль Х., Баруки Р., Бенелли С., Бортоли С. (июнь 2011 г.). «Бутират вызывает метаболическое переключение в клетках рака толстой кишки человека, воздействуя на комплекс пируватдегидрогеназы» . Международный журнал рака . 128 (11): 2591–601. дои : 10.1002/ijc.25599 . ПМИД 20715114 . S2CID 27407499 .
^ Лю Цз, Чен X, Ван Ю, Пэн Х, Ван Ю, Цзин Ю, Чжан Х (октябрь 2014 г.). «Белок PDK4 способствует онкогенезу посредством активации белка, связывающего элементы ответа цАМФ (CREB) - гомолога Ras, обогащенного сигнальным каскадом мозга (RHEB)-mTORC1» . Журнал биологической химии . 289 (43): 29739–49. дои : 10.1074/jbc.M114.584821 . ПМК 4207987 . ПМИД 25164809 .

Дальнейшее чтение

Сагден MC, Холнесс MJ (май 2003 г.). «Последние достижения в механизмах регуляции окисления глюкозы на уровне комплекса пируватдегидрогеназы с помощью PDK». Американский журнал физиологии. Эндокринология и обмен веществ . 284 (5): E855–62. дои : 10.1152/ajpendo.00526.2002 . ПМИД 12676647 .
Квон Х.С., Харрис Р.А. (2005). «Механизмы, ответственные за регуляцию экспрессии гена киназы 4 пируватдегидрогеназы». Достижения в регуляции ферментов . 44 : 109–21. дои : 10.1016/j.advenzreg.2003.11.020 . ПМИД 15581486 .
Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Роулз Дж., Шерер С.В., Си Т., Майер М., Никл Д.С., Ромменс Дж.М., Попов К.М., Харрис Р.А., Рибоу Н.Л., Ся Дж., Цуй Л.К., Богардус С., Прохазка М. (сентябрь 1996 г.). «Клонирование и характеристика PDK4 на 7q21.3, кодирующем четвертый изофермент киназы пируватдегидрогеназы у человека» . Журнал биологической химии . 271 (37): 22376–82. дои : 10.1074/jbc.271.37.22376 . ПМИД 8798399 .
Сузуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Майер М., Попов К.М., Харрис Р.А., Богардус С., Прохазка М. (октябрь 1998 г.). «Инсулин подавляет мРНК киназы пируватдегидрогеназы (PDK): потенциальный механизм, способствующий усилению окисления липидов у инсулинорезистентных субъектов» . Молекулярная генетика и обмен веществ . 65 (2): 181–6. дои : 10.1006/mgme.1998.2748 . ПМИД 9787110 .
Пилегаард Х., Ордуэй Г.А., Салтин Б., Нойфер П.Д. (октябрь 2000 г.). «Транкрипционная регуляция экспрессии генов в скелетных мышцах человека во время восстановления после тренировки». Американский журнал физиологии. Эндокринология и обмен веществ . 279 (4): E806–14. дои : 10.1152/ajpendo.2000.279.4.e806 . ПМИД 11001762 . S2CID 1008940 .
Колобова Е., Туганова А., Булатников И., Попов К.М. (август 2001 г.). «Регуляция активности пируватдегидрогеназы посредством фосфорилирования во многих сайтах» . Биохимический журнал . 358 (Часть 1): 69–77. дои : 10.1042/0264-6021:3580069 . ПМК 1222033 . ПМИД 11485553 .
Корочкина Л.Г., Патель М.С. (октябрь 2001 г.). «Сайт-специфичность четырех изоферментов киназы пируватдегидрогеназы по отношению к трем сайтам фосфорилирования пируватдегидрогеназы человека» . Журнал биологической химии . 276 (40): 37223–9. дои : 10.1074/jbc.M103069200 . ПМИД 11486000 .
Петерс С.Дж., Харрис Р.А., Ву П., Пелеман Т.Л., Хайгенхаузер Г.Дж., Сприет Л.Л. (декабрь 2001 г.). «Активность киназы PDH скелетных мышц человека и экспрессия изоформы во время трехдневной диеты с высоким содержанием жиров и низким содержанием углеводов». Американский журнал физиологии. Эндокринология и обмен веществ . 281 (6): E1151–8. дои : 10.1152/ajpendo.2001.281.6.e1151 . ПМИД 11701428 . S2CID 22798857 .
Туганова А, Булатников И, Попов КМ (август 2002 г.). «Взаимодействие между отдельными изоферментами киназы пируватдегидрогеназы и внутренним липоилсодержащим доменом трансацетилазного компонента пируватдегидрогеназного комплекса» . Биохимический журнал . 366 (Часть 1): 129–36. дои : 10.1042/BJ20020301 . ПМЦ 1222743 . ПМИД 11978179 .
Разеги П., Янг М.Э., Инь Дж., Депре С., Урай И.П., Колесар Дж., Шипли Г.Л., Моравец К.С., Дэвис П.Дж., Фрейзер О.Г., Тэгтмейер Х. (2002). «Понижение экспрессии метаболических генов при недостаточности человеческого сердца до и после механической разгрузки». Кардиология . 97 (4): 203–9. дои : 10.1159/000063122 . ПМИД 12145475 . S2CID 46861699 .
Булатников И., Попов К.М. (февраль 2003 г.). «Образование функциональных гетеродимеров изоферментами 1 и 2 киназы пируватдегидрогеназы». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Белки и протеомика . 1645 (2): 183–92. дои : 10.1016/S1570-9639(02)00542-3 . ПМИД 12573248 .
Роза Дж., Ди Рокко П., Манко М., Греко А.В., Кастаньето М., Видал Х., Мингроне Дж. (февраль 2003 г.). «Снижение экспрессии PDK4 связано с повышенной чувствительностью к инсулину у пациентов с ожирением» . Исследования ожирения . 11 (2): 176–82. дои : 10.1038/oby.2003.28 . ПМИД 12582211 .
Пилегаард Х., Салтин Б., Нойфер П.Д. (март 2003 г.). «Влияние кратковременного голодания и возобновления питания на регуляцию транскрипции метаболических генов в скелетных мышцах человека» . Диабет . 52 (3): 657–62. дои : 10.2337/диабет.52.3.657 . ПМИД 12606505 .

[WikiPathways-26] Интерактивную карту маршрутов можно редактировать на WikiPathways: «TCACycle_WP78» .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000004799 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019577 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7499431-5] Гуди Р., Боукер-Кинли М.М., Кедишвили Н.Ю., Чжао Ю., Попов К.М. (декабрь 1995 г.). «Разнообразие семейства генов киназы пируватдегидрогеназы у человека» . Журнал биологической химии . 270 (48): 28989–94. дои : 10.1074/jbc.270.48.28989 . ПМИД 7499431 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б ^с «Ген Энтрез: киназа пируватдегидрогеназы PDK4, изофермент 4» .

[pmid9653197-7] Эндрюс М.Т., Сквайр Т.Л., Боуэн К.М., Роллинз М.Б. (июль 1998 г.). «Утилизация углерода при низких температурах регулируется новой активностью генов в сердце спящего млекопитающего» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (14): 8392–7. Бибкод : 1998PNAS...95.8392A . дои : 10.1073/pnas.95.14.8392 . ЧВК 20986 . ПМИД 9653197 .

[8] Кукимото-Ниино М., Токмаков А., Терада Т., Обаяси Н., Фудзимото Т., Гоми С., Широмидзу И., Кавамото М., Мацусуэ Т., Ширузу М., Ёкояма С. (сентябрь 2011 г.). «Ингибитор-связанные структуры киназы 4 пируватдегидрогеназы человека». Acta Crystallographica Раздел D. 67 (Часть 9): 763–73. дои : 10.1107/S090744491102405X . ПМИД 21904029 .

[9] Колобова Е., Туганова А., Булатников И., Попов К.М. (август 2001 г.). «Регуляция активности пируватдегидрогеназы посредством фосфорилирования во многих сайтах» . Биохимический журнал . 358 (Часть 1): 69–77. дои : 10.1042/0264-6021:3580069 . ПМК 1222033 . ПМИД 11485553 .

[10] Квон Х.С., Хуан Б., Хо Чжон Н., Ву П., Стейсси К.Н., Харрис Р.А. (2006). «Ретиноевые кислоты и трихостатин А (TSA), ингибитор гистондеацетилазы, индуцируют экспрессию гена киназы 4 пируватдегидрогеназы человека (PDK4)». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1759 (3–4): 141–51. дои : 10.1016/j.bbaexp.2006.04.005 . ПМИД 16757381 .

[11] Кадудал Т., Дистел Э., Дюрант С., Фуке Ф., Блуэн Ж.М., Коллине М., Бортоли С., Форест К., Бенелли К. (сентябрь 2008 г.). «Киназа пируватдегидрогеназы 4: регуляция тиазолидиндионами и участие в глицеронеогенезе в жировой ткани» . Диабет . 57 (9): 2272–9. дои : 10.2337/db08-0477 . ПМК 2518477 . ПМИД 18519799 .

[12] Савкур Р.С., Брамлетт К.С., Майкл Л.Ф., Беррис Т.П. (апрель 2005 г.). «Регуляция экспрессии киназы пируватдегидрогеназы с помощью рецептора фарнезоида X». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 329 (1): 391–6. дои : 10.1016/j.bbrc.2005.01.141 . ПМИД 15721319 .

[13] Квон Х.С., Хуан Б., Унтерман Т.Г., Харрис Р.А. (апрель 2004 г.). «Протеинкиназа B-альфа ингибирует индукцию гена киназы-4 пируватдегидрогеназы человека дексаметазоном посредством инактивации факторов транскрипции FOXO» . Диабет . 53 (4): 899–910. дои : 10.2337/диабет.53.4.899 . ПМИД 15047604 .

[14] Эббот Э.Л., МакКормак Дж.Г., Рейнет С., Хассал Д.Г., Бьюкен К.В., Йеман С.Дж. (июнь 2005 г.). «Различная регуляция экспрессии гена изоформы киназы пируватдегидрогеназы в культивируемых мышечных клетках человека» . Журнал ФЭБС . 272 (12): 3004–14. дои : 10.1111/j.1742-4658.2005.04713.x . ПМИД 15955060 . S2CID 21366281 .

[15] Сприет Л.Л., Танстолл Р.Дж., Уотт М.Дж., Механ К.А., Харгривз М., Кэмерон-Смит Д. (июнь 2004 г.). «Активация пируватдегидрогеназы и экспрессия киназы в скелетных мышцах человека во время голодания». Журнал прикладной физиологии . 96 (6): 2082–7. doi : 10.1152/japplphysicalol.01318.2003 . ПМИД 14966024 . S2CID 13601849 .

[16] Пилегаард Х., Салтин Б., Нойфер П.Д. (март 2003 г.). «Влияние кратковременного голодания и возобновления питания на регуляцию транскрипции метаболических генов в скелетных мышцах человека» . Диабет . 52 (3): 657–62. дои : 10.2337/диабет.52.3.657 . ПМИД 12606505 .

[17] Винн Р.М., Като М., Чуанг Дж.Л., Цо С.К., Ли Дж., Чуанг Д.Т. (сентябрь 2008 г.). «Структуры киназы-4 пируватдегидрогеназы обнаруживают метастабильную открытую конформацию, способствующую устойчивой базальной активности без ядра» . Журнал биологической химии . 283 (37): 25305–15. дои : 10.1074/jbc.M802249200 . ПМЦ 2533096 . ПМИД 18658136 .

[18] Роза Дж., Ди Рокко П., Манко М., Греко А.В., Кастаньето М., Видал Х., Мингроне Дж. (февраль 2003 г.). «Снижение экспрессии PDK4 связано с повышенной чувствительностью к инсулину у пациентов с ожирением» . Исследования ожирения . 11 (2): 176–82. дои : 10.1038/oby.2003.28 . ПМИД 12582211 .

[19] Майер М., Попов К.М., Харрис Р.А., Богардус С., Прохазка М. (октябрь 1998 г.). «Инсулин подавляет мРНК киназы пируватдегидрогеназы (PDK): потенциальный механизм, способствующий усилению окисления липидов у инсулинорезистентных субъектов» . Молекулярная генетика и обмен веществ . 65 (2): 181–6. дои : 10.1006/mgme.1998.2748 . ПМИД 9787110 .

[20] Пилегаард Х., Ордуэй Г.А., Салтин Б., Нойфер П.Д. (октябрь 2000 г.). «Транкрипционная регуляция экспрессии генов в скелетных мышцах человека во время восстановления после тренировки». Американский журнал физиологии. Эндокринология и обмен веществ . 279 (4): Е806-14. дои : 10.1152/ajpendo.2000.279.4.e806 . ПМИД 11001762 . S2CID 1008940 .

[21] Ван Л., Сахлин К. (апрель 2012 г.). «Влияние непрерывных и интервальных упражнений на мРНК PGC-1α и PDK4 в волокнах типа I и типа II скелетных мышц человека». Акта Физиологика . 204 (4): 525–32. дои : 10.1111/j.1748-1716.2011.02354.x . ПМИД 21883960 . S2CID 13208033 .

[22] Ли Дж.Х., Ким Э.Дж., Ким Д.К., Ли Дж.М., Пак С.Б., Ли И.К., Харрис Р.А., Ли МО, Чой Х.С. (2012). «Гипоксия индуцирует экспрессию гена PDK4 посредством индукции сиротского ядерного рецептора ERRγ» . ПЛОС ОДИН . 7 (9): e46324. Бибкод : 2012PLoSO...746324L . дои : 10.1371/journal.pone.0046324 . ПМЦ 3457976 . ПМИД 23050013 .

[23] Разеги П., Янг М.Э., Инь Дж., Депре С., Урай И.П., Колесар Дж., Шипли Г.Л., Моравец К.С., Дэвис П.Дж., Фрейзер О.Г., Тэгтмейер Х. (2002). «Понижение экспрессии метаболических генов при недостаточности человеческого сердца до и после механической разгрузки». Кардиология . 97 (4): 203–9. дои : 10.1159/000063122 . ПМИД 12145475 . S2CID 46861699 .

[24] Блуэн Ж.М., Пено Дж., Коллине М., Накфер М., Форест С., Лоран-Пуч П., Кумуль Х., Баруки Р., Бенелли С., Бортоли С. (июнь 2011 г.). «Бутират вызывает метаболическое переключение в клетках рака толстой кишки человека, воздействуя на комплекс пируватдегидрогеназы» . Международный журнал рака . 128 (11): 2591–601. дои : 10.1002/ijc.25599 . ПМИД 20715114 . S2CID 27407499 .

[25] Лю Цз, Чен X, Ван Ю, Пэн Х, Ван Ю, Цзин Ю, Чжан Х (октябрь 2014 г.). «Белок PDK4 способствует онкогенезу посредством активации белка, связывающего элементы ответа цАМФ (CREB) - гомолога Ras, обогащенного сигнальным каскадом мозга (RHEB)-mTORC1» . Журнал биологической химии . 289 (43): 29739–49. дои : 10.1074/jbc.M114.584821 . ПМК 4207987 . ПМИД 25164809 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ § 1 ]