Протеинкиназа R
| ЭИФ2АК2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | EIF2AK2 , PKR, PPP1R83, PRKR, эукариотический фактор инициации трансляции 2, альфа-киназа 2, LEUDEN, DYT33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Опустить : 176871 ; МГИ : 1353449 ; Гомологен : 48134 ; Генные карты : EIF2AK2 ; ОМА : EIF2AK2 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Номер ЕС | 2.7.10.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Протеинкиназа РНК-активируемая, также известная как протеинкиназа R ( PKR ), интерферон-индуцированная двухцепочечная РНК-активируемая протеинкиназа или эукариотический фактор инициации трансляции 2-альфа-киназа 2 ( EIF2AK2 ) представляет собой фермент , который у человека кодируется ген EIF2AK2 на хромосоме 2 . [ 5 ] [ 6 ] PKR представляет собой серин/тирозинкиназу длиной 551 аминокислоту. [ 7 ]
PKR индуцируется различными механизмами стресса и защищает от вирусных инфекций . [ 8 ] Он также играет роль в нескольких сигнальных путях. [ 9 ] [ 10 ]
Механизм действия
[ редактировать ]Протеинкиназа-R активируется двухцепочечной РНК (дцРНК), введенной в клетки вирусной инфекцией. [ 9 ] В ситуациях вирусной инфекции дсРНК, созданная в результате репликации вируса и экспрессии генов, связывается с N-концевым доменом, активируя белок. [ 9 ] Активация PKR посредством дцРНК зависит от длины, поэтому для связывания с молекулами PKR требуется, чтобы дсРНК имела длину 30 п.о. [ 9 ] Однако избыток дцРНК может снизить активацию PKR. [ 9 ] Считается, что связывание с дцРНК активирует PKR, индуцируя димеризацию киназных доменов и последующие реакции аутофосфорилирования . [ 9 ] PKR также может быть активирован белком PACT посредством фосфорилирования S287 в его домене M3. [ 11 ] Промоторная область PKR содержит элементы стимулируемого интерфероном ответа, с которыми связываются интерфероны типа I (IFN), индуцируя транскрипцию генов PKR. [ 11 ] [ 12 ] Некоторые исследования показывают, что PKR может стимулироваться белками теплового шока , гепарином , факторами роста , бактериальной инфекцией, провоспалительными цитокинами, активными формами кислорода , повреждением ДНК, механическим стрессом и избыточным потреблением питательных веществ. [ 11 ]
Будучи активным, PKR способен фосфорилировать эукариотический фактор инициации трансляции eIF2α . [ 11 ] Это ингибирует дальнейшую трансляцию клеточной мРНК, тем самым предотвращая синтез вирусного белка. [ 10 ] В целом это приводит к апоптозу инфицированных вирусом клеток, что предотвращает дальнейшее распространение вируса. PKR также может индуцировать апоптоз при бактериальной инфекции, реагируя на ЛПС и провоспалительные цитокины. [ 10 ] Апоптоз также может происходить посредством PKR-активации сигнального пути FADD и каспазы . [ 12 ]
PKR также выполняет провоспалительные функции, поскольку может опосредовать активацию транскрипционного фактора NF-kB путем фосфорилирования его ингибирующей субъединицы IkB. [ 12 ] Это приводит к экспрессии молекул адгезии и факторов транскрипции, которые их активируют, что вызывает воспалительные реакции, такие как секреция провоспалительных цитокинов. [ 11 ] PKR также активирует несколько митоген-активируемых протеинкиназ (MAPK), что приводит к воспалению. [ 12 ]
Чтобы сбалансировать эффекты апоптоза и воспаления, PKR выполняет регуляторные функции. Активный PKR также способен активировать опухолевый супрессор PP2A , который регулирует клеточный цикл и метаболизм. [ 13 ] Есть также доказательства того, что PKR является аутофагическим регуляторным механизмом. [ 12 ]
Путь стресса PKR
[ редактировать ]PKR находится в центре клеточного ответа на различные сигналы стресса, такие как патогены, недостаток питательных веществ, цитокинов, облучение , механический стресс или стресс ER . [ 11 ] Путь PKR приводит к реакции на стресс посредством активации других путей стресса, таких как JNK , p38 , NFkB , PP2A и фосфорилирования eIF2α . [ 10 ] Стресс ЭР, вызванный избытком развернутых белков, приводит к воспалительным реакциям. [ 14 ] PKR способствует этому ответу, взаимодействуя с несколькими воспалительными киназами, такими как IKK, JNK, ElF2α, рецепторами инсулина и другими. [ 14 ] Этот метаболически активированный воспалительный комплекс называется метаболической инфламмасомой или метафламмасомой. [ 15 ] [ 16 ] Через сигнальный путь JNK PKR также играет роль в резистентности к инсулину, диабете и ожирении путем фосфорилирования IRS1 . [ 17 ] Ингибирование PKR у мышей приводило к снижению воспаления в жировых тканях, повышению чувствительности к инсулину и уменьшению симптомов диабета. [ 17 ] PKR также участвует в ответе митохондриального развернутого белка (UPR тонна ) . [ 18 ] Здесь PKR индуцируется посредством транскрипционного фактора AP-1 и активируется независимо от PACT. [ 18 ] В этом контексте было показано, что PKR имеет отношение к воспалению кишечника. [ 18 ]
Вирусная защита
[ редактировать ]Вирусы разработали множество механизмов противодействия механизму PKR. Это может быть сделано путем приманки дцРНК , деградации, сокрытия вирусной дсРНК , блокады димеризации, дефосфорилирования субстрата или псевдосубстрата .
Например, вирус Эпштейна-Барра (EBV) использует ген EBER1 для производства ложной дсРНК. Это приводит к таким видам рака, как лимфома Беркитта , болезнь Ходжкина , карцинома носоглотки и различные лейкозы .
| Тип защиты | Вирус | Молекула |
|---|---|---|
| Приманка дсРНК | Аденовирус | ГО РНК |
| Вирус Эпштейна-Барра | ЭБЕР | |
| ВИЧ | ТАР | |
| Деградация ПКР | Полиовирус | 2А про |
| Скрыть вирусную дсРНК | Вирус коровьей оспы | Е3Л |
| Реовирус | п3 | |
| Вирус гриппа | НС1 | |
| Блок димеризации | Вирус гриппа | стр58 средний балл |
| Вирус гепатита С | НС5А | |
| Псевдосубстрат | Вирус коровьей оспы | К3Л |
| ВИЧ | Гат | |
| Дефосфорилирование субстрата | Вирус простого герпеса | ICP34.5 |
Память и обучение
[ редактировать ]PKR Мыши с нокаутом или ингибирование PKR у мышей улучшают память и обучение. [ 19 ]
Нейрональная дегенерация
[ редактировать ]В первом сообщении в 2002 году было показано, что иммуногистохимический маркер фосфорилированного PKR и eIF2α положительно проявляется в дегенерирующих нейронах гиппокампа и лобной коры пациентов с болезнью Альцгеймера (БА), что указывает на связь между PKR и БА. Кроме того, многие из этих нейронов были также окрашены антителами к фосфорилированному белку Тау . [ 20 ] Активированная PKR была специфически обнаружена в цитоплазме и ядре, а также локализована совместно с нейрональными маркерами апоптоза. [ 21 ] Дальнейшие исследования оценивали уровни PKR в крови и спинномозговой жидкости (СМЖ) пациентов с АД и контрольной группы. Результат анализа концентраций общих и фосфорилированных PKR (pPKR) в мононуклеарных клетках периферической крови (PBMC) у 23 больных БА и 19 лиц контрольной группы показал статистически значимое повышение уровня соотношения фосфорилированных PKR/PKR у больных АД по сравнению с группой больных АД. элементы управления. [ 22 ] Оценка биомаркеров спинномозговой жидкости, таких как Aβ1-42 , Aβ1-40 , тау и фосфорилированный тау в треонине 181, была подтвержденным использованием в клинических исследованиях и в повседневной практике для определения наличия у пациентов нарушений спинномозговой жидкости и поражений головного мозга при AD. Исследование показало, что «общая концентрация PKR и pPKR была повышена у пациентов с БА и амнезиальными умеренными когнитивными нарушениями, при этом значение pPKR (единицы оптической плотности) отличало пациентов с АД от контрольных субъектов с чувствительностью 91,1% и специфичностью 94,3%. Среди пациентов с АД У некоторых пациентов с AD с нормальными уровнями Aß, T-tau или p181tau в спинномозговой жидкости наблюдались аномальные общие уровни PKR и pPKR». [ 23 ] Был сделан вывод, что проапоптотический путь PKR-eIF2α может быть вовлечен в дегенерацию нейронов , которая приводит к различным нейропатологическим поражениям в зависимости от восприимчивости нейронов.
PKR и бета-амилоид
Активация PKR может вызвать накопление амилоидного β-пептида (Aβ) посредством дерепрессии экспрессии BACE1 (β-сайт расщепляющего фермента APP) у пациентов с болезнью Альцгеймера. [ 24 ] В норме 5'-нетранслируемая область (5'-UTR) в промоторе BACE1 фундаментально ингибирует экспрессию гена BACE1. Однако экспрессия BACE1 может быть активирована путем фосфорилирования eIF2a, что обращает вспять ингибирующий эффект, оказываемый 5'-UTR BACE1. Фосфорилирование eIF2a запускается активацией PKR. Вирусная инфекция, такая как вирус простого герпеса (ВПГ) или окислительный стресс, могут увеличить экспрессию BACE1 за счет активации пути PKR-eIF2a. [ 25 ]
Кроме того, повышенная активность BACE1 может также приводить к β-расщепленному карбокси-концевому фрагменту белка-предшественника β-амилоида (APP-βCTF), индуцированному дисфункции эндосом при AD. [ 26 ] Эндосомы являются высокоактивными сайтами процессинга белка-предшественника β-амилоида (APP), а аномалии эндосом связаны с повышенной экспрессией раннего эндосомального регулятора, Rab5 . Это самая ранняя известная болезнь-специфическая реакция нейронов при БА. Повышенная активность BACE1 приводит к синтезу APP-βCTF. Повышенный уровень βCTF затем вызывает гиперактивацию Rab5. βCTF рекрутирует APPL1 в эндосомы rab5, где он стабилизирует активный GTP -Rab5, что приводит к патологически ускоренному эндоцитозу, набуханию эндосом и избирательному нарушению аксонального транспорта эндосом Rab5.
Фосфорилирование PKR и тау
Ранее сообщалось, что фосфорилированный PKR может локализоваться совместно с фосфорилированным белком Тау в пораженных нейронах. [ 27 ] [ 20 ] Известно, что ингибитор протеинфосфатазы -2А (ингибитор PP2A) – окадаиновая кислота (ОА) – увеличивает фосфорилирование тау, отложение Aβ и гибель нейронов. Изучено, что ОА также индуцирует фосфорилирование PKR и, следовательно, фосфорилирование eIF2a. Фосфорилирование eIF2a затем вызывает активацию транскрипционного фактора 4 (ATF4), который индуцирует апоптоз и ядерную транслокацию, способствуя гибели нейронов. [ 28 ]
Киназа гликогенсинтазы 3β (GSK-3β) отвечает за фосфорилирование тау и контролирует несколько клеточных функций, включая апоптоз. Другое исследование продемонстрировало, что туникомицином лечение или Aβ может индуцировать активацию PKR в клетках нейробластомы человека и может вызвать активацию GSK3β, а также фосфорилирование тау. Они обнаружили, что в мозге с болезнью Альцгеймера как активированные PKR, так и GSK3β локализуются совместно с фосфорилированным тау в нейронах. В культурах клеток SH-SY5Y туникомицин и Aβ(1-42) активируют PKR, который затем может модулировать активацию GSK-3β и индуцировать тау-фосфорилирование и апоптоз. Все эти процессы ослабляются ингибиторами PKR или миРНК PKR . PKR может представлять собой важнейшую сигнальную точку, передающую сигналы стресса нейронным путям путем взаимодействия с фактором транскрипции или косвенного контроля активации GSK3β, что приводит к клеточной дегенерации при AD. [ 29 ]
Фетальный алкогольный синдром
[ редактировать ]PKR также опосредует индуцированное этанолом ингибирование синтеза белка и апоптоз, что связано с алкогольным синдромом плода . [ 30 ]
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что протеинкиназа R взаимодействует с:
- СПРОС1 , [ 31 ]
- ДНКJC3 , [ 32 ]
- ILF3 , [ 33 ] [ 34 ] [ 35 ] [ 36 ]
- МЕТАП2 , [ 37 ]
- Р53 , [ 38 ]
- ППП1КА , [ 39 ]
- ПРКРА , [ 40 ] [ 41 ]
- СТАТ1 , [ 42 ] [ 43 ] и
- ТАРБП2 . [ 44 ] [ 45 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000055332 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024079 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ген Энтрез: эукариотический фактор инициации трансляции EIF2AK2 2-альфа-киназа 2» .
- ^ Фэн Г.С., Чонг К., Кумар А., Уильямс Б.Р. (июнь 1992 г.). «Идентификация двухцепочечных РНК-связывающих доменов в индуцированной интерфероном двухцепочечной РНК-активируемой киназы p68» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 89 (12): 5447–5451. Бибкод : 1992PNAS...89.5447F . дои : 10.1073/pnas.89.12.5447 . ПМК 49309 . ПМИД 1351683 .
- ^ Гупта П., Тайяб А., Хасан М.И. (январь 2021 г.). Донев Р. (ред.). «Новая роль протеинкиназ при сахарном диабете: от механизма к терапии». Достижения в области химии белков и структурной биологии . Протеинкиназы в открытии лекарств. 124 . Академическая пресса: 47–85. дои : 10.1016/bs.apcsb.2020.11.001 . ISBN 9780323853132 . ПМИД 33632470 . S2CID 229608384 .
- ^ Бу-Надер С., Гордон Дж.М., Хендерсон Ф.Е., Чжан Дж. (май 2019 г.). «Поиск код-дифференциальной регуляции PKR активности протеинкиназы R различными РНК и белковыми регуляторами» . РНК . 25 (5): 539–556. дои : 10.1261/rna.070169.118 . ПМК 6467004 . ПМИД 30770398 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж Мац К.М., Гузман Р.М., Goodman AG (01.01.2019). Ванпуй-Бокс С., Галлуцци Л. (ред.). «Роль определения нуклеиновой кислоты в контроле микробных и аутоиммунных заболеваний» . Международное обозрение клеточной и молекулярной биологии . Обнаружение нуклеиновых кислот и иммунитет - Часть B. 345 . Академическая пресса: 35–136. дои : 10.1016/bs.ircmb.2018.08.002 . ISBN 9780128159811 . ПМК 6445394 . ПМИД 30904196 .
- ^ Jump up to: а б с д Ли Ю.С., Кункио Н., Ли Ю.С. (март 2020 г.). «Протеинкиназа R и ее клеточные регуляторы при раке: активный игрок или наблюдатель?» . Междисциплинарные обзоры Wiley. РНК . 11 (2): e1558. дои : 10.1002/wrna.1558 . ПМИД 31231984 . S2CID 195327674 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж Галь-Бен-Ари С., Баррера И., Эрлих М., Розенблюм К. (2019). «PKR: киназа, которую следует помнить» . Границы молекулярной нейронауки . 11 : 480. doi : 10.3389/fnmol.2018.00480 . ПМК 6333748 . ПМИД 30686999 .
- ^ Jump up to: а б с д и Смит Р., Сан Дж. (2021). «Протеинкиназа R при бактериальных инфекциях: друг или враг?» . Границы в иммунологии . 12 : 702142. дои : 10.3389/fimmu.2021.702142 . ПМЦ 8297547 . ПМИД 34305942 .
- ^ Ченг X, Бирн М., Браун К.Д., Коноплева М.Ю., Корнблау С.М., Беннетт Р.Л., Мэй В.С. (сентябрь 2015 г.). «PKR ингибирует реакцию повреждения ДНК и связана с плохой выживаемостью при ОМЛ и ускорением лейкемии у мышей NHD13» . Кровь . 126 (13): 1585–1594. дои : 10.1182/blood-2015-03-635227 . ПМЦ 4582335 . ПМИД 26202421 .
- ^ Jump up to: а б Ли ES, Юн CH, Ким YS, Бэ YS (сентябрь 2007 г.). «Двухцепочечная РНК-зависимая протеинкиназа PKR играет значительную роль в устойчивом апоптозе, индуцированном стрессом ER» . Письма ФЭБС . 581 (22): 4325–4332. doi : 10.1016/j.febslet.2007.08.001 . ПМИД 17716668 . S2CID 45865684 .
- ^ Гарсиа М.А., Хиль Дж., Вентосо И., Герра С., Доминго Э., Ривас К., Эстебан М. (декабрь 2006 г.). «Влияние протеинкиназы PKR в клеточной биологии: от противовирусного к антипролиферативному действию» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 70 (4): 1032–1060. дои : 10.1128/MMBR.00027-06 . ПМЦ 1698511 . ПМИД 17158706 .
- ^ Хотамислигил Г.С. (март 2010 г.). «Стресс эндоплазматической сети и воспалительная основа метаболических заболеваний» . Клетка . 140 (6): 900–917. дои : 10.1016/j.cell.2010.02.034 . ПМЦ 2887297 . ПМИД 20303879 .
- ^ Jump up to: а б Му Х, Ахмад С, Хур С (01 января 2016 г.). Альтернативный FW (ред.). Эндогенные ретроэлементы и сенсоры врожденного иммунитета хозяина . Достижения иммунологии. Том. 132. Академическая пресса. стр. 47–69. дои : 10.1016/bs.ai.2016.07.001 . ISBN 9780128047972 . ПМК 5135014 . ПМИД 27769507 .
- ^ Jump up to: а б с Рат Э., Бергер Э., Месслик А., Нуньес Т., Лю Б., Ким С.К. и др. (сентябрь 2012 г.). «Индукция дцРНК-активируемой протеинкиназы связывает ответ митохондриального развернутого белка с патогенезом воспаления кишечника» . Гут . 61 (9): 1269–1278. дои : 10.1136/gutjnl-2011-300767 . ПМЦ 4514769 . ПМИД 21997551 .
- ^ Чжу П.Дж., Хуанг В., Каликулов Д., Ю Дж.В., Плачек А.Н., Стойка Л. и др. (декабрь 2011 г.). «Подавление PKR способствует сетевой возбудимости и усилению когнитивных функций за счет растормаживания, опосредованного интерфероном-γ» . Клетка . 147 (6): 1384–1396. дои : 10.1016/j.cell.2011.11.029 . ПМЦ 3569515 . ПМИД 22153080 .
- Хилари Робертс (19 декабря 2011 г.). «Открытие может вывести таблетки для улучшения памяти из области научной фантастики» . Канада .
- ^ Jump up to: а б Чанг Р.К., Вонг А.К., Нг Х.К., Хьюгон Дж. (декабрь 2002 г.). «Фосфорилирование эукариотического фактора инициации-2альфа (eIF2альфа) связано с дегенерацией нейронов при болезни Альцгеймера». НейроОтчёт . 13 (18): 2429–2432. дои : 10.1097/00001756-200212200-00011 . ПМИД 12499843 . S2CID 84266563 .
- ^ Пейдж Дж., Риу Билан А., Ингран С., Лафай-Шебасье С., Пейн С., Перо Поша MC и др. (2006). «Активированная двухцепочечная РНК-зависимая протеинкиназа и гибель нейронов в моделях болезни Альцгеймера». Нейронаука . 139 (4): 1343–1354. doi : 10.1016/j.neuroscience.2006.01.047 . ПМИД 16581193 . S2CID 36700744 .
- ^ Паккалин М., Пейн-Барк С., Плюшон С., Пол С., Бессон М.Н., Каррет-Ребиллат А.С. и др. (2006). «Активные киназы mTOR и PKR в лимфоцитах коррелируют со снижением памяти и когнитивных функций при болезни Альцгеймера». Деменция и гериатрические когнитивные расстройства . 22 (4): 320–326. дои : 10.1159/000095562 . ПМИД 16954686 . S2CID 45647507 .
- ^ Мутон-Лигер Ф., Паке С., Дюмуржье Ж., Лапалус П., Грей Ф., Лапланш Ж.Л., Хьюгон Дж. (май 2012 г.). «Повышение уровня двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназы в спинномозговой жидкости при болезни Альцгеймера». Биологическая психиатрия . 71 (9): 829–835. doi : 10.1016/j.biopsych.2011.11.031 . ПМИД 22281122 . S2CID 21131086 .
- ^ Илл-Рага Г., Паломер Э., Возняк М.А., Рамос-Фернандес Э., Бош-Морато М., Таджес М. и др. (28 июня 2011 г.). «Активация PKR вызывает накопление β-пептида амилоида посредством дерепрессии экспрессии BACE1» . ПЛОС ОДИН . 6 (6): e21456. Бибкод : 2011PLoSO...621456I . дои : 10.1371/journal.pone.0021456 . ПМК 3125189 . ПМИД 21738672 .
- ^ Мутон-Лигер Ф., Паке К., Дюмуржье Ж., Бурас К., Прадье Л., Грей Ф., Хьюгон Дж. (июнь 2012 г.). «Окислительный стресс повышает уровень белка BACE1 за счет активации пути PKR-eIF2α» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярные основы болезней . 1822 (6): 885–896. дои : 10.1016/j.bbadis.2012.01.009 . ПМИД 22306812 .
- ^ Ким С., Сато Ю., Мохан П.С., Петергоф С., Пенсалфини А., Ригоглиозо А. и др. (май 2016 г.). «Доказательства того, что эффектор rab5 APPL1 опосредует APP-βCTF-индуцированную дисфункцию эндосом при синдроме Дауна и болезни Альцгеймера» . Молекулярная психиатрия . 21 (5): 707–716. дои : 10.1038/mp.2015.97 . ПМК 4721948 . ПМИД 26194181 .
- ^ Пил А.Л., Бредесен Д.Е. (октябрь 2003 г.). «Активация киназы клеточного стресса PKR при болезни Альцгеймера и трансгенных мышах, содержащих белок-предшественник амилоида человека». Нейробиология болезней . 14 (1): 52–62. дои : 10.1016/S0969-9961(03)00086-X . ПМИД 13678666 . S2CID 13109874 .
- ^ Ким С.М., Юн С.Ю., Чхве Дж.Э., Пак Дж.С., Чхве Дж.М., Нгуен Т., Ким Д.Х. (сентябрь 2010 г.). «Активация альфа-киназы фактора инициации эукариот-2 в нейронах, обработанных окадаиновой кислотой». Нейронаука . 169 (4): 1831–1839. doi : 10.1016/j.neuroscience.2010.06.016 . ПМИД 20600673 . S2CID 207248721 .
- ^ Бозе А, Мутон-Лигер Ф, Паке С, Мазо П, Виньи М, Грей Ф, Хьюгон Дж (март 2011 г.). «Модуляция фосфорилирования тау киназой PKR: последствия болезни Альцгеймера» . Патология головного мозга . 21 (2): 189–200. дои : 10.1111/j.1750-3639.2010.00437.x . ПМЦ 8094269 . ПМИД 21029237 . S2CID 39517621 .
- ^ Чен Г, Ма С, Бауэр К.А., Кэ З, Луо Дж (июнь 2006 г.). «Взаимодействие между RAX и PKR модулирует влияние этанола на синтез белка и выживаемость нейронов» . Журнал биологической химии . 281 (23): 15909–15915. дои : 10.1074/jbc.M600612200 . ПМИД 16574643 .
- ^ Такизава Т., Татемацу С., Наканиси Ю. (декабрь 2002 г.). «Двухцепочечная РНК-активируемая протеинкиназа взаимодействует с киназой 1, регулирующей сигнал апоптоза. Значение для сигнальных путей апоптоза» . Европейский журнал биохимии . 269 (24): 6126–6132. дои : 10.1046/j.1432-1033.2002.03325.x . ПМИД 12473108 .
- ^ Поляк С.Дж., Тан Н., Вамбах М., Барбер Г.Н., Катце М.Г. (январь 1996 г.). «Клеточный ингибитор P58 образует комплексы с интерферон-индуцированной двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназой PKR, чтобы регулировать ее аутофосфорилирование и активность» . Журнал биологической химии . 271 (3): 1702–1707. дои : 10.1074/jbc.271.3.1702 . ПМИД 8576172 .
- ^ Сондерс Л.Р., Перкинс Д.Д., Балачандран С., Майклс Р., Форд Р., Майеда А., Барбер Г.Н. (август 2001 г.). «Характеристика двух эволюционно консервативных, альтернативно сплайсированных ядерных фосфопротеинов, NFAR-1 и -2, которые участвуют в процессинге мРНК и взаимодействуют с двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназой PKR» . Журнал биологической химии . 276 (34): 32300–32312. дои : 10.1074/jbc.M104207200 . ПМИД 11438536 .
- ^ Лэнгленд Дж.О., Као П.Н., Джейкобс Б.Л. (май 1999 г.). «Ядерный фактор-90 активированных Т-клеток: двухцепочечный РНК-связывающий белок и субстрат для двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназы, PKR». Биохимия . 38 (19): 6361–6368. дои : 10.1021/bi982410u . ПМИД 10320367 .
- ^ Паркер Л.М., Фиерро-Монти I, Мэтьюз М.Б. (август 2001 г.). «Ядерный фактор 90 является субстратом и регулятором эукариотической киназы инициации фактора 2, активируемой двухцепочечной РНК протеинкиназой» . Журнал биологической химии . 276 (35): 32522–32530. дои : 10.1074/jbc.M104408200 . ПМИД 11438540 .
- ^ Патель Р.К., Вестал Д.Д., Сюй З., Бандиопадхьяй С., Го В., Эрме С.М. и др. (июль 1999 г.). «DRBP76, двухцепочечный РНК-связывающий ядерный белок, фосфорилируется интерферон-индуцированной протеинкиназой PKR» . Журнал биологической химии . 274 (29): 20432–20437. дои : 10.1074/jbc.274.29.20432 . ПМИД 10400669 .
- ^ Гил Дж., Эстебан М., Рот Д. (декабрь 2000 г.). «Регуляция in vivo дцРНК-зависимой протеинкиназы PKR клеточным гликопротеином p67». Биохимия . 39 (51): 16016–16025. дои : 10.1021/bi001754t . ПМИД 11123929 .
- ^ Каддихи А.Р., Вонг А.Х., Там Н.В., Ли С., Коромилас А.Е. (апрель 1999 г.). «Двухцепочечная РНК-активированная протеинкиназа PKR физически связывается с белком-супрессором опухоли p53 и фосфорилирует человеческий p53 по серину 392 in vitro» . Онкоген . 18 (17): 2690–2702. дои : 10.1038/sj.onc.1202620 . ПМИД 10348343 .
- ^ Тан С.Л., Тарин С.У., Мелвилл М.В., Блейкли С.М., Катце М.Г. (сентябрь 2002 г.). «Прямое связывание каталитической субъединицы протеинфосфатазы 1 с протеинкиназой PKR необходимо, но недостаточно для инактивации и нарушения образования димера фермента» . Журнал биологической химии . 277 (39): 36109–36117. дои : 10.1074/jbc.M205109200 . ПМИД 12138106 .
- ^ Хуан X, Хатчинс Б., Патель Р.С. (август 2002 г.). «С-концевой, третий консервативный мотив белка-активатора PACT играет важную роль в активации двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназы (PKR)» . Биохимический журнал . 366 (Часть 1): 175–186. дои : 10.1042/BJ20020204 . ПМЦ 1222748 . ПМИД 11985496 .
- ^ Патель Р.К., Сен Г.К. (август 1998 г.). «PACT, белок-активатор интерферон-индуцированной протеинкиназы, PKR» . Журнал ЭМБО . 17 (15): 4379–4390. дои : 10.1093/emboj/17.15.4379 . ПМК 1170771 . ПМИД 9687506 .
- ^ Вонг А.Х., Там Н.В., Ян Ю.Л., Каддихи А.Р., Ли С., Кирхгоф С. и др. (март 1997 г.). «Физическая связь между STAT1 и интерферон-индуцируемой протеинкиназой PKR и значение для сигнальных путей интерферона и двухцепочечной РНК» . Журнал ЭМБО . 16 (6): 1291–1304. дои : 10.1093/emboj/16.6.1291 . ПМЦ 1169727 . ПМИД 9135145 .
- ^ Вонг А.Х., Дурбин Дж.Э., Ли С., Девер Т.Е., Декер Т., Коромилас А.Е. (апрель 2001 г.). «Усиленные противовирусные и антипролиферативные свойства мутанта STAT1, неспособного взаимодействовать с протеинкиназой PKR» . Журнал биологической химии . 276 (17): 13727–13737. дои : 10.1074/jbc.M011240200 . ПМИД 11278865 .
- ^ Косентино Г.П., Венкатесан С., Серлука ФК, Грин С.Р., Мэтьюз М.Б., Соненберг Н. (октябрь 1995 г.). «Двухцепочечная РНК-зависимая протеинкиназа и РНК-связывающий белок TAR образуют гомо- и гетеродимеры in vivo» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (21): 9445–9449. Бибкод : 1995PNAS...92.9445C . дои : 10.1073/pnas.92.21.9445 . ПМК 40818 . ПМИД 7568151 .
- ^ Дахер А., Лонге М., Дорен Д., Буа Ф., Сегерал Э., Баннварт С. и др. (сентябрь 2001 г.). «Два домена димеризации в РНК-связывающем белке транс-активационного ответа (TRBP) индивидуально обращают ингибирование протеинкиназой R экспрессии длинных концевых повторов ВИЧ-1» . Журнал биологической химии . 276 (36): 33899–33905. дои : 10.1074/jbc.M103584200 . ПМИД 11438532 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Уильямс БР (ноябрь 1999 г.). «PKR; сигнальная киназа клеточного стресса» . Онкоген . 18 (45): 6112–6120. дои : 10.1038/sj.onc.1203127 . ПМИД 10557102 .
- Гарсиа М.А., Мерс Э.Ф., Эстебан М. (2007). «Протеинкиназа дцРНК PKR: вирусный и клеточный контроль». Биохимия . 89 (6–7): 799–811. дои : 10.1016/j.biochi.2007.03.001 . ПМИД 17451862 .
- Томис, округ Колумбия, Духан Дж.П., Сэмюэл С.Э. (май 1992 г.). «Механизм действия интерферона: структура кДНК, экспрессия и регуляция интерферон-индуцированной РНК-зависимой альфа-протеинкиназы P1 / eIF-2 из клеток человека». Вирусология . 188 (1): 33–46. дои : 10.1016/0042-6822(92)90732-5 . ПМИД 1373553 .
- МакКормак С.Дж., Томис, округ Колумбия, Сэмюэл С.Э. (май 1992 г.). «Механизм действия интерферона: идентификация РНК-связывающего домена в N-концевой области человеческой РНК-зависимой альфа-протеинкиназы P1/eIF-2». Вирусология . 188 (1): 47–56. дои : 10.1016/0042-6822(92)90733-6 . ПМИД 1373554 .
- Меллор Х., Proud CG (июль 1991 г.). «Синтетический пептидный субстрат для киназ инициации фактора-2». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 178 (2): 430–437. дои : 10.1016/0006-291X(91)90125-Q . ПМИД 1677563 .
- Мерс Э., Чонг К., Галабру Дж., Томас Н.С., Керр И.М., Уильямс Б.Р., Хованессян А.Г. (июль 1990 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика человеческой двухцепочечной РНК-активируемой протеинкиназы, индуцированной интерфероном». Клетка . 62 (2): 379–390. дои : 10.1016/0092-8674(90)90374-Н . ПМИД 1695551 . S2CID 20477995 .
- Сильверман Р.Х., Сенгупта Д.Н. (1991). «Регуляция трансляции с помощью лидерной РНК ВИЧ, ТАТ и интерферон-индуцируемых ферментов». Журнал экспериментальной патологии . 5 (2): 69–77. ПМИД 1708818 .
- Рой С., Катце М.Г., Паркин Н.Т., Эдери И., Хованессян А.Г., Соненберг Н. (март 1990 г.). «Контроль индуцированной интерфероном протеинкиназы массой 68 килодальтон с помощью продукта гена tat ВИЧ-1». Наука . 247 (4947): 1216–1219. Бибкод : 1990Sci...247.1216R . дои : 10.1126/science.2180064 . ПМИД 2180064 .
- Макмиллан Н.А., Чун Р.Ф., Сидеровски Д.П., Галабру Дж., Тун В.М., Сэмюэл С.Э. и др. (ноябрь 1995 г.). «ВИЧ-1 Tat напрямую взаимодействует с интерферон-индуцированной двухцепочечной РНК-зависимой киназой PKR» . Вирусология . 213 (2): 413–424. дои : 10.1006/виро.1995.0014 . ПМИД 7491766 .
- Барбер Г.Н., Эдельхофф С., Катце М.Г., Дистече К.М. (июнь 1993 г.). «Хромосомное присвоение интерферон-индуцируемой двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназы (PRKR) человеческой хромосоме 2p21-p22 и мышиной хромосоме 17 E2». Геномика . 16 (3): 765–767. дои : 10.1006/geno.1993.1262 . ПМИД 7686883 .
- Сквайр Дж., Мерс Э.Ф., Чонг К.Л., Макмиллан Н.А., Хованессян А.Г., Уильямс Б.Р. (июнь 1993 г.). «Локализация индуцированного человеческим интерфероном гена киназы p68, активируемого дц-РНК (PRKR), на хромосоме 2p21-p22». Геномика . 16 (3): 768–770. дои : 10.1006/geno.1993.1263 . ПМИД 7686884 .
- Пригмор Э., Ахмед С., Бест А., Козма Р., Мансер Э., Сигал А.В., Лим Л. (май 1995 г.). «Киназа 68-кДа и НАДФН-оксидазный компонент p67phox являются мишенями для Cdc42Hs и Rac1 в нейтрофилах» . Журнал биологической химии . 270 (18): 10717–10722. дои : 10.1074/jbc.270.18.10717 . ПМИД 7738010 .
- Барбер Г.Н., Вамбах М., Вонг М.Л., Девер Т.Е., Хиннебуш А.Г., Катце М.Г. (май 1993 г.). «Регуляция трансляции с помощью индуцированной интерфероном двухцепочечной РНК-активируемой протеинкиназы массой 68 кДа» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 90 (10): 4621–4625. Бибкод : 1993PNAS...90.4621B . дои : 10.1073/pnas.90.10.4621 . ПМК 46564 . ПМИД 8099444 .
- Чен З.Дж., Родитель Л., Маниатис Т. (март 1996 г.). «Сайт-специфическое фосфорилирование IkappaBalpha с помощью новой убиквитин-зависимой протеинкиназной активности» . Клетка . 84 (6): 853–862. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81064-8 . ПМИД 8601309 . S2CID 112412 .
- Кухен К.Л., Шен X, Карлайл Э.Р., Ричардсон А.Л., Вейер Х.У., Танака Х., Сэмюэл С.Э. (август 1996 г.). «Структурная организация человеческого гена (PKR), кодирующего интерферон-индуцируемую РНК-зависимую протеинкиназу (PKR), и отличия от ее мышиного гомолога». Геномика . 36 (1): 197–201. дои : 10.1006/geno.1996.0446 . ПМИД 8812437 .
- Тейлор Д.Р., Ли С.Б., Романо П.Р., Маршак Д.Р., Хиннебуш А.Г., Эстебан М., Мэтьюз М.Б. (ноябрь 1996 г.). «Сайты аутофосфорилирования участвуют в активации двухцепочечной РНК-активируемой протеинкиназы PKR» . Молекулярная и клеточная биология . 16 (11): 6295–6302. дои : 10.1128/mcb.16.11.6295 . ПМК 231632 . ПМИД 8887659 .
- Кухен К.Л., Шен X, Сэмюэл CE (октябрь 1996 г.). «Механизм последовательности действия интерферона человеческой интерферон-индуцируемой РНК-зависимой протеинкиназы (PKR), выведенной из геномных клонов». Джин . 178 (1–2): 191–193. дои : 10.1016/0378-1119(96)00314-9 . ПМИД 8921913 .
галерея PDB |
|---|
