ПРИЛОЖЕНИЕ1

ПРИЛОЖЕНИЕ1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2EJ8, 2ELA, 2ELB, 2Q12, 2Q13, 2Z0N, 2Z0O, 5C5B
Идентификаторы
Псевдонимы	APPL1 , APPL, DIP13альфа, MODY14, адаптерный белок, фосфотирозин, взаимодействующий с доменом PH, и лейциновая молния 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 604299 ; МГИ : 1920243 ; Гомологен : 32143 ; GeneCards : APPL1 ; OMA : APPL1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 3 (human)
End	57,278,105 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 14 (mouse)
End	26,693,189 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	Achilles tendon; ; biceps brachii; ; germinal epithelium; ; body of pancreas; ; vastus lateralis muscle; ; human penis; ; gastrocnemius muscle; ; Skeletal muscle tissue of biceps brachii; ; muscle of thigh; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis;
	Top expressed in
	primary oocyte; ; aortic valve; ; ascending aorta; ; secondary oocyte; ; vestibular sensory epithelium; ; vestibular membrane of cochlear duct; ; substantia nigra; ; primitive streak; ; conjunctival fornix; ; iris;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein kinase B binding; protein binding; identical protein binding; phosphatidylserine binding; phosphatidylinositol binding; protein homodimerization activity; protein-containing complex binding; beta-tubulin binding;
Cellular component	cytoplasm; NuRD complex; cytosol; endosome; early endosome membrane; membrane; vesicle membrane; endosome membrane; extracellular exosome; nucleus; early endosome; ruffle; plasma membrane; cytoplasmic vesicle; early phagosome; macropinosome; intracellular vesicle; cell projection; phagocytic vesicle;
Biological process	regulation of glucose import; extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand; cell cycle; cell population proliferation; signal transduction; insulin receptor signaling pathway; regulation of protein localization to plasma membrane; transforming growth factor beta receptor signaling pathway; regulation of fibroblast migration; signaling; adiponectin-activated signaling pathway; regulation of toll-like receptor 4 signaling pathway; cellular response to hepatocyte growth factor stimulus; regulation of innate immune response; positive regulation of glucose import; positive regulation of melanin biosynthetic process; positive regulation of cytokine production involved in inflammatory response; positive regulation of macropinocytosis; negative regulation of Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis; protein import into nucleus;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	26060
	72993
	ENSG00000157500
	ENSMUSG00000040760
	Q9UKG1
	Q8K3H0
	НМ_012096
	НМ_145221
	НП_036228
	НП_660256
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок-адаптер, фосфотирозин, взаимодействующий с доменом PH и лейциновой застежкой-молнией 1 (APPL1) , или белок 13-альфа, взаимодействующий с DCC (DIP13alpha), представляет собой белок , который у людей кодируется APPL1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} APPL1 содержит несколько ключевых взаимодействующих доменов: домен гомологии плекстрина (PH) , фосфотирозин-связывающий домен (PTB) и домен Bin-амфифизин-Rvs (BAR). ^{[ 8 ]}

Функция

APPL1 представляет собой адаптерный белок, локализованный в подмножестве Rab5 -положительных («ранних») эндосом , где он рекрутирует других партнеров по связыванию и регулирует транспорт везикул и передачу эндосомальных сигналов . APPL1 обогащен очень ранними эндосомами, которые отрицательны для EEA1 , что указывает на то, что APPL1 влияет на самые ранние стадии эндосомального трафика до того, как EEA1 вступит во владение. Это согласуется с наблюдениями о том, что APPL1 и EEA1 конкурируют за связывание Rab5. APPL1 влияет на скорость интернализации ключевого эндосомального груза (например, рецептора EGF ), что зависит от активации Rab5. ^{[ 8 ]}

Домен PTB APPL1 регулирует многие события передачи сигналов клетками в определенных эндосомальных компартментах, иногда называемых «сигнальными эндосомами». Сюда входит передача сигналов, индуцированная лизофосфатидной кислотой (LPA) (вместе с взаимодействующим белком GIPC1 ). Дополнительные роли APPL1 были определены в ядре , где APPL1 может локализоваться после диссоциации от эндосом. ^{[ 8 ]}

Исследования мутантов

Мышиные мутантные аллели для Appl1
Маркерный символ мышиного гена. Этот символ присвоен геномному локусу MGI .	Приложение1
Мутантные клоны эмбриональных стволовых клеток мыши. Это известные целевые мутации этого гена у мышей.	Приложение1 ^{tm1a(KOMP)Wtsi}
Пример структуры целевого условного мутантного аллеля этого гена

Эти мутантные ES-клетки можно изучать напрямую или использовать для создания мышей с нокаутом этого гена. Исследование этих мышей может пролить свет на функцию Appl1: см. Нокаутная мышь

Взаимодействия

Было показано, что APPL1 взаимодействует с удаленным при колоректальном раке . ^{[ 9 ]} АКТ2 , ^{[ 5 ]} но также Rab5 , Rab21 , OCRL и почти 30 других белков. ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000157500 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040760 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б Мицуучи Ю., Джонсон С.В., Сонода Г., Танно С., Големис Э.А., Теста Дж.Р. (сентябрь 1999 г.). «Идентификация гена хромосомы 3p14.3-21.1, APPL, кодирующего молекулу-адаптер, которая взаимодействует с онкопротеин-серин/треониновой киназой AKT2». Онкоген . 18 (35): 4891–8. дои : 10.1038/sj.onc.1203080 . ПМИД 10490823 . S2CID 25245749 .
^ Нехамен К.А., Томас Р.М., Диас Дж.А. (январь 2007 г.). «APPL1, APPL2, Akt2 и FOXO1a взаимодействуют с FSHR в потенциальном сигнальном комплексе» . Молекулярная и клеточная эндокринология . 260–262: 93–9. дои : 10.1016/j.mce.2006.08.014 . ПМЦ 1782224 . ПМИД 17030088 .
^ «Ген Entrez: адаптерный белок APPL1, взаимодействие фосфотирозина, домен PH и лейциновая молния, содержащая 1» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Диггинс, Н.Л., диджей Уэбб (июнь 2017 г.). «APPL1 представляет собой многофункциональный эндосомальный сигнальный адаптерный белок» . Труды Биохимического общества . 45 (3): 771–779. дои : 10.1042/bst20160191 . ПМК 5844352 . ПМИД 28620038 .
^ Лю Дж., Яо Ф., Ву Р., Морган М., Торберн А., Финли Р.Л., Чен YQ (июль 2002 г.). «Опосредование апоптотического сигнала DCC с помощью DIP13 альфа» . Журнал биологической химии . 277 (29): 26281–5. дои : 10.1074/jbc.M204679200 . ПМИД 12011067 .

Дальнейшее чтение

Накадзима Д., Оказаки Н., Ямакава Х., Кикуно Р., Охара О., Нагасе Т. (июнь 2002 г.). «Создание готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное курирование 330 клонов кДНК KIAA» . Исследование ДНК . 9 (3): 99–106. дои : 10.1093/dnares/9.3.99 . ПМИД 12168954 .
Нагасе Т., Кикуно Р., Исикава К.И., Хиросава М., Охара О (февраль 2000 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XVI. Полные последовательности 150 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . Исследование ДНК . 7 (1): 65–73. дои : 10.1093/dnares/7.1.65 . ПМИД 10718198 .
Лю Дж., Яо Ф., Ву Р., Морган М., Торберн А., Финли Р.Л., Чен YQ (июль 2002 г.). «Опосредование апоптотического сигнала DCC с помощью DIP13 альфа» . Журнал биологической химии . 277 (29): 26281–5. дои : 10.1074/jbc.M204679200 . ПМИД 12011067 .
Ян Л., Линь Х.К., Алтувайджри С., Се С., Ван Л., Чанг С. (май 2003 г.). «APPL подавляет трансактивацию андрогенных рецепторов посредством усиления активности Akt» . Журнал биологической химии . 278 (19): 16820–7. дои : 10.1074/jbc.M213163200 . ПМИД 12621049 .
Мячинска М, Христофоридис С, Гинер А, Шевченко А, Уттенвейлер-Джозеф С, Хаберманн Б, Вильм М, Партон Р.Г., Зериал М (февраль 2004 г.). «Белки APPL связывают Rab5 с передачей ядерного сигнала через эндосомальный компартмент» . Клетка . 116 (3): 445–56. дои : 10.1016/S0092-8674(04)00117-5 . ПМИД 15016378 . S2CID 18281503 .
Нехамен К.А., Томас Р.М., Коэн Б.Д., Асеведо Г., Пуликакос П.И., Теста Дж.Р., Диас Дж.А. (август 2004 г.). «Рецептор фолликулостимулирующего гормона человека (ФСГ) взаимодействует с адаптерным белком APPL1 в клетках HEK 293: потенциальное участие пути PI3K в передаче сигналов ФСГ» . Биология размножения . 71 (2): 629–36. дои : 10.1095/biolreprod.103.025833 . ПМИД 15070827 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж.Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кэнтли Л.К., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .
Баллиф Б.А., Виллен Дж., Босолей С.А., Шварц Д., Гиги С.П. (ноябрь 2004 г.). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши» . Молекулярная и клеточная протеомика . 3 (11): 1093–101. дои : 10.1074/mcp.M400085-MCP200 . ПМИД 15345747 .
Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хиродзан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж, Зогби Х.И., Смоляр А, Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Мао X, Кикани С.К., Риохас Р.А., Лангле П., Ван Л., Рамос Ф.Дж., Фанг К., Крист-Робертс С.И., Хонг Дж.Ю., Ким Р.Ю., Лю Ф., Донг LQ (май 2006 г.). «APPL1 связывается с рецепторами адипонектина и опосредует передачу сигналов и функцию адипонектина». Природная клеточная биология . 8 (5): 516–23. дои : 10.1038/ncb1404 . ПМИД 16622416 . S2CID 21273764 .
Ли Дж, Мао X, Донг LQ, Лю Ф, Тонг Л (май 2007 г.). «Кристаллические структуры доменов BAR-PH и PTB человеческого APPL1» . Структура . 15 (5): 525–33. дои : 10.1016/j.str.2007.03.011 . ПМИД 17502098 .
Чжу Дж., Чен Дж., Лю Дж., Брунзель Дж.С., Хуан Б., Уэйкхэм Н., Терзян С., Ли Х, Рао З., Ли Г., Чжан XC (июль 2007 г.). «Структура домена APPL1 BAR-PH и характеристика его взаимодействия с Rab5» . Журнал ЭМБО . 26 (14): 3484–93. дои : 10.1038/sj.emboj.7601771 . ЧВК 1933402 . ПМИД 17581628 .
Сайто Т., Джонс К.С., Хуанг С., член парламента Чехии, Пилч П.Ф. (ноябрь 2007 г.). «Взаимодействие Akt с APPL1 необходимо для стимулируемой инсулином транслокации Glut4» . Журнал биологической химии . 282 (44): 32280–7. дои : 10.1074/jbc.M704150200 . ПМИД 17848569 .

Внешние ссылки

человека Местоположение генома APPL1 и страница сведений о гене APPL1 в браузере генома UCSC .

статья о гене на хромосоме 3 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000157500 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040760 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10490823-5] Jump up to: ^а ^б Мицуучи Ю., Джонсон С.В., Сонода Г., Танно С., Големис Э.А., Теста Дж.Р. (сентябрь 1999 г.). «Идентификация гена хромосомы 3p14.3-21.1, APPL, кодирующего молекулу-адаптер, которая взаимодействует с онкопротеин-серин/треониновой киназой AKT2». Онкоген . 18 (35): 4891–8. дои : 10.1038/sj.onc.1203080 . ПМИД 10490823 . S2CID 25245749 .

[pmid17030088-6] Нехамен К.А., Томас Р.М., Диас Дж.А. (январь 2007 г.). «APPL1, APPL2, Akt2 и FOXO1a взаимодействуют с FSHR в потенциальном сигнальном комплексе» . Молекулярная и клеточная эндокринология . 260–262: 93–9. дои : 10.1016/j.mce.2006.08.014 . ПМЦ 1782224 . ПМИД 17030088 .

[entrez-7] «Ген Entrez: адаптерный белок APPL1, взаимодействие фосфотирозина, домен PH и лейциновая молния, содержащая 1» .

[Diggins_2017-8] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Диггинс, Н.Л., диджей Уэбб (июнь 2017 г.). «APPL1 представляет собой многофункциональный эндосомальный сигнальный адаптерный белок» . Труды Биохимического общества . 45 (3): 771–779. дои : 10.1042/bst20160191 . ПМК 5844352 . ПМИД 28620038 .

[pmid12011067-9] Лю Дж., Яо Ф., Ву Р., Морган М., Торберн А., Финли Р.Л., Чен YQ (июль 2002 г.). «Опосредование апоптотического сигнала DCC с помощью DIP13 альфа» . Журнал биологической химии . 277 (29): 26281–5. дои : 10.1074/jbc.M204679200 . ПМИД 12011067 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]