РАБ5А

РАБ5А
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1N6H, 1N6I, 1N6K, 1N6L, 1N6N, 1N6O, 1N6P, 1N6R, 1R2Q, 1TU3, 1TU4, 3MJH, 4Q9U
Идентификаторы
Псевдонимы	RAB5A , RAB5, член семейства онкогенов РАС.
Внешние идентификаторы	Опустить : 179512 ; МГИ : 105926 ; Гомологен : 68142 ; Генные карты : RAB5A ; ОМА : RAB5A – ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 3 (human)
End	19,985,175 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	53,814,708 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	gingival epithelium; ; endothelial cell; ; lower lobe of lung; ; skin of thigh; ; corpus epididymis; ; pons; ; Pars compacta; ; human penis; ; pars reticulata; ; medulla oblongata;
	Top expressed in
	esophagus; ; ganglionic eminence; ; hippocampus proper; ; lens; ; primary visual cortex; ; cerebellar cortex; ; right kidney; ; zone of skin; ; superior frontal gyrus; ; neural tube;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	nucleotide binding; GDP binding; GTP binding; protein binding; GTPase activity; guanyl nucleotide binding;
Cellular component	cytoplasm; axon terminus; endosome; cell projection; membrane; synaptic vesicle; melanosome; ruffle; plasma membrane; endocytic vesicle; axon; neuronal cell body; terminal bouton; dendrite; somatodendritic compartment; early endosome; phagocytic vesicle; actin cytoskeleton; membrane raft; cytoplasmic side of early endosome membrane; extracellular exosome; cytoplasmic vesicle; phagocytic vesicle membrane; cytosol; endosome membrane; clathrin-coated vesicle membrane; early endosome membrane; early phagosome; postsynaptic early endosome; anchored component of synaptic vesicle membrane;
Biological process	regulation of endocytosis; regulation of filopodium assembly; endocytosis; blood coagulation; receptor internalization involved in canonical Wnt signaling pathway; regulation of autophagosome assembly; synaptic vesicle recycling; early endosome to late endosome transport; transport; protein transport; positive regulation of exocytosis; regulation of synaptic vesicle exocytosis; regulation of endosome size; viral RNA genome replication; phagocytosis; phosphatidylinositol biosynthetic process; membrane organization; post-translational protein modification; intracellular protein transport; Rab protein signal transduction; regulation of long-term neuronal synaptic plasticity; amyloid-beta clearance by transcytosis;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	5868
	271457
	ENSG00000144566
	ENSMUSG00000017831
	P20339
	Q9CQD1
	НМ_004162 ; НМ_001292048
	НМ_025887
	НП_001278977 ; НП_004153
	НП_080163
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ras-родственный белок Rab-5A представляет собой белок , который у человека кодируется RAB5A геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

RAB5A локализуется в ранних эндосомах , где участвует в рекрутировании RAB7A и созревании этих компартментов до ранних эндосом. ^{[ 7 ]} Он управляет созреванием эндосом путем транспортировки вакуолярных (H+)-АТФаз (V-АТФаз) из транс-сети Гольджи в эндоцитарные пузырьки. ^{[ 8 ]}

Взаимодействия

Было показано, что RAB5A взаимодействует с:

ЧМЛ , ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}
РАБЕП1 , ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}
СДКБП , ^{[ 15 ]} и
ZFYVE20 ^{[ 16 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000144566 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000017831 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Руссо-Мерк М.Ф., Зарауи А., Тушо Н., Тавитян А., Бергер Р. (февраль 1991 г.). «Назначение хромосом четырех генов RAB, связанных с RAS». Генетика человека . 86 (4): 350–4. дои : 10.1007/BF00201831 . ПМИД 1999336 . S2CID 30730416 .
^ «Ген Энтрез: RAB5A RAB5A, член семейства онкогенов RAS» .
^ Хуотари Дж., Хелениус А. (август 2011 г.). «Созревание эндосом» . Журнал ЭМБО . 30 (17): 3481–500. дои : 10.1038/emboj.2011.286 . ПМК 3181477 . ПМИД 21878991 .
^ Чжан С., Ли А., Чжан Х., Сяо Х. (март 2011 г.). «Новый белковый комплекс TIP30 регулирует передачу сигналов рецептора EGF и эндоцитарную деградацию» . Журнал биологической химии . 286 (11): 9373–81. дои : 10.1074/jbc.M110.207720 . ПМЦ 3058969 . ПМИД 21252234 .
^ Анант Дж.С., Деснуайерс Л., Мачиус М., Демелер Б., Хансен Дж.К., Вестовер К.Д., Дайзенхофер Дж., Сибра MC (сентябрь 1998 г.). «Механизм Rab-геранилгеранилирования: образование каталитического тройного комплекса». Биохимия . 37 (36): 12559–68. дои : 10.1021/bi980881a . ПМИД 9730828 .
^ Кремерс Ф.П., Армстронг С.А., Сибра М.С., Браун М.С., Гольдштейн Дж.Л. (январь 1994 г.). «REP-2, эскортный белок Rab, кодируемый геном, подобным хороидеремии» . Журнал биологической химии . 269 (3): 2111–7. дои : 10.1016/S0021-9258(17)42142-9 . ПМИД 8294464 .
^ Сяо Г.Х., Шоаринеджад Ф., Джин Ф., Големис Э.А., Юнг Р.С. (март 1997 г.). «Продукт гена туберозного склероза 2, туберин, действует как белок, активирующий Rab5 GTPase (GAP), модулируя эндоцитоз» . Журнал биологической химии . 272 (10): 6097–100. дои : 10.1074/jbc.272.10.6097 . hdl : 20.500.12613/9244 . ПМИД 9045618 .
^ Витале Г., Рыбин В., Христофоридис С., Торнквист П., Маккаффри М., Стенмарк Х., Зериал М. (апрель 1998 г.). «Отдельные Rab-связывающие домены опосредуют взаимодействие рабаптина-5 с GTP-связанными Rab4 и Rab5» . Журнал ЭМБО . 17 (7): 1941–51. дои : 10.1093/emboj/17.7.1941 . ПМК 1170540 . ПМИД 9524117 .
^ Стенмарк Х., Витале Г., Ульрих О., Зериал М. (ноябрь 1995 г.). «Рабаптин-5 является прямым эффектором малой ГТФазы Rab5 при слиянии эндоцитарных мембран» . Клетка . 83 (3): 423–32. дои : 10.1016/0092-8674(95)90120-5 . ПМИД 8521472 . S2CID 18768939 .
^ Валсдоттир Р., Хасимото Х., Ашман К., Кода Т., Сторри Б., Нильссон Т. (ноябрь 2001 г.). «Идентификация рабаптина-5, рабекса-5 и GM130 как предполагаемых эффекторов rab33b, регулятора ретроградного движения между аппаратом Гольджи и ЭР» . Письма ФЭБС . 508 (2): 201–9. дои : 10.1016/s0014-5793(01)02993-3 . ПМИД 11718716 . S2CID 21545088 .
^ Томода Т., Ким Дж. Х., Жан С., Хаттен М. Е. (март 2004 г.). «Роль Unc51.1 и его партнеров по связыванию в росте аксонов ЦНС» . Гены и развитие . 18 (5): 541–58. дои : 10.1101/gad.1151204 . ПМЦ 374236 . ПМИД 15014045 .
^ Нильсен Э., Христофоридис С., Уттенвейлер-Джозеф С., Мячинска М., Девитте Ф., Вильм М., Хофлак Б., Зериал М. (октябрь 2000 г.). «Рабеносин-5, новый эффектор Rab5, образует комплекс с hVPS45 и рекрутируется в эндосомы через пальцевый домен FYVE» . Журнал клеточной биологии . 151 (3): 601–12. дои : 10.1083/jcb.151.3.601 . ПМК 2185588 . ПМИД 11062261 .

Дальнейшее чтение

Буччи С., Партон Р.Г., Мазер И.Х., Станненберг Х., Саймонс К., Хофлак Б., Зериал М. (сентябрь 1992 г.). «Маленькая ГТФаза rab5 действует как регуляторный фактор на раннем эндоцитарном пути» . Клетка . 70 (5): 715–28. дои : 10.1016/0092-8674(92)90306-W . ПМИД 1516130 .
Зарауи А., Тушо Н., Шарден П., Тавитян А. (июль 1989 г.). «Гены Rab человека кодируют семейство GTP-связывающих белков, связанных с дрожжевыми продуктами YPT1 и SEC4, участвующими в секреции» . Журнал биологической химии . 264 (21): 12394–401. дои : 10.1016/S0021-9258(18)63872-4 . ПМИД 2501306 .
Фарнсворт CC, Сибра MC, Эрикссон Л.Х., Гелб М.Х., Гломсет Дж.А. (декабрь 1994 г.). «Rab-геранилгеранилтрансфераза катализирует геранилгеранилирование соседних цистеинов в малых ГТФазах Rab1A, Rab3A и Rab5A» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (25): 11963–7. Бибкод : 1994PNAS...9111963F . дои : 10.1073/pnas.91.25.11963 . ПМК 45356 . ПМИД 7991565 .
Кремерс Ф.П., Армстронг С.А., Сибра М.С., Браун М.С., Гольдштейн Дж.Л. (январь 1994 г.). «REP-2, эскортный белок Rab, кодируемый геном, подобным хороидеремии» . Журнал биологической химии . 269 (3): 2111–7. дои : 10.1016/S0021-9258(17)42142-9 . ПМИД 8294464 .
Стенмарк Х., Витале Г., Ульрих О., Зериал М. (ноябрь 1995 г.). «Рабаптин-5 является прямым эффектором малой ГТФазы Rab5 при слиянии эндоцитарных мембран» . Клетка . 83 (3): 423–32. дои : 10.1016/0092-8674(95)90120-5 . ПМИД 8521472 . S2CID 18768939 .
Вита Ф, Сорансо М.Р., Борелли В., Бертончин П., Забукки Г. (сентябрь 1996 г.). «Субклеточная локализация малой ГТФазы Rab5a в покоящихся и стимулированных нейтрофилах человека». Экспериментальные исследования клеток . 227 (2): 367–73. дои : 10.1006/excr.1996.0286 . ПМИД 8831575 .
Сяо Г.Х., Шоаринеджад Ф., Джин Ф., Големис Э.А., Юнг Р.С. (март 1997 г.). «Продукт гена туберозного склероза 2, туберин, действует как белок, активирующий Rab5 GTPase (GAP), модулируя эндоцитоз» . Журнал биологической химии . 272 (10): 6097–100. дои : 10.1074/jbc.272.10.6097 . hdl : 20.500.12613/9244 . ПМИД 9045618 .
Симонсен А., Липпе Р., Христофоридис С., Голье Дж. М., Брех А., Каллаган Дж., То Б. Х., Мерфи С., Зериал М., Стенмарк Х. (июль 1998 г.). «EEA1 связывает функцию PI (3) K с регуляцией Rab5 слияния эндосом». Природа . 394 (6692): 494–8. Бибкод : 1998Natur.394..494S . дои : 10.1038/28879 . ПМИД 9697774 . S2CID 4305220 .
Анант Дж.С., Деснуайерс Л., Мачиус М., Демелер Б., Хансен Дж.К., Вестовер К.Д., Дайзенхофер Дж., Сибра MC (сентябрь 1998 г.). «Механизм Rab-геранилгеранилирования: образование каталитического тройного комплекса». Биохимия . 37 (36): 12559–68. дои : 10.1021/bi980881a . ПМИД 9730828 .
Буччи С., Кьяриелло М., Латтеро Д., Майорано М., Бруни С.Б. (май 1999 г.). «Взаимодействие клонирования и характеристика кДНК, кодирующей пренилированный акцептор раба человека (PRA1)». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 258 (3): 657–62. дои : 10.1006/bbrc.1999.0651 . ПМИД 10329441 .
Каллаган Дж., Никсон С., Буччи С., То Б.Х., Стенмарк Х. (октябрь 1999 г.). «Прямое взаимодействие EEA1 с Rab5b» . Европейский журнал биохимии . 265 (1): 361–6. дои : 10.1046/j.1432-1327.1999.00743.x . ПМИД 10491193 .
Шишева А., Чинни С.Р., ДеМарко С. (сентябрь 1999 г.). «Общая роль ингибитора диссоциации GDP 2 в мембранном высвобождении белков Rab: модуляция его функциональных взаимодействий посредством структурных модификаций in vitro и in vivo». Биохимия . 38 (36): 11711–21. дои : 10.1021/bi990200r . ПМИД 10512627 .
Масуда Э.С., Луо И., Янг С., Шен М., Росси А.Б., Хуанг Б.С., Ю С., Беннетт М.К., Паян Д.Г., Шеллер Р.Х. (март 2000 г.). «Rab37 представляет собой новую ГТФазу, специфичную для тучных клеток, локализованную в секреторных гранулах». Письма ФЭБС . 470 (1): 61–4. дои : 10.1016/S0014-5793(00)01288-6 . ПМИД 10722846 . S2CID 38218555 .
Хоффенберг С., Лю Х, Николова Л., Холл Х.С., Дай В., Баун Р.Э., Дики Б.Ф., Барбьери М.А., Абаллай А., Шталь П.Д., Нолл Б.Дж. (август 2000 г.). «Новый мембранно-заякоренный белок, взаимодействующий с Rab5, необходимый для гомотипического слияния эндосом» . Журнал биологической химии . 275 (32): 24661–9. дои : 10.1074/jbc.M909600199 . ПМИД 10818110 .
Нильсен Э., Христофоридис С., Уттенвейлер-Джозеф С., Мячинска М., Девитте Ф., Вильм М., Хофлак Б., Зериал М. (октябрь 2000 г.). «Рабеносин-5, новый эффектор Rab5, образует комплекс с hVPS45 и рекрутируется в эндосомы через пальцевый домен FYVE» . Журнал клеточной биологии . 151 (3): 601–12. дои : 10.1083/jcb.151.3.601 . ПМК 2185588 . ПМИД 11062261 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Ланцетти Л., Рыбин В., Малабарба М.Г., Кристофоридис С., Сцита Г., Зериал М., Ди Фиоре П.П. (ноябрь 2000 г.). «Белок Eps8 координирует передачу сигналов рецептора EGF через Rac и транспортировку через Rab5». Природа . 408 (6810): 374–7. Бибкод : 2000Natur.408..374L . дои : 10.1038/35042605 . ПМИД 11099046 . S2CID 4405293 .
Вольф Р.М., Уилкс Дж.Дж., Чао М.В., Реш, доктор медицинских наук (октябрь 2001 г.). «Фосфорилирование тирозина p190 RhoGAP с помощью Fyn регулирует дифференцировку олигодендроцитов». Журнал нейробиологии . 49 (1): 62–78. дои : 10.1002/neu.1066 . ПМИД 11536198 .
Сикрист Дж.Л., Лапорт С.А., Дейл Л.Б., Бабва А.В., Кэрон М.Г., Анборг П.Х., Фергюсон С.С. (январь 2002 г.). «Ассоциация Rab5 с рецептором ангиотензина II типа 1А способствует связыванию Rab5 GTP и слиянию везикул» . Журнал биологической химии . 277 (1): 679–85. дои : 10.1074/jbc.M109022200 . ПМИД 11682489 .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000144566 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000017831 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1999336-5] Руссо-Мерк М.Ф., Зарауи А., Тушо Н., Тавитян А., Бергер Р. (февраль 1991 г.). «Назначение хромосом четырех генов RAB, связанных с RAS». Генетика человека . 86 (4): 350–4. дои : 10.1007/BF00201831 . ПМИД 1999336 . S2CID 30730416 .

[entrez-6] «Ген Энтрез: RAB5A RAB5A, член семейства онкогенов RAS» .

[7] Хуотари Дж., Хелениус А. (август 2011 г.). «Созревание эндосом» . Журнал ЭМБО . 30 (17): 3481–500. дои : 10.1038/emboj.2011.286 . ПМК 3181477 . ПМИД 21878991 .

[8] Чжан С., Ли А., Чжан Х., Сяо Х. (март 2011 г.). «Новый белковый комплекс TIP30 регулирует передачу сигналов рецептора EGF и эндоцитарную деградацию» . Журнал биологической химии . 286 (11): 9373–81. дои : 10.1074/jbc.M110.207720 . ПМЦ 3058969 . ПМИД 21252234 .

[pmid9730828-9] Анант Дж.С., Деснуайерс Л., Мачиус М., Демелер Б., Хансен Дж.К., Вестовер К.Д., Дайзенхофер Дж., Сибра MC (сентябрь 1998 г.). «Механизм Rab-геранилгеранилирования: образование каталитического тройного комплекса». Биохимия . 37 (36): 12559–68. дои : 10.1021/bi980881a . ПМИД 9730828 .

[pmid8294464-10] Кремерс Ф.П., Армстронг С.А., Сибра М.С., Браун М.С., Гольдштейн Дж.Л. (январь 1994 г.). «REP-2, эскортный белок Rab, кодируемый геном, подобным хороидеремии» . Журнал биологической химии . 269 (3): 2111–7. дои : 10.1016/S0021-9258(17)42142-9 . ПМИД 8294464 .

[pmid9045618-11] Сяо Г.Х., Шоаринеджад Ф., Джин Ф., Големис Э.А., Юнг Р.С. (март 1997 г.). «Продукт гена туберозного склероза 2, туберин, действует как белок, активирующий Rab5 GTPase (GAP), модулируя эндоцитоз» . Журнал биологической химии . 272 (10): 6097–100. дои : 10.1074/jbc.272.10.6097 . hdl : 20.500.12613/9244 . ПМИД 9045618 .

[pmid9524117-12] Витале Г., Рыбин В., Христофоридис С., Торнквист П., Маккаффри М., Стенмарк Х., Зериал М. (апрель 1998 г.). «Отдельные Rab-связывающие домены опосредуют взаимодействие рабаптина-5 с GTP-связанными Rab4 и Rab5» . Журнал ЭМБО . 17 (7): 1941–51. дои : 10.1093/emboj/17.7.1941 . ПМК 1170540 . ПМИД 9524117 .

[pmid8521472-13] Стенмарк Х., Витале Г., Ульрих О., Зериал М. (ноябрь 1995 г.). «Рабаптин-5 является прямым эффектором малой ГТФазы Rab5 при слиянии эндоцитарных мембран» . Клетка . 83 (3): 423–32. дои : 10.1016/0092-8674(95)90120-5 . ПМИД 8521472 . S2CID 18768939 .

[pmid11718716-14] Валсдоттир Р., Хасимото Х., Ашман К., Кода Т., Сторри Б., Нильссон Т. (ноябрь 2001 г.). «Идентификация рабаптина-5, рабекса-5 и GM130 как предполагаемых эффекторов rab33b, регулятора ретроградного движения между аппаратом Гольджи и ЭР» . Письма ФЭБС . 508 (2): 201–9. дои : 10.1016/s0014-5793(01)02993-3 . ПМИД 11718716 . S2CID 21545088 .

[pmid15014045-15] Томода Т., Ким Дж. Х., Жан С., Хаттен М. Е. (март 2004 г.). «Роль Unc51.1 и его партнеров по связыванию в росте аксонов ЦНС» . Гены и развитие . 18 (5): 541–58. дои : 10.1101/gad.1151204 . ПМЦ 374236 . ПМИД 15014045 .

[pmid11062261-16] Нильсен Э., Христофоридис С., Уттенвейлер-Джозеф С., Мячинска М., Девитте Ф., Вильм М., Хофлак Б., Зериал М. (октябрь 2000 г.). «Рабеносин-5, новый эффектор Rab5, образует комплекс с hVPS45 и рекрутируется в эндосомы через пальцевый домен FYVE» . Журнал клеточной биологии . 151 (3): 601–12. дои : 10.1083/jcb.151.3.601 . ПМК 2185588 . ПМИД 11062261 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]