Protein-coding gene in the species Homo sapiens
ОБСК Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB показывать Список идентификационных кодов PDB 1V1C , 2CR6 , 2DKU , 2DM7 , 2E7B , 2EDF , 2EDH , 2EDL , 2EDQ , 2EDR , 2EDT , 2EDW , 2ENY , 2EO1 , 2GQH , 2YZ8 , 4C4K , 2MWC , 4RSV , 2N56
Идентификаторы Псевдонимы OBSCN , ARHGEF30, UNC89, обскурин, цитоскелетный кальмодулин и взаимодействующий с тайтином RhoGEF Внешние идентификаторы Опустить : 608616 ; МГИ : 2681862 ; Гомологен : 70869 ; GeneCards : OBSCN ; ОМА : OBSCN - ортологи показывать экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog)Top expressed in muscle of thigh apex of heart gastrocnemius muscle Skeletal muscle tissue of rectus abdominis right auricle left ventricle body of tongue biceps brachii Skeletal muscle tissue of biceps brachii right hemisphere of cerebellum
Top expressed in muscle of thigh myocardium of ventricle knee joint skeletal muscle tissue interventricular septum triceps brachii muscle quadriceps femoris muscle temporal muscle digastric muscle extraocular muscle
More reference expression data
BioGPS
Викиданные
Обскурин — белок , который у человека кодируется OBSCN геном . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] Обскурин принадлежит к семейству гигантских саркомерных сигнальных белков, в которое входят тайтин и небулин . Обскурин экспрессируется в сердечной и скелетных мышцах и играет роль в организации миофибрилл во время саркомера сборки . Мутация гена OBSCN связана с гипертрофической кардиомиопатией , а измененные свойства белка обскурина связаны с другими мышечными заболеваниями.
Человеческий обскурин может существовать в виде множественных вариантов сплайсинга массой около 720 кДа . [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] однако на сегодняшний день описан только один из них в полный рост. [ 13 ] Обскурин экспрессируется в сердечной и скелетных мышцах. Ген обскурина имеет размер более 150 т.п.н., содержит более 80 экзонов . [ 14 ] Кодируемый белок содержит 68 доменов Ig , 2 домена фибронектина, 1 мотив связывания кальмодулина IQ , 1 домен RhoGEF со связанным доменом PH и 2 домена серин-треониновой киназы. [ 13 ] Доминирующая локализация обскурина в зрелых миофибриллах находится в саркомерном М-диапазоне . [ 13 ] [ 15 ] Титин , обскурин, обскурин-подобный-1 и миомезин образуют тройной комплекс на саркомерных М-полосах , что имеет решающее значение для механики саркомера . [ 16 ]
Обскурин принадлежит к семейству гигантских саркомерных сигнальных белков, которое включает тайтин и небулин , и может играть роль в организации миофибрилл во время сборки и может опосредовать взаимодействия между саркоплазматическим ретикулумом и миофибриллами . Обскурин является основным цитоплазматическим лигандом малого анкирина 1 (sANK1), саркоплазматического ретикулярного белка, и каркасная функция обскурина, по-видимому, предотвращает деградацию sANK1 . [ 17 ] Эти данные свидетельствуют о том, что обскурин служит сигнальным звеном между саркомерным и саркоплазматическим ретикулярными доменами. [ 18 ] [ 19 ] Обскурин играет роль в образовании новых саркомеров во время сборки миофибрилл . [ 20 ] в частности, на периферии саркомера, где лежат места инициации и прогрессирования миофибрилогенеза. [ 21 ] [ 22 ] Обскурин, по-видимому, необходим для правильного включения миозиновых нитей в саркомеры и сборки А-полос . [ 15 ] [ 23 ] Более того, киназные домены обскурина ферментативно активны и, по-видимому, участвуют в регуляции клеточной адгезии. [ 24 ]
Было показано, что обскурин демонстрирует связанное с заболеванием переключение изоформ у пациентов с дилатационной кардиомиопатией . [ 25 ] была выявлена мутация обскурина Arg 4344 Gln У пациентов с гипертрофической кардиомиопатией , которая нарушала связывание обскурина с доменами Z9-Z10 тайтина . [ 26 ] Однако более позднее исследование не смогло воспроизвести этот эффект. [ 27 ] Из-за отсутствия доказательств механизма и высокой распространенности среди афроамериканцев вариант Arg4344Gln в настоящее время не считается патогенным. [ 28 ] [ 29 ] Мутации, обнаруженные в гене, кодирующем тайтин , у пациентов с мышечной дистрофией конечностей 2J или миопатией Салиха, снижают способность тайтина связывать обскурин, что позволяет предположить, что это может быть причиной проявления заболевания. [ 30 ]
Было показано, что Обскурин взаимодействует с Титином . [ 5 ] [ 31 ] в частности, с Novex-3 тайтина размером 6,5 т.п.н., , экзоном расположенным выше кардиоспецифического N2B экзона . [ 32 ] С-концевая область обскурина взаимодействует с цитоплазматическим доменом малого анкирина 1. [ 33 ] [ 34 ] и с областью экзона 43' B. анкирина [ 35 ] Ig3 обскурина связывает миомезин в линкере между My4 и My5. [ 30 ]
^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000154358 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000061462 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: а б Янг П., Элер Э., Готель М. (июль 2001 г.). «Обскурин, гигантский саркомерный белок фактора обмена гуаниновых нуклеотидов рогуанина, участвующий в сборке саркомера» . Журнал клеточной биологии . 154 (1): 123–36. дои : 10.1083/jcb.200102110 . ПМК 2196875 . ПМИД 11448995 .
^ Рассел М.В., Ракер М.О., Корытковски К.А., Зоннеман К.Дж. (январь 2002 г.). «Идентификация, тканевая экспрессия и хромосомная локализация человеческого обскурина-MLCK, члена семейств тайтина и Dbl киназ легкой цепи миозина». Джин . 282 (1–2): 237–46. дои : 10.1016/S0378-1119(01)00795-8 . ПМИД 11814696 .
^ «Ген Энтрез: обскурин OBSCN, цитоскелетный кальмодулин и взаимодействующий с тайтином RhoGEF» .
^ «Q5VST9» .
^ «Q5VST9-6» .
^ «Q5VST9-2» .
^ «Q5VST9-3» .
^ «Q5VST9-5» .
^ Перейти обратно: а б с Янг П., Элер Э., Готель М. (июль 2001 г.). «Обскурин, гигантский саркомерный белок фактора обмена гуаниновых нуклеотидов рогуанина, участвующий в сборке саркомера» . Журнал клеточной биологии . 154 (1): 123–36. дои : 10.1083/jcb.200102110 . ПМК 2196875 . ПМИД 11448995 .
^ Фукузава А., Идову С., Гаутель М. (2005). «Полная генная структура обскурина человека: значение для генерации изоформ путем дифференциального сплайсинга». Журнал исследований мышц и подвижности клеток . 26 (6–8): 427–34. дои : 10.1007/s10974-005-9025-6 . ПМИД 16625316 . S2CID 20522555 .
^ Перейти обратно: а б Карлссон Л., Ю Дж.Г., Торнелл Л.Е. (июль 2008 г.). «Новые аспекты обскурина в поперечнополосатых мышцах человека». Гистохимия и клеточная биология . 130 (1): 91–103. дои : 10.1007/s00418-008-0413-z . ПМИД 18350308 . S2CID 35469988 .
^ Перниго С., Фукудзава А., Берц М., Холт М., Риф М., Штайнер Р.А., Гаутель М. (февраль 2010 г.). «Структурное понимание сборки и механики M-диапазона комплекса тайтин-обскурин-подобный-1» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (7): 2908–13. Бибкод : 2010PNAS..107.2908P . дои : 10.1073/pnas.0913736107 . ПМЦ 2814874 . ПМИД 20133654 .
^ Ланге С., Перера С., Тэ П., Чен Дж. (июль 2012 г.). «Обскурин и KCTD6 регулируют куллинозависимый оборот малого белка анкирина-1 (sAnk1.5)» . Молекулярная биология клетки . 23 (13): 2490–504. дои : 10.1091/mbc.E12-01-0052 . ПМК 3386213 . ПМИД 22573887 .
^ Баньято П., Бароне В., Джакомелло Э., Росси Д., Соррентино В. (январь 2003 г.). «Связывание изоформы анкирина-1 с обскурином предполагает молекулярную связь между саркоплазматическим ретикулумом и миофибриллами в поперечнополосатых мышцах» . Журнал клеточной биологии . 160 (2): 245–53. дои : 10.1083/jcb.200208109 . ПМК 2172649 . ПМИД 12527750 .
^ Контроджианни-Константопулос А., Джонс Э.М., Ван Россум Д.Б., Блох Р.Дж. (март 2003 г.). «Обскурин является лигандом малого анкирина 1 в скелетных мышцах» . Молекулярная биология клетки . 14 (3): 1138–48. дои : 10.1091/mbc.E02-07-0411 . ПМЦ 151585 . ПМИД 12631729 .
^ Борисов А.Б., Контроджианни-Константопулос А., Блох Р.Дж., Вестфолл М.В., Рассел М.В. (сентябрь 2004 г.). «Динамика локализации обскурина при дифференцировке и ремоделировании кардиомиоцитов: обскурин как интегратор миофибриллярной структуры» . Журнал гистохимии и цитохимии . 52 (9): 1117–27. дои : 10.1369/jhc.3A6183.2004 . ПМИД 15314079 .
^ Борисов А.Б., Ракер М.О., Контроджианни-Константопулос А., Ян К., Курнит Д.М., Блох Р.Дж., Рассел М.В. (октябрь 2003 г.). «Быстрая реакция кластера генов сердечного обскурина на аортальный стеноз: дифференциальная активация Rho-GEF и MLCK и участие в гипертрофическом росте». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 310 (3): 910–8. дои : 10.1016/j.bbrc.2003.09.035 . ПМИД 14550291 .
^ Борисов А.Б., Мартынова М.Г., Рассел М.В. (апрель 2008 г.). «Раннее включение обскурина в зарождающиеся саркомеры: значение сборки миофибрилл во время сердечного миогенеза» . Гистохимия и клеточная биология . 129 (4): 463–78. дои : 10.1007/s00418-008-0378-y . ПМЦ 2761667 . ПМИД 18219491 .
^ Борисов А.Б., Саттер С.Б., Контроджианни-Константопулос А., Блох Р.Дж., Вестфолл М.В., Рассел М.В. (март 2006 г.). «Существенная роль обскурина в сердечном миофибриллогенезе и гипертрофическом ответе: данные молчания генов, опосредованного небольшой интерферирующей РНК» (PDF) . Гистохимия и клеточная биология . 125 (3): 227–38. дои : 10.1007/s00418-005-0069-x . hdl : 2027.42/47398 . ПМИД 16205939 . S2CID 13623244 .
^ Ху Л.Ю., Контроджианни-Константопулос А. (май 2013 г.). «Киназные домены обскурина взаимодействуют с белками межклеточной адгезии» . Журнал ФАСЭБ . 27 (5): 2001–12. дои : 10.1096/fj.12-221317 . ПМЦ 3633816 . ПМИД 23392350 .
^ Макаренко И., Опиц К.А., Лик М.С., Ниго С., Кулке М. , Гватми Дж.К. и др. (октябрь 2004 г.). «Изменения пассивной жесткости, вызванные усилением регуляции податливых изоформ тайтина в сердцах человека с дилатационной кардиомиопатией» . Исследование кровообращения . 95 (7): 708–16. дои : 10.1161/01.RES.0000143901.37063.2f . ПМИД 15345656 .
^ Аримура Т., Мацумото Ю., Оказаки О., Хаяши Т., Такахаши М., Инагаки Н. и др. (октябрь 2007 г.). «Структурный анализ гена обскурина при гипертрофической кардиомиопатии». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 362 (2): 281–7. дои : 10.1016/j.bbrc.2007.07.183 . ПМИД 17716621 .
^ Фукузава А., Кох Д., Гровер С., Рис М., Готель М. (июнь 2021 г.). «Когда вариант обскурина является патогенным? Влияние вариантов Arg4344Gln и Arg4444Trp на белок-белковые взаимодействия и стабильность белка» . Молекулярная генетика человека . 30 (12): 1131–1141. дои : 10.1093/hmg/ddab010 . ПМК 8188405 . ПМИД 33438037 .
^ Фукузава А., Кох Д., Гровер С., Рис М., Готель М. (июнь 2021 г.). «Когда вариант обскурина является патогенным? Влияние вариантов Arg4344Gln и Arg4444Trp на белок-белковые взаимодействия и стабильность белка» . Молекулярная генетика человека . 30 (12): 1131–1141. дои : 10.1093/hmg/ddab010 . ПМК 8188405 . ПМИД 33438037 .
^ Манрай А.К., Функе Б.Х., Рем Х.Л., Олесен М.С., Марон Б.А., Соловиц П. и др. (август 2016 г.). «Генетические ошибочные диагнозы и потенциальные различия в состоянии здоровья» . Медицинский журнал Новой Англии . 375 (7): 655–65. дои : 10.1056/NEJMsa1507092 . ПМК 5292722 . ПМИД 27532831 .
^ Перейти обратно: а б Фукудзава А., Ланге С., Холт М., Вихола А., Карминьяк В., Феррейро А. и др. (июнь 2008 г.). «Взаимодействие с тайтином и миомезином, направленное на обскурин и обскурин-подобный 1 в M-диапазон: последствия для наследственных миопатий» . Журнал клеточной науки . 121 (11): 1841–51. дои : 10.1242/jcs.028019 . ПМИД 18477606 .
^ Перниго С., Фукудзава А., Пандини А., Холт М., Кляйнджунг Дж., Готель М., Штайнер Р.А. (февраль 2015 г.). «Кристаллическая структура человеческого комплекса тайтин:обскурин обнаруживает консервативный, но специфический модуль застежки-молнии в мышцах М-полосы» . Журнал молекулярной биологии . 427 (4): 718–36. дои : 10.1016/j.jmb.2014.11.019 . ПМИД 25490259 .
^ Банг М.Л., Центнер Т., Форнофф Ф., Гич А.Дж., Готхардт М., Макнабб М., Витт CC, Лабейт Д., Грегорио CC, Гранзье Х., Лабейт С. (ноябрь 2001 г.). «Полная последовательность гена тайтина, экспрессия необычной изоформы тайтина массой около 700 кДа и ее взаимодействие с обскурином идентифицируют новую систему связи Z-линии с I-диапазоном» . Исследование кровообращения . 89 (11): 1065–72. дои : 10.1161/hh2301.100981 . ПМИД 11717165 .
^ Контроджианни-Константопулос А., Джонс Э.М., Ван Россум Д.Б., Блох Р.Дж. (март 2003 г.). «Обскурин является лигандом малого анкирина 1 в скелетных мышцах» . Молекулярная биология клетки . 14 (3): 1138–48. дои : 10.1091/mbc.E02-07-0411 . ПМЦ 151585 . ПМИД 12631729 .
^ Басби Б., Оаши Т., Уиллис С.Д., Акерманн М.А., Контроджианни-Константопулос А., Маккерелл А.Д., Блох Р.Дж. (апрель 2011 г.). «Электростатические взаимодействия опосредуют связывание обскурина с небольшим анкирином 1: исследования биохимического и молекулярного моделирования» . Журнал молекулярной биологии . 408 (2): 321–34. дои : 10.1016/j.jmb.2011.01.053 . ПМЦ 3367564 . ПМИД 21333652 .
^ Кунья С.Р., Молер П.Дж. (ноябрь 2008 г.). «Обскурин нацеливает анкирин-В и протеинфосфатазу 2А на сердечную М-линию» . Журнал биологической химии . 283 (46): 31968–80. дои : 10.1074/jbc.M806050200 . ПМК 2581558 . ПМИД 18782775 .
Нагасе Т., Кикуно Р., Накаяма М., Хиросава М., Охара О. (август 2000 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XVIII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют крупные белки in vitro» . Исследование ДНК . 7 (4): 273–81. дои : 10.1093/dnares/7.4.271 . ПМИД 10997877 .
Банг М.Л., Центнер Т., Форнофф Ф., Гич А.Дж., Готхардт М., Макнабб М., Витт CC, Лабейт Д., Грегорио CC, Гранзье Х., Лабейт С. (ноябрь 2001 г.). «Полная последовательность гена тайтина, экспрессия необычной изоформы тайтина массой около 700 кДа и ее взаимодействие с обскурином идентифицируют новую систему связи Z-линии с I-диапазоном» . Исследование кровообращения . 89 (11): 1065–72. дои : 10.1161/hh2301.100981 . ПМИД 11717165 .
Баньято П., Бароне В., Джакомелло Э., Росси Д., Соррентино В. (январь 2003 г.). «Связывание изоформы анкирина-1 с обскурином предполагает молекулярную связь между саркоплазматическим ретикулумом и миофибриллами в поперечнополосатых мышцах» . Журнал клеточной биологии . 160 (2): 245–53. дои : 10.1083/jcb.200208109 . ПМК 2172649 . ПМИД 12527750 .
Контроджианни-Константопулос А., Джонс Э.М., Ван Россум Д.Б., Блох Р.Дж. (март 2003 г.). «Обскурин является лигандом малого анкирина 1 в скелетных мышцах» . Молекулярная биология клетки . 14 (3): 1138–48. дои : 10.1091/mbc.E02-07-0411 . ПМЦ 151585 . ПМИД 12631729 .
Контроджианни-Константопулос А., Катино Д.Х., Стронг Дж.К., Рэндалл В.Р., Блох Р.Дж. (июль 2004 г.). «Обскурин регулирует организацию миозина в полосы А». Американский журнал физиологии. Клеточная физиология . 287 (1): C209-17. doi : 10.1152/ajpcell.00497.2003 . ПМИД 15013951 .
Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С., Лей С., Мураж Дж., Фиск Г.Дж., Ли Ю, Сюй С., Фанг Р., Гуглер К., Рао М.С., Мандалам Р., Лебковски Дж., Стэнтон Л.В. (июнь 2004 г.). «Описание характеристик транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Природная биотехнология . 22 (6): 707–16. дои : 10.1038/nbt971 . ПМИД 15146197 . S2CID 27764390 .
Саттер С.Б., Ракер М.О., Борисов А.Б., Рассел М.В. (июль 2004 г.). «Ортологическое родство обскурина и Unc-89: филогения нового семейства тандемных киназ легкой цепи миозина» (PDF) . Гены развития и эволюция . 214 (7): 352–9. дои : 10.1007/s00427-004-0413-5 . hdl : 2027.42/47514 . ПМИД 15185077 . S2CID 7676954 .
Борисов А.Б., Саттер С.Б., Контроджианни-Константопулос А., Блох Р.Дж., Вестфолл М.В., Рассел М.В. (март 2006 г.). «Существенная роль обскурина в сердечном миофибриллогенезе и гипертрофическом ответе: данные молчания генов, опосредованного небольшой интерферирующей РНК» (PDF) . Гистохимия и клеточная биология . 125 (3): 227–38. дои : 10.1007/s00418-005-0069-x . hdl : 2027.42/47398 . ПМИД 16205939 . S2CID 13623244 .
Кимура К, Вакамацу А, Судзуки Ю, Ота Т, Нисикава Т, Ямашита Р, Ямамото Дж, Секине М, Цуритани К, Вакагури Х, Исии С, Сугияма Т, Сайто К, Исоно Ю, Ириэ Р, Кушида Н, Ёнеяма Т , Оцука Р., Канда К., Ёкой Т., Кондо Х., Вагацума М., Муракава К., Исида С., Исибаши Т., Такахаши-Фуджи А., Танасе Т., Нагай К., Кикучи Х., Накаи К., Исогай Т., Сугано С. (январь 2006 г.) «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов человеческих генов» . Геномные исследования . 16 (1): 55–65 . 10.1101 . ПМЦ 1356129 . гр.4039406 /
Фукудзава А., Идову С., Гаутель М. (2007). «Полная генная структура обскурина человека: значение для генерации изоформ путем дифференциального сплайсинга». Журнал исследований мышц и подвижности клеток . 26 (6–8): 427–34. дои : 10.1007/s10974-005-9025-6 . ПМИД 16625316 . S2CID 20522555 .
Прайс Н.Д., Трент Дж., Эль-Наггар А.К., Когделл Д., Тейлор Э., Хант К.К., Поллок Р.Э., Худ Л., Шмулевич И., Чжан В. (февраль 2007 г.). «Высокоточный двухгенный классификатор для дифференциации стромальных опухолей желудочно-кишечного тракта и лейомиосарком» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (9): 3414–9. Бибкод : 2007PNAS..104.3414P . дои : 10.1073/pnas.0611373104 . ПМК 1805517 . ПМИД 17360660 .
Боуман А.Л., Контроджианни-Константопулос А., Хирш С.С., Гейслер С.Б., Гонсалес-Серратос Х., Рассел М.В., Блох Р.Дж. (апрель 2007 г.). «Различные изоформы обскурина локализуются в разных участках саркомеров» . Письма ФЭБС . 581 (8): 1549–54. дои : 10.1016/j.febslet.2007.03.011 . ЧВК 1899168 . ПМИД 17382936 .
Аримура Т., Мацумото Ю., Окадзаки О., Хаяси Т., Такахаши М., Инагаки Н., Хинохара К., Асидзава Н., Яно К., Кимура А. (октябрь 2007 г.). «Структурный анализ гена обскурина при гипертрофической кардиомиопатии». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 362 (2): 281–7. дои : 10.1016/j.bbrc.2007.07.183 . ПМИД 17716621 .
Борзок М.А., Катино Д.Х., Николсон Дж.Д., Контроджианни-Константопулос А., Блох Р.Дж. (ноябрь 2007 г.). «Картирование сайта связывания на маленьком анкирине 1 для обскурина» . Журнал биологической химии . 282 (44): 32384–96. дои : 10.1074/jbc.M704089200 . ПМИД 17720975 .
показывать галерея PDB
1v1c : SOLUTION STRUCTURE OF THE SH3 DOMAIN OF OBSCURIN
2cr6 : Solution structure of the Ig domain (2998-3100) of human obscurin
2dku : Solution structure of the third Ig-like domain of human KIAA1556 protein
показывать Activity Regulation Classification Kinetics Types