Домен RhoGEF

Дедикатор цитокинеза (DOCK) RhoGEF домен
Дедикатор цитокинеза (DOCK) RhoGEF домен
Идентификаторы
Символ	Давать
Пфам	PF06920
ИнтерПро	ИПР010703 ИПР026791, ИПР010703
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2	1wg7 / SCOPe / СУПФАМ
CDD	cd11684
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary
PDB	1wg7

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary
PDB	1foeE:1044-1233 1f5xA:198-372 1ki1D:1241-1422 1ntyA:1237-1407 1kzgC:636-811 1lb1C:636-811 1kz7C:636-811 1rj2D:511-686 1xcgE:738-922 1txdA:791-976 1x86E:791-976 1by1A:275-450 1dbhA:204-389 1xdvB:204-389 1xd4A:204-389

Домен DH/PH RhoGEF
Домен DH/PH RhoGEF
	Структура домена RhoGEF человеческого белка Son of Sevenless, пример домена DH/PH RhoGEF.
Идентификаторы
Символ	Давать
Пфам	PF00621
ИнтерПро	ИПР035899 ИПР000219, ИПР035899
УМНЫЙ	Давать
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2	1дбх / СКОПе / СУПФАМ
белок OPM	1xd4
CDD	cd00160
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary
PDB	1foeE:1044-1233 1f5xA:198-372 1ki1D:1241-1422 1ntyA:1237-1407 1kzgC:636-811 1lb1C:636-811 1kz7C:636-811 1rj2D:511-686 1xcgE:738-922 1txdA:791-976 1x86E:791-976 1by1A:275-450 1dbhA:204-389 1xdvB:204-389 1xd4A:204-389

Домен RhoGEF описывает два различных структурных домена с активностью фактора обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF) для регулирования малых ГТФаз в семействе Rho . Малые ГТФазы Rho неактивны, когда связаны с GDP , но активны, когда связаны с GTP ; Домены RhoGEF в белках способны способствовать высвобождению GDP и связыванию GTP для активации специфических членов семейства Rho, включая RhoA , Rac1 и Cdc42 .

Самый большой класс RhoGEF состоит из белков, содержащих домен « Dbl -гомологии» ( DH ), который почти всегда обнаруживается вместе с доменом гомологии плекстрина (PH), образуя комбинированную структуру домена DH/PH. ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}

Отдельным классом RhoGEF являются белки, содержащие домен DOCK/CZH/DHR-2 . Эта структура не имеет сходства последовательностей с доменами DBL-гомологии. ^{[ 4 ]}

Белки человека, содержащие домен DH/PH RhoGEF

АБР ; AKAP13/ARHGEF13/Lbc ; БАС2 ; АЛС2CL ; ARHGEF1/p115-RhoGEF ; АРХГЭФ10 ; АРХГЕФ10L ; ARHGEF11/PDZ-RhoGEF. ; ARHGEF12/LARG ; АРХГЭФ15 ; АРХГЭФ16 ; ARHGEF17 ; ARHGEF18 ; АРХГЭФ19 ; АРХГЭФ2 ; АРХГЭФ25 ; АРХГЭФ26 ; ARHGEF28 ; АРХГЭФ3 ; АРХГЕФ33 ; АРХГЭФ35 ; ARHGEF37 ; ARHGEF38 ; ARHGEF39 ; АРХГЭФ4 ; АРХГЭФ40 ; АРХГЭФ5 ; ARHGEF6/альфа-PIX ; ARHGEF7/бета-PIX ; АРХГЭФ9 ; БЦР ; ДНМБП ; ЕКТ2 ; ЕКТ2Л ; ФАРП1 ; ФАРП2 ; ФГД1 ; ФГД2 ; ФГД3 ; ФГД4 ; ФГД5 ; ФГД6 ; ITSN1/Интерсектин 1 ; ITSN2/Интерсектин 2 ; КАЛРН/Калирин ; МЦФ2 ; МЦФ2Л ; МЦФ2Л2 ; NET1 ; НЭФ ; ОБСКН ; ПЛЕХГ1 ; ПЛЕХГ2 ; ПЛЕХГ3 ; ПЛЕХГ4 ; ПЛЕХГ4Б ; ПЛЕХГ5 ; ПЛЕХГ6 ; ПРЕКС1 ; ПРЕКС2 ; РАСГРФ1 ; РАСГРФ2 ; СПАТА13 ; ТИАМ1 ; ТИАМ2 ; ТРИО ; ВАВ1 ; ВАВ2 ; ВАВ3 .

Белки человека, содержащие домен DOCK/CZH RhoGEF

ДОК1/ДОК180 ; ДОК2 ; ДОК3/МОКА ; ДОК4 ; ДОК5 ; ДОК6/ЗИР1 ; ДОК7/ЗИР2 ; ДОК8/ЗИР3 ; ДОК9/Зизимин1 ; ДОК10/Зизимин2 ; ДОК11/Зизимин3

См. также

Ссылки

^ Суассон С.М., Нимнуал А.С., Уй М., Бар-Саги Д., Куриян Дж. (октябрь 1998 г.). «Кристаллическая структура доменов гомологичности Dbl и плекстрина человеческого сына безсемерного белка» . Клетка . 95 (2): 259–68. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81756-0 . ПМИД 9790532 . S2CID 11868669 .
^ Форт П, Бланжи А (июнь 2017 г.). «Эволюционный ландшафт Dbl-подобных семейств RhoGEF: адаптация эукариотических клеток к сигналам окружающей среды» . Геномная биология и эволюция . 9 (6): 1471–1486. дои : 10.1093/gbe/evx100 . ПМЦ 5499878 . ПМИД 28541439 .
^ Черионе Р.А., Чжэн Ю (апрель 1996 г.). «Семейство онкогенов Dbl» . Современное мнение в области клеточной биологии . 8 (2): 216–22. дои : 10.1016/s0955-0674(96)80068-8 . ПМИД 8791419 .
^ Коте Ж.Ф., Вуори К. (декабрь 2002 г.). «Идентификация эволюционно консервативного суперсемейства родственных DOCK180 белков с обменной активностью гуаниновых нуклеотидов» . Журнал клеточной науки . 115 (Часть 24): 4901–13. дои : 10.1242/jcs.00219 . ПМИД 12432077 .

Дальнейшее чтение

Харт М.Дж., Ева А., Эванс Т., Ааронсон С.А., Серионе Р.А. (ноябрь 1991 г.). «Катализ обмена гуаниновых нуклеотидов на белке CDC42Hs продуктом онкогена dbl». Природа . 354 (6351): 311–4. дои : 10.1038/354311a0 . ПМИД 1956381 . S2CID 4240053 .
Тан Э.К., Люнг Т., Мансер Э., Лим Л. (декабрь 1993 г.). «Ген, связанный с областью кластера активной точки разрыва человека, кодирует белок головного мозга, гомологичный белкам обмена гуаниновых нуклеотидов и белкам, активирующим ГТФазу» . Журнал биологической химии . 268 (36): 27291–8. дои : 10.1016/S0021-9258(19)74248-3 . ПМИД 8262969 .
Суассон С.М., Нимнуал А.С., Уй М., Бар-Саги Д., Куриян Дж. (октябрь 1998 г.). «Кристаллическая структура доменов гомологичности Dbl и плекстрина человеческого сына безсемерного белка» . Клетка . 95 (2): 259–68. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81756-0 . ПМИД 9790532 . S2CID 11868669 .

Эта мембранных белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[pmid9790532-1] Суассон С.М., Нимнуал А.С., Уй М., Бар-Саги Д., Куриян Дж. (октябрь 1998 г.). «Кристаллическая структура доменов гомологичности Dbl и плекстрина человеческого сына безсемерного белка» . Клетка . 95 (2): 259–68. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81756-0 . ПМИД 9790532 . S2CID 11868669 .

[pmid28541439-2] Форт П, Бланжи А (июнь 2017 г.). «Эволюционный ландшафт Dbl-подобных семейств RhoGEF: адаптация эукариотических клеток к сигналам окружающей среды» . Геномная биология и эволюция . 9 (6): 1471–1486. дои : 10.1093/gbe/evx100 . ПМЦ 5499878 . ПМИД 28541439 .

[pmid8791419-3] Черионе Р.А., Чжэн Ю (апрель 1996 г.). «Семейство онкогенов Dbl» . Современное мнение в области клеточной биологии . 8 (2): 216–22. дои : 10.1016/s0955-0674(96)80068-8 . ПМИД 8791419 .

[pmid12432077-4] Коте Ж.Ф., Вуори К. (декабрь 2002 г.). «Идентификация эволюционно консервативного суперсемейства родственных DOCK180 белков с обменной активностью гуаниновых нуклеотидов» . Журнал клеточной науки . 115 (Часть 24): 4901–13. дои : 10.1242/jcs.00219 . ПМИД 12432077 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]