АККАУНТ13

АККАУНТ13
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2DRN, 2LG1, 4D0N, 4D0O
Идентификаторы
Псевдонимы	AKAP13 , якорный белок 13 киназы A (PRKA), AKAP-13, AKAP-Lbc, ARHGEF13, BRX, HA-3, Ht31, LBC, PRKA13, PROTO-LB, PROTO-LBC, c-lbc, p47, A-киназа якорный белок 13, якорный белок 13 А-киназы
Внешние идентификаторы	Опустить : 604686 ; МГИ : 2676556 ; Гомологен : 4903 ; Генные карты : AKAP13 ; ОМА : AKAP13 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 15 (human)
End	85,749,358 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	75,754,609 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	tendon of biceps brachii; ; Achilles tendon; ; lower lobe of lung; ; sural nerve; ; epithelium of colon; ; visceral pleura; ; pylorus; ; apex of heart; ; tail of epididymis; ; right ventricle;
	Top expressed in
	mesenteric lymph nodes; ; lumbar spinal ganglion; ; blood; ; submandibular gland; ; bone marrow; ; spleen; ; granulocyte; ; foot; ; extraocular muscle; ; ankle;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	metal ion binding; MAP-kinase scaffold activity; guanyl-nucleotide exchange factor activity; protein binding; molecular adaptor activity; protein kinase A binding; signal transducer activity; cAMP-dependent protein kinase activity;
Cellular component	membrane; cytosol; actin cytoskeleton; perinuclear region of cytoplasm; nucleus; cell cortex; actin filament; cortical actin cytoskeleton; cytoplasm; intracellular anatomical structure;
Biological process	regulation of cardiac muscle hypertrophy; bone development; intracellular signal transduction; regulation of glucocorticoid mediated signaling pathway; positive regulation of Rho protein signal transduction; regulation of sarcomere organization; positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; adrenergic receptor signaling pathway; regulation of small GTPase mediated signal transduction; adenylate cyclase-activating adrenergic receptor signaling pathway involved in heart process; heart development; positive regulation of apoptotic process; cardiac muscle cell differentiation; regulation of Rho protein signal transduction; protein phosphorylation; regulation of protein kinase activity; nuclear export; G protein-coupled receptor signaling pathway; positive regulation of MAP kinase activity; cell growth involved in cardiac muscle cell development;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	11214
	75547
	ENSG00000170776
	ENSMUSG00000066406
	Q12802
	E9Q394
	НМ_144767 ; НМ_001270546 ; НМ_006738 ; НМ_007200 ; НМ_032162
	НМ_029332
	НП_001257475 ; НП_006729 ; НП_009131
	НП_083608
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Якорный белок 13 А-киназы — это белок , который у человека кодируется AKAP13 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Этот белок также называется AKAP-Lbc, поскольку он кодирует онкоген лимфоцитарного бластного кризиса (Lbc) , и ARHGEF13/RhoGEF13, поскольку он содержит фактора обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF) домен для RhoA малого GTP-связывающего белка .

Функция

Якорный белок 13 А-киназы/фактор обмена гуаниновых нуклеотидов 13 Rho представляет собой фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF) для RhoA малого белка ГТФазы . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} Rho представляет собой небольшой белок ГТФазы , который неактивен при связывании с гуаниновым нуклеотидом GDP . Но под действием белков Rho GEF, таких как AKAP13, этот GDP высвобождается и заменяется GTP , что приводит к активному состоянию Rho. В этой активной, GTP-связанной конформации Rho может связываться со специфическими эффекторными белками и ферментами и активировать их для регулирования клеточных функций. ^{[ 10 ]} клетки В частности, активный Rho является основным регулятором актинового цитоскелета . ^{[ 10 ]}

AKAP13 является членом группы из четырех белков RhoGEF, которые, как известно, активируются рецепторами, связанными с G-белком , связанными с G ₁₂ и G ₁₃ гетеротримерными G-белками . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} Другими являются ARHGEF1 (также известный как p115-RhoGEF), ARHGEF11 (также известный как PDZ-RhoGEF) и ARHGEF12 (также известный как LARG). ^{[ 11 ]}^{[ 8 ]} GPCR-регулируемый AKAP13 (и родственные ему белки GEF) действует как эффектор для белков G ₁₂ и G ₁₃ G. В отличие от трех других членов, AKAP13 не действует как семейства RGS белки, активирующие ГТФазу (GAP) , увеличивая скорость гидролиза GTP белков G ₁₂ /G ₁₃ альфа. ^{[ 12 ]}

Якорные белки А-киназы (AKAP) представляют собой группу структурно разнообразных белков, которые имеют общую функцию связывания с регуляторной субъединицей протеинкиназы А (PKA), тем самым удерживая голофермент в отдельных местах внутри клетки. Ген AKAP13 кодирует члена семейства AKAP, поскольку белок прочно связывается с PKA, особенно в сердце.

Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к образованию как минимум трех вариантов транскрипта, кодирующих разные изоформы. Все три содержат домен гомологии онкогена Dbl (DH) плюс домен гомологии плекстрина (PH) (домен DH/PH), характерный для GEF семейства Rho, в то время как только две более длинные изоформы также содержат домен AKAP. ^{[ 7 ]} Следовательно, эти изоформы могут функционировать как каркасные белки для координации передачи сигналов Rho и передачи сигналов протеинкиназы А.

Взаимодействия

Было показано, что AKAP13 взаимодействует с:

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000170776 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000066406 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б Рубино Д., Дриггерс П., Арбит Д., Кемп Л., Миллер Б., Косо О. и др. (май 1998 г.). «Характеристика Brx, нового члена семейства Dbl, который модулирует действие рецепторов эстрогена». Онкоген . 16 (19): 2513–26. дои : 10.1038/sj.onc.1201783 . ПМИД 9627117 . S2CID 20906586 .
^ Карр Д.В., Стофко-Хан Р.Э., Фрейзер И.Д., Бишоп С.М., Экотт Т.С., Бреннан Р.Г., Скотт Дж.Д. (август 1991 г.). «Взаимодействие регуляторной субъединицы (RII) цАМФ-зависимой протеинкиназы с RII-заякоренными белками происходит посредством мотива связывания амфипатической спирали» . Журнал биологической химии . 266 (22): 14188–92. дои : 10.1016/S0021-9258(18)98665-5 . ПМИД 1860836 .
^ Jump up to: ^а ^б «Введите ген: якорный белок 13 киназы AKAP13 A (PRKA)» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Дивиани Д., Содерлинг Дж., Скотт Дж.Д. (ноябрь 2001 г.). «AKAP-Lbc закрепляет протеинкиназу А и зарождает Galpha 12-селективное Rho-опосредованное образование стрессовых волокон» . Журнал биологической химии . 276 (47): 44247–57. дои : 10.1074/jbc.M106629200 . ПМИД 11546812 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Датт П., Нгуен Н., Токсоз Д. (февраль 2004 г.). «Роль Lbc RhoGEF в индуцированных Galpha12/13 сигналах к Rho GTPase». Сотовая сигнализация . 16 (2): 201–9. дои : 10.1016/S0898-6568(03)00132-3 . ПМИД 14636890 .
^ Jump up to: ^а ^б Тумкео Д., Ватанабэ С., Нарумия С. (октябрь – ноябрь 2013 г.). «Физиологическая роль Rho и Rho-эффекторов у млекопитающих». Европейский журнал клеточной биологии . 92 (10–11): 303–15. дои : 10.1016/j.ejcb.2013.09.002 . ПМИД 24183240 .
^ Фукухара С., Чикуми Х., Гуткинд Дж.С. (март 2001 г.). «RGS-содержащие RhoGEF: недостающее звено между трансформацией G-белков и Rho?» . Онкоген . 20 (13): 1661–8. дои : 10.1038/sj.onc.1204182 . ПМИД 11313914 .
^ Козаса Т. (апрель 2001 г.). «Регуляция передачи сигнала, опосредованной G-белком, белками RGS». Науки о жизни . 68 (19–20): 2309–17. дои : 10.1016/S0024-3205(01)01020-7 . ПМИД 11358341 .
^ Парк Б., Нгуен Н.Т., Датт П., Мердек К.Д., Башар М., Стерпетти П. и др. (ноябрь 2002 г.). «Ассоциация фактора обмена гуаниновых нуклеотидов Lbc Rho с белком, родственным альфа-катенину, альфа-катулин / CTNNAL1, поддерживает активацию фактора ответа сыворотки» . Журнал биологической химии . 277 (47): 45361–70. дои : 10.1074/jbc.M202447200 . ПМИД 12270917 .
^ Альто Н.М., Содерлинг С.Х., Хоши Н., Лангеберг Л.К., Файос Р., Дженнингс П.А., Скотт Дж.Д. (апрель 2003 г.). «Биоинформатический дизайн белка, закрепляющего А-киназу, in silico: мощный и селективный пептидный антагонист закрепления протеинкиназы А типа II» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (8): 4445–50. Бибкод : 2003PNAS..100.4445A . дои : 10.1073/pnas.0330734100 . ПМЦ 153575 . ПМИД 12672969 .
^ Карр Д.В., Хаускен З.Е., Фрейзер И.Д., Стофко-Хан Р.Э., Скотт Дж.Д. (июль 1992 г.). «Ассоциация цАМФ-зависимой протеинкиназы типа II с белком, закрепляющим RII щитовидной железы человека. Клонирование и характеристика RII-связывающего домена» . Журнал биологической химии . 267 (19): 13376–82. дои : 10.1016/S0021-9258(18)42221-1 . ПМИД 1618839 .

Внешние ссылки

человека Местоположение генома AKAP13 и AKAP13 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q12802 (якорный белок 13 A-киназы) в PDBe-KB .

Дальнейшее чтение

Хаускен З.Е., Коглан В.М., Гастингс К.А., Рейманн Э.М., Скотт Дж.Д. (сентябрь 1994 г.). «Регуляторная субъединица типа II (RII) для взаимодействия цАМФ-зависимой протеинкиназы с якорными белками А-киназы требует изолейцинов 3 и 5» . Журнал биологической химии . 269 (39): 24245–51. дои : 10.1016/S0021-9258(19)51074-2 . ПМИД 7929081 .
Токсоз Д., Уильямс Д.А. (февраль 1994 г.). «Новый человеческий онкоген lbc, обнаруженный путем трансфекции с различными областями гомологии с продуктами сигнальной трансдукции». Онкоген . 9 (2): 621–8. ПМИД 8290273 .
Стерпетти П., Хак А.А., Башар М.П., Парк Б., Ченг С.Д., Нолл Дж.Х. и др. (февраль 1999 г.). «Активация протоонкогена фактора обмена Lbc Rho путем усечения расширенного С-конца, который регулирует трансформацию и нацеливание» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (2): 1334–45. дои : 10.1128/mcb.19.2.1334 . ПМК 116062 . ПМИД 9891067 .
Саги С.А., Сишольц Т.М., Кобиашвили М., Уилсон Б.А., Токсоз Д., Браун Дж.Х. (май 2001 г.). «Физические и функциональные взаимодействия Галфака с Ро и его факторами обмена» . Журнал биологической химии . 276 (18): 15445–52. дои : 10.1074/jbc.M008961200 . ПМЦ 1761691 . ПМИД 11278452 .
Ньюлон М.Г., Рой М., Морикис Д., Карр Д.В., Вестфаль Р., Скотт Дж.Д., Дженнингс П.А. (апрель 2001 г.). «Новый механизм закрепления ПКА, раскрытый структурами растворов закрепляющих комплексов» . Журнал ЭМБО . 20 (7): 1651–62. дои : 10.1093/emboj/20.7.1651 . ПМК 145475 . ПМИД 11285229 .
Дриггерс П.Х., Сегарс Дж.Х., Рубино Д.М. (декабрь 2001 г.). «Протоонкопротеин Brx активирует бета-рецептор эстрогена с помощью протеинкиназного пути, активируемого митогеном p38» . Журнал биологической химии . 276 (50): 46792–7. дои : 10.1074/jbc.M106927200 . ПМК 4152864 . ПМИД 11579095 .
Клуссманн Э., Эдемир Б., Пепперле Б., Тамма Г., Хенн В., Клаушенц Е. и др. (ноябрь 2001 г.). «Ht31: первый белок, закрепляющий протеинкиназу А, который интегрирует передачу сигналов протеинкиназы А и Rho» . Письма ФЭБС . 507 (3): 264–8. дои : 10.1016/S0014-5793(01)02995-7 . ПМИД 11696353 .
Тан Ю.К., Ву Х., Ван В.Н., Чжэн Ю., Ван ZX (ноябрь 2002 г.). «Характеристика взаимодействия между малой ГТФазой RhoA и ее факторами обмена гуаниновых нуклеотидов». Аналитическая биохимия . 310 (2): 156–62. дои : 10.1016/S0003-2697(02)00382-2 . ПМИД 12423633 .
Спирингс Э., Брикнер А.Г., Колдуэлл Дж.А., Зегвельд С., Тацис Н., Блокланд Э. и др. (июль 2003 г.). «Малый антиген гистосовместимости HA-3 возникает в результате дифференциального протеасомного расщепления онкопротеина лимфоидного бластного кризиса (Lbc)». Кровь . 102 (2): 621–9. дои : 10.1182/кровь-2003-01-0260 . ПМИД 12663445 . S2CID 17864975 .
Хорнеманн Т., Кемпа С., Химмель М., Хейсс К., Фюрст Д.О., Валлиманн Т. (сентябрь 2003 г.). «Креатинкиназа мышечного типа взаимодействует с центральными доменами белков М-диапазона миомезина и М-белка». Журнал молекулярной биологии . 332 (4): 877–87. дои : 10.1016/S0022-2836(03)00921-5 . ПМИД 12972258 .
Чен Л.Ю., Зурав Б.Л., Йе Р.Д., Пан З.К. (февраль 2004 г.). «Фактор обмена Rho опосредует fMet-Leu-Phe-индуцированную активацию NF-kappaB в моноцитах периферической крови человека» . Журнал биологической химии . 279 (8): 7208–12. дои : 10.1074/jbc.M309542200 . ПМИД 14660653 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 15 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000170776 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000066406 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9627117-5] Jump up to: ^а ^б Рубино Д., Дриггерс П., Арбит Д., Кемп Л., Миллер Б., Косо О. и др. (май 1998 г.). «Характеристика Brx, нового члена семейства Dbl, который модулирует действие рецепторов эстрогена». Онкоген . 16 (19): 2513–26. дои : 10.1038/sj.onc.1201783 . ПМИД 9627117 . S2CID 20906586 .

[pmid1860836-6] Карр Д.В., Стофко-Хан Р.Э., Фрейзер И.Д., Бишоп С.М., Экотт Т.С., Бреннан Р.Г., Скотт Дж.Д. (август 1991 г.). «Взаимодействие регуляторной субъединицы (RII) цАМФ-зависимой протеинкиназы с RII-заякоренными белками происходит посредством мотива связывания амфипатической спирали» . Журнал биологической химии . 266 (22): 14188–92. дои : 10.1016/S0021-9258(18)98665-5 . ПМИД 1860836 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Введите ген: якорный белок 13 киназы AKAP13 A (PRKA)» .

[pmid11546812-8] Jump up to: ^а ^б ^с Дивиани Д., Содерлинг Дж., Скотт Дж.Д. (ноябрь 2001 г.). «AKAP-Lbc закрепляет протеинкиназу А и зарождает Galpha 12-селективное Rho-опосредованное образование стрессовых волокон» . Журнал биологической химии . 276 (47): 44247–57. дои : 10.1074/jbc.M106629200 . ПМИД 11546812 .

[pmid14636890-9] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Датт П., Нгуен Н., Токсоз Д. (февраль 2004 г.). «Роль Lbc RhoGEF в индуцированных Galpha12/13 сигналах к Rho GTPase». Сотовая сигнализация . 16 (2): 201–9. дои : 10.1016/S0898-6568(03)00132-3 . ПМИД 14636890 .

[pmid24183240-10] Jump up to: ^а ^б Тумкео Д., Ватанабэ С., Нарумия С. (октябрь – ноябрь 2013 г.). «Физиологическая роль Rho и Rho-эффекторов у млекопитающих». Европейский журнал клеточной биологии . 92 (10–11): 303–15. дои : 10.1016/j.ejcb.2013.09.002 . ПМИД 24183240 .

[pmid11313914-11] Фукухара С., Чикуми Х., Гуткинд Дж.С. (март 2001 г.). «RGS-содержащие RhoGEF: недостающее звено между трансформацией G-белков и Rho?» . Онкоген . 20 (13): 1661–8. дои : 10.1038/sj.onc.1204182 . ПМИД 11313914 .

[pmid11358341-12] Козаса Т. (апрель 2001 г.). «Регуляция передачи сигнала, опосредованной G-белком, белками RGS». Науки о жизни . 68 (19–20): 2309–17. дои : 10.1016/S0024-3205(01)01020-7 . ПМИД 11358341 .

[pmid12270917-13] Парк Б., Нгуен Н.Т., Датт П., Мердек К.Д., Башар М., Стерпетти П. и др. (ноябрь 2002 г.). «Ассоциация фактора обмена гуаниновых нуклеотидов Lbc Rho с белком, родственным альфа-катенину, альфа-катулин / CTNNAL1, поддерживает активацию фактора ответа сыворотки» . Журнал биологической химии . 277 (47): 45361–70. дои : 10.1074/jbc.M202447200 . ПМИД 12270917 .

[pmid12672969-14] Альто Н.М., Содерлинг С.Х., Хоши Н., Лангеберг Л.К., Файос Р., Дженнингс П.А., Скотт Дж.Д. (апрель 2003 г.). «Биоинформатический дизайн белка, закрепляющего А-киназу, in silico: мощный и селективный пептидный антагонист закрепления протеинкиназы А типа II» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (8): 4445–50. Бибкод : 2003PNAS..100.4445A . дои : 10.1073/pnas.0330734100 . ПМЦ 153575 . ПМИД 12672969 .

[pmid1618839-15] Карр Д.В., Хаускен З.Е., Фрейзер И.Д., Стофко-Хан Р.Э., Скотт Дж.Д. (июль 1992 г.). «Ассоциация цАМФ-зависимой протеинкиназы типа II с белком, закрепляющим RII щитовидной железы человека. Клонирование и характеристика RII-связывающего домена» . Журнал биологической химии . 267 (19): 13376–82. дои : 10.1016/S0021-9258(18)42221-1 . ПМИД 1618839 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]