ПОДАРОК11

ПОДАРОК11
Доступные структуры
ПДБ	Поиск Human UniProt: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1HTJ, 1XCG, 2DLS, 3KZ1, 3T06, 5E6P
Идентификаторы
Псевдонимы	ARHGEF11 , GTRAP48, PDZ-RHOGEF, фактор обмена гуаниновых нуклеотидов Rho 11
Внешние идентификаторы	Опустить : 605708 ; МГИ : 2441869 ; Гомологен : 11409 ; GeneCards : ARHGEF11 ; OMA : ARHGEF11 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	157,045,742 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	87,645,341 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right testis; ; left testis; ; right hemisphere of cerebellum; ; blood; ; monocyte; ; right frontal lobe; ; superior frontal gyrus; ; primary visual cortex; ; sural nerve; ; prefrontal cortex;
	Top expressed in
	zygote; ; genital tubercle; ; tail of embryo; ; primary oocyte; ; hand; ; secondary oocyte; ; granulocyte; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; otolith organ; ; cerebellar cortex;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	GTPase activator activity; protein binding; guanyl-nucleotide exchange factor activity; G protein-coupled receptor binding;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; membrane;
Biological process	G protein-coupled receptor signaling pathway; positive regulation of transcription, DNA-templated; regulation of cell growth; Rho protein signal transduction; establishment of cell polarity; positive regulation of apoptotic process; regulation of Rho protein signal transduction; regulation of small GTPase mediated signal transduction; striated muscle contraction; actin cytoskeleton organization; positive regulation of GTPase activity;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9826
	213498
	ENSG00000132694
	ENSMUSG00000041977
	О15085
	н/д
	НМ_014784 ; НМ_198236 ; НМ_001377418 ; НМ_001377419
	НМ_001003912 ; НМ_001360195 ; НМ_001360197
	НП_055599 ; НП_937879 ; НП_001364347 ; НП_001364348
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фактор обмена ро-гуаниновых нуклеотидов 11 представляет собой белок , который у человека кодируется ARHGEF11 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Этот белок также называется RhoGEF11 или PDZ-RhoGEF.

Функция

Фактор обмена гуаниновых нуклеотидов Rho 11 представляет собой фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF) для RhoA малого белка GTPase . ^{[ 8 ]} Rho представляет собой небольшой белок ГТФазы , который неактивен при связывании с гуаниновым нуклеотидом GDP . Но под действием белков Rho GEF, таких как RhoGEF1, этот GDP высвобождается и заменяется GTP , что приводит к активному состоянию Rho. В этой активной, GTP-связанной конформации Rho может связываться со специфическими эффекторными белками и ферментами и активировать их для регулирования клеточных функций. ^{[ 9 ]} клетки В частности, активный Rho является основным регулятором актинового цитоскелета . ^{[ 9 ]}

RhoGEF11 является членом группы из четырех белков RhoGEF , которые, как известно, активируются рецепторами, связанными с G-белком , связанными с G ₁₂ и G ₁₃ гетеротримерными G-белками . ^{[ 8 ]} Другими являются ARHGEF1 (также известный как p115-RhoGEF), ARHGEF12 (также известный как LARG) и AKAP13 (также известный как ARHGEF13 и Lbc). ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} GPCR-регулируемый RhoGEF11 (и родственные ему белки GEF) действует как эффектор для белков G ₁₂ и G ₁₃ G. Помимо активации G-белками G ₁₂ или G ₁₃ , три из этих четырех белков RhoGEF (ARHGEF1/11/12) также действуют как семейства RGS белки, активирующие GTPазу (GAP) , увеличивая скорость гидролиза GTP G ₁₂ / Белки G ₁₃ альфа (которые сами являются белками ГТФазы). Это действие увеличивает скорость дезактивации G-белка, ограничивая время, в течение которого эти RhoGEF активируют Rho. ^{[ 12 ]}

Описаны два альтернативных транскрипта, кодирующие разные изоформы. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что ARHGEF11 взаимодействует с:

ГНА12 ^{[ 13 ]}
ГНА13 ^{[ 13 ]}
ПЛХНБ1 , ^{[ 14 ]}^{[ 15 ]}^{[ 16 ]}^{[ 17 ]}
PLXNB2 ^{[ 14 ]}^{[ 15 ]}
PLXNB3 , ^{[ 14 ]}
РОА ^{[ 5 ]}

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000132694 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041977 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б Руменапп У., Бломквист А., Шверер Г., Шабловски Х., Псома А., Якобс К.Х. (октябрь 1999 г.). «Rho-специфическое связывание и катализ обмена гуаниновых нуклеотидов с помощью KIAA0380, члена семейства dbl». Письма ФЭБС . 459 (3): 313–8. дои : 10.1016/S0014-5793(99)01270-3 . ПМИД 10526156 . S2CID 8529412 .
^ Нагасе Т., Исикава К., Накадзима Д., Охира М., Секи Н., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (апрель 1997 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. VII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro» . Исследование ДНК . 4 (2): 141–50. дои : 10.1093/dnares/4.2.141 . ПМИД 9205841 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: ARHGEF11 фактор обмена гуаниновых нуклеотидов Rho (GEF) 11» .
^ Jump up to: ^а ^б Фукухара С., Мурга С., Зохар М., Игиши Т., Гуткинд Дж.С. (февраль 1999 г.). «Новый домен PDZ, содержащий фактор обмена гуаниновых нуклеотидов, связывает гетеротримерные G-белки с Rho» . Журнал биологической химии . 274 (9): 5868–79. дои : 10.1074/jbc.274.9.5868 . ПМИД 10026210 .
^ Jump up to: ^а ^б Тумкео, Д; Ватанабэ, С; Нарумия, С. (октябрь – ноябрь 2013 г.). «Физиологическая роль Rho и Rho-эффекторов у млекопитающих». Европейский журнал клеточной биологии . 92 (10–11): 303–315. дои : 10.1016/j.ejcb.2013.09.002 . ПМИД 24183240 .
^ Фукухара С., Чикуми Х., Гуткинд Дж.С. (2001). «RGS-содержащие RhoGEF: недостающее звено между трансформацией G-белков и Rho?» . Онкоген . 20 (13): 1661–8. дои : 10.1038/sj.onc.1204182 . ПМИД 11313914 .
^ Дивиани, Д; Содерлинг, Дж; Скотт, доктор юридических наук (ноябрь 2001 г.). «AKAP-Lbc закрепляет протеинкиназу А и зарождает Galpha 12-селективное Rho-опосредованное образование стрессовых волокон» . Журнал биологической химии . 276 (47): 44247–44257. дои : 10.1074/jbc.M106629200 . ПМИД 11546812 .
^ Козаса Т (2001). «Регуляция передачи сигнала, опосредованной G-белком, белками RGS». Наука о жизни . 68 (19–20): 2309–17. дои : 10.1016/S0024-3205(01)01020-7 . ПМИД 11358341 .
^ Jump up to: ^а ^б Чен, З; Сингер, WD; Данеш, С.М.; Штернвейс, ПК; Спранг, СР (октябрь 2008 г.). «Распознавание активированных состояний Galpha13 доменом rgRGS PDZRhoGEF» . Структура . 16 (10): 1532–1543. дои : 10.1016/j.str.2008.07.009 . ПМК 2586972 . ПМИД 18940608 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Перро В., Васкес-Прадо Дж., Гуткинд Дж.С. (ноябрь 2002 г.). «Плексин B регулирует Rho посредством факторов обмена гуаниновых нуклеотидов, связанных с лейкозом Rho GEF (LARG) и PDZ-RhoGEF» . Журнал биологической химии . 277 (45): 43115–20. дои : 10.1074/jbc.M206005200 . ПМИД 12183458 .
^ Jump up to: ^а ^б Сверч Дж. М., Кунер Р., Беренс Дж., Офферманнс С. (июль 2002 г.). «Плексин-B1 напрямую взаимодействует с PDZ-RhoGEF/LARG, регулируя RhoA и морфологию конуса роста» . Нейрон . 35 (1): 51–63. дои : 10.1016/S0896-6273(02)00750-X . ПМИД 12123608 . S2CID 18981429 .
^ Оинума И, Като Х, Харада А, Негиши М (июль 2003 г.). «Прямое взаимодействие Rnd1 с плексином-B1 регулирует PDZ-RhoGEF-опосредованную активацию Rho плексином-B1 и индуцирует сокращение клеток в клетках COS-7» . Журнал биологической химии . 278 (28): 25671–7. дои : 10.1074/jbc.M303047200 . ПМИД 12730235 .
^ Хиротани М., Охока Ю., Ямамото Т., Нирасава Х., Фуруяма Т., Кого М., Мацуя Т., Инагаки С. (сентябрь 2002 г.). «Взаимодействие плексина-B1 с факторами обмена Rho-гуаниновых нуклеотидов, содержащими домен PDZ». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 297 (1): 32–7. дои : 10.1016/S0006-291X(02)02122-8 . ПМИД 12220504 .

Дальнейшее чтение

Тогаши Х., Нагата К., Такагиши М., Сайто Н., Инагаки М. (сентябрь 2000 г.). «Функции ро-специфического фактора обмена гуаниновых нуклеотидов при ретракции нейритов. Возможная роль богатого пролином мотива KIAA0380 в локализации» . Журнал биологической химии . 275 (38): 29570–8. дои : 10.1074/jbc.M003726200 . ПМИД 10900204 .
Джексон М., Сонг В., Лю М.Ю., Джин Л., Дайкс-Хоберг М., Лин С.И., Бауэрс В.Дж., Федерофф Х.Дж., Штернвейс П.С., Ротштейн Дж.Д. (март 2001 г.). «Модуляция нейронального переносчика глутамата EAAT4 двумя взаимодействующими белками» . Природа . 410 (6824): 89–93. Бибкод : 2001Natur.410...89J . дои : 10.1038/35065091 . ПМИД 11242047 . S2CID 4381210 .
Лонгенекер К.Л., Льюис М.Э., Чикуми Х., Гуткинд Дж.С., Деревенда З.С. (июль 2001 г.). «Структура RGS-подобного домена из PDZ-RhoGEF: связывание передачи сигналов, связанной с гетеротримерным g-белком, с Rho GTPases» . Структура . 9 (7): 559–69. дои : 10.1016/S0969-2126(01)00620-7 . ПМИД 11470431 .
Перро В., Васкес-Прадо Дж., Гуткинд Дж.С. (ноябрь 2002 г.). «Плексин B регулирует Rho посредством факторов обмена гуаниновых нуклеотидов, связанных с лейкозом Rho GEF (LARG) и PDZ-RhoGEF» . Журнал биологической химии . 277 (45): 43115–20. дои : 10.1074/jbc.M206005200 . ПМИД 12183458 .
Дриссенс М.Х., Олив С., Нагата К., Инагаки М., Коллард Дж.Г. (октябрь 2002 г.). «Плексины B активируют Rho через PDZ-RhoGEF» . Письма ФЭБС . 529 (2–3): 168–72. дои : 10.1016/S0014-5793(02) 03323-9 ПМИД 12372594 .
Накаяма М., Кикуно Р., Охара О (ноябрь 2002 г.). «Белко-белковые взаимодействия между крупными белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК» . Геномные исследования . 12 (11): 1773–84. дои : 10.1101/гр.406902 . ПМК 187542 . ПМИД 12421765 .
Барак А., Базиль Дж., Васкес-Прадо Х., Гао Ю., Чжэн Ю., Гуткинд Дж.С. (февраль 2004 г.). «Прямое взаимодействие p21-активируемой киназы 4 с PDZ-RhoGEF, фактором обмена Rho-гуанина, связанным с G-белком» . Журнал биологической химии . 279 (7): 6182–9. дои : 10.1074/jbc.M309579200 . ПМИД 14625312 .
Давидкова Г., МакКаллумсмит Р.Э., Мидор-Вудрафф Дж.Х. (ноябрь 2003 г.). «Экспрессия мРНК ARHGEF11 в таламусе шизофреников» (PDF) . Анналы Нью-Йоркской академии наук . 1003 (1): 375–7. Бибкод : 2003НАУКА1003..375D . дои : 10.1196/анналы.1300.030 . hdl : 2027.42/74092 . ПМИД 14684465 . S2CID 8158533 .
Банерджи Дж., Ведегертнер П.Б. (апрель 2004 г.). «Идентификация новой последовательности в PDZ-RhoGEF, которая опосредует взаимодействие с актиновым цитоскелетом» . Молекулярная биология клетки . 15 (4): 1760–75. doi : 10.1091/mbc.E03-07-0527 . ПМК 379273 . ПМИД 14742719 .
Ван Кью, Лю М., Козаса Т., Ротштейн Дж.Д., Штернвайс П.К., Нойбиг Р.Р. (июль 2004 г.). «Рецепторы тромбина и лизофосфатидной кислоты используют разные rhoGEF в клетках рака простаты» . Журнал биологической химии . 279 (28): 28831–4. дои : 10.1074/jbc.C400105200 . ПМИД 15143072 .
Го X, Ли Ю, Пэн К, Ху Ю, Ли С, Ся Б, Цзинь С (ноябрь 2005 г.). «Структуры раствора и динамика основной цепи арсенатредуктазы из Bacillus subtilis: обратимое конформационное переключение, связанное с восстановлением арсената» . Журнал биологической химии . 280 (47): 39601–8. дои : 10.1074/jbc.M508132200 . ПМИД 16192272 .
Лонгхерст Д.М., Ватанабэ М., Ротштейн Дж.Д., Джексон М. (апрель 2006 г.). «Взаимодействие PDZRhoGEF с легкими цепями белка 1, ассоциированного с микротрубочками: связь между микротрубочками, актиновым цитоскелетом и полярностью нейронов» . Журнал биологической химии . 281 (17): 12030–40. дои : 10.1074/jbc.M513756200 . ПМИД 16478718 .
Гу Дж, Ву X, Донг Q, Ромео MJ, Лин X, Гуткинд Дж. С., Берман Д. М. (июнь 2006 г.). «Несинонимичный однонуклеотидный полиморфизм в факторе обмена гуаниновых нуклеотидов PDZ-Rho (Ser1416Gly) модулирует риск рака легких у американцев мексиканского происхождения» . Рак . 106 (12): 2716–24. дои : 10.1002/cncr.21944 . ПМИД 16691626 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф., Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .
Ма Л., Хэнсон Р.Л., Ке Л.Н., Кали А.М., Фу М., Мак Дж.Л., Инфанте А.М., Кобес С., Богардус С., Шульдинер А.Р., Байер Л.Дж. (май 2007 г.). «Варианты ARHGEF11, гена-кандидата на связь с диабетом 2 типа на хромосоме 1q, номинально связаны с резистентностью к инсулину и диабетом 2 типа у индейцев пима» . Диабет . 56 (5): 1454–9. дои : 10.2337/db06-0640 . ПМИД 17287471 .

Внешние ссылки

человека ARHGEF11 Расположение генома ARHGEF11 и страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000132694 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041977 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10526156-5] Jump up to: ^а ^б Руменапп У., Бломквист А., Шверер Г., Шабловски Х., Псома А., Якобс К.Х. (октябрь 1999 г.). «Rho-специфическое связывание и катализ обмена гуаниновых нуклеотидов с помощью KIAA0380, члена семейства dbl». Письма ФЭБС . 459 (3): 313–8. дои : 10.1016/S0014-5793(99)01270-3 . ПМИД 10526156 . S2CID 8529412 .

[pmid9205841-6] Нагасе Т., Исикава К., Накадзима Д., Охира М., Секи Н., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (апрель 1997 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. VII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro» . Исследование ДНК . 4 (2): 141–50. дои : 10.1093/dnares/4.2.141 . ПМИД 9205841 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: ARHGEF11 фактор обмена гуаниновых нуклеотидов Rho (GEF) 11» .

[pmid10026210-8] Jump up to: ^а ^б Фукухара С., Мурга С., Зохар М., Игиши Т., Гуткинд Дж.С. (февраль 1999 г.). «Новый домен PDZ, содержащий фактор обмена гуаниновых нуклеотидов, связывает гетеротримерные G-белки с Rho» . Журнал биологической химии . 274 (9): 5868–79. дои : 10.1074/jbc.274.9.5868 . ПМИД 10026210 .

[pmid24183240-9] Jump up to: ^а ^б Тумкео, Д; Ватанабэ, С; Нарумия, С. (октябрь – ноябрь 2013 г.). «Физиологическая роль Rho и Rho-эффекторов у млекопитающих». Европейский журнал клеточной биологии . 92 (10–11): 303–315. дои : 10.1016/j.ejcb.2013.09.002 . ПМИД 24183240 .

[pmid11313914-10] Фукухара С., Чикуми Х., Гуткинд Дж.С. (2001). «RGS-содержащие RhoGEF: недостающее звено между трансформацией G-белков и Rho?» . Онкоген . 20 (13): 1661–8. дои : 10.1038/sj.onc.1204182 . ПМИД 11313914 .

[pmid11546812-11] Дивиани, Д; Содерлинг, Дж; Скотт, доктор юридических наук (ноябрь 2001 г.). «AKAP-Lbc закрепляет протеинкиназу А и зарождает Galpha 12-селективное Rho-опосредованное образование стрессовых волокон» . Журнал биологической химии . 276 (47): 44247–44257. дои : 10.1074/jbc.M106629200 . ПМИД 11546812 .

[pmid11358341-12] Козаса Т (2001). «Регуляция передачи сигнала, опосредованной G-белком, белками RGS». Наука о жизни . 68 (19–20): 2309–17. дои : 10.1016/S0024-3205(01)01020-7 . ПМИД 11358341 .

[pmid18940608-13] Jump up to: ^а ^б Чен, З; Сингер, WD; Данеш, С.М.; Штернвейс, ПК; Спранг, СР (октябрь 2008 г.). «Распознавание активированных состояний Galpha13 доменом rgRGS PDZRhoGEF» . Структура . 16 (10): 1532–1543. дои : 10.1016/j.str.2008.07.009 . ПМК 2586972 . ПМИД 18940608 .

[pmid12183458-14] Jump up to: ^а ^б ^с Перро В., Васкес-Прадо Дж., Гуткинд Дж.С. (ноябрь 2002 г.). «Плексин B регулирует Rho посредством факторов обмена гуаниновых нуклеотидов, связанных с лейкозом Rho GEF (LARG) и PDZ-RhoGEF» . Журнал биологической химии . 277 (45): 43115–20. дои : 10.1074/jbc.M206005200 . ПМИД 12183458 .

[pmid12123608-15] Jump up to: ^а ^б Сверч Дж. М., Кунер Р., Беренс Дж., Офферманнс С. (июль 2002 г.). «Плексин-B1 напрямую взаимодействует с PDZ-RhoGEF/LARG, регулируя RhoA и морфологию конуса роста» . Нейрон . 35 (1): 51–63. дои : 10.1016/S0896-6273(02)00750-X . ПМИД 12123608 . S2CID 18981429 .

[pmid12730235-16] Оинума И, Като Х, Харада А, Негиши М (июль 2003 г.). «Прямое взаимодействие Rnd1 с плексином-B1 регулирует PDZ-RhoGEF-опосредованную активацию Rho плексином-B1 и индуцирует сокращение клеток в клетках COS-7» . Журнал биологической химии . 278 (28): 25671–7. дои : 10.1074/jbc.M303047200 . ПМИД 12730235 .

[pmid12220504-17] Хиротани М., Охока Ю., Ямамото Т., Нирасава Х., Фуруяма Т., Кого М., Мацуя Т., Инагаки С. (сентябрь 2002 г.). «Взаимодействие плексина-B1 с факторами обмена Rho-гуаниновых нуклеотидов, содержащими домен PDZ». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 297 (1): 32–7. дои : 10.1016/S0006-291X(02)02122-8 . ПМИД 12220504 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]