ARHGEF1

ARHGEF1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1IAP, 1SHZ, 3AB3, 3ODO, 3ODW, 3ODX, 3P6A
Идентификаторы
Псевдонимы	ARHGEF1 , GEF1, LBCL2, LSC, P115-RHOGEF, SUB1.5, фактор обмена гуаниновых нуклеотидов Rho 1, IMD62
Внешние идентификаторы	Опустить : 601855 ; МГИ : 1353510 ; Гомологен : 3454 ; GeneCards : ARHGEF1 ; OMA : ARHGEF1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	41,930,150 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	24,626,019 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	granulocyte; ; lymph node; ; upper lobe of left lung; ; right lung; ; spleen; ; right uterine tube; ; cardia; ; monocyte; ; right lobe of thyroid gland; ; left uterine tube;
	Top expressed in
	granulocyte; ; thymus; ; mesenteric lymph nodes; ; lip; ; neural layer of retina; ; yolk sac; ; tibiofemoral joint; ; spleen; ; superior frontal gyrus; ; blood;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; GTPase activator activity; RNA binding; guanyl-nucleotide exchange factor activity; G protein-coupled receptor binding;
Cellular component	plasma membrane; membrane; cytoplasm; cytosol;
Biological process	cell population proliferation; regulation of Rho protein signal transduction; Rho protein signal transduction; positive regulation of GTPase activity; positive regulation of apoptotic process; regulation of small GTPase mediated signal transduction; G protein-coupled receptor signaling pathway; regulation of molecular function;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9138
	16801
	ENSG00000076928
	ENSMUSG00000040940
	Q92888
	Q61210
	НМ_004706 ; НМ_198977 ; НМ_199002
	НМ_001130150 ; НМ_001130151 ; НМ_001130152 ; НМ_001130153 ; НМ_008488
	НП_004697 ; НП_945328 ; НП_945353
	НП_001123622 ; НП_001123623 ; НП_001123624 ; НП_001123625 ; НП_032514
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фактор обмена гуаниновых нуклеотидов 1 — это белок , который у человека кодируется ARHGEF1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Этот белок также называется RhoGEF1 или p115-RhoGEF.

Функция

Фактор обмена гуаниновых нуклеотидов Rho 1 представляет собой фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF) для RhoA малого белка GTPase . ^{[ 5 ]} Rho представляет собой небольшой белок ГТФазы , который неактивен при связывании с гуаниновым нуклеотидом GDP . Но под действием белков Rho GEF, таких как RhoGEF1, этот GDP высвобождается и заменяется GTP , что приводит к активному состоянию Rho. В этой активной, GTP-связанной конформации Rho может связываться со специфическими эффекторными белками и ферментами и активировать их для регулирования клеточных функций. ^{[ 8 ]} клетки В частности, активный Rho является основным регулятором актинового цитоскелета . ^{[ 8 ]}

RhoGEF1 является членом группы из четырех белков RhoGEF, которые, как известно, активируются рецепторами, связанными с G-белком , связанными с G ₁₂ и G ₁₃ гетеротримерными G-белками . ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} Другими являются ARHGEF11 (также известный как PDZ-RhoGEF), ARHGEF12 (также известный как LARG) и AKAP13 (также известный как ARHGEF13 и Lbc). ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]} GPCR-регулируемый RhoGEF1 (и родственные ему белки GEF) действует как эффектор для белков G ₁₂ и G ₁₃ G. Помимо активации G-белками G ₁₂ или G ₁₃ , три из этих четырех белков RhoGEF (ARHGEF1/11/12) также действуют как семейства RGS белки, активирующие GTPазу (GAP) , увеличивая скорость гидролиза GTP G ₁₂ / Белки G ₁₃ альфа (которые сами являются белками ГТФазы). Это действие увеличивает скорость дезактивации G-белка, ограничивая время, в течение которого эти RhoGEF активируют Rho. ^{[ 13 ]}

Для этого гена было идентифицировано множество альтернативно сплайсированных вариантов транскрипта, но полноразмерная природа и функция некоторых вариантов не определены. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что ARHGEF1 взаимодействует с:

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000076928 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040940 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б Харт М.Дж., Шарма С., ЭльМасри Н., Цю Р.Г., Маккейб П., Полакис П. и др. (октябрь 1996 г.). «Идентификация нового фактора обмена гуаниновых нуклеотидов для Rho GTPase» . Журнал биологической химии . 271 (41): 25452–8. дои : 10.1074/jbc.271.41.25452 . ПМИД 8810315 .
^ Аасхайм ХК, Педетур Ф, Смеланд ЭБ (апрель 1997 г.). «Характеристика, экспрессия и хромосомная локализация человеческого гена, гомологичного онкогену Lsc мыши, с наиболее сильной экспрессией в кроветворных тканях». Онкоген . 14 (14): 1747–52. дои : 10.1038/sj.onc.1200994 . ПМИД 9135076 . S2CID 24528606 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: фактор обмена гуаниновых нуклеотидов Rho ARHGEF1 (GEF) 1» .
^ Jump up to: ^а ^б Тумкео Д., Ватанабэ С., Нарумия С. (октябрь – ноябрь 2013 г.). «Физиологическая роль Rho и Rho-эффекторов у млекопитающих». Европейский журнал клеточной биологии . 92 (10–11): 303–15. дои : 10.1016/j.ejcb.2013.09.002 . ПМИД 24183240 .
^ Козаса Т., Цзян Х., Харт М.Дж., Штернвейс П.М., Сингер В.Д., Гилман А.Г. и др. (июнь 1998 г.). «p115 RhoGEF, белок, активирующий ГТФазу для Galpha12 и Galpha13». Наука . 280 (5372): 2109–11. дои : 10.1126/science.280.5372.2109 . ПМИД 9641915 .
^ Jump up to: ^а ^б Харт М.Дж., Цзян Х., Козаса Т., Роско В., Сингер В.Д., Гилман А.Г. и др. (июнь 1998 г.). «Прямая стимуляция обменной активности гуаниновых нуклеотидов p115 RhoGEF с помощью Galpha13». Наука . 280 (5372): 2112–4. дои : 10.1126/science.280.5372.2112 . ПМИД 9641916 .
^ Фукухара С., Чикуми Х., Гуткинд Дж.С. (март 2001 г.). «RGS-содержащие RhoGEF: недостающее звено между трансформацией G-белков и Rho?» . Онкоген . 20 (13): 1661–8. дои : 10.1038/sj.onc.1204182 . ПМИД 11313914 .
^ Дивиани Д., Содерлинг Дж., Скотт Дж.Д. (ноябрь 2001 г.). «AKAP-Lbc закрепляет протеинкиназу А и зарождает Galpha 12-селективное Rho-опосредованное образование стрессовых волокон» . Журнал биологической химии . 276 (47): 44247–57. дои : 10.1074/jbc.M106629200 . ПМИД 11546812 .
^ Козаса Т. (апрель 2001 г.). «Регуляция передачи сигнала, опосредованной G-белком, белками RGS». Науки о жизни . 68 (19–20): 2309–17. дои : 10.1016/S0024-3205(01)01020-7 . ПМИД 11358341 .
^ Jump up to: ^а ^б Джонсон Э.Н., Сишольц Т.М., Вахид А.А., Кройц Б., Сузуки Н., Козаса Т. и др. (декабрь 2003 г.). «RGS16 ингибирует передачу сигналов через ось G альфа 13-Rho» . Природная клеточная биология . 5 (12): 1095–103. дои : 10.1038/ncb1065 . ПМИД 14634662 . S2CID 6798899 .
^ Холинстат М., Мехта Д., Козаса Т., Миншалл Р.Д., Малик А.Б. (август 2003 г.). «Протеинкиназа Кальфа-индуцированное фосфорилирование p115RhoGEF сигнализирует о перестройке эндотелиального цитоскелета» . Журнал биологической химии . 278 (31): 28793–8. дои : 10.1074/jbc.M303900200 . ПМИД 12754211 .

Внешние ссылки

Расположение генома человека ARHGEF1 и ARHGEF1 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

Бхаттачарья Р., Ведегертнер П.Б. (май 2000 г.). «Гальфа 13 требует пальмитоилирования для локализации на плазматической мембране, Rho-зависимой передачи сигналов и стимулирования мембранного связывания p115-RhoGEF» . Журнал биологической химии . 275 (20): 14992–9. дои : 10.1074/jbc.M000415200 . ПМИД 10747909 .
Уэллс К.Д., Гутовски С., Боллаг Г., Штернвейс ПК (август 2001 г.). «Идентификация потенциальных механизмов регуляции p115 RhoGEF посредством анализа эндогенных и мутантных форм обменного фактора» . Журнал биологической химии . 276 (31): 28897–905. дои : 10.1074/jbc.M102913200 . ПМИД 11384980 .
Чен З., Уэллс К.Д., Стернвайс ПК, Спранг С.Р. (сентябрь 2001 г.). «Структура домена rgRGS p115RhoGEF». Структурная биология природы . 8 (9): 805–9. дои : 10.1038/nsb0901-805 . ПМИД 11524686 . S2CID 11040143 .
Чен З., Сингер В.Д., Уэллс К.Д., Спранг С.Р., Стернвейс ПК (март 2003 г.). «Картирование интерфейса связывания Galpha13 домена rgRGS p115RhoGEF» . Журнал биологической химии . 278 (11): 9912–9. дои : 10.1074/jbc.M212695200 . ПМИД 12525488 .
Бхаттачарья Р., Ведегертнер П.Б. (май 2003 г.). «Характеристика G-альфа-13-зависимого рекрутирования p115RhoGEF в плазматическую мембрану» . Биохимический журнал . 371 (Часть 3): 709–20. дои : 10.1042/BJ20021897 . ПМЦ 1223324 . ПМИД 12534370 .
Бхаттачария Р., Ведегертнер П.Б. (апрель 2003 г.). «Мутация N-концевой богатой кислотой области p115-RhoGEF диссоциирует связывание альфа13 и рекрутирование плазматической мембраны, стимулируемое альфа13». Письма ФЭБС . 540 (1–3): 211–6. дои : 10.1016/S0014-5793(03)00267-9 . ПМИД 12681510 . S2CID 84132104 .
Бургиньон Л.Ю., Синглтон П.А., Чжу Х., Дидрих Ф. (август 2003 г.). «Гиалуронан-опосредованное взаимодействие CD44 с RhoGEF и Rho-киназой способствует фосфорилированию Grb2-связывающего-1 и передаче сигналов фосфатидилинозитол-3-киназы, что приводит к выработке цитокинов (факторов, стимулирующих колонии макрофагов) и прогрессированию опухоли молочной железы» . Журнал биологической химии . 278 (32): 29420–34. дои : 10.1074/jbc.M301885200 . ПМИД 12748184 .
Холинстат М., Мехта Д., Козаса Т., Миншалл Р.Д., Малик А.Б. (август 2003 г.). «Протеинкиназа Кальфа-индуцированное фосфорилирование p115RhoGEF сигнализирует о перестройке эндотелиального цитоскелета» . Журнал биологической химии . 278 (31): 28793–8. дои : 10.1074/jbc.M303900200 . ПМИД 12754211 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 19 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000076928 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040940 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8810315-5] Jump up to: ^а ^б Харт М.Дж., Шарма С., ЭльМасри Н., Цю Р.Г., Маккейб П., Полакис П. и др. (октябрь 1996 г.). «Идентификация нового фактора обмена гуаниновых нуклеотидов для Rho GTPase» . Журнал биологической химии . 271 (41): 25452–8. дои : 10.1074/jbc.271.41.25452 . ПМИД 8810315 .

[pmid9135076-6] Аасхайм ХК, Педетур Ф, Смеланд ЭБ (апрель 1997 г.). «Характеристика, экспрессия и хромосомная локализация человеческого гена, гомологичного онкогену Lsc мыши, с наиболее сильной экспрессией в кроветворных тканях». Онкоген . 14 (14): 1747–52. дои : 10.1038/sj.onc.1200994 . ПМИД 9135076 . S2CID 24528606 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: фактор обмена гуаниновых нуклеотидов Rho ARHGEF1 (GEF) 1» .

[pmid24183240-8] Jump up to: ^а ^б Тумкео Д., Ватанабэ С., Нарумия С. (октябрь – ноябрь 2013 г.). «Физиологическая роль Rho и Rho-эффекторов у млекопитающих». Европейский журнал клеточной биологии . 92 (10–11): 303–15. дои : 10.1016/j.ejcb.2013.09.002 . ПМИД 24183240 .

[pmid9641915-9] Козаса Т., Цзян Х., Харт М.Дж., Штернвейс П.М., Сингер В.Д., Гилман А.Г. и др. (июнь 1998 г.). «p115 RhoGEF, белок, активирующий ГТФазу для Galpha12 и Galpha13». Наука . 280 (5372): 2109–11. дои : 10.1126/science.280.5372.2109 . ПМИД 9641915 .

[pmid9641916-10] Jump up to: ^а ^б Харт М.Дж., Цзян Х., Козаса Т., Роско В., Сингер В.Д., Гилман А.Г. и др. (июнь 1998 г.). «Прямая стимуляция обменной активности гуаниновых нуклеотидов p115 RhoGEF с помощью Galpha13». Наука . 280 (5372): 2112–4. дои : 10.1126/science.280.5372.2112 . ПМИД 9641916 .

[pmid11313914-11] Фукухара С., Чикуми Х., Гуткинд Дж.С. (март 2001 г.). «RGS-содержащие RhoGEF: недостающее звено между трансформацией G-белков и Rho?» . Онкоген . 20 (13): 1661–8. дои : 10.1038/sj.onc.1204182 . ПМИД 11313914 .

[pmid11546812-12] Дивиани Д., Содерлинг Дж., Скотт Дж.Д. (ноябрь 2001 г.). «AKAP-Lbc закрепляет протеинкиназу А и зарождает Galpha 12-селективное Rho-опосредованное образование стрессовых волокон» . Журнал биологической химии . 276 (47): 44247–57. дои : 10.1074/jbc.M106629200 . ПМИД 11546812 .

[pmid11358341-13] Козаса Т. (апрель 2001 г.). «Регуляция передачи сигнала, опосредованной G-белком, белками RGS». Науки о жизни . 68 (19–20): 2309–17. дои : 10.1016/S0024-3205(01)01020-7 . ПМИД 11358341 .

[pmid14634662-14] Jump up to: ^а ^б Джонсон Э.Н., Сишольц Т.М., Вахид А.А., Кройц Б., Сузуки Н., Козаса Т. и др. (декабрь 2003 г.). «RGS16 ингибирует передачу сигналов через ось G альфа 13-Rho» . Природная клеточная биология . 5 (12): 1095–103. дои : 10.1038/ncb1065 . ПМИД 14634662 . S2CID 6798899 .

[pmid12754211-15] Холинстат М., Мехта Д., Козаса Т., Миншалл Р.Д., Малик А.Б. (август 2003 г.). «Протеинкиназа Кальфа-индуцированное фосфорилирование p115RhoGEF сигнализирует о перестройке эндотелиального цитоскелета» . Журнал биологической химии . 278 (31): 28793–8. дои : 10.1074/jbc.M303900200 . ПМИД 12754211 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]