FARP1

FARP1
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	4H6Y
Идентификаторы
Псевдонимы	FARP1 , CDEP, FARP1-IT1, PLEKHC2, PPP1R75, FERM, ARH/RHOGEF и PLECKSTRIN ДОМЕЙН 1 белок 1
Внешние идентификаторы	Омим : 602654 ; MGI : 2446173 ; Гомологен : 38098 ; GeneCards : FARP1 ; OMA : FARP1 - Ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 13 (human)
End	98,455,176 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 14 (mouse)
End	121,521,156 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	renal medulla; ; stromal cell of endometrium; ; corpus epididymis; ; ganglionic eminence; ; human kidney; ; ventricular zone; ; epithelium of colon; ; right lobe of liver; ; parotid gland; ; thyroid gland;
	Top expressed in
	internal carotid artery; ; external carotid artery; ; mandibular prominence; ; molar; ; maxillary prominence; ; hand; ; Gonadal ridge; ; medullary collecting duct; ; vas deferens; ; pituitary gland;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	guanyl-nucleotide exchange factor activity; cytoskeletal protein binding;
Cellular component	cytosol; cell projection; membrane; filopodium; extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane; plasma membrane; dendritic spine; synapse; cell junction; dendrite; neuron projection; cytoskeleton; cytoplasm;
Biological process	dendrite morphogenesis; negative regulation of phosphatase activity; multicellular organism development; synapse assembly; regulation of Rho protein signal transduction;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10160
	223254
	ENSG00000152767
	ENSMUSG000000255555
	Q9Y4F1
	F8VPU2
	NM_001001715 ; NM_001286839 ; NM_005766
	NM_134082
	NP_001001715 ; NP_001273768 ; NP_005757
	NP_598843
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Ферма, Rhogef и Pleckstrin Domain-содержащий белок 1 -это белок , который у людей кодируется FARP1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Этот ген первоначально был выделен с помощью вычищенной гибридизации из -за его повышенной экспрессии в дифференцированных хондроцитах по сравнению с дедифференцированными хондроцитами. Полученный белок содержит прогнозируемый эзрин -подобный домен, домен гомологии DBL и гомологический домен Pleckstrin . Считается, что он является членом суперсемейства Band 4.1 , члены которого связывают цитоскелет с клеточной мембраной . два альтернативных варианта сплайсированных транскриптов, кодирующих различные изоформы . Для этого гена были обнаружены ^{[ 6 ]}

Смотрите также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000152767 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg000000255555 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Koyano Y, Kawamoto T, Shen M, Yan W, Noshiro M, Fujii K, Kato Y (январь 1998). «Молекулярное клонирование и характеристика CDEP, нового белка человека, содержащего эзриноподобный домен суперсемейства полосы 4.1 и гомологического домена DBL факторов обмена нуклеотидов Rho Guanine». Biochem Biophys Res Commun . 241 (2): 369–75. doi : 10.1006/bbrc.1997.7826 . PMID 9425278 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: Farp1 Ferm, Rhogef (Arhgef) и белок домена Pleckstrin (полученный из хондроцитов)» .

Дальнейшее чтение

Zhuang B, Su YS, Sockanathan S (февраль 2009 г.). «FARP1 способствует дендритному росту подтипов моторных нейронов позвоночника посредством передачи сигналов трансмембранного семафорина6A и plexina4» . Нейрон . 61 (3): 359–72. doi : 10.1016/j.neuron.2008.12.022 . PMC 2654783 . PMID 19217374 .
Хартли Дж. Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (2001). «Клонирование ДНК с использованием специфической для сайта рекомбинации in vitro» . Геном Res . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК» . НАТ Генет . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
Dunham A, Matthews LH, Burton J, et al. (2004). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы человека 13» . Природа . 428 (6982): 522–8. Bibcode : 2004natur.428..522d . doi : 10.1038/nature02379 . PMC 2665288 . PMID 15057823 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «Статус, качество и расширение полноразмерного проекта кДНК NIH: коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Res . 14 (10b): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). «От Orfeome до биологии: функциональный конвейер геномики» . Геном Res . 14 (10b): 2136–44. doi : 10.1101/gr.2576704 . PMC 528930 . PMID 15489336 .
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, et al. (2006). «База данных LIFEDB в 2006 году» . Нуклеиновые кислоты Res . 34 (проблема базы данных): D415–8. doi : 10.1093/nar/gkj139 . PMC 1347501 . PMID 16381901 .

Внешние ссылки

FARP1 Расположение гена в браузере генома UCSC .
FARP1 ЧЕЛОВЕЧЕСКИЙ ГЕН ГЕН в браузере генома UCSC .

Эта статья о гене о хромосоме человека 13 представляет собой заглушку . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000152767 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg000000255555 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid9425278-5] Koyano Y, Kawamoto T, Shen M, Yan W, Noshiro M, Fujii K, Kato Y (январь 1998). «Молекулярное клонирование и характеристика CDEP, нового белка человека, содержащего эзриноподобный домен суперсемейства полосы 4.1 и гомологического домена DBL факторов обмена нуклеотидов Rho Guanine». Biochem Biophys Res Commun . 241 (2): 369–75. doi : 10.1006/bbrc.1997.7826 . PMID 9425278 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: Farp1 Ferm, Rhogef (Arhgef) и белок домена Pleckstrin (полученный из хондроцитов)» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]