Дедикатор белка цитокинеза 9

ДОК9
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1WG7, 2WM9, 2WMN, 2WMO
Идентификаторы
Псевдонимы	DOCK9 , ZIZ1, ZIZIMIN1, Dock9, представитель цитокинеза 9
Внешние идентификаторы	Опустить : 607325 ; МГИ : 106321 ; Гомологен : 41026 ; Генные карты : DOCK9 ; OMA : DOCK9 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 13 (human)
End	99,086,625 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 14 (mouse)
End	122,035,249 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	Achilles tendon; ; right lung; ; corpus callosum; ; Region I of hippocampus proper; ; lower lobe of lung; ; oral cavity; ; sural nerve; ; skin of hip; ; inferior olivary nucleus; ; upper lobe of lung;
	Top expressed in
	subiculum; ; right lung lobe; ; sciatic nerve; ; CA3 field; ; cerebellar vermis; ; Region I of hippocampus proper; ; lobe of cerebellum; ; tunica adventitia of aorta; ; deep cerebellar nuclei; ; endothelial cell of lymphatic vessel;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; guanyl-nucleotide exchange factor activity; cadherin binding;
Cellular component	cytosol; endomembrane system; membrane;
Biological process	blood coagulation; small GTPase mediated signal transduction; positive regulation of GTPase activity; biological process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	23348
	105445
	ENSG00000088387
	ENSMUSG00000025558
	Q9BZ29
	Q8BIK4
showНМ_001130048 ; НМ_001130049 ; НМ_001130050 ; НМ_015296 ; НМ_001318849 ;
	NM_001366676; NM_001366677; NM_001366678; NM_001366679; NM_001366680; NM_001366681; NM_001366682; NM_001366683; NM_001366684
	НМ_001081039 ; НМ_001128307 ; НМ_001128308 ; НМ_134074 ; НМ_001347596
showНП_001123520 ; НП_001123521 ; НП_001123522 ; НП_001305778 ; НП_056111 ;
	NP_001353605; NP_001353606; NP_001353607; NP_001353608; NP_001353609; NP_001353610; NP_001353611; NP_001353612; NP_001353613
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок-представитель цитокинеза 9 ( Dock9 ), также известный как Zizimin1 , представляет собой крупный (~230 кДа) белок, кодируемый у человека геном DOCK9 , участвующим во внутриклеточных сигнальных сетях . ^{[ 5 ]} Он является членом подсемейства DOCK-D семейства факторов DOCK обмена гуаниновых нуклеотидов , которые действуют как активаторы малых G-белков . Dock9 активирует небольшой G-белок Cdc42 .

Открытие

Dock9 был обнаружен с использованием аффинного протеомного подхода, разработанного для идентификации новых активаторов небольшого G-белка Cdc42 в фибробластах . ^{[ 6 ]} Последующий нозерн-блот- анализ показал, что Dock9 экспрессируется преимущественно в головном мозге , сердце , скелетных мышцах , почках , плаценте и легких . Более низкие уровни были обнаружены в толстой кишке , тимусе , печени , тонком кишечнике и в лейкоцитах периферической крови.

Структура и функции

Dock9 имеет аналогичную структуру из двух основных доменов (известных как DHR1 и DHR2 ), которые являются общими для всех членов семейства DOCK. С -концевой домен DHR2 функционирует как атипичный домен GEF для малых G-белков (см. Dock180: структура и функции ), а домен DHR1, как известно, в некоторых белках подсемейства DOCK-A/B/C участвует в их рекрутировании в плазматическая мембрана . В отличие от белков DOCK-A/B/C белки DOCK-D (включая Dock9) содержат N-концевой домен гомологичности плекстрина (PH) , который опосредует их рекрутирование на мембрану. ^{[ 7 ]} Dock9, наряду с другими членами подсемейства DOCK-C/D, может активировать Cdc42 in vitro и in vivo через свой домен DHR2. ^{[ 6 ]} Однако Dock9 принимает аутоингибирующую конформацию, которая маскирует домен DHR2 в состоянии покоя. ^{[ 7 ]} Механизм преодоления этого аутоингибирования до сих пор неясен, хотя в некоторых других белках DOCK, которые также подвергаются аутоингибированию, требуется взаимодействие с адаптерными белками, такими как ELMO . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} Сообщалось также, что Dock9 димеризуется в условиях покоя через свои домены DHR2, и это исследование предполагает, что другие белки семейства DOCK также могут вести себя таким же образом. ^{[ 10 ]} Недавний анализ хромосомной области, связанной с предрасположенностью к биполярному расстройству, показал, что однонуклеотидные полиморфизмы в гене DOCK9 способствуют риску и тяжести этого состояния. ^{[ 11 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000088387 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025558 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Энтрез: представитель цитокинеза DOCK9 9» .
^ Jump up to: ^а ^б Меллер Н., Ирани-Техрани М., Киоссес В.Б. и др. (сентябрь 2002 г.). «Зизимин1, новый активатор Cdc42, обнаруживает новый домен GEF для белков Rho». Нат. Клеточная Биол . 4 (9): 639–47. дои : 10.1038/ncb835 . ПМИД 12172552 . S2CID 24507862 .
^ Jump up to: ^а ^б Меллер Н., Уэстбрук М.Дж., Шеннон Дж.Д. и др. (январь 2008 г.). «Функция N-конца зизимина1: аутоингибирование и нацеливание на мембрану» . Биохим. Дж 409 (2): 525–33. дои : 10.1042/BJ20071263 . ПМК 2740492 . ПМИД 17935486 .
^ Лу М., Кинчен Дж.М., Россман К.Л. и др. (август 2004 г.). «PH-домен ELMO функционирует в транс-регуляции активации Rac через Dock180». Нат. Структура. Мол. Биол . 11 (8): 756–62. дои : 10.1038/nsmb800 . ПМИД 15247908 . S2CID 125990 .
^ Лу М., Кинчен Дж.М., Россман К.Л. и др. (февраль 2005 г.). «Модель стерического ингибирования для регуляции нуклеотидного обмена посредством семейства GEF Dock180» . Курс. Биол . 15 (4): 371–77. Бибкод : 2005CBio...15..371L . дои : 10.1016/j.cub.2005.01.050 . ПМИД 15723800 .
^ Меллер Н., Ирани-Техрани М., Ратников Б.И. и др. (сентябрь 2004 г.). «Новый фактор обмена гуаниновых нуклеотидов Cdc42, зизимин1, димеризуется через Cdc42-связывающий домен CZH2» . Ж. Биол. Хим . 279 (36): 37470–76. дои : 10.1074/jbc.M404535200 . ПМИД 15247287 .
^ Детера-Уодли С.Д., Лю С.И., Махешвари М. и др. (октябрь 2007 г.). «Вариации последовательности DOCK9 и гетерогенность при биполярном расстройстве» . Психиатр. Жене . 17 (5): 274–86. дои : 10.1097/YPG.0b013e328133f352 . ПМИД 17728666 . S2CID 7102906 .

Дальнейшее чтение

Накадзима Д., Оказаки Н., Ямакава Х. и др. (2003). «Создание готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное курирование 330 клонов кДНК KIAA» . ДНК Рез . 9 (3): 99–106. дои : 10.1093/dnares/9.3.99 . ПМИД 12168954 .
Квофи М.А., Сковронски Дж. (2008). «Специфическое распознавание Rac2 и Cdc42 факторами обмена гуаниновых нуклеотидов DOCK2 и DOCK9» . Ж. Биол. Хим . 283 (6): 3088–96. дои : 10.1074/jbc.M705170200 . ПМИД 18056264 .
Меллер Н., Уэстбрук М.Дж., Шеннон Дж.Д. и др. (2008). «Функция N-конца зизимина1: аутоингибирование и нацеливание на мембрану» . Биохим. Дж . 409 (2): 525–33. дои : 10.1042/BJ20071263 . ПМК 2740492 . ПМИД 17935486 .
Детера-Уодли С.Д., Лю С.И., Махешвари М. и др. (2007). «Вариации последовательности DOCK9 и гетерогенность при биполярном расстройстве» . Психиатр. Жене . 17 (5): 274–86. дои : 10.1097/YPG.0b013e328133f352 . ПМИД 17728666 . S2CID 7102906 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Данэм А., Мэтьюз Л.Х., Бертон Дж. и др. (2004). «Последовательность ДНК и анализ 13-й хромосомы человека» . Природа . 428 (6982): 522–8. Бибкод : 2004Natur.428..522D . дои : 10.1038/nature02379 . ПМЦ 2665288 . ПМИД 15057823 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Коте Ж.Ф., Вуори К. (2003). «Идентификация эволюционно консервативного суперсемейства родственных DOCK180 белков с обменной активностью гуаниновых нуклеотидов». Дж. Клеточная наука . 115 (Часть 24): 4901–13. дои : 10.1242/jcs.00219 . ПМИД 12432077 . S2CID 14669715 .
Меллер Н., Ирани-Техрани М., Киоссес В.Б. и др. (2002). «Зизимин1, новый активатор Cdc42, обнаруживает новый домен GEF для белков Rho». Нат. Клеточная Биол . 4 (9): 639–47. дои : 10.1038/ncb835 . ПМИД 12172552 . S2CID 24507862 .
Кикуно Р., Нагасе Т., Исикава К. и др. (1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XIV. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . ДНК Рез . 6 (3): 197–205. дои : 10.1093/dnares/6.3.197 . ПМИД 10470851 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 13 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000088387 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025558 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Ген Энтрез: представитель цитокинеза DOCK9 9» .

[Meller_2002-6] Jump up to: ^а ^б Меллер Н., Ирани-Техрани М., Киоссес В.Б. и др. (сентябрь 2002 г.). «Зизимин1, новый активатор Cdc42, обнаруживает новый домен GEF для белков Rho». Нат. Клеточная Биол . 4 (9): 639–47. дои : 10.1038/ncb835 . ПМИД 12172552 . S2CID 24507862 .

[Meller_2008-7] Jump up to: ^а ^б Меллер Н., Уэстбрук М.Дж., Шеннон Дж.Д. и др. (январь 2008 г.). «Функция N-конца зизимина1: аутоингибирование и нацеливание на мембрану» . Биохим. Дж 409 (2): 525–33. дои : 10.1042/BJ20071263 . ПМК 2740492 . ПМИД 17935486 .

[Lu_2004-8] Лу М., Кинчен Дж.М., Россман К.Л. и др. (август 2004 г.). «PH-домен ELMO функционирует в транс-регуляции активации Rac через Dock180». Нат. Структура. Мол. Биол . 11 (8): 756–62. дои : 10.1038/nsmb800 . ПМИД 15247908 . S2CID 125990 .

[Lu_2005-9] Лу М., Кинчен Дж.М., Россман К.Л. и др. (февраль 2005 г.). «Модель стерического ингибирования для регуляции нуклеотидного обмена посредством семейства GEF Dock180» . Курс. Биол . 15 (4): 371–77. Бибкод : 2005CBio...15..371L . дои : 10.1016/j.cub.2005.01.050 . ПМИД 15723800 .

[Meller_2004-10] Меллер Н., Ирани-Техрани М., Ратников Б.И. и др. (сентябрь 2004 г.). «Новый фактор обмена гуаниновых нуклеотидов Cdc42, зизимин1, димеризуется через Cdc42-связывающий домен CZH2» . Ж. Биол. Хим . 279 (36): 37470–76. дои : 10.1074/jbc.M404535200 . ПМИД 15247287 .

[Detera-Wadleigh_2007-11] Детера-Уодли С.Д., Лю С.И., Махешвари М. и др. (октябрь 2007 г.). «Вариации последовательности DOCK9 и гетерогенность при биполярном расстройстве» . Психиатр. Жене . 17 (5): 274–86. дои : 10.1097/YPG.0b013e328133f352 . ПМИД 17728666 . S2CID 7102906 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]