Посвятник белка цитокинеза 9

Док9
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	1WG7, 2WM9, 2WMN, 2WMO
Идентификаторы
Псевдонимы	Dock9 , Ziz1, Zizimin1, Dock9, посвятник цитокинеза 9
Внешние идентификаторы	Омим : 607325 ; MGI : 106321 ; Гомологен : 41026 ; Genecards : Dock9 ; OMA : Dock9 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 13 (human)
End	99,086,625 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 14 (mouse)
End	122,035,249 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	Achilles tendon; ; right lung; ; corpus callosum; ; Region I of hippocampus proper; ; lower lobe of lung; ; oral cavity; ; sural nerve; ; skin of hip; ; inferior olivary nucleus; ; upper lobe of lung;
	Top expressed in
	subiculum; ; right lung lobe; ; sciatic nerve; ; CA3 field; ; cerebellar vermis; ; Region I of hippocampus proper; ; lobe of cerebellum; ; tunica adventitia of aorta; ; deep cerebellar nuclei; ; endothelial cell of lymphatic vessel;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	protein binding; guanyl-nucleotide exchange factor activity; cadherin binding;
Cellular component	cytosol; endomembrane system; membrane;
Biological process	blood coagulation; small GTPase mediated signal transduction; positive regulation of GTPase activity; biological process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	23348
	105445
	ENSG00000088387
	Ensmusg00000025558
	Q9BZ29
	Q8BIK4
showNM_001130048 ; NM_001130049 ; NM_001130050 ; NM_015296 ; NM_001318849 ;
	NM_001366676; NM_001366677; NM_001366678; NM_001366679; NM_001366680; NM_001366681; NM_001366682; NM_001366683; NM_001366684
	NM_001081039 ; NM_001128307 ; NM_001128308 ; NM_134074 ; NM_001347596
showNP_001123520 ; NP_001123521 ; NP_001123522 ; NP_001305778 ; NP_056111 ;
	NP_001353605; NP_001353606; NP_001353607; NP_001353608; NP_001353609; NP_001353610; NP_001353611; NP_001353612; NP_001353613
	n/a
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Посвятник белка цитокинеза 9 ( DOCK9 ), также известный как Zizimin1 , представляет собой большой белок (~ 230 кДа) , кодируемый в человеке геном DOCK9 , участвующего во внутриклеточных сигнальных сетях . ^{[ 5 ]} Он является членом подсемейства док-D семейства -док док -нуклеотидных обменных факторов , которые функционируют как активаторы мелких G-белков . Dock9 активирует небольшой G -белок CDC42 .

Открытие

DOCK9 был обнаружен с использованием аффинного протеомного подхода, предназначенного для идентификации новых активаторов небольшого G -белка CDC42 в фибробластах . ^{[ 6 ]} Последующий северный блот -анализ показал, что DOCK9 экспрессируется в основном в мозге , сердце , скелетных мышцах , почке , плаценте и легких . Более низкие уровни были обнаружены в толстой кишке , тимусе , печени , тонкой кишке и лейкоцитах из периферической крови.

Структура и функция

Dock9 разделяет аналогичную структуру двух основных доменов (известных как DHR1 и DHR2 ), которые разделяются всеми членами семейства доков. C -концевой домен DHR2 функционирует как атипичный домен GEF для небольших G-белков (см. DOCK180: Структура и функция ), и домен DHR1 известен, в некоторых белках подсемейства DOCK-A/B/C, которые участвуют в их рекрутировании в DOCK-A/B/C. плазматическая мембрана . В отличие от белков DOCK-A/B/C, белки DOCK-D (включая DOCK9) содержат N-концевой домен гомологии PLECKSTRIN (PH) , который опосредует их рекрутирование в мембрану. ^{[ 7 ]} Dock9, наряду с другими членами подсемейства DOCK-C/D, может активировать CDC42 in vitro и in vivo через свой домен DHR2. ^{[ 6 ]} Тем не менее, DOCK9 принимает аутоингибирующую конформацию, которая маскирует домен DHR2 в его состоянии покоя. ^{[ 7 ]} Механизм, с помощью которого это аутоингибирование преодолевается, до сих пор неясен, хотя в некоторых других белках док -белков, которые также подвергаются аутоингибированию, это требует взаимодействия с адаптерными белками, такими как ELMO . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} Также сообщалось, что DOCK9 димеризация в условиях покоя, через свои домены DHR2, и это исследование предполагает, что другие белки семейства доков также могут вести себя так же. ^{[ 10 ]} Недавний анализ хромосомной области , связанной с восприимчивостью к биполярному расстройству, показал, что отдельные нуклеотидные полиморфизмы в гене DOCK9 способствуют риску и тяжести этого состояния. ^{[ 11 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000088387 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: ENSMUSG000000255558 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ "Entrez Gene: Dock9 Dedicator цитокинеза 9" .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Meller N, Irani-Tehrani M, Kiosses WB, et al. (Сентябрь 2002 г.). «Zizimin1, новый активатор CDC42, выявляет новый домен GEF для белков RHO». НАТ Клеточная биол . 4 (9): 639–47. doi : 10.1038/ncb835 . PMID 12172552 . S2CID 24507862 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Meller N, Westbrook MJ, Shannon JD, et al. (Январь 2008 г.). «Функция N-конца Zizimin1: автонегибирование и нацеливание на мембрану » Биохимия. Дж 409 (2): 525–3 Doi : 10.1042/ bj2 2740492PMC PMID 17935486
^ Lu M, Kinchen JM, Rossman KL, et al. (Август 2004 г.). «PH -домен функций ELMO в TRANS для регулирования активации RAC через DOCK180». НАТ Структура Мол Биол . 11 (8): 756–62. doi : 10.1038/nsmb800 . PMID 15247908 . S2CID 125990 .
^ Lu M, Kinchen JM, Rossman KL, et al. (Февраль 2005 г.). «Модель стерического ингибирования для регуляции нуклеотидного обмена через семейство GEF DOCK180» . Карт Биол . 15 (4): 371–77. Bibcode : 2005cbio ... 15..371L . doi : 10.1016/j.cub.2005.01.050 . PMID 15723800 .
^ Meller N, Irani-Tehrani M, Ratnikov Bi, et al. (Сентябрь 2004 г.). «Новый CDC42 Гуаниновый нуклеотидный фактор обмена, Zizimin1, димеризуется через CDC42-связывающий домен CZH2» . Дж. Биол. Химический 279 (36): 37470–76. doi : 10.1074/jbc.m404535200 . PMID 15247287 .
^ Deterera-Wadleigh SD, Liu CY, Maheshwari M, et al. (Октябрь 2007 г.). «Изменение последовательности в DOCK9 и гетерогенность при биполярном расстройстве» . Психиатр. Генет . 17 (5): 274–86. doi : 10.1097/ypg.0b013e328133f352 . PMID 17728666 . S2CID 7102906 .

Дальнейшее чтение

Накаджима Д., Оказаки Н., Якава Х. и др. (2003). для Kiaa Penes: ручное тереление клонов кДНК 330 KIAA» «Конструкция экспрессии- клоны кДНК Rady ДНК Res 9 (3): 99–1 Doi : 10.1093/ dnares/ 9.3.9 PMID 12168954 .
Kwofie MA, Skowronski J (2008). «Специальное распознавание Rac2 и CDC42 с помощью факторов обмена нуклеотида Dock2 и DOCK9» . Дж. Биол. Химический 283 (6): 3088–96. doi : 10.1074/jbc.m705170200 . PMID 18056264 .
Meller N, Westbrook MJ, Shannon JD, et al. (2008). «Функция N-конца Zizimin1: автоингибирование и нацеливание на мембрану» . Биохимия. Дж . 409 (2): 525–33. doi : 10.1042/bj20071263 . PMC 2740492 . PMID 17935486 .
Deterera-Wadleigh SD, Liu CY, Maheshwari M, et al. (2007). «Изменение последовательности в DOCK9 и гетерогенность при биполярном расстройстве» . Психиатр. Генет . 17 (5): 274–86. doi : 10.1097/ypg.0b013e328133f352 . PMID 17728666 . S2CID 7102906 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «Статус, качество и расширение полноразмерного проекта кДНК NIH: коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Res . 14 (10b): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Dunham A, Matthews LH, Burton J, et al. (2004). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы человека 13» . Природа . 428 (6982): 522–8. Bibcode : 2004natur.428..522d . doi : 10.1038/nature02379 . PMC 2665288 . PMID 15057823 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК» . НАТ Генет . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Côté JF, Vuori K (2003). «Идентификация эволюционно консервативного суперсемейства белков, связанных с DOCK180 с активностью обмена нуклеотидов гуанина». J. Cell Sci . 115 (Pt 24): 4901–13. doi : 10.1242/jcs.00219 . PMID 12432077 . S2CID 14669715 .
Meller N, Irani-Tehrani M, Kiosses WB, et al. (2002). «Zizimin1, новый активатор CDC42, выявляет новый домен GEF для белков RHO». НАТ Клеточная биол . 4 (9): 639–47. doi : 10.1038/ncb835 . PMID 12172552 . S2CID 24507862 .
Kikuno R, Nagase T, Ishikawa K, et al. (1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XIV. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые код для крупных белков in vitro» . ДНК Res . 6 (3): 197–205. doi : 10.1093/dnares/6.3.197 . PMID 10470851 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 13 представляет собой заглушку . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000088387 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: ENSMUSG000000255558 - ENSEMBL , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[entrez-5] "Entrez Gene: Dock9 Dedicator цитокинеза 9" .

[Meller_2002-6] Jump up to: ^а ^{беременный} Meller N, Irani-Tehrani M, Kiosses WB, et al. (Сентябрь 2002 г.). «Zizimin1, новый активатор CDC42, выявляет новый домен GEF для белков RHO». НАТ Клеточная биол . 4 (9): 639–47. doi : 10.1038/ncb835 . PMID 12172552 . S2CID 24507862 .

[Meller_2008-7] Jump up to: ^а ^{беременный} Meller N, Westbrook MJ, Shannon JD, et al. (Январь 2008 г.). «Функция N-конца Zizimin1: автонегибирование и нацеливание на мембрану » Биохимия. Дж 409 (2): 525–3 Doi : 10.1042/ bj2 2740492PMC PMID 17935486

[Lu_2004-8] Lu M, Kinchen JM, Rossman KL, et al. (Август 2004 г.). «PH -домен функций ELMO в TRANS для регулирования активации RAC через DOCK180». НАТ Структура Мол Биол . 11 (8): 756–62. doi : 10.1038/nsmb800 . PMID 15247908 . S2CID 125990 .

[Lu_2005-9] Lu M, Kinchen JM, Rossman KL, et al. (Февраль 2005 г.). «Модель стерического ингибирования для регуляции нуклеотидного обмена через семейство GEF DOCK180» . Карт Биол . 15 (4): 371–77. Bibcode : 2005cbio ... 15..371L . doi : 10.1016/j.cub.2005.01.050 . PMID 15723800 .

[Meller_2004-10] Meller N, Irani-Tehrani M, Ratnikov Bi, et al. (Сентябрь 2004 г.). «Новый CDC42 Гуаниновый нуклеотидный фактор обмена, Zizimin1, димеризуется через CDC42-связывающий домен CZH2» . Дж. Биол. Химический 279 (36): 37470–76. doi : 10.1074/jbc.m404535200 . PMID 15247287 .

[Detera-Wadleigh_2007-11] Deterera-Wadleigh SD, Liu CY, Maheshwari M, et al. (Октябрь 2007 г.). «Изменение последовательности в DOCK9 и гетерогенность при биполярном расстройстве» . Психиатр. Генет . 17 (5): 274–86. doi : 10.1097/ypg.0b013e328133f352 . PMID 17728666 . S2CID 7102906 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]