ПРКД2

ПРКД2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2COA, 3BGM, 4NNX, 4NNY
Идентификаторы
Псевдонимы	PRKD2 , PKD2, nPKC-D2, HSPC187, протеинкиназа D2
Внешние идентификаторы	Опустить : 607074 ; МГИ : 2141917 ; Гомологен : 9516 ; Генные карты : PRKD2 ; ОМА : PRKD2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	46,717,127 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	16,604,389 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	vena cava; ; superficial temporal artery; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis; ; granulocyte; ; spleen; ; body of tongue; ; pylorus; ; lactiferous duct; ; cardia; ; skin of leg;
	Top expressed in
	thymus; ; granulocyte; ; mesenteric lymph nodes; ; spleen; ; blood; ; primary oocyte; ; right lung; ; right lung lobe; ; left lung; ; external carotid artery;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	transferase activity; protein kinase activity; nucleotide binding; protein kinase C activity; metal ion binding; kinase activity; protein binding; ATP binding; protein serine/threonine kinase activity; protein kinase C binding;
Cellular component	cytoplasm; Golgi apparatus; membrane; nucleoplasm; nucleus; cytosol; plasma membrane; intracellular anatomical structure;
Biological process	positive regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway; intracellular signal transduction; positive regulation of endothelial cell proliferation; adaptive immune response; phosphorylation; immune system process; endothelial tube morphogenesis; positive regulation of fibroblast growth factor receptor signaling pathway; positive regulation of T cell receptor signaling pathway; positive regulation of endothelial cell chemotaxis; positive regulation of DNA-binding transcription factor activity; cell death; protein kinase D signaling; positive regulation of intracellular signal transduction; positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation; positive regulation of angiogenesis; positive regulation of endothelial cell migration; protein phosphorylation; positive regulation of histone deacetylase activity; positive regulation of CREB transcription factor activity; vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway; cell adhesion; positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; positive regulation of interleukin-2 production; angiogenesis; positive regulation of interleukin-8 production; positive regulation of blood vessel endothelial cell migration; positive regulation of DNA biosynthetic process; positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; positive regulation of endothelial cell chemotaxis by VEGF-activated vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway; protein autophosphorylation; cellular response to vascular endothelial growth factor stimulus; T cell receptor signaling pathway; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; positive regulation of cell adhesion; sphingolipid biosynthetic process; peptidyl-serine phosphorylation; peptidyl-threonine phosphorylation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	25865
	101540
	ENSG00000105287
	ENSMUSG00000041187
	Q9BZL6
	Q8BZ03
	НМ_001079880 ; НМ_001079881 ; НМ_001079882 ; НМ_016457
	НМ_001252458 ; НМ_178900
	НП_001073349 ; НП_001073350 ; НП_001073351 ; НП_057541
	НП_001239387 ; НП_849231
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Серин/треонин-протеинкиназа D2 или PKD2 представляет собой фермент , который у человека кодируется PRKD2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к семейству протеинкиназ D (PKD) серин / треониновых протеинкиназ, подсемейству протеинкиназы C. Эта киназа может активироваться эфирами форбола, а также гастрином через рецептор холецистокинина B (CCKBR) в клетках рака желудка. Он может связываться с диацилглицерином (DAG) в транс-сети Гольджи (TGN) и может регулировать выход базолатеральных мембранных белков из TGN. Альтернативный сплайсинг приводит к образованию множества вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы. ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000105287 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041187 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Чжан QH, Е М, Ву XY, Рен SX, Чжао М, Чжао CJ, Фу Г, Шен Ю, Фань ХИ, Лу Г, Чжун М, Сюй XR, Хань ZG, Чжан ЮВ, Тао Дж, Хуан QH, Чжоу Дж , Ху GX, Гу J, Чен SJ, Чен Z (ноябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее неопределенных генов, экспрессируемых в CD34+ гемопоэтических стволовых клетках/клетках-предшественниках» . Геном Рез . 10 (10): 1546–60. дои : 10.1101/гр.140200 . ПМК 310934 . ПМИД 11042152 .
^ Стурани С., Ван Линт Дж., Мюллер Ф., Вильда М., Хамейстер Х., Хокер М., Брей А., Герн У., Ванденхид Дж., Гресс Т., Адлер Г., Зойфферляйн Т. (май 2001 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика человеческой протеинкиназы D2. Новый член семейства протеинкиназ D серин-треониновых киназ» . J Биол Хим . 276 (5): 3310–8. дои : 10.1074/jbc.M008719200 . ПМИД 11062248 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: протеинкиназа D2 PRKD2» .

Дальнейшее чтение

Стурани С., Ван Линт Дж., Гилкрист А. и др. (2002). «Механизм активации протеинкиназы D2 (PKD2) рецептором CCK (B) / гастрина» . Ж. Биол. Хим . 277 (33): 29431–6. дои : 10.1074/jbc.M200934200 . ПМИД 12058027 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Рей О, Юань Дж, Розенгурт Э (2003). «Внутриклеточное перераспределение протеинкиназы D2 в ответ на агонисты рецепторов, связанных с G-белком». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 302 (4): 817–24. дои : 10.1016/S0006-291X(03)00269-9 . ПМИД 12646243 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Йеман С., Аяла М.И., Райт-младший и др. (2004). «Протеинкиназа D регулирует выход белков базолатеральной мембраны из транс-сети Гольджи» . Нат. Клеточная Биол . 6 (2): 106–12. дои : 10.1038/ncb1090 . ПМЦ 3372901 . ПМИД 14743217 .
Михайлович Т., Маркс М., Ауэр А. и др. (2005). «Протеинкиназа D2 опосредует активацию ядерного фактора каппаB с помощью Bcr-Abl в клетках миелоидного лейкоза человека Bcr-Abl +» . Рак Рез . 64 (24): 8939–44. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-04-0981 . ПМИД 15604256 .
Парра М., Каслер Х., McKinsey TA и др. (2005). «Протеинкиназа D1 фосфорилирует HDAC7 и индуцирует его ядерный экспорт после активации рецептора Т-клеток» . Ж. Биол. Хим . 280 (14): 13762–70. дои : 10.1074/jbc.M413396200 . ПМИД 15623513 .
Ауэр А., фон Блюм Дж., Стурани С. и др. (2006). «Роль регуляторного домена протеинкиназы D2 в связывании сложного эфира форбола, каталитической активности и нуклеоцитоплазматическом передвижении» . Мол. Биол. Клетка . 16 (9): 4375–85. doi : 10.1091/mbc.E05-03-0251 . ПМК 1196345 . ПМИД 15975900 .
Ким Дж.Э., Танненбаум С.Р., White FM (2005). «Глобальный фосфопротеом клеток аденокарциномы толстой кишки человека HT-29». J. Протеом Рез . 4 (4): 1339–46. дои : 10.1021/pr050048h . ПМИД 16083285 .
Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация модуляции транскрипции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» . Геном Рез . 16 (1): 55–65. дои : 10.1101/гр.4039406 . ПМК 1356129 . ПМИД 16344560 .
Джексон Л.Н., Ли Дж., Чен Л.А. и др. (2006). «Сверхэкспрессия PKD2 дикого типа приводит к усилению пролиферации и инвазии эндокринных клеток BON» . Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 348 (3): 945–9. дои : 10.1016/j.bbrc.2006.07.142 . ПМК 2430871 . ПМИД 16899224 .
Чиу Т.Т., Люнг Вайоминг, Мойер М.П. и др. (2007). «Протеинкиназа D2 опосредует индуцированное лизофосфатидной кислотой производство интерлейкина 8 в нетрансформированных эпителиальных клетках толстой кишки человека посредством NF-kappaB». Являюсь. J. Physiol., Cell Physiol . 292 (2): C767–77. doi : 10.1152/ajpcell.00308.2006 . ПМИД 16928771 . S2CID 2220790 .
Ириэ А., Харада К., Цукамото Х. и др. (2007). «Протеинкиназа D2 способствует либо регуляции промотора IL-2, либо индукции гибели клеток при стимуляции TCR, в зависимости от ее активности в клетках Jurkat» . Межд. Иммунол . 18 (12): 1737–47. doi : 10.1093/intimm/dxl108 . ПМИД 17077180 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .
Коллерс С., Мусилова П., Рубес Дж., Роча Д. (2007). «Сравнительное картирование выявляет множественные перестройки между хромосомой 6 свиньи и 19q13 человека». Аним. Жене . 37 (6): 595–6. дои : 10.1111/j.1365-2052.2006.01516.x . ПМИД 17121608 .
Виссинг Дж., Янш Л., Нимц М. и др. (2007). «Протеомный анализ протеинкиназ с помощью селективного префракционирования по целевым классам и тандемной масс-спектрометрии» . Мол. Клетка. Протеомика . 6 (3): 537–47. дои : 10.1074/mcp.T600062-MCP200 . HDL : 10033/19756 . ПМИД 17192257 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 19 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000105287 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041187 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11042152-5] Чжан QH, Е М, Ву XY, Рен SX, Чжао М, Чжао CJ, Фу Г, Шен Ю, Фань ХИ, Лу Г, Чжун М, Сюй XR, Хань ZG, Чжан ЮВ, Тао Дж, Хуан QH, Чжоу Дж , Ху GX, Гу J, Чен SJ, Чен Z (ноябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее неопределенных генов, экспрессируемых в CD34+ гемопоэтических стволовых клетках/клетках-предшественниках» . Геном Рез . 10 (10): 1546–60. дои : 10.1101/гр.140200 . ПМК 310934 . ПМИД 11042152 .

[pmid11062248-6] Стурани С., Ван Линт Дж., Мюллер Ф., Вильда М., Хамейстер Х., Хокер М., Брей А., Герн У., Ванденхид Дж., Гресс Т., Адлер Г., Зойфферляйн Т. (май 2001 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика человеческой протеинкиназы D2. Новый член семейства протеинкиназ D серин-треониновых киназ» . J Биол Хим . 276 (5): 3310–8. дои : 10.1074/jbc.M008719200 . ПМИД 11062248 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: протеинкиназа D2 PRKD2» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

v т и Ферменты
Активность	Активный сайт Связывающий сайт Каталитическая триада Оксианионная дырка Ферментная распущенность Фермент, ограниченный диффузией Кофактор Ферментативный катализ
Регулирование	Аллостерическая регуляция Кооперативность Ингибитор ферментов Активатор ферментов
Классификация	Номер ЕС Суперсемейство ферментов Семейство ферментов Список ферментов
Кинетика	Кинетика ферментов Диаграмма Иди – Хофсти Заговор Хейнса – Вульфа График Лайнуивера – Берка Кинетика Михаэлиса – Ментен
Типы	EC1 Оксидоредуктазы ( список ) EC2 Трансферазы ( список ) EC3 Гидролазы ( список ) EC4- лиазы ( список ) EC5 Изомеразы ( список ) EC6- лигазы ( список ) EC7 Транслоказы ( список )