ТАРБП2

ТАРБП2
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB показывать Список идентификационных кодов PDB 2CPN, 3ADL, 3LLH, 4WYQ
Идентификаторы
Псевдонимы	TARBP2 , LOQS, TRBP, TRBP1, TRBP2, загрузочный комплекс RISC, РНК-связывающая субъединица, субъединица TARBP2 загрузочного комплекса RISC
Внешние идентификаторы	Опустить : 605053 ; МГИ : 103027 ; Гомологен : 7562 ; GeneCards : TARBP2 ; OMA : TARBP2 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 12 (human) Band 12q13.13 Start 53,500,921 bp End 53,506,431 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 15 (mouse) Band 15 F3|15 57.65 cM Start 102,426,627 bp End 102,432,111 bp
показывать экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in right hemisphere of cerebellum right uterine tube right lobe of thyroid gland right adrenal gland right adrenal cortex mucosa of transverse colon granulocyte left lobe of thyroid gland right lobe of liver body of pancreas Top expressed in spermatocyte yolk sac testicle spermatid epiblast embryo mesencephalon neural tube heart embryo More reference expression data BioGPS More reference expression data
показывать Генная онтология Molecular function protein N-terminus binding protein binding siRNA binding RNA binding enzyme binding pre-mRNA binding double-stranded RNA binding identical protein binding protein homodimerization activity pre-miRNA binding miRNA binding Cellular component cytoplasm cytosol perinuclear region of cytoplasm nucleus nucleoplasm nuclear body RISC-loading complex RISC complex Biological process regulation of viral transcription negative regulation of protein kinase activity multicellular organism growth positive regulation of translation single fertilization negative regulation of defense response to virus by host spermatid development positive regulation of viral genome replication regulation of translation production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA miRNA metabolic process gene silencing production of siRNA involved in RNA interference pre-miRNA processing regulation of production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA skeletal muscle tissue regeneration positive regulation of muscle cell differentiation neural precursor cell proliferation Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи Разновидность Человек Мышь Входить 6895 21357 Вместе ENSG00000139546 ENSMUSG00000023051 ЮниПрот Q15633 P97473 RefSeq (мРНК) НМ_004178 НМ_134323 НМ_134324 НМ_001253795 НМ_009319 RefSeq (белок) НП_004169 НП_599150 НП_599151 НП_001240724 НП_033345 Местоположение (UCSC) Чр 12: 53,5 – 53,51 Мб Чр 15: 102,43 – 102,43 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Субъединица RISC-загрузочного комплекса TARBP2 представляет собой белок , который у человека кодируется TARBP2 геном .

Функция

ВИЧ-1 , возбудитель синдрома приобретенного иммунодефицита (СПИД), содержит геном РНК, который продуцирует интегрированную в хромосому ДНК во время репликативного цикла. Активация экспрессии гена ВИЧ-1 трансактиватором Tat зависит от регуляторного элемента РНК (TAR), расположенного ниже сайта инициации транскрипции. Белок, кодируемый этим геном, связывается между выпуклостью и петлей регуляторного элемента РНК TAR ВИЧ-1 и активирует экспрессию гена ВИЧ-1 в синергии с вирусным белком Tat. Альтернативный сплайсинг приводит к образованию множества вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы. У этого гена также есть псевдоген .

Взаимодействия

Было показано, что TARBP2 взаимодействует с протеинкиназой R. и РБМ14 .

Дальнейшее чтение

• Косентино Г.П., Венкатесан С., Серлука ФК, Грин С.Р., Мэтьюз М.Б., Соненберг Н. (октябрь 1995 г.). «Двухцепочечная РНК-зависимая протеинкиназа и РНК-связывающий белок TAR образуют гомо- и гетеродимеры in vivo» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (21): 9445–9. Бибкод : 1995PNAS...92.9445C . дои : 10.1073/pnas.92.21.9445 . ПМК   40818 . ПМИД   7568151 .
• Козак К.А., Гатиньоль А., Грэм К., Жанг К.Т., Макбрайд О.В. (январь 1995 г.). «Генетическое картирование у человека и мыши локуса, кодирующего TRBP, белок, который связывает область TAR вируса иммунодефицита человека (ВИЧ-1)» . Геномика . 25 (1): 66–72. дои : 10.1016/0888-7543(95)80110-8 . ПМИД   7774957 .
• Гатиньоль А., Баклер С., Жанг К.Т. (апрель 1993 г.). «Связь РНК-связывающего мотива в РНК-связывающем белке TRBP TAR вируса иммунодефицита человека типа 1 с киназой P1/dsI человека и штауфеном Drosophila» . Молекулярная и клеточная биология . 13 (4): 2193–202. дои : 10.1128/mcb.13.4.2193 . ПМК   359540 . ПМИД   8455607 .
• Гатиньоль А., Дуарте М., Давиет Л., Чанг Й.Н., Жанг К.Т. (1996). «Последовательные этапы транс-активации Tat ВИЧ-1, опосредованной клеточной ДНК, РНК и факторами связывания белков» . Экспрессия генов . 5 (4–5): 217–28. ПМК   6138028 . ПМИД   8723388 .
• Касоф Г.М., Гоял Л., Уайт Э. (июнь 1999 г.). «Btf, новый репрессор транскрипции, способствующий гибели, который взаимодействует с белками, родственными Bcl-2» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (6): 4390–404. дои : 10.1128/mcb.19.6.4390 . ПМЦ   104398 . ПМИД   10330179 .
• Давиет Л., Эрард М., Дорин Д., Дуарте М., Вакеро С., Гатиньоль А. (апрель 2000 г.). «Анализ разницы в связывании между двумя доменами, связывающими дцРНК, в TRBP выявляет модульную функцию мотива KR-спирали». Европейский журнал биохимии . 267 (8): 2419–31. дои : 10.1046/j.1432-1327.2000.01256.x . ПМИД   10759868 .
• Дуарте М., Грэм К., Дахер А., Баттисти П.Л., Баннварт С., Сегерал Э., Жанг К.Т., Гатиньоль А. (2001). «Характеристика TRBP1 и TRBP2. Стабильная структура «стебель-петля» на 5'-конце мРНК TRBP2 напоминает TAR ВИЧ-1 и не обнаруживается в его процессированном псевдогене». Журнал биомедицинской науки . 7 (6): 494–506. дои : 10.1007/bf02253365 . ПМИД   11060498 .
• Сиффруа Дж.П., Павляк А., Альфонси М.Ф., Троален Ф., Геллаен Г., Дадун Дж.П. (март 2001 г.). «Экспрессия РНК-связывающего белка TAR в семенниках человека» . Молекулярная репродукция человека . 7 (3): 219–25. дои : 10.1093/моль/7.3.219 . ПМИД   11228241 .
• Даэр А., Лонге М., Дорин Д., Буа Ф., Сегерал Э., Баннварт С., Баттисти П.Л., Перселл Д.Ф., Бенарус Р., Вакеро С., Мерс Э.Ф., Гатиньоль А. (сентябрь 2001 г.). «Два домена димеризации в РНК-связывающем белке транс-активационного ответа (TRBP) индивидуально обращают ингибирование протеинкиназой R экспрессии длинных концевых повторов ВИЧ-1» . Журнал биологической химии . 276 (36): 33899–905. дои : 10.1074/jbc.M103584200 . ПМИД   11438532 .
• Ивасаки Т., Чин В.В., Ко Л. (сентябрь 2001 г.). «Идентификация и характеристика RRM-содержащего активатора коактиватора (CoAA) как белка, взаимодействующего с TRBP, и его сплайсингового варианта как модулятора коактиватора (CoAM)» . Журнал биологической химии . 276 (36): 33375–83. дои : 10.1074/jbc.M101517200 . ПМИД   11443112 .
• Баннварт С., Талакуб Л., Летурнер Ф., Дуарте М., Перселл Д.Ф., Хискотт Дж., Гатиньоль А. (декабрь 2001 г.). «Организация человеческого гена tarbp2 обнаруживает два промотора, которые репрессированы в линии астроцитарных клеток» . Журнал биологической химии . 276 (52): 48803–13. дои : 10.1074/jbc.M104645200 . ПМИД   11641396 .
• Сюй Ю.К., Ву РФ, Гу Ю, Ян Ю.С., Ян МК, Нвариаку Ф.Е., Терада Л.С. (август 2002 г.). «Участие TRAF4 в окислительной активации N-концевой киназы c-Jun» . Журнал биологической химии . 277 (31): 28051–7. дои : 10.1074/jbc.M202665200 . ПМИД   12023963 .
• Баттисти П.Л., Дахер А., Баннварт С., Воортман Дж., Педен К.В., Хискотт Дж., Муланд А.Дж., Бенарус Р., Гатиньоль А. (сентябрь 2003 г.). «Аддитивная активность между РНК-связывающим белком трансактивационного ответа, TRBP2 и циклином Т1 в отношении экспрессии ВИЧ типа 1 и продукции вируса в мышиных клетках». Исследования СПИДа и ретровирусы человека . 19 (9): 767–78. дои : 10.1089/088922203769232566 . ПМИД   14585207 .
• Lee JY, Kim H, Ryu CH, Kim JY, Choi BH, Lim Y, Huh PW, Kim YH, Lee KH, Jun TY, Rha HK, Kang JK, Choi CR (июль 2004 г.). «Мерлин, супрессор опухоли, взаимодействует с реагирующим на трансактивацию РНК-связывающим белком и ингибирует его онкогенную активность» . Журнал биологической химии . 279 (29): 30265–73. дои : 10.1074/jbc.M312083200 . ПМИД   15123692 .
• Хаазе А.Д., Яскевич Л., Чжан Х., Лайне С., Зак Р., Гатиньоль А., Филипович В. (октябрь 2005 г.). «TRBP, регулятор клеточной экспрессии PKR и вируса ВИЧ-1, взаимодействует с Dicer и участвует в подавлении РНК» . Отчеты ЭМБО . 6 (10): 961–7. дои : 10.1038/sj.embor.7400509 . ПМЦ   1369185 . ПМИД   16142218 .
• Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж, Зогби Х.И., Смоляр А, Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД   16189514 . S2CID   4427026 .
• Баннварт С., Лене С., Дагер А., Гранво Н., Клерзиус Г., Леблан А.С., Хискотт Дж., Гатиньоль А. (февраль 2006 г.). «Клеточно-специфическая регуляция промотора TRBP1 с помощью фактора транскрипции NF-Y в лимфоцитах и ​​астроцитах». Журнал молекулярной биологии . 355 (5): 898–910. дои : 10.1016/j.jmb.2005.11.026 . ПМИД   16343534 .
• Кристенсен Х.С., Дахер А., Сой К.Дж., Франкель Л.Б., Александр М.Р., Лейне С., Баннварт С., Онг К.Л., Чунг С.В., Кэмпбелл С.М., Перселл Д.Ф., Гатиньоль А. (май 2007 г.). «Малые интерферирующие РНК против РНК-связывающего белка TAR, TRBP, кофактора Dicer, ингибируют экспрессию длинных концевых повторов вируса иммунодефицита человека типа 1 и продукцию вируса» . Журнал вирусологии . 81 (10): 5121–31. дои : 10.1128/JVI.01511-06 . ПМК   1900231 . ПМИД   17360756 .