Рибосомный белок 40 -х годов S16

RPS16
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 4KZY, 3J7R, 4D61, 4KZX, 4D5L, 4V5Z, 5FLX, 4UJD, 3J7P, 4KZZ, 4UJE, 4UJC
Идентификаторы
Псевдонимы	RPS16 , S16, рибосомный белок S16
Внешние идентификаторы	Омим : 603675 ; MGI : 98118 ; Гомологен : 794 ; Genesis : RPS16 ; OMA : RPS16 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	39,435,949 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	28,052,580 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	epithelium of nasopharynx; ; germinal epithelium; ; visceral pleura; ; parietal pleura; ; superficial temporal artery; ; skin of hip; ; nipple; ; skin of thigh; ; cardia; ; pericardium;
	Top expressed in
	yolk sac; ; epiblast; ; embryo; ; spleen; ; thymus; ; morula; ; embryo; ; lip; ; pancreas; ; ventricular zone;
	More reference expression data
	n/a
showДжин Онтология
Molecular function	structural constituent of ribosome; protein binding; RNA binding;
Cellular component	cytosol; ribosome; membrane; focal adhesion; small ribosomal subunit; extracellular exosome; nucleoplasm; extracellular matrix; cytosolic small ribosomal subunit;
Biological process	maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA); viral transcription; SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; translational initiation; nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; ribosomal small subunit biogenesis; protein biosynthesis; rRNA processing; cellular response to leukemia inhibitory factor; liver regeneration;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6217
	20055
	ENSG00000105193
	Ensmusg00000037563
	P62249
	P14131
	NM_001020 ; NM_001321111 ; NM_001363860
	NM_013647
	NP_001011 ; NP_001308040 ; NP_001350789
	NP_038675
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Рибосомный белок 40S S16 ' - это белок , который у людей кодируется RPS16 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Рибосомы , органеллы , которые катализируют синтез белка , состоят из небольших субъединиц 40 -х годов и субъединицы больших 60 -х годов . Вместе эти субъединицы состоят из 4 видов РНК и приблизительно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомный белок , который является компонентом субъединицы 40 -х годов. Белок принадлежит к семейству рибосомных белков S9P. Он расположен в цитоплазме . Как типично для генов, кодирующих рибосомные белки, существует множественные обработанные псевдогены этого гена, диспергированные через геном. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Рибосомный белок S16 является одним из белков из маленькой рибосомной субъединицы. Он принадлежит к семейству рибосомных белков, которое разделено на три группы на основе сходства последовательностей:

* Eubacterial S16.

* Водоросль и растение хлоропласт S16.

* Cyanelle S16.

* Neurospora Crassa Mitochondrial S24 (CYT-21).

Белки S16 имеют около 100 аминокислотных остатков. Есть два паралога в Arabidopsis thaliana, RPS16-1 (хлоропластика) и RPS16-2 (нацеленный на хлоропласт и митохондрион)

[4].

Было показано, что RPS16 взаимодействует с CDC5L . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000105193 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000037563 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Batra SK, Metzgar RS, Hollingsworth MA (май 1991). «Молекулярное клонирование и анализ последовательности человеческого рибосомного белка S16» . J Biol Chem . 266 (11): 6830–3. doi : 10.1016/s0021-9258 (20) 89575-1 . PMID 2016298 .
^ Кенмочи Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Е., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж Д.К. (август 1998). «Карта 75 человеческих рибосомных генов белка» . Геном Res . 8 (5): 509–23. doi : 10.1101/gr.8.5.509 . PMID 9582194 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: рибосомный белок RPS16 S16» .
^ Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса CDC5L человека и идентификация его компонентов с помощью масс -спектрометрии» . Embo j . 19 (23). Англия: 6569–81. doi : 10.1093/emboj/19.23.6569 . ISSN 0261-4189 . PMC 305846 . PMID 11101529 .

Дальнейшее чтение

Wool Ig, Chan YL, Glück A (1996). «Структура и эволюция рибосомных белков млекопитающих». Биохимия. Клеточная биол . 73 (11–12): 933–47. doi : 10.1139/O95-101 . PMID 8722009 .
Kato S, Sekine S, OH SW, et al. (1995). «Строительство полноразмерного банка кДНК человека». Ген . 150 (2): 243–50. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90433-2 . PMID 7821789 .
Владимиров С.Н., Иванов А.В., Карпова Г.Г. и др. (1996). «Характеристика белков с малой рибосом-субъединицей человека с помощью N-концевого и внутреннего секвенирования и масс-спектрометрии» . Евро. J. Biochem . 239 (1): 144–9. doi : 10.1111/j.1432-1033.1996.0144u.x . PMID 8706699 .
Бональдо М.Ф., Леннон Г., Соарс М.Б. (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов» . Геном Res . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
Lei XH, Shen X, XQ, Bernstein HS (2001). «Человеческий CDC5, регулятор митотического входа, может действовать как сайт-специфический ДНК-связывающий белок». J. Cell Sci . 113 Pt 24 (24): 4523–31. doi : 10.1242/jcs.113.24.4523 . PMID 11082045 .
Ajuh P, Kuster B, Panov K, et al. (2001). «Функциональный анализ комплекса CDC5L человека и идентификация его компонентов с помощью масс -спектрометрии» . Embo j . 19 (23): 6569–81. doi : 10.1093/emboj/19.23.6569 . PMC 305846 . PMID 11101529 .
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, et al. (2002). «Переданный протеомный анализ человеческого ядры» . Карт Биол . 12 (1): 1–11. Bibcode : 2002cbio ... 12 .... 1a . doi : 10.1016/s0960-9822 (01) 00650-9 . PMID 11790298 . S2CID 14132033 .
Yoshihama M, Uechi T, Asakawa S, et al. (2002). «Гены рибосомного белка человека: секвенирование и сравнительный анализ 73 генов» . Геном Res . 12 (3): 379–90. doi : 10.1101/gr.214202 . PMC 155282 . PMID 11875025 .
Karan D, Kelly DL, Rizzino A, et al. (2002). «Профиль экспрессии дифференциально регулируемых генов при прогрессировании андроген-независимого роста в клетках рака предстательной железы человека» . Канцерогенез . 23 (6): 967–75. doi : 10.1093/карцин/23.6.967 . PMID 12082018 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК» . НАТ Генет . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, et al. (2004). «Физическая и функциональная карта человеческого пути передачи сигнала TNF-альфа/NF-Kappa B». НАТ Клеточная биол . 6 (2): 97–105. doi : 10.1038/ncb1086 . PMID 14743216 . S2CID 11683986 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «Статус, качество и расширение полноразмерного проекта кДНК NIH: коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Res . 14 (10b): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, et al. (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Bibcode : 2005natur.433 ... 77a . doi : 10.1038/nature03207 . PMID 15635413 . S2CID 4344740 .
Yu Y, Ji H, Doudna JA, Leary JA (2005). «Масс-спектрометрический анализ рибосомальной субъединицы 40-х годов: нативные и HCV-связанные комплексы» . Белок Sci . 14 (6): 1438–46. doi : 10.1110/ps.041293005 . PMC 2253395 . PMID 15883184 .
Tu LC, Yan X, Hood L, Lin B (2007). «Протеомический анализ взаимодействия N-Myc Нижнего регулируемого гена 1 и его взаимодействия с программой реакции андрогенов в клетках рака простаты» . Мол Клетка. Протеомика . 6 (4): 575–88. doi : 10.1074/mcp.m600249-mcp200 . PMID 17220478 .
Ewing RM, Chu P, Elisma F, et al. (2007). «Крупномасштабное картирование взаимодействия белка белка человека с помощью масс-спектрометрии» . Мол Система Биол . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .

Эта связанная с белком статья является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000105193 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000037563 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid2016298-5] Batra SK, Metzgar RS, Hollingsworth MA (май 1991). «Молекулярное клонирование и анализ последовательности человеческого рибосомного белка S16» . J Biol Chem . 266 (11): 6830–3. doi : 10.1016/s0021-9258 (20) 89575-1 . PMID 2016298 .

[pmid9582194-6] Кенмочи Н., Кавагути Т., Розен С., Дэвис Е., Гудман Н., Хадсон Т.Дж., Танака Т., Пейдж Д.К. (август 1998). «Карта 75 человеческих рибосомных генов белка» . Геном Res . 8 (5): 509–23. doi : 10.1101/gr.8.5.509 . PMID 9582194 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: рибосомный белок RPS16 S16» .

[pmid11101529-8] Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса CDC5L человека и идентификация его компонентов с помощью масс -спектрометрии» . Embo j . 19 (23). Англия: 6569–81. doi : 10.1093/emboj/19.23.6569 . ISSN 0261-4189 . PMC 305846 . PMID 11101529 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]