SRSF2

SRSF2
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	2KN4, 2LEA, 2LEB, 2LEC
Идентификаторы
Псевдонимы	SRSF2 , PR264, SC-35, SC35, SFRS2, SFRS2A, SRP30B, Serine/Arginine-богатый фактор сплайсинга 2, сериновый и богатый аргинин Фактор сплайсинга 2
Внешние идентификаторы	Омим : 600813 ; MGI : 98284 ; Гомологен : 37721 ; GeneCards : SRSF2 ; OMA : SRSF2 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 17 (human)
End	76,737,333 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	116,853,094 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	tibia; ; embryo; ; tendon of biceps brachii; ; thymus; ; ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; granulocyte; ; male germ cell; ; sperm; ; lymph node;
	Top expressed in
	corneal stroma; ; otic placode; ; tail of embryo; ; otic vesicle; ; Ileal epithelium; ; superior surface of tongue; ; genital tubercle; ; medial ganglionic eminence; ; saccule; ; lactiferous gland;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	transcription corepressor activity; protein binding; nucleic acid binding; RNA binding; protein kinase C binding; pre-mRNA binding;
Cellular component	PML body; nuclear speck; nucleoplasm; extracellular exosome; nucleus; cytosol; spliceosomal complex; interchromatin granule; cytoplasm;
Biological process	mRNA splicing, via spliceosome; termination of RNA polymerase II transcription; mRNA processing; mRNA export from nucleus; RNA splicing; mRNA 3'-end processing; RNA export from nucleus; negative regulation of nucleic acid-templated transcription; mitotic cell cycle; regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome; response to vitamin E; regulation of RNA splicing; mRNA cis splicing, via spliceosome;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6427
	20382
	ENSG00000161547
	Ensmusg00000034120
	Q01130
	Q62093
	NM_001195427 ; NM_003016
	NM_011358
	NP_001182356 ; NP_003007
	NP_035488
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Серин/богатый аргинином фактор сплайсинга 2 является белком , который у людей кодируется SRSF2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Основанный MDS-фактор сплайсинга SRSF2 влияет на экспрессию изоформ класса III и класса IV и пробуждает гранулопоэз, а SRSF2 P95H способствует сплайсингу класса IV путем связывания с ключевыми последовательностями ESE в экзоне CSF3R, и что SRSF2, когда мутировал, вкладывается в дизигранузаси. ^{[ 8 ]}

Взаимодействия

Было показано, что SFRS2 взаимодействует с CDC5L ^{[ 9 ]} и ASF/SF2 . ^{[ 10 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000161547 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: ENSMUSG00000034120 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Bermingham JR, Arden KC, Naumova AK, Sapienza C, Viars CS, Fu XD, et al. (Сентябрь 1995). «Хромосомная локализация мышиных и человеческих генов, кодирующих факторы сплайсинга ASF/SF2 (SFRS1) и SC-35 (SFRS2)» . Геномика . 29 (1): 70–79. doi : 10.1006/geno.1995.1216 . PMID 8530103 .
^ Fu XD, Maniatis T (апрель 1992 г.). «Выделение дополнительной ДНК, которая кодирует фактор сплайсинга млекопитающих SC35». Наука . 256 (5056): 535–538. Bibcode : 1992sci ... 256..535f . doi : 10.1126/science.1373910 . PMID 1373910 .
^ «Ген Entrez: SFRS2-фактор сплайсинга, аргинин/сериновый 2» .
^ Wang Ba, Mehta HM, Penumatchu SR, Tolbert BS, Cheng C, Kimmel M, et al. (Октябрь 2022). «В качестве альтернативы изоформы CSF3R в SRSF2 P95H мутированные миелоидные новообразования». Лейкемия . 36 (10): 2499–2508. doi : 10.1038/s41375-022-01672-4 . PMID 35941213 . S2CID 251408524 .
^ Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса CDC5L человека и идентификация его компонентов с помощью масс -спектрометрии» . Embo Journal . 19 (23): 6569–6581. doi : 10.1093/emboj/19.23.6569 . PMC 305846 . PMID 11101529 .
^ Zhang WJ, Wu JY (октябрь 1996 г.). «Функциональные свойства p54, нового белка SR, активного в конститутивном и альтернативном сплайсингах» . Молекулярная и клеточная биология . 16 (10): 5400–5408. doi : 10.1128/mcb.16.10.5400 . PMC 231539 . PMID 8816452 .

Дальнейшее чтение

Sureau A, Soaret J, Vellard M, Crochet J, Perbal B (декабрь 1992 г.). «Подключение PR264/C-MYB: экспрессия фактора сплайсинга, модулируемого ядерным протонкогеном» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 89 (24): 11683–11687. Bibcode : 1992pnas ... 8911683S . doi : 10.1073/pnas.89.24.11683 . PMC 50620 . PMID 1465383 .
Веллард М., Сурео А., Соре Дж., Мартинер С., Перабал Б (апрель 1992 г.). «Потенциальный коэффициент сплайсинга кодируется противоположной прядью транс-сплайденного экзона C-MYB» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 89 (7): 2511–2515. Bibcode : 1992pnas ... 89.2511v . doi : 10.1073/pnas.89.7.2511 . PMC 48691 . PMID 1557353 .
Захлер А.М., Лейн В.С., Столк Дж. А., Рот М.Б. (май 1992). «Белки SR: консервативное семейство факторов сплайсинга до мРНК» . Гены и развитие . 6 (5): 837–847. doi : 10.1101/gad.6.5.837 . PMID 1577277 .
Dubridge RB, Tang P, HSIA HC, Leong PM, Miller JH, Calos MP (январь 1987 г.). «Анализ мутации в клетках человека с использованием трансфера вируса Эпштейна-Барра» . Молекулярная и клеточная биология . 7 (1): 379–387. doi : 10.1128/mcb.7.1.379 . PMC 365079 . PMID 3031469 .
Tacke R, Manley JL (июль 1995 г.). «Человеческие факторы сплайсинга ASF/SF2 и SC35 обладают различными, функционально значимыми спецификами связывания РНК» . Embo Journal . 14 (14): 3540–3551. doi : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07360.x . PMC 394422 . PMID 7543047 .
Luznik L, Martone ME, Kraus G, Zhang Y, Xu Y, Ellisman MH, Wong-Staal F (июль 1995 г.). «Локализация вируса иммунодефицита человека в трансфицированных и вирусных клетках». Исследование СПИДа и ретровирусы человека . 11 (7): 795–804. doi : 10.1089/apid.1995.11.795 . PMID 7546906 . S2CID 24916512 .
Maruyama K, Sugano S (январь 1994 г.). «Олиго-капитализация: простой метод замены структуры крышки эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген . 138 (1–2): 171–174. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Kohtz JD, Jamison SF, Will CL, Zuo P, Lührmann R, Garcia-Blanco MA, Manley JL (март 1994 г.). «Белковые взаимодействия и распознавание 5'-сплайс-сайта у предшественников мРНК млекопитающих». Природа . 368 (6467): 119–124. Bibcode : 1994natur.368..119k . doi : 10.1038/368119A0 . PMID 8139654 . S2CID 4283089 .
У JY, Maniatis T (декабрь 1993 г.). «Конкретные взаимодействия между белками, участвующими в выборе сайта сплайсинга и регулируемым альтернативным сплайсингом». Клетка . 75 (6): 1061–1070. doi : 10.1016/0092-8674 (93) 90316-I . PMID 8261509 . S2CID 22951690 .
Sureua A, Perbal B (февраль 1994 г.). «Несколько мРНК с переменными 3 'нетранслируемыми областями и различной стабильностью кодируют коэффициент сплайсинга PR264/SC35» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (3): 932–936. Bibcode : 1994pnas ... 91..932s . doi : 10.1073/pnas.91.3.932 . PMC 521427 . PMID 8302870 .
FU XD (сентябрь 1993 г.). «Конкретная приверженность различных пре-мРНК сплайсингу с помощью одиночных белков SR». Природа . 365 (6441): 82–85. Bibcode : 1993natur.365 ... 82f . doi : 10.1038/365082A0 . PMID 8361546 . S2CID 4332012 .
Zhang WJ, Wu JY (октябрь 1996 г.). «Функциональные свойства p54, нового белка SR, активного в конститутивном и альтернативном сплайсингах» . Молекулярная и клеточная биология . 16 (10): 5400–5408. doi : 10.1128/mcb.16.10.5400 . PMC 231539 . PMID 8816452 .
Tronchère H, Wang J, Fu XD (июль 1997 г.). «Белок, связанный с фактором сплайсинга U2AF35, который взаимодействует с белками U2AF65 и SR в сплайсинге пре-мРНК» . Природа . 388 (6640): 397–400. Bibcode : 1997natur.388..397t . doi : 10.1038/41137 . PMID 9237760 . S2CID 4386808 .
Sureua A, Soaret J, Guyon C, Gaillard C, Dumon S, Keller M, et al. (Ноябрь 1997). «Характеристика множественных альтернативных РНК, возникающих в результате антисмысловой транскрипции гена сплайсинга PR264/SC35» . Исследование нуклеиновых кислот . 25 (22): 4513–4522. doi : 10.1093/nar/25.22.4513 . PMC 147067 . PMID 9358160 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (октябрь 1997 г.). «Строительство и характеристика обогащенной полной длиной и библиотекой кДНК с 5'-эндом». Ген . 200 (1–2): 149–156. doi : 10.1016/s0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Zhang WJ, Wu JY (февраль 1998 г.). «SIP1, новый домен RS-домен, необходимый для сплайсинга пре-мРНК» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (2): 676–684. doi : 10.1128/mcb.18.2.676 . PMC 108778 . PMID 9447963 .
Имай Y, Мацуо Н., Огава С., Тохьяма М., Такаги Т (январь 1998 г.). «Клонирование гена, YT521, для нового белка, связанного с сплайсингом РНК, индуцированного гипоксией/реоксигенацией». Исследование мозга. Молекулярное исследование мозга . 53 (1–2): 33–40. doi : 10.1016/s0169-328x (97) 00262-3 . PMID 9473574 .
Parfenov VN, Davis DS, Pochukalina GN, Kostyuchek D, Murti KG (апрель 1998 г.). «Динамика распределения компонентов сплайсинга относительно транскрипционного состояния человеческих ооцитов из антральных фолликулов». Журнал сотовой биохимии . 69 (1): 72–80. doi : 10.1002/(SICI) 1097-4644 (19980401) 69: 1 <72 :: AID-JCB8> 3.0.CO; 2-S . PMID 9513048 . S2CID 29105448 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для Uniprot : Q01130 (коэффициент сплайсинга 2 серина/аргинина) в PDBE-KB .

Эта статья о гене о хромосоме человека 17 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000161547 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: ENSMUSG00000034120 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid8530103-5] Bermingham JR, Arden KC, Naumova AK, Sapienza C, Viars CS, Fu XD, et al. (Сентябрь 1995). «Хромосомная локализация мышиных и человеческих генов, кодирующих факторы сплайсинга ASF/SF2 (SFRS1) и SC-35 (SFRS2)» . Геномика . 29 (1): 70–79. doi : 10.1006/geno.1995.1216 . PMID 8530103 .

[pmid1373910-6] Fu XD, Maniatis T (апрель 1992 г.). «Выделение дополнительной ДНК, которая кодирует фактор сплайсинга млекопитающих SC35». Наука . 256 (5056): 535–538. Bibcode : 1992sci ... 256..535f . doi : 10.1126/science.1373910 . PMID 1373910 .

[entrez-7] «Ген Entrez: SFRS2-фактор сплайсинга, аргинин/сериновый 2» .

[pmid35941213-8] Wang Ba, Mehta HM, Penumatchu SR, Tolbert BS, Cheng C, Kimmel M, et al. (Октябрь 2022). «В качестве альтернативы изоформы CSF3R в SRSF2 P95H мутированные миелоидные новообразования». Лейкемия . 36 (10): 2499–2508. doi : 10.1038/s41375-022-01672-4 . PMID 35941213 . S2CID 251408524 .

[pmid11101529-9] Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ комплекса CDC5L человека и идентификация его компонентов с помощью масс -спектрометрии» . Embo Journal . 19 (23): 6569–6581. doi : 10.1093/emboj/19.23.6569 . PMC 305846 . PMID 11101529 .

[10] Zhang WJ, Wu JY (октябрь 1996 г.). «Функциональные свойства p54, нового белка SR, активного в конститутивном и альтернативном сплайсингах» . Молекулярная и клеточная биология . 16 (10): 5400–5408. doi : 10.1128/mcb.16.10.5400 . PMC 231539 . PMID 8816452 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]