Jump to content

Перевод (биология)

(Перенаправлено с Перевода (генетика) )
Обзор трансляции эукариотической информационной РНК (мРНК)
Трансляция мРНК и синтез рибосомального белка
Стадии инициации и элонгации трансляции с участием нуклеиновых оснований РНК , рибосомы, транспортной РНК и аминокислот.
Три фазы трансляции: (1) при инициации малая субъединица рибосомы связывается с цепью РНК, а комплекс инициаторная тРНК-аминокислота связывается со стартовым кодоном, что завершается присоединением большой субъединицы; (2) элонгация происходит в виде цикла, в котором кодоны последовательно распознаются заряженными тРНК с последующим образованием пептидной связи с переносом полипептида между тРНК внутри рибосомы и, наконец, транслокацией рибосомы к следующему кодону; (3) терминация: когда достигается стоп-кодон, фактор высвобождения связывается и полипептид высвобождается (обратите внимание, что метки для транслокации и образования пептидной связи на этом изображении перевернуты)

В биологии , трансляция — это процесс в живых клетках в котором белки производятся с использованием РНК молекул в качестве шаблонов. Генерируемый белок представляет собой последовательность аминокислот . Эта последовательность определяется последовательностью нуклеотидов в РНК. Нуклеотиды считаются тремя одновременно. Каждая такая тройка приводит к добавлению одной конкретной аминокислоты к образующемуся белку. Соответствие тройки нуклеотидов аминокислоте называется генетическим кодом . Трансляцию осуществляет большой комплекс функциональных РНК и белков, называемых рибосомами . Весь этот процесс называется экспрессией генов .

При трансляции информационная РНК (мРНК) декодируется в рибосоме вне ядра с образованием определенной аминокислотной цепи или полипептида . Полипептид позже сворачивается в активный белок и выполняет свои функции в клетке. Рибосома облегчает декодирование, индуцируя связывание комплементарных последовательностей транспортной РНК (тРНК) антикодонных с кодонами мРНК . ТРНК несут определенные аминокислоты, которые соединяются в полипептид по мере прохождения мРНК и «читаются» рибосомой.

Перевод происходит в три этапа:

  1. Инициация : рибосома собирается вокруг целевой мРНК. Первая тРНК присоединяется к стартовому кодону.
  2. Элонгация : последняя тРНК, подтвержденная малой субъединицей рибосомы ( аккомодация ), передает аминокислоту. Он переносится на большую субъединицу рибосомы , которая связывает его с одной из предшествующих допущенных тРНК ( транспептидация ). Затем рибосома перемещается к следующему кодону мРНК, чтобы продолжить процесс ( транслокацию ), создавая аминокислотную цепь.
  3. Терминация : когда достигается стоп-кодон, рибосома высвобождает полипептид. Рибосомальный комплекс остается нетронутым и переходит к следующей мРНК, подлежащей трансляции.

У прокариот (бактерий и архей) трансляция происходит в цитозоле, где большие и малые субъединицы рибосомы связываются с мРНК. У эукариот трансляция происходит в цитоплазме или через мембрану эндоплазматического ретикулума в процессе, называемом котрансляционной транслокацией . При котрансляционной транслокации весь комплекс рибосома/мРНК связывается с внешней мембраной шероховатой эндоплазматической сети (ЭР), и новый белок синтезируется и высвобождается в ЭР; вновь созданный полипептид может храниться внутри ЭР для будущего транспорта везикул и секреции вне клетки или немедленно секретироваться.

Многие типы транскрибируемых РНК, такие как тРНК, рибосомальная РНК и малая ядерная РНК, не подвергаются трансляции в белки.

Некоторые антибиотики действуют путем ингибирования трансляции. К ним относятся анизомицин , циклогексимид , хлорамфеникол , тетрациклин , стрептомицин , эритромицин и пуромицин . Прокариотические рибосомы имеют структуру, отличную от структуры эукариотических рибосом, и поэтому антибиотики могут специфически воздействовать на бактериальные инфекции без какого-либо вреда для эукариотических клеток- хозяев .

Основные механизмы

[ редактировать ]
Рибосома, транслирующая белок, секретируемый в эндоплазматический ретикулум (тРНК окрашены в темно-синий цвет).
Третичная структура тРНК ( хвост CCA - желтый, акцепторный стебель - фиолетовый, вариабельная петля - оранжевый, плечо D - красный, плечо антикодона - синее с антикодоном - черным, плечо T - зеленым)

Основной процесс производства белка – это добавление по одной аминокислоте к концу белка. Эту операцию выполняет рибосома . [1] Рибосома состоит из двух субъединиц: малой субъединицы и большой субъединицы. Эти субъединицы собираются вместе перед трансляцией мРНК в белок, обеспечивая место для проведения трансляции и образования полипептида. [2] Выбор типа добавляемой аминокислоты определяется молекулой информационной РНК (мРНК). Каждая добавленная аминокислота соответствует трехнуклеотидной подпоследовательности мРНК. Для каждого такого возможного триплета принимается соответствующая аминокислота. Последовательные аминокислоты, добавленные в цепь, соответствуют последовательным тройкам нуклеотидов в мРНК. Таким образом, последовательность нуклеотидов в матричной цепи мРНК определяет последовательность аминокислот в создаваемой аминокислотной цепи. [3] Добавление аминокислоты происходит на С-конце пептида; таким образом, говорят, что трансляция направлена ​​от амина к карбоксилу. [4]

мРНК переносит генетическую информацию, закодированную в виде рибонуклеотидной последовательности, от хромосом к рибосомам. Рибонуклеотиды «читаются» механизмом трансляции в последовательности триплетов нуклеотидов , называемых кодонами. Каждый из этих триплетов кодирует определенную аминокислоту . [ нужна ссылка ]

Молекулы рибосомы переводят этот код в определенную последовательность аминокислот. Рибосома представляет собой многосубъединичную структуру, содержащую рибосомальную РНК (рРНК) и белки. Это «фабрика», на которой аминокислоты собираются в белки.

Транспортные РНК (тРНК) представляют собой небольшие некодирующие цепи РНК (74–93 нуклеотида), которые транспортируют аминокислоты к рибосоме. Репертуар генов тРНК широко варьируется у разных видов: некоторые бактерии имеют от 20 до 30 генов, тогда как сложные эукариоты могут иметь тысячи. [5] У тРНК есть сайт прикрепления аминокислот и сайт, называемый антикодоном. Антикодон представляет собой триплет РНК, комплементарный триплету мРНК, который кодирует грузовую аминокислоту .

Аминоацил-тРНК-синтетазы ( ферменты ) катализируют связь между конкретными тРНК и аминокислотами , которые необходимы их антикодоновым последовательностям. Продуктом этой реакции является аминоацил-тРНК . Аминокислота соединена своей карбоксильной группой с 3'-ОН тРНК сложноэфирной связью . Когда тРНК имеет связанную с ней аминокислоту, тРНК называют «заряженной». У бактерий эта аминоацил-тРНК переносится в рибосому с помощью EF-Tu , где кодоны мРНК сопоставляются посредством комплементарного спаривания оснований со специфическими антикодонами тРНК. Аминоацил-тРНК-синтетазы, которые неправильно спаривают тРНК с неправильными аминокислотами, могут производить неправильно заряженные аминоацил-тРНК, что может привести к появлению неподходящих аминокислот в соответствующем положении в белке. Этот «неправильный перевод» [6] генетического кода естественным образом встречается на низких уровнях у большинства организмов, но определенные клеточные среды вызывают увеличение разрешающего декодирования мРНК, иногда к выгоде клетки.

Рибосома имеет два сайта связывания тРНК. Это аминоацильный сайт (сокращенно А) и пептидильный сайт/сайт выхода (сокращенно P/E). Что касается мРНК, то три сайта ориентированы от 5’ к 3’-ЭПК, поскольку рибосомы движутся к 3’-концу мРНК. А -сайт связывает входящую тРНК с комплементарным кодоном мРНК. P /E-сайт удерживает тРНК с растущей полипептидной цепью. Когда аминоацил-тРНК первоначально связывается с соответствующим кодоном мРНК, она находится в А-сайте. Затем между аминокислотой тРНК в А-сайте и аминокислотой заряженной тРНК в P/E-сайте образуется пептидная связь. Растущая полипептидная цепь переносится на тРНК в А-сайте. Происходит транслокация, перемещающая тРНК в сайт P/E, теперь уже без аминокислоты; тРНК, которая находилась в сайте A и теперь заряжена полипептидной цепью, перемещается в сайт P/E, и незаряженная тРНК уходит, а другая аминоацил-тРНК входит в сайт A, чтобы повторить процесс. [7]

После добавления новой аминокислоты к цепи и после высвобождения тРНК из рибосомы в цитозоль энергия, обеспечиваемая гидролизом GTP, связанного с транслоказой EF -G бактерий ) и a/eEF -2 эукариот и архей ) перемещает рибосому на один кодон вниз к 3'-концу . Энергия, необходимая для трансляции белков, значительна. Для белка, содержащего n аминокислот, количество высокоэнергетических фосфатных связей, необходимых для его трансляции, составляет 4 n -1. [8] Скорость перевода варьируется; в прокариотических клетках он значительно выше (до 17–21 аминокислотного остатка в секунду), чем в эукариотических клетках (до 6–9 аминокислотных остатков в секунду). [9]

Начало и прекращение трансляции

[ редактировать ]

Инициация включает связывание небольшой субъединицы рибосомы с 5'-концом мРНК с помощью факторов инициации (IF). У бактерий и меньшинства архей инициация синтеза белка включает распознавание богатой пуринами инициирующей последовательности на мРНК, называемой последовательностью Шайна-Дальгарно . Последовательность Шайна-Дальгарно связывается с комплементарной богатой пиримидином последовательностью на 3'-конце части 16S рРНК 30S субъединицы рибосомы. Связывание этих комплементарных последовательностей гарантирует, что 30S рибосомальная субъединица связана с мРНК и выровнена таким образом, что инициирующий кодон помещается в 30S часть P-сайта. Как только мРНК и субъединица 30S правильно связаны, фактор инициации переносит комплекс инициаторная тРНК-аминокислота, f-Met -тРНК, в сайт 30S P. Фаза инициации завершается, когда субъединица 50S присоединяется к субъединице 30S, образуя активную рибосому 70S. [10] Терминация полипептида происходит, когда участок А рибосомы занимает стоп-кодон (UAA, UAG или UGA) на мРНК, создавая первичную структуру белка. тРНК обычно не может распознавать стоп-кодоны или связываться со ими. Вместо этого стоп-кодон индуцирует связывание фактора высвобождения . белка [11] (RF1 и RF2), что вызывает разборку всего комплекса рибосома/мРНК путем гидролиза полипептидной цепи из пептидилтрансферазного центра. [1] рибосомы. [12] Лекарственные препараты или специальные мотивы последовательности мРНК могут изменить структуру рибосом так, что почти родственные тРНК будут связываться со стоп-кодоном вместо факторов высвобождения. В таких случаях «трансляционного чтения» трансляция продолжается до тех пор, пока рибосома не встретит следующий стоп-кодон. [13]

Ошибки в переводе

[ редактировать ]

Несмотря на то, что рибосомы обычно считаются точными и процессивными машинами, процесс трансляции подвержен ошибкам, которые могут привести либо к синтезу ошибочных белков, либо к преждевременному прекращению трансляции либо потому, что тРНК соединяется с неправильным кодоном, либо потому, что тРНК связан с неправильной аминокислотой. [14] По оценкам, частота ошибок при синтезе белков составляет 1 из 10. 5 и 1 из 10 3 неправильно включенные аминокислоты в зависимости от условий эксперимента. [15] Вместо этого, по оценкам, уровень преждевременного отказа от перевода составляет порядка 10. −4 событий на транслируемый кодон. [16] [17]

Регулирование

[ редактировать ]

Процесс трансляции строго регулируется как у эукариотических, так и у прокариотических организмов. Регуляция трансляции может влиять на глобальную скорость синтеза белка, которая тесно связана с метаболическим и пролиферативным состоянием клетки.

Чтобы глубже разобраться в этом сложном процессе, ученые обычно используют метод, известный как профилирование рибосом. [18] Этот метод позволяет исследователям сделать снимок транслатома, показывая, какие части мРНК транслируются рибосомами в белки в данный момент времени. Профилирование рибосом дает ценную информацию о динамике трансляции, раскрывая сложное взаимодействие между последовательностью генов, структурой мРНК и регуляцией трансляции. Например, исследования с использованием этого метода показали, что генетические различия и их последующая экспрессия в виде мРНК также могут влиять на скорость трансляции РНК-специфичным образом. [19]

В развитие этой концепции более поздней разработкой является профилирование рибосом отдельных клеток — метод, который позволяет нам изучать процесс трансляции с разрешением отдельных клеток. [20] Это особенно важно, поскольку клетки, даже одного типа, могут демонстрировать значительную вариабельность синтеза белка. Профилирование одноклеточных рибосом потенциально может пролить свет на гетерогенную природу клеток, что приведет к более глубокому пониманию того, как регуляция трансляции может влиять на поведение клеток, метаболическое состояние и реакцию на различные стимулы или условия.

Клиническое значение

[ редактировать ]

Трансляционный контроль имеет решающее значение для развития и выживания рака . Раковые клетки часто должны регулировать фазу трансляции экспрессии генов, хотя до конца не понятно, почему трансляция нацелена на такие этапы, как транскрипция. Хотя раковые клетки часто имеют генетически измененные факторы трансляции, гораздо чаще раковые клетки изменяют уровни существующих факторов трансляции. [21] Несколько основных онкогенных сигнальных путей, включая пути RAS-MAPK , PI3K/AKT/mTOR , MYC и WNT-β-катенин , в конечном итоге перепрограммируют геном посредством трансляции. [22] Раковые клетки также контролируют трансляцию, чтобы адаптироваться к клеточному стрессу. Во время стресса клетка транслирует мРНК, которые могут смягчить стресс и способствовать выживанию. Примером этого является экспрессия AMPK при различных видах рака; его активация запускает каскад, который в конечном итоге может позволить раку избежать апоптоза (запрограммированной гибели клеток), вызванного лишением питания. Будущие методы лечения рака могут включать в себя нарушение механизма трансляции клетки, чтобы противостоять последующим эффектам рака. [21]

Математическое моделирование перевода

[ редактировать ]
Рисунок М0. Базовая и простейшая модель М0 синтеза белка . Здесь * M – количество мРНК с сайтом инициации трансляции, не занятым сборкой рибосомы, * F – количество мРНК с сайтом инициации трансляции, занятым сборкой рибосомы, * R – количество рибосом, сидящих на мРНК, синтезирующей белки, * P – количество синтезированные белки. [23]
Рисунок М1'. Расширенная модель синтеза белка M1 с явным представлением связывания 40S, 60S и факторов инициации (IF). [23]

Описание процесса транскрипции-трансляции с упоминанием лишь самых основных «элементарных» процессов состоит из:

  1. производство молекул мРНК (включая сплайсинг),
  2. инициация этих молекул с помощью факторов инициации (например, инициация может включать стадию циркуляризации, хотя это не требуется повсеместно),
  3. инициация трансляции, рекрутирование малой рибосомальной субъединицы,
  4. сборка полных рибосом,
  5. элонгация (т.е. перемещение рибосом вдоль мРНК с образованием белка),
  6. прекращение перевода,
  7. деградация молекул мРНК,
  8. деградация белков.

Процесс построения аминокислот для создания белка в процессе трансляции долгое время был предметом различных физических моделей, начиная с первых детальных кинетических моделей, таких как [24] или другие, принимая во внимание стохастические аспекты перевода и используя компьютерное моделирование. За последние четыре десятилетия было разработано и проанализировано множество моделей синтеза белка, основанных на химической кинетике. [25] [26] Помимо химической кинетики, различные формализмы моделирования, такие как полностью асимметричный простой процесс исключения , [26] Вероятностные логические сети , сети Петри и алгебра макс-плюс применялись для моделирования детальной кинетики синтеза белка или некоторых его стадий. Разработана базовая модель синтеза белка, учитывающая все восемь «элементарных» процессов. [23] следуя парадигме , согласно которой «полезные модели просты и расширяемы». [27] Простейшая модель M0 представлена ​​кинетическим механизмом реакции (рис. M0). Было обобщено, что оно включает связывание 40S, 60S и факторов инициации (IF) (рис. M1'). Оно было расширено и теперь включает влияние микроРНК на синтез белка. [28] Большинство моделей в этой иерархии могут быть решены аналитически. Эти решения были использованы для извлечения «кинетических сигнатур» различных конкретных механизмов регуляции синтеза.

Генетический код

[ редактировать ]

Также возможен перевод вручную (для коротких последовательностей) или с помощью компьютера (после предварительного программирования, см. раздел ниже); это позволяет биологам и химикам нарисовать на бумаге химическую структуру кодируемого белка.

Сначала преобразуйте каждое основание ДНК-матрицы в его РНК-комплемент (обратите внимание, что комплементом A теперь является U), как показано ниже. Обратите внимание, что матричная цепь ДНК — это та, против которой полимеризуется РНК; другая цепь ДНК будет такой же, как РНК, но с тимином вместо урацила.

DNA -> RNA
 A  ->  U
 T  ->  A
 C  ->  G
 G  ->  C
 A=T-> A=U

Затем разделите РНК на триплеты (группы из трех оснований). Обратите внимание, что существует 3 «окна» перевода, или рамки чтения , в зависимости от того, где вы начинаете читать код. Наконец, используйте таблицу « Генетический код» , чтобы перевести приведенное выше в структурную формулу , используемую в химии.

Это даст первичную структуру белка. Однако белки имеют тенденцию сворачиваться , частично в зависимости от гидрофильных и гидрофобных сегментов цепи. О вторичной структуре часто еще можно догадаться, но правильную третичную структуру зачастую очень трудно определить.

В то время как другие аспекты, такие как трехмерная структура, называемая третичной структурой белка, могут быть предсказаны только с использованием сложных алгоритмов , аминокислотную последовательность, называемую первичной структурой, можно определить исключительно на основе последовательности нуклеиновой кислоты с помощью таблицы трансляции .

Этот подход может не дать правильный аминокислотный состав белка, в частности, если в белок включены нетрадиционные аминокислоты , такие как селеноцистеин , который кодируется обычным стоп-кодоном в сочетании с расположенной ниже шпилькой (SElenoCysteine ​​Insertion Sequence или СЕКИС).

Существует множество компьютерных программ, способных транслировать последовательность ДНК/РНК в последовательность белка. Обычно это выполняется с использованием стандартного генетического кода, однако немногие программы могут обрабатывать все «особые» случаи, такие как использование альтернативных инициирующих кодонов, которые являются биологически значимыми. Например, редкий альтернативный стартовый кодон CTG кодирует метионин , когда он используется в качестве стартового кодона, и лейцин во всех других положениях.

Пример: таблица сокращенного перевода стандартного генетического кода (с веб-страницы таксономии NCBI). [29]

 AAs    = FFLLSSSSYY**CC*WLLLLPPPPHHQQRRRRIIIMTTTTNNKKSSRRVVVVAAAADDEEGGGG
 Starts = ---M---------------M---------------M----------------------------
 Base1  = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGG
 Base2  = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGG
 Base3  = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG

В строке «Начала» указаны три стартовых кодона: UUG, CUG и очень распространенный AUG. Он также указывает на первый аминокислотный остаток, если интерпретировать его как начало: в данном случае это полностью метионин.

Таблицы перевода

[ редактировать ]

Даже при работе с обычными эукариотическими последовательностями, такими как геном дрожжей , часто желательно иметь возможность использовать альтернативные таблицы перевода, а именно для трансляции митохондриальных генов. определяет следующие таблицы перевода В настоящее время группа таксономии NCBI для перевода последовательностей в GenBank : [29]

  1. Стандартный код
  2. позвоночных Митохондриальный код
  3. дрожжей Митохондриальный код
  4. Митохондриальный код плесени , простейших и кишечнополостных, а также код микоплазмы/спироплазмы.
  5. Митохондриальный код беспозвоночных
  6. Ядерный код инфузорий , дазикладовых и гексамитов
  7. Код кинетопласта
  8. Митохондриальный код иглокожих и плоских червей
  9. Эуплотидный ядерный код
  10. Бактериальный , архейный и растительный пластидный код
  11. Альтернативный ядерный код дрожжей
  12. Асцидианный митохондриальный код
  13. Альтернативный митохондриальный код плоских червей
  14. Блефаризмы Ядерный код
  15. хлорофицеев Митохондриальный код
  16. трематоды Митохондриальный код
  17. Scenedesmus Косой митохондриальный код
  18. Thraustochytrium Митохондриальный код
  19. птеробранхии Митохондриальный код
  20. Кандидатный раздел SR1 и код gracilibacteria
  21. Pachysolen tannophilus Ядерный код
  22. Кариореликтный ядерный код
  23. кондилостомы Ядерный код
  24. мезодиния код Ядерный
  25. Перитриховый ядерный код
  26. бластокритидий код Ядерный
  27. Cephalodiscidae Митохондриальный код

См. также

[ редактировать ]
  1. Перейти обратно: Перейти обратно: а б Тирумалай М.Р., Ривас М., Тран К., Фокс Дж.Э. (ноябрь 2021 г.). «Центр пептидилтрансферазы: окно в прошлое» . Микробиол Мол Биол Rev. 85 (4): e0010421. дои : 10.1128/MMBR.00104-21 . ПМЦ   8579967 . ПМИД   34756086 .
  2. ^ Брукер Р.Дж., Видмайер Э.П., Грэм Л.Е., Стайлинг П.Д. (2014). Биология (Третье международное студенческое изд.). Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: McGraw Hill Education. п. 249. ИСБН  978-981-4581-85-1 .
  3. ^ Нил С. (1996). Биология (Четвертое изд.). Издательская компания Бенджамина/Каммингса. стр. 309–310. ISBN  0-8053-1940-9 .
  4. ^ Страйер Л. (2002). Биохимия (Пятое изд.). WH Фриман и компания . п. 826. ИСБН  0-7167-4684-0 .
  5. ^ САНТОС, Фенисия Брито; Дель-Бем, Луис-Эдуардо (2023). «Эволюция числа копий и репертуара тРНК в клеточной жизни» . Гены . 14 (1): 27. doi : 10.3390/genes14010027 . ISSN   2073-4425 . ПМЦ   9858662 . ПМИД   36672768 .
  6. ^ Могал А., Молер К., Ибба М. (ноябрь 2014 г.). «Неправильный перевод генетического кода» . Письма ФЭБС . 588 (23): 4305–10. дои : 10.1016/j.febslet.2014.08.035 . ПМК   4254111 . ПМИД   25220850 .
  7. ^ Гриффитс А (2008). «9». Введение в генетический анализ (9-е изд.). Нью-Йорк: WH Freeman and Company. стр. 335–339. ISBN  978-0-7167-6887-6 .
  8. ^ «Вычислительный анализ геномных последовательностей с использованием машинного обучения» . ученый.googleusercontent.com . Проверено 12 января 2022 г.
  9. ^ Росс Дж. Ф., Орловски М. (февраль 1982 г.). «Регулировка функции рибосом в зависимости от скорости роста в клетках гриба Mucor Racemosus, выращенных с помощью хемостата» . Журнал бактериологии . 149 (2): 650–3. дои : 10.1128/JB.149.2.650-653.1982 . ПМК   216554 . ПМИД   6799491 .
  10. ^ Накамото Т. (февраль 2011 г.). «Механизмы инициации синтеза белка: в рамке считывания связывание рибосом с мРНК». Отчеты по молекулярной биологии . 38 (2): 847–55. дои : 10.1007/s11033-010-0176-1 . ПМИД   20467902 . S2CID   22038744 .
  11. ^ Баггетт Н.Э., Чжан Ю, Гросс, Калифорния (март 2017 г.). Ибба М (ред.). «Глобальный анализ терминации трансляции в E. coli» . ПЛОС Генетика . 13 (3): e1006676. дои : 10.1371/journal.pgen.1006676 . ПМЦ   5373646 . ПМИД   28301469 .
  12. ^ Мора Л., Завьялов А., Эренберг М., Бэкингем Р.Х. (декабрь 2003 г.). «Распознавание стоп-кодонов и взаимодействие с фактором высвобождения пептида RF3 усеченных и химерных RF1 и RF2 из Escherichia coli» . Молекулярная микробиология . 50 (5): 1467–76. дои : 10.1046/j.1365-2958.2003.03799.x . ПМИД   14651631 .
  13. ^ Шурен Ф., Томс С. (август 2016 г.). «Функционально-трансляционное прочтение: взгляд на системную биологию» . ПЛОС Генетика . 12 (8): e1006196. doi : 10.1371/JOURNAL.PGEN.1006196 . ПМЦ   4973966 . ПМИД   27490485 .
  14. ^ Оу Икс, Цао Дж, Ченг А, депутат Пеппеленбош, Пан Ц (март 2019 г.). «Ошибки трансляционного декодирования: колебание тРНК или неправильное включение?» . ПЛОС Генетика . 15 (3): 2979–2986. дои : 10.1371/journal.pgen.1008017 . ПМЦ   3158919 . ПМИД   21930591 .
  15. ^ Вольгемут И., Пол С., Миттельштет Дж., Коневега А.Л., Роднина М.В. (октябрь 2011 г.). «Эволюционная оптимизация скорости и точности декодирования на рибосоме» . Философские труды Лондонского королевского общества. Серия Б, Биологические науки . 366 (1580): 2979–86. дои : 10.1098/rstb.2011.0138 . ПМК   6438450 . ПМИД   30921315 .
  16. ^ Син С., Кьяруджи Д., Валлериани А. (апрель 2016 г.). «Количественная оценка отпадания рибосом в кишечной палочке» . Исследования нуклеиновых кислот . 44 (6): 2528–37. дои : 10.1093/nar/gkw137 . ПМЦ   4824120 . ПМИД   26935582 .
  17. ^ Авад С., Валериани А., Кьяруги Д. (апрель 2024 г.). «Оценка скорости отпадания рибосом у S. cerevisiae на основе данных выявила корреляцию с длиной генов» . НАР Геномика и биоинформатика . 6 (2): lqae036. дои : 10.1093/nargab/lqae036 . ПМЦ   11025885 . ПМИД   38638702 .
  18. ^ Инголия NT, Гаеммагами С., Ньюман-младший, Вайсман Дж.С. (апрель 2009 г.). «Полногеномный анализ трансляции in vivo с разрешением нуклеотидов с использованием профилирования рибосом» . Наука . 324 (5924): 218–23. Бибкод : 2009Sci...324..218I . дои : 10.1126/science.1168978 . ПМЦ   2746483 . ПМИД   19213877 .
  19. ^ Сеник С., Ченик Е.С., Бён Г.В., Груберт Ф., Кандилль С.И., Спейсек Д. и др. (ноябрь 2015 г.). «Интегративный анализ уровней РНК, трансляции и белка выявляет явные регуляторные различия у разных людей» . Геномные исследования . 25 (11): 1610–21. дои : 10.1101/гр.193342.115 . ПМЦ   4617958 . ПМИД   26297486 .
  20. ^ Озадам Х, Тонн Т, Хан СМ, Сегура А, Хоскинс И, Рао С; и др. (2023). «Количественная оценка занятости рибосом в отдельных клетках на ранних стадиях развития мышей» . Природа . 618 (7967): 1057–1064. Бибкод : 2023Natur.618.1057O . дои : 10.1038/s41586-023-06228-9 . ПМЦ   10307641 . ПМИД   37344592 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  21. Перейти обратно: Перейти обратно: а б Сюй Ю, Руджеро Д (март 2020 г.). «Роль контроля трансляции в онкогенезе и его терапевтические последствия» . Ежегодный обзор биологии рака . 4 (1): 437–457. doi : 10.1146/annurev-cancerbio-030419-033420 .
  22. ^ Труитт М.Л., Руджеро Д. (апрель 2016 г.). «Новые рубежи в трансляционном контроле ракового генома» . Обзоры природы. Рак . 16 (5): 288–304. дои : 10.1038/nrc.2016.27 . ПМК   5491099 . ПМИД   27112207 .
  23. Перейти обратно: Перейти обратно: а б с Горбань А.Н., Харель-Беллан А., Морозова Н., Зиновьев А. (июль 2019 г.). «Базовая, простая и расширяемая кинетическая модель синтеза белка» . Математические биологические науки и инженерия . 16 (6): 6602–6622. arXiv : 1204.5941 . дои : 10.3934/mbe.2019329 . ПМИД   31698578 .
  24. ^ Макдональд CT, Гиббс Дж. Х., Пипкин AC (1968). «Кинетика биополимеризации на матрицах нуклеиновых кислот». Биополимеры . 6 (1): 1–5. дои : 10.1002/bip.1968.360060102 . ПМИД   5641411 . S2CID   27559249 .
  25. ^ Генрих Р., Рапопорт Т.А. (сентябрь 1980 г.). «Математическое моделирование трансляции мРНК в эукариотах; стационарные, нестационарные процессы и применение к ретикулоцитам». Журнал теоретической биологии . 86 (2): 279–313. Бибкод : 1980JThBi..86..279H . дои : 10.1016/0022-5193(80)90008-9 . ПМИД   7442295 .
  26. Перейти обратно: Перейти обратно: а б Скьёндал-Бар Н., Моррис Д.Р. (январь 2007 г.). «Динамическая модель процесса синтеза белка в эукариотических клетках». Бюллетень математической биологии . 69 (1): 361–93. дои : 10.1007/s11538-006-9128-2 . ПМИД   17031456 . S2CID   83701439 .
  27. ^ Койт К.З., Табуто Х., Гаффни Э.А., Фостер К.Р., Дарем В.М. (апрель 2017 г.). «Ответ Бавейю и Дарно: полезные модели просты и расширяемы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 114 (14): Е2804–Е2805. Бибкод : 2017PNAS..114E2804C . дои : 10.1073/pnas.1702303114 . ПМЦ   5389313 . ПМИД   28341710 .
  28. ^ Морозова Н., Зиновьев А., Нонне Н., Притчард Л.Л., Горбан А.Н., Харель-Беллан А. (сентябрь 2012 г.). «Кинетические признаки действия микроРНК» . РНК . 18 (9): 1635–55. дои : 10.1261/rna.032284.112 . ПМЦ   3425779 . ПМИД   22850425 .
  29. Перейти обратно: Перейти обратно: а б Эльжановский, Анджей; Остелл, Джим (январь 2019 г.). «Генетические коды» . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 31 мая 2022 г.

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 074a674775141c9e86b9b9ece5499bf3__1721398260
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/07/f3/074a674775141c9e86b9b9ece5499bf3.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Translation (biology) - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)