Митохондриальный код позвоночных

Митохондриальный код позвоночных (таблица перевода 2 ) — это генетический код , обнаруженный в митохондриях всех позвоночных .

Эволюция

Считалось, что AGA и AGG стали митохондриальными стоп-кодонами на ранних этапах эволюции позвоночных. ^{[ 1 ]} Однако теперь показано, по крайней мере, у людей, что последовательности AGA и AGG не распознаются как терминирующие кодоны . -1 Сдвиг рамки миторибосомы происходит в кодонах AGA и AGG, которые, как предполагается, завершают открытые рамки считывания CO1 и ND6 (ORF), и, следовательно, обе ORF оканчиваются на стандартном кодоне UAG. ^{[ 2 ]}

Неполные стоп-кодоны

Митохондриальные гены у некоторых позвоночных (включая человека) имеют неполные стоп-кодоны, оканчивающиеся на U или UA, которые при последующем полиаденилировании становятся полными терминирующими кодонами (UAA) . ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Таблица перевода

аминокислот Биохимические свойства	неполярный	полярный	базовый	кислый		Терминация: стоп-кодон

Митохондриальный генетический код
1-й база	2-я база								3-й база
1-й база	В		С		А		Г		3-й база
В	Ууу	(Phe/F) Фенилаланин	КОНЧИК	(Сер/С) Серин	УХ ТЫ	(Тир/Y) Тирозин	САМЫЙ	(Цис/Ц) Цистеин	В
	УУК	(Phe/F) Фенилаланин	УКК		ОАК	(Тир/Y) Тирозин	Пользовательский контент	(Цис/Ц) Цистеин	С
	УАА	(Лей/л) Лейцин	УЦА		УАА	Останавливаться	УГА	(Trp/W) Триптофан	А
	УУГ		УКГ		УАГ	Останавливаться	Угги	(Trp/W) Триптофан	Г
С	КУУ		CCU	(Про/П) Пролин	КАУ	(His/H) Гистидин	ЕГДС	(Arg/R) Аргинин	В
	CUC		CCC		САС	(His/H) Гистидин	КГК		С
	ВОЗДУХ		Приблизительно		САА	(Gln/Q) Глутамин	CGA		А
	КУГ		CCG		ЦАГ	(Gln/Q) Глутамин	КГГ		Г
А	Австралия	(Ile/I) Изолейцин	АКУ	(Thr/T) Треонин	ААУ	(Asn/N) Аспарагин	АГУ	(Сер/С) Серин	В
	АУК	(Ile/I) Изолейцин	АСС		ААС	(Asn/N) Аспарагин	АРУ	(Сер/С) Серин	С
	НЕ	(Met/M) Метионин	АСА		ААА	(Свет/К) Лизин	НО	Останавливаться	А
	АВГ ^[А]	(Met/M) Метионин	АКГ		ААГ	(Свет/К) Лизин	АГГ	Останавливаться	Г
Г	ГУУ	(Val/V) Valine	ГКУ	(Ала/А) Оранжевый	НОЧЬ	(Asp/D) Аспарагиновая кислота	ГГУ	(Gly/G) Глицин	В
	GUC		GCC		ПКК	(Asp/D) Аспарагиновая кислота	ГГК		С
	ПЕЩЕРА		ГКА		ИДТИ	(Glu/E) Глутаминовая кислота	ГГА		А
	ГУГ		ГКГ		кляп	(Glu/E) Глутаминовая кислота	ГГГ		Г

^А Кодон AUG одновременно кодирует метионин и служит сайтом инициации: первый AUG в кодирующей области мРНК — это место, где начинается трансляция в белок. ^{[ 7 ]}

Отличия от стандартного кода


Кодоны ДНК	Кодоны РНК	Этот код (2)	Стандартный код (1)
`AGA`	`AGA`	`STOP = Ter` `(*)`	`Arg` `(R)`
`AGG`	`AGG`	`STOP = Ter` `(*)`	`Arg` `(R)`
`ATA`	`AUA`	`Met` `(M)`	`Ile` `(I)`
`TGA`	`UGA`	`Trp` `(W)`	`STOP = Ter` `(*)`

Альтернативные кодоны инициации

Лес : АУА
Гомо : НЕТ, НЕТ
Муз : НЕТ, НЕТ, НЕТ.
Котурникс , Галл : также ГУГ ^{[ 8 ]}

См. также

Список генетических кодов

Ссылки

Эта статья содержит общедоступный текст со страницы NCBI , составленный Анджеем Эльжановским и Джимом Остеллом. ^{[ 9 ]}

^ С. Осава, Т. Охама, Т. Х. Джукс и К. Ватанабэ (сентябрь 1989 г.). «Эволюция митохондриального генетического кода. I. Происхождение серина AGR и стоп-кодонов в митохондриях многоклеточных животных». Джей Мол Эвол . 29 (3): 202–7. Бибкод : 1989JMolE..29..202O . дои : 10.1007/bf02100203 . ПМИД 2506356 . S2CID 21051869 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
^ Р. Дж. Темперли; Р Рихтер; С. Деннерляйн; Р. Н. Лайтаулерс; З. М. Хшановска-Лайтваулерс (январь 2010 г.). «Голодные кодоны способствуют сдвигу рамки митохондриальных рибосом человека». Наука . 327 (5963): 301. Бибкод : 2010Sci...327..301T . дои : 10.1126/science.1180674 . ПМИД 20075246 . S2CID 206522983 .
^ Темперли, Р.Дж.; Видро, М; Лайтаулерс, Р.Н.; Хшановска-Лайтаулерс, З.М. (2010). «Человеческие митохондриальные мРНК — представители всех семейств, похожие, но разные» . Биохимия и биофизика Acta (BBA) - Биоэнергетика 1797 (6–7): 1081–5. дои : 10.1016/j.bbabio.2010.02.036 . ПМК 3003153 . ПМИД 20211597 .
^ WR Hou, Y. Chen, X. Wu, JC Hu, ZS Peng, J. Yang, ZX Tang, CQ Zhou, YM Li, SK Yang, YJ Du, LL Kong, ZL Ren, HY Zhang и SS Shuai (декабрь 2006 г.) ). «Полная последовательность митохондриального генома азиатского черного медведя сычуаньского подвида (Ursus thibetanus mupinensis)» . Int J Biol Sci . 3 (2): 85–90. дои : 10.7150/ijbs.3.85 . ПМЦ 1752227 . ПМИД 17205108 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
^ О, диджей; Ким, JY; Ли, Дж.А.; Юн, WJ; Парк, Ю.Ю.; Юнг, Ю.Х. (2007). «Полный митохондриальный геном рыбы-кролика Siganus fuscescens (Perciformes, Siganidae)». Последовательность ДНК . 18 (4): 295–301. дои : 10.1080/10425170701248525 . ПМИД 17541835 . S2CID 38458668 .
^ Ки, Дж.С.; Хван, Д.С.; Парк, Ти Джей; Хан, Ш.; Ли, Дж. С. (2009). «Сравнительный анализ полного митохондриального генома евразийской выдры Lutra lutra (Carnivora; Mustelidae)». Отчеты по молекулярной биологии . 37 (4): 1943–55. дои : 10.1007/s11033-009-9641-0 . ПМИД 19757186 . S2CID 24233602 .
^ Накамото Т. (март 2009 г.). «Эволюция и универсальность механизма инициации синтеза белка». Джин . 432 (1–2): 1–6. дои : 10.1016/j.gene.2008.11.001 . ПМИД 19056476 .
^ П. Дежарден и Р. Мораис (февраль 1991 г.). «Нуклеотидная последовательность и эволюция кодирующих и некодирующих областей митохондриального генома перепела». Джей Мол Эвол . 32 (2): 153–161. Бибкод : 1991JMolE..32..153D . дои : 10.1007/bf02515387 . ПМИД 1706782 . S2CID 1974138 .
^ Генетические коды

[OOJ&W-1] С. Осава, Т. Охама, Т. Х. Джукс и К. Ватанабэ (сентябрь 1989 г.). «Эволюция митохондриального генетического кода. I. Происхождение серина AGR и стоп-кодонов в митохондриях многоклеточных животных». Джей Мол Эвол . 29 (3): 202–7. Бибкод : 1989JMolE..29..202O . дои : 10.1007/bf02100203 . ПМИД 2506356 . S2CID 21051869 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )

[Temperly-2] Р. Дж. Темперли; Р Рихтер; С. Деннерляйн; Р. Н. Лайтаулерс; З. М. Хшановска-Лайтваулерс (январь 2010 г.). «Голодные кодоны способствуют сдвигу рамки митохондриальных рибосом человека». Наука . 327 (5963): 301. Бибкод : 2010Sci...327..301T . дои : 10.1126/science.1180674 . ПМИД 20075246 . S2CID 206522983 .

[Temperly2-3] Темперли, Р.Дж.; Видро, М; Лайтаулерс, Р.Н.; Хшановска-Лайтаулерс, З.М. (2010). «Человеческие митохондриальные мРНК — представители всех семейств, похожие, но разные» . Биохимия и биофизика Acta (BBA) - Биоэнергетика 1797 (6–7): 1081–5. дои : 10.1016/j.bbabio.2010.02.036 . ПМК 3003153 . ПМИД 20211597 .

[Hou-4] WR Hou, Y. Chen, X. Wu, JC Hu, ZS Peng, J. Yang, ZX Tang, CQ Zhou, YM Li, SK Yang, YJ Du, LL Kong, ZL Ren, HY Zhang и SS Shuai (декабрь 2006 г.) ). «Полная последовательность митохондриального генома азиатского черного медведя сычуаньского подвида (Ursus thibetanus mupinensis)» . Int J Biol Sci . 3 (2): 85–90. дои : 10.7150/ijbs.3.85 . ПМЦ 1752227 . ПМИД 17205108 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )

[Oh-5] О, диджей; Ким, JY; Ли, Дж.А.; Юн, WJ; Парк, Ю.Ю.; Юнг, Ю.Х. (2007). «Полный митохондриальный геном рыбы-кролика Siganus fuscescens (Perciformes, Siganidae)». Последовательность ДНК . 18 (4): 295–301. дои : 10.1080/10425170701248525 . ПМИД 17541835 . S2CID 38458668 .

[Ki-6] Ки, Дж.С.; Хван, Д.С.; Парк, Ти Джей; Хан, Ш.; Ли, Дж. С. (2009). «Сравнительный анализ полного митохондриального генома евразийской выдры Lutra lutra (Carnivora; Mustelidae)». Отчеты по молекулярной биологии . 37 (4): 1943–55. дои : 10.1007/s11033-009-9641-0 . ПМИД 19757186 . S2CID 24233602 .

[pmid19056476-7] Накамото Т. (март 2009 г.). «Эволюция и универсальность механизма инициации синтеза белка». Джин . 432 (1–2): 1–6. дои : 10.1016/j.gene.2008.11.001 . ПМИД 19056476 .

[D&M-8] П. Дежарден и Р. Мораис (февраль 1991 г.). «Нуклеотидная последовательность и эволюция кодирующих и некодирующих областей митохондриального генома перепела». Джей Мол Эвол . 32 (2): 153–161. Бибкод : 1991JMolE..32..153D . дои : 10.1007/bf02515387 . ПМИД 1706782 . S2CID 1974138 .

[Elzanowski-9] Генетические коды

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]