Митохондриальный код Cephalodiscidae
( Митохондриальный код Cephalodiscidae таблица перевода 33 ) — генетический код , используемый митохондриальным геномом Cephalodiscidae ( Pterobranchia ). Pterobranchia — одна из двух групп Hemichordata , которые вместе с Echinodermata и Chordata образуют основные клады вторичноротых .
Код 33 очень похож на митохондриальный код 24 Pterobranchia, которые также принадлежат Hemichordata, за исключением того, что он использует UAA для тирозина, а не в качестве стоп-кодона. [ 1 ]
Этот код, как и многие другие митохондриальные коды, переназначает UGA STOP на триптофан , а AGG и AGA на аминокислоту, отличную от аргинина . Однако отнесение AGG к лизину в митогеномах крыложаберных костей не обнаружено где-либо еще в митохондриях вторичноротых, но встречается у некоторых таксонов Arthropoda . [ 2 ]
Код
[ редактировать ]AAs = FFLLSSSSYYY*CCWWLLLLPPPPHHQQRRRRIIIMTTTTNNKKSSSKVVVVAAAADDEEGGGGStarts = ---M-------*-------M---------------M---------------M------------Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGGBase2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGBase3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG
Основания: аденин (А), цитозин (С), гуанин (G) и тимин (Т) или урацил (U).
Аминокислоты: аланин (Ala, A), аргинин (Arg, R), аспарагин (Asn, N), аспарагиновая кислота (Asp, D), цистеин (Cys, C), глутаминовая кислота (Glu, E), глутамин (Gln). , Q), глицин (Gly, G), гистидин (His, H), изолейцин (Ile, I), лейцин (Leu, L), лизин (Lys, K), метионин (Met, M), фенилаланин (Phe, F), пролин (Pro, P), серин (Ser, S), треонин (Thr, T), триптофан (Trp, W), тирозин ( Тир, Ю), Валин (Вал, В).
Отличия от стандартного кода
[ редактировать ]| Кодоны ДНК | Кодоны РНК | Этот код (33) | Стандартный код (1) | |
|---|---|---|---|---|
TAA |
UAA |
Tyr (Y) |
STOP = Ter (*)
| |
TGA |
UGA |
Trp (W) |
STOP = Ter (*)
| |
AGA |
AGA |
Ser (S) |
Arg (R)
| |
AGG |
AGG |
Lys (K) |
Arg (R)
|
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе . [ 3 ]
- ^ Ли, Юаньнин; Кокот, Кевин М.; Тассиа, Майкл Г.; Кэннон, Джоанна Т.; Бернт, Матиас; Халанич, Кеннет М. (01 января 2019 г.). «Митогеномика раскрывает новый генетический код полухордовых» . Геномная биология и эволюция . 11 (1): 29–40. дои : 10.1093/gbe/evy254 . ПМК 6319601 . ПМИД 30476024 .
- ^ Персеке М., Хетманк Дж., Бернт М., Стадлер П.Ф., Шлегель М., Бернхард Д. (май 2011 г.). «Загадочный митохондриальный геном Rhabdopleura Compacta (Pterobranchia) открывает возможность выбора эффективной системы тРНК и поддерживает монофилию Ambulacraria» . БМК Эвол Биол . 11 (134): 134. дои : 10.1186/1471-2148-11-134 . ПМК 3121625 . ПМИД 21599892 .
- ^ Эльжановский А., Остелл Дж., Лейпе Д., Суссов В. «Генетические коды» . Браузер таксономии . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), Национальная медицинская библиотека США . Проверено 7 января 2019 г.