Митохондриальный код птеробранхии
( Митохондриальный код птеробранхий таблица перевода 24 ) — генетический код, используемый митохондриальным геномом Rhabdopleura Compacta ( Pterobranchia ). Pterobranchia — одна из двух групп Hemichordata , которые вместе с Echinodermata и Chordata образуют три основные линии вторичноротых . AUA переводится как изолейцин у Rhabdopleura, как и у Echinodermata и Enteropneusta, тогда как AUA кодирует метионин у Chordata. Отнесение AGG к лизину не обнаружено где-либо еще в митохондриях вторичноротых, но происходит у некоторых таксонов Arthropoda . [ 1 ] Этот код, как и многие другие митохондриальные коды, переназначает UGA STOP на триптофан , а AGG и AGA на аминокислоту, отличную от аргинина . Инициаторными кодонами Rhabdopleura Compacta являются ATG и GTG. [ 1 ]
Код 24 очень похож на митохондриальный код 33 крылобранхий. [ 2 ]
Код
[ редактировать ]AAs = FFLLSSSSYY**CCWWLLLLPPPPHHQQRRRRIIIMTTTTNNKKSSSKVVVVAAAADDEEGGGG
Starts = ---M---------------M---------------M---------------M------------
Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGG
Base2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGG
Base3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG
Основания: аденин (А), цитозин (С), гуанин (G) и тимин (Т) или урацил (U).
Аминокислоты: аланин (Ala, A), аргинин (Arg, R), аспарагин (Asn, N), аспарагиновая кислота (Asp, D), цистеин (Cys, C), глутаминовая кислота (Glu, E), глутамин (Gln). , Q), глицин (Gly, G), гистидин (His, H), изолейцин (Ile, I), лейцин (Leu, L), лизин (Lys, K), метионин (Met, M), фенилаланин (Phe, F), пролин (Pro, P), серин (Ser, S), треонин (Thr, T), триптофан (Trp, W), тирозин (Tyr, Y), валин (Val, V)
Отличия от стандартного кода
[ редактировать ]Кодоны ДНК | Кодоны РНК | Этот код (24) | Стандартный код (1) | |
---|---|---|---|---|
AGA |
AGA |
Ser (S) |
Arg (R)
| |
AGG |
AGG |
Lys (K) |
Arg (R)
| |
TGA |
UGA |
Trp (W) |
STOP = Ter (*)
|
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе . [ 3 ]
- ^ Jump up to: а б Персеке, Марлин; Гетманк, Йорг; Бернт, Матиас; Стадлер, Питер Ф; Шлегель, Мартин; Бернхард, Детлеф (20 мая 2011 г.). «Загадочный митохондриальный геном Rhabdopleura Compacta (Pterobranchia) открывает возможность выбора эффективной системы тРНК и поддерживает монофилию Ambulacraria» . Эволюционная биология BMC . 11 (1): 134. дои : 10.1186/1471-2148-11-134 . ISSN 1471-2148 . ПМК 3121625 . ПМИД 21599892 .
- ^ Ли, Юаньнин; Кокот, Кевин М.; Тассиа, Майкл Г.; Кэннон, Джоанна Т.; Бернт, Матиас; Халанич, Кеннет М. (01 января 2019 г.). «Митогеномика раскрывает новый генетический код полухордовых» . Геномная биология и эволюция . 11 (1): 29–40. дои : 10.1093/gbe/evy254 . ПМК 6319601 . ПМИД 30476024 .
- ^ Эльжановский А., Остелл Дж., Лейпе Д., Суссов В. «Генетические коды» . Браузер таксономии . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), Национальная медицинская библиотека США . Проверено 28 июня 2014 г.