кондилостомы Ядерный код

кондилостомы ядерным Ядерный код (таблица перевода 28) представляет собой генетический код используемый геномом гетеротрих , инфузории Condylostoma magnum . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} Этот код вместе с таблицами перевода 27 и 31 примечателен тем, что каждый из 64 возможных кодонов может быть смысловым кодоном. Экспериментальные данные свидетельствуют о том, что терминация трансляции зависит от контекста, в частности от близости к поли(А)-хвосту. Рядом с таким хвостом PABP может помочь терминировать белок, рекрутируя eRF1 и eRF3, чтобы предотвратить связывание родственной тРНК. ^{[ 3 ]}

Код (28)

AAs = FFLLSSSSYYQQCCWWLLLAPPPPHHQQRRRRIIIMTTTTNNKKSSRRVVVVAAAADDEEGGGG

Starts = ----------**--*--------------------M----------------------------

Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGG

Base2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGG

Base3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG

Основания: аденин (А), цитозин (С), гуанин (G) и тимин (Т) или урацил (U).

Аминокислоты: аланин (Ala, A), аргинин (Arg, R), аспарагин (Asn, N), аспарагиновая кислота (Asp, D), цистеин (Cys, C), глутаминовая кислота (Glu, E), глутамин (Gln). , Q), глицин (Gly, G), гистидин (His, H), изолейцин (Ile, I), лейцин (Leu, L), лизин (Lys, K), метионин (Met, M), фенилаланин (Phe, F), пролин (Pro, P), серин (Ser, S), треонин (Thr, T), триптофан (Trp, W), тирозин ( Тир, Y) и Валин (Вал, V).

Отличия от стандартного кода

Кодоны ДНК	Кодоны РНК	Этот код (28)			Стандартный код (1)
СЕГОДНЯ	УАА	Иметь (*)	или	Глн (клавиша Q)	Иметь (*)
`TAG`	`UAG`	`Ter` `(*)`	или	`Gln` `(Q)`	`Ter` `(*)`
`TGA`	`UGA`	`Ter` `(*)`	или	`Trp` `(W)`	`Ter` `(*)`

См. также

Список всех генетических кодов : таблицы перевода с 1 по 16 и с 21 по 31.
База данных генетических кодов .

Ссылки

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе . ^{[ 2 ]}

^ Хифи, Стивен М.; Мариотти, Марко; Гладышев Вадим Н.; Аткинс, Джон Ф.; Баранов, Павел В. (01 ноября 2016 г.). «Новые варианты генетического кода инфузорий, включая переназначение всех трех стоп-кодонов на смысловые кодоны в Condylostoma magnum » . Молекулярная биология и эволюция . 33 (11): 2885–2889. дои : 10.1093/molbev/msw166 . ISSN 0737-4038 . ПМК 5062323 . ПМИД 27501944 .
^ Jump up to: ^а ^б Эльжановский А., Остелл Дж., Лейпе Д., Суссов В. «Генетические коды» . Браузер таксономии . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), Национальная медицинская библиотека США . Проверено 18 ноября 2016 г.
^ Сварт, Эстьен Карл; Серра, Валентина; Петрони, Джулио; Новацкий, Мариуш (2016). «Генетические коды без выделенного стоп-кодона: контекстно-зависимое завершение трансляции» . Клетка . 166 (3): 691–702. дои : 10.1016/j.cell.2016.06.020 . ПМЦ 4967479 . ПМИД 27426948 .

[1] Хифи, Стивен М.; Мариотти, Марко; Гладышев Вадим Н.; Аткинс, Джон Ф.; Баранов, Павел В. (01 ноября 2016 г.). «Новые варианты генетического кода инфузорий, включая переназначение всех трех стоп-кодонов на смысловые кодоны в Condylostoma magnum » . Молекулярная биология и эволюция . 33 (11): 2885–2889. дои : 10.1093/molbev/msw166 . ISSN 0737-4038 . ПМК 5062323 . ПМИД 27501944 .

[NCBI-2] Jump up to: ^а ^б Эльжановский А., Остелл Дж., Лейпе Д., Суссов В. «Генетические коды» . Браузер таксономии . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), Национальная медицинская библиотека США . Проверено 18 ноября 2016 г.

[3] Сварт, Эстьен Карл; Серра, Валентина; Петрони, Джулио; Новацкий, Мариуш (2016). «Генетические коды без выделенного стоп-кодона: контекстно-зависимое завершение трансляции» . Клетка . 166 (3): 691–702. дои : 10.1016/j.cell.2016.06.020 . ПМЦ 4967479 . ПМИД 27426948 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]