Асцидианский митохондриальный код
Митохондриальный код асцидий (таблица перевода 13 ) — генетический код , обнаруженный в митохондриях асцидий .
Код
[ редактировать ]AAs = FFLLSSSSYY**CCWWLLLLPPPPHHQQRRRRIIMMTTTTNNKKSSGGVVVVAAAADDEEGGGGStarts = ---M------------------------------MM---------------M------------Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGGBase2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGBase3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG
Основания: аденин (А), цитозин (С), гуанин (G) и тимин (Т) или урацил (U).
Аминокислоты: аланин (Ala, A), аргинин (Arg, R), аспарагин (Asn, N), аспарагиновая кислота (Asp, D), цистеин (Cys, C), глутаминовая кислота (Glu, E), глутамин (Gln). , Q), глицин (Gly, G), гистидин (His, H), изолейцин (Ile, I), лейцин (Leu, L), лизин (Lys, K), метионин (Met, M), фенилаланин (Phe, F), пролин (Pro, P), серин (Ser, S), треонин (Thr, T), триптофан (Trp, W), тирозин (Tyr, Y), валин (Val, V)
Отличия от стандартного кода
[ редактировать ]| Кодоны ДНК | Кодоны РНК | Этот код (13) | Стандартный код (1) | |
|---|---|---|---|---|
AGA |
AGA |
Gly (G) |
Arg (R)
| |
AGG |
AGG |
Gly (G) |
Arg (R)
| |
ATA |
AUA |
Met (M) |
Ile (I)
| |
TGA |
UGA |
Trp (W) |
STOP = Ter (*)
|
Систематический ассортимент и комментарии
[ редактировать ]) имеются доказательства На филогенетически разнообразных образцах оболочников ( Urochordata того, что AGA и AGG кодируют глицин . У других организмов AGA/AGG кодируют либо аргинин , либо серин , а в митохондриях позвоночных они кодируют STOP. Доказательства глициновой трансляции AGA/AGG были впервые обнаружены в 1993 году у Pyura stolonifera. [ 1 ] и Halocynthia roretzi . [ 2 ] Затем это было подтверждено секвенированием тРНК. [ 3 ] и секвенирование целых митохондриальных геномов. [ 4 ] [ 5 ]
Альтернативные кодоны инициации
[ редактировать ]- АТА, ГТГ и ТТГ [ 5 ]
- АТТ является стартовым кодоном гена CytB у Halocynthia roretzi . [ 6 ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе . [ 7 ]
- ^ Дюргейм Г.А., Корфилд В.А., Харли Э.Х., Рикеттс М.Х. (1993). «Нуклеотидная последовательность цитохромоксидазы (субъединицы III) из митохондрии оболочника Pyura stolonifera : свидетельство того, что AGR кодирует глицин» . Исследования нуклеиновых кислот . 21 (15): 3587–8. дои : 10.1093/нар/21.15.3587 . ПМЦ 331473 . ПМИД 8393993 .
- ^ Ёкобори С., Уэда Т., Ватанабэ К. (январь 1993 г.). «Кодоны AGA и AGG читаются как глицин в асцидийных митохондриях». Журнал молекулярной эволюции . 36 (1): 1–8. Бибкод : 1993JMolE..36....1Y . дои : 10.1007/bf02407301 . ПМИД 8381878 . S2CID 12603691 .
- ^ Кондоу А., Сузуки Т., Ёкобори С., Уэда Т., Ватанабэ К. (июнь 1999 г.). «Дополнительная тРНКГли(U*CU), обнаруженная в асцидийных митохондриях, отвечает за декодирование неуниверсальных кодонов AGA/AGG в глицин» . Исследования нуклеиновых кислот . 27 (12): 2554–9. дои : 10.1093/нар/27.12.2554 . ПМК 148460 . ПМИД 10352185 .
- ^ Ёкобори С., Уэда Т., Фельдмайер-Фукс Г., Паабо С., Уэсима Р., Кондов А., Нисикава К., Ватанабэ К. (декабрь 1999 г.). «Полная последовательность ДНК митохондриального генома асцидии Halocynthia roretzi (Chordata, Urochordata)» . Генетика . 153 (4): 1851–62. дои : 10.1093/генетика/153.4.1851 . ПМК 1460873 . ПМИД 10581290 .
- ^ Jump up to: а б Ёкобори С., Ватанабэ Ю., Осима Т. (ноябрь 2003 г.). «Митохондриальный геном Ciona savigni (Urochordata, Ascidiacea, Enterogona): сравнение расположения генов и генов тРНК с Halocynthia roretzi митохондриальным геномом » . Журнал молекулярной эволюции . 57 (5): 574–87. Бибкод : 2003JMolE..57..574Y . дои : 10.1007/s00239-003-2511-9 . ПМИД 14738316 . S2CID 19474615 .
- ^ Гисси С., Песоле Дж. (2003). «Картирование транскрипта и аннотация генома мтДНК асцидий с использованием данных EST» . Геномные исследования . 13 (9): 2203–12. дои : 10.1101/гр.1227803 . ПМК 403730 . ПМИД 12915488 .
- ^ Эльжановский А., Остелл Дж., Лейпе Д., Суссов В. «Генетические коды» . Браузер таксономии . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), Национальная медицинская библиотека США . Проверено 5 июня 2016 г.
 | Эта о генетике статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |