ПФКЛ
ПФКЛ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | ПФКЛ , АТФ-ПФК, ПФК-В, ПФК-Л, фосфофруктокиназа, печеночный тип | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | ОМИМ : 171860 ; МГИ : 97547 ; Гомологен : 55668 ; GeneCards : PFKL ; ОМА : ПФКЛ – ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
6-фосфофруктокиназа печеночного типа (PFKL) представляет собой фермент , который у человека кодируется PFKL геном на хромосоме 21. [5] Этот ген кодирует изоформу печени (L) фосфофруктокиназы-1 , фермента, который катализирует превращение D - фруктозо-6-фосфата в D - фруктозо-1,6-бисфосфат , что является ключевым этапом глюкозы метаболизма ( гликолиза ). Этот фермент представляет собой тетрамер , который может состоять из разных субъединиц, кодируемых разными генами в разных тканях. Альтернативный сплайсинг приводит к образованию множества вариантов транскрипта. [предоставлено RefSeq, март 2014 г.] [5]
Структура
[ редактировать ]Ген
[ редактировать ]Последовательность мРНК PFKL включает 55 нуклеотидов в 5'- и 515 нуклеотидов в 3'- некодирующих областях , а также 2337 нуклеотидов в кодирующей области, кодирующей 779 аминокислот . мышечного типа только на 68% Эта кодирующая область имеет сходство между PFKL и PFKM . [6]
Белок
[ редактировать ]Этот белок массой 80 кДа является одним из трех типов субъединиц, которые включают пять тетрамерных изоферментов PFK . ПФК печени (ПФК-5) содержит только ПФКЛ, тогда как ПФК эритроцитов включает пять изоферментов, состоящих из различных комбинаций ПФКЛ и второго типа субъединицы, ПФКМ. [7] [8] Мышечный изофермент ( PFK-1 ) состоит исключительно из PFKM. [7] [9] [10] Эти субъединицы произошли от общего прокариотического предка посредством дупликации генов и мутаций. Как правило, N-конец субъединицы осуществляет свою каталитическую активность, тогда как C-конец содержит аллостерические лиганда . сайты связывания [11]
Функция
[ редактировать ]Этот ген кодирует одну из трех белковых субъединиц PFK, которые экспрессируются и объединяются с образованием тетрамерной PFK тканеспецифичным образом. Как субъединица PFK, PFKL участвует в катализе фосфорилирования фруктозо -6-фосфата во фруктозо-1,6-бисфосфат. Эта необратимая реакция служит основной , лимитирующей скорость . стадией гликолиза [7] [10] [11] [12] Примечательно, нокдаун PFKL что , как было показано, ухудшает гликолиз и способствует метаболизму через пентозофосфатный путь . Более того, ПФКЛ регулирует активность НАДФН-оксидазы посредством пентозофосфатного пути и в зависимости от уровня НАДФН . [12]
ПФКЛ также был обнаружен в лейкоцитах , почках и мозге . [9]
Клиническое значение
[ редактировать ]Поскольку ПФК эритроцитов состоит как из ПФКЛ, так и из ПФКМ, этот гетерогенный состав объясняется различной активностью ПФК и поражением органов, наблюдаемыми при некоторых наследственных состояниях дефицита ПФК, при которых может возникнуть миопатия или гемолиз, или и то, и другое, например, гликогеноз типа VII (болезнь Таруи). ). [7] [8]
Сверхэкспрессия ПФКЛ связана с синдрома Дауна эритроцитами и фибробластами (СД) и связана с биохимическими изменениями в ПФК, которые усиливают ее гликолитическую функцию. Более того, ген PFKL картирован в тройной области хромосомы 21, ответственной за СД, что указывает на то, что этот ген также был утроен. [13]
Интерактивная карта маршрутов
[ редактировать ]Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы перейти к соответствующим статьям. [§ 1]
- ^ Интерактивную карту маршрутов можно редактировать на WikiPathways: «Гликолиз-Глюконеогенез_WP534» .
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000141959 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020277 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Jump up to: а б «Ген Энтрез: фосфофруктокиназа PFKL, печень» .
- ^ Леванон Д., Дансигер Э., Дафни Н., Бернштейн Ю., Элсон А., Моенс В., Брандейс М., Гронер Ю. (декабрь 1989 г.). «Первичная структура фосфофруктокиназы печени человека и ее сравнение с другими типами ПФК». ДНК . 8 (10): 733–43. дои : 10.1089/dna.1989.8.733 . ПМИД 2533063 .
- ^ Jump up to: а б с д Вора С., Симэн С., Дарем С., Пиомелли С. (январь 1980 г.). «Изозимы фосфофруктокиназы человека: идентификация и структурная характеристика субъединиц новой системы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 77 (1): 62–6. Бибкод : 1980PNAS...77...62В . дои : 10.1073/pnas.77.1.62 . ПМК 348208 . ПМИД 6444721 .
- ^ Jump up to: а б Вора С., Дэвидсон М., Симэн С., Миранда А.Ф., Нобл Н.А., Танака К.Р., Френкель Э.П., Димауро С. (декабрь 1983 г.). «Гетерогенность молекулярных поражений при наследственном дефиците фосфофруктокиназы» . Журнал клинических исследований . 72 (6): 1995–2006. дои : 10.1172/JCI111164 . ПМК 437040 . ПМИД 6227635 .
- ^ Jump up to: а б Костер Дж. Ф., Сли Р. Г., Ван Беркель Т. Дж. (апрель 1980 г.). «Изоферменты фосфофруктокиназы человека». Клиника Химика Акта; Международный журнал клинической химии . 103 (2): 169–73. дои : 10.1016/0009-8981(80)90210-7 . ПМИД 6445244 .
- ^ Jump up to: а б Мусумечи О, Бруно С, Монджини Т, Родолико С, Агеннуз М, Барса Е, Амати А, Кассандрини Д, Серленга Л, Вита Г, Тоскано А (апрель 2012 г.). «Клинические особенности и новые молекулярные данные при дефиците мышечной фосфофруктокиназы (GSD типа VII)». Нервно-мышечные расстройства . 22 (4): 325–30. дои : 10.1016/j.nmd.2011.10.022 . ПМИД 22133655 . S2CID 20133199 .
- ^ Jump up to: а б Брюзер А., Кирхбергер Дж., Клоос М., Стратер Н., Шенеберг Т. (май 2012 г.). «Функциональная связь участков связывания адениновых нуклеотидов в 6-фосфофруктокиназе мышц млекопитающих» . Журнал биологической химии . 287 (21): 17546–53. дои : 10.1074/jbc.M112.347153 . ПМК 3366854 . ПМИД 22474333 .
- ^ Jump up to: а б Грэм Д.Б., Беккер CE, Доан А., Гоэл Дж., Виллабланка Э.Дж., Найтс Д., Мок А., Нг AC, Дёнч Дж.Г., Рут DE, Клиш CB, Ксавьер Р.Дж. (21 июля 2015 г.). «Функциональная геномика идентифицирует негативные регуляторные узлы, контролирующие окислительный взрыв фагоцитов» . Природные коммуникации . 6 : 7838. Бибкод : 2015NatCo...6.7838G . дои : 10.1038/ncomms8838 . ПМЦ 4518307 . ПМИД 26194095 .
- ^ Элсон А., Бернштейн Ю., Дегани Х., Леванон Д., Бен-Гур Х., Гронер Ю. (март 1992 г.). «Дозировка генов и синдром Дауна: метаболические и ферментативные изменения в клетках PC12, сверхэкспрессирующих трансфицированную фосфофруктокиназу печеночного типа человека». Соматическая клетка и молекулярная генетика . 18 (2): 143–61. дои : 10.1007/bf01233161 . ПМИД 1533471 . S2CID 38259672 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Кан А., Мейенхофер М.К., Коттро Д., Лагранж Дж.Л., Дрейфус Дж.К. (апрель 1979 г.). «Изоферменты фосфофруктокиназы (PFK) у человека. I. Исследования тканей взрослого человека». Генетика человека . 48 (1): 93–108. дои : 10.1007/bf00273280 . ПМИД 156693 . S2CID 23300861 .
- Кристенсен Т., Лопес Р., Прюдз Х. (1992). «Оценка частоты ошибок секвенирования в базах данных последовательностей ДНК». Последовательность ДНК . 2 (6): 343–6. дои : 10.3109/10425179209020815 . ПМИД 1446073 .
- Ван Д., Фанг Х., Кантор Ч.Р., Смит К.Л. (апрель 1992 г.). «Непрерывная карта рестрикции Not I полосы q22.3 хромосомы 21 человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 89 (8): 3222–6. Бибкод : 1992PNAS...89.3222W . дои : 10.1073/pnas.89.8.3222 . ПМК 48838 . ПМИД 1565613 .
- Элсон А., Леванон Д., Брандейс М., Дафни Н., Бернштейн Ю., Дансигер Э., Гронер Ю. (май 1990 г.). «Структура гена фосфофруктокиназы печеночного типа человека». Геномика . 7 (1): 47–56. дои : 10.1016/0888-7543(90)90517-X . ПМИД 2139864 .
- Леванон Д., Дансигер Э., Дафни Н., Бернштейн Ю., Элсон А., Моенс В., Брандейс М., Гронер Ю. (декабрь 1989 г.). «Первичная структура фосфофруктокиназы печени человека и ее сравнение с другими типами ПФК». ДНК . 8 (10): 733–43. дои : 10.1089/dna.1989.8.733 . ПМИД 2533063 .
- Ван Кеурен М., Драбкин Х., Харт И., Харкер Д., Паттерсон Д., Вора С. (сентябрь 1986 г.). «Региональное присвоение 6-фосфофруктокиназы печени типа человека хромосоме 21q22.3 с использованием гибридов соматических клеток и моноклонального антитела против L». Генетика человека . 74 (1): 34–40. дои : 10.1007/bf00278782 . ПМИД 2944814 . S2CID 26346007 .
- Леванон Д., Дансигер Э., Дафни Н., Гронер Ю. (ноябрь 1986 г.). «Геномные клоны фосфофруктокиназы печеночного типа человека». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 141 (1): 374–80. дои : 10.1016/S0006-291X(86)80379-5 . ПМИД 2948503 .
- Вора С., Дэвидсон М., Симэн С., Миранда А.Ф., Нобл Н.А., Танака К.Р., Френкель Э.П., Димауро С. (декабрь 1983 г.). «Гетерогенность молекулярных поражений при наследственном дефиците фосфофруктокиназы» . Журнал клинических исследований . 72 (6): 1995–2006. дои : 10.1172/JCI111164 . ПМК 437040 . ПМИД 6227635 .
- Вора С., Симэн С., Дарем С., Пиомелли С. (январь 1980 г.). «Изозимы фосфофруктокиназы человека: идентификация и структурная характеристика субъединиц новой системы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 77 (1): 62–6. Бибкод : 1980PNAS...77...62В . дои : 10.1073/pnas.77.1.62 . ПМК 348208 . ПМИД 6444721 .
- Костер Дж. Ф., Сли Р. Г., Ван Беркель Т. Дж. (апрель 1980 г.). «Изоферменты фосфофруктокиназы человека». Клиника Химика Акта; Международный журнал клинической химии . 103 (2): 169–73. дои : 10.1016/0009-8981(80)90210-7 . ПМИД 6445244 .
- Вора С., Франк У (июнь 1981 г.). «Присвоение человеческого гена изозима 6-фосфофруктокиназы печени типа (PFKL) хромосоме 21 с использованием гибридов соматических клеток и моноклональных антител против L» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 78 (6): 3738–42. Бибкод : 1981PNAS...78.3738V . дои : 10.1073/pnas.78.6.3738 . ПМК 319647 . ПМИД 6455664 .
- Зейтшель У, Бигл М, Эшрих К, Бигл В (декабрь 1996 г.). «Клеточное распределение изоферментов 6-фосфофрукто-1-киназы в мозге крысы». Журнал нейрохимии . 67 (6): 2573–80. дои : 10.1046/j.1471-4159.1996.67062573.x . ПМИД 8931492 . S2CID 46068703 .
- Геварт К., Готалс М., Мартенс Л., Ван Дамм Дж., Стас А., Томас Г.Р., Вандекеркхове Дж. (май 2003 г.). «Изучение протеомов и анализ обработки белков путем масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Природная биотехнология . 21 (5): 566–9. дои : 10.1038/nbt810 . ПМИД 12665801 . S2CID 23783563 .
- Чжан С., Дауд Д.Р., Стаал А., Гу С., Лиан Дж.Б., ван Вейнен А.Дж., Штейн Г.С., Макдональд П.Н. (сентябрь 2003 г.). «Белок, взаимодействующий с ядерным коактиватором-62 кДа/Ski, представляет собой коактиватор, связанный с ядерным матриксом, который может сочетать транскрипцию, опосредованную рецептором витамина D, и сплайсинг РНК» . Журнал биологической химии . 278 (37): 35325–36. дои : 10.1074/jbc.M305191200 . ПМИД 12840015 .
- Колланд Ф, Жак Икс, Труплен В, Мужен С, Гроазело С, Гамбургер А, Мейл А, Войчик Дж, Легрен П, Готье ЖМ (июль 2004 г.). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека» . Геномные исследования . 14 (7): 1324–32. дои : 10.1101/гр.2334104 . ПМЦ 442148 . ПМИД 15231748 .
- Раш Дж., Мориц А., Ли К.А., Го А., Госс В.Л., Спек Э.Дж., Чжан Х., Чжа К.М., Полакевич Р.Д., Комб М.Дж. (январь 2005 г.). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Природная биотехнология . 23 (1): 94–101. дои : 10.1038/nbt1046 . ПМИД 15592455 . S2CID 7200157 .