ЭГЛН2

ЭГЛН2
Идентификаторы
Псевдонимы	EGLN2 , EIT6, HIF-PH1, HIFPH1, HPH-1, HPH-3, PHD1, фактор 2, индуцируемый семейной гипоксией egl-9, EIT-6
Внешние идентификаторы	Опустить : 606424 ; МГИ : 1932287 ; Гомологен : 14204 ; Генные карты : EGLN2 ; ОМА : EGLN2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 19 (human) Band 19q13.2 Start 40,798,996 bp End 40,808,434 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 7 (mouse) Band 7 A3|7 15.83 cM Start 26,858,083 bp End 26,866,227 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in left testis right testis blood spleen right lung apex of heart upper lobe of left lung mucosa of transverse colon primary visual cortex putamen Top expressed in seminiferous tubule entorhinal cortex Ileal epithelium perirhinal cortex choroid plexus of fourth ventricle CA3 field spermatid muscle of thigh Paneth cell crypt of lieberkuhn of small intestine More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity L-ascorbic acid binding iron ion binding dioxygenase activity metal ion binding protein binding oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen oxidoreductase activity ferrous iron binding oxygen gasoreceptor activity peptidyl-proline 4-dioxygenase activity Cellular component nucleoplasm nucleus Biological process response to hypoxia positive regulation of protein catabolic process regulation of neuron apoptotic process peptidyl-proline hydroxylation to 4-hydroxy-L-proline cell redox homeostasis regulation of cell growth regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia intracellular estrogen receptor signaling pathway Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 112398 112406 Вместе ENSG00000269858 ENSMUSG00000058709 ЮниПрот Q96KS0 Q91YE2 RefSeq (мРНК) НМ_080732 НМ_017555 НМ_053046 НМ_053208 НМ_001357767 RefSeq (белок) НП_444274 НП_542770 НП_444438 НП_001344696 Местоположение (UCSC) Чр 19: 40,8 – 40,81 Мб Chr 7: 26,86 – 26,87 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Девятый гомолог 2 Egl — это белок , который у человека кодируется EGLN2 геном . ELGN2 представляет собой альфа-кетоглутарат-зависимую гидроксилазу , суперсемейство негемовых железосодержащих белков.

Фактор , индуцируемый гипоксией (HIF) представляет собой транскрипционный комплекс, который участвует в кислородном гомеостазе . При нормальном уровне кислорода альфа-субъединица HIF подвергается деградации путем гидроксилирования пролила . Этот ген кодирует фермент, ответственный за эту посттрансляционную модификацию. Было идентифицировано множество альтернативно сплайсированных вариантов, кодирующих один и тот же белок.

Дальнейшее чтение

• Семенза Г.Л. (2001). «HIF-1, O (2) и 3 PHD: как клетки животных сигнализируют ядру о гипоксии» . Клетка . 107 (1): 1–3. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00518-9 . ПМИД   11595178 . S2CID   14922615 .
• Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геном Рез . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК   310948 . ПМИД   11076863 .
• Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных кДНК человека, кодирующих белки» . Геном Рез . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК   311072 . ПМИД   11230166 .
• Яаккола П., Моул Д.Р., Тиан Ю.М. и др. (2001). «Нацеливание HIF-альфа на комплекс убиквитилирования фон Хиппель-Линдау посредством O2-регулируемого пролилгидроксилирования» . Наука . 292 (5516): 468–72. Бибкод : 2001Sci...292..468J . дои : 10.1126/science.1059796 . ПМИД   11292861 . S2CID   20914281 .
• Иван М., Кондо К., Ян Х. и др. (2001). «HIF-альфа нацелен на разрушение, опосредованное VHL, путем гидроксилирования пролина: значение для восприятия O2» . Наука . 292 (5516): 464–8. Бибкод : 2001Sci...292..464I . дои : 10.1126/science.1059817 . ПМИД   11292862 . S2CID   33725562 .
• Тейлор М.С. (2001). «Характеристика и сравнительный анализ семейства генов EGLN». Джин . 275 (1): 125–32. дои : 10.1016/S0378-1119(01)00633-3 . ПМИД   11574160 .
• Эпштейн А.С., Глидл Дж.М., Макнил Л.А. и др. (2001). «C. elegans EGL-9 и гомологи млекопитающих определяют семейство диоксигеназ, которые регулируют HIF путем гидроксилирования пролила» . Клетка . 107 (1): 43–54. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00507-4 . ПМИД   11595184 . S2CID   18372306 .
• Брюик Р.К., Макнайт С.Л. (2001). «Консервативное семейство пролил-4-гидроксилаз, модифицирующих HIF». Наука . 294 (5545): 1337–40. Бибкод : 2001Sci...294.1337B . дои : 10.1126/science.1066373 . ПМИД   11598268 . S2CID   9695199 .
• Сет П., Кроп И., Портер Д., Поляк К. (2002). «Новые гены, индуцированные эстрогеном и тамоксифеном, идентифицированные с помощью SAGE (серийный анализ экспрессии генов)» . Онкоген . 21 (5): 836–43. дои : 10.1038/sj.onc.1205113 . ПМИД   11850811 .
• Мин Дж.Х., Ян Х., Иван М. и др. (2002). «Структура комплекса HIF-1альфа-pVHL: распознавание гидроксипролина в передаче сигналов» . Наука . 296 (5574): 1886–9. Бибкод : 2002Sci...296.1886M . дои : 10.1126/science.1073440 . ПМИД   12004076 . S2CID   19641938 .
• Макнил Л.А., Хьюитсон К.С., Глидл Дж.М. и др. (2002). «Использование дикислорода пролилгидроксилазой HIF (PHD1)». Биоорг. Мед. хим. Летт . 12 (12): 1547–50. дои : 10.1016/S0960-894X(02)00219-6 . ПМИД   12039559 .
• Оме Ф., Эллингхаус П., Колкхоф П. и др. (2002). «Сверхэкспрессия PH-4, новой предполагаемой пролин-4-гидроксилазы, модулирует активность факторов транскрипции, индуцируемых гипоксией». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 296 (2): 343–9. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00862-8 . ПМИД   12163023 .
• Иван М., Хабербергер Т., Герваси Д.С. и др. (2002). «Биохимическая очистка и фармакологическое ингибирование пролилгидроксилазы млекопитающих, действующей на фактор, индуцируемый гипоксией» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (21): 13459–64. Бибкод : 2002PNAS...9913459I . дои : 10.1073/pnas.192342099 . ПМК   129695 . ПМИД   12351678 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Метцен Э., Берхнер-Пфанншмидт У., Стенгель П. и др. (2003). «Внутриклеточная локализация альфа-гидроксилаз HIF-1 человека: значение для восприятия кислорода» . Дж. Клеточная наука . 116 (Часть 7): 1319–26. дои : 10.1242/jcs.00318 . ПМИД   12615973 .
• Чиоффи CL, Лю XQ, Косински П.А. и др. (2003). «Дифференциальная регуляция генов альфа-пролил-4-гидроксилазы HIF-1 под действием гипоксии в сердечно-сосудистых клетках человека». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 303 (3): 947–53. дои : 10.1016/S0006-291X(03)00453-4 . ПМИД   12670503 .
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД   14702039 .
• Апреликова О., Чандрамули Г.В., Вуд М. и др. (2004). «Регуляция пролилгидроксилаз HIF факторами, индуцируемыми гипоксией» . Дж. Селл. Биохим . 92 (3): 491–501. дои : 10.1002/jcb.20067 . ПМИД   15156561 . S2CID   24455956 .
• Колланд Ф., Жак Икс, Труплин В. и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека» . Геном Рез . 14 (7): 1324–32. дои : 10.1101/гр.2334104 . ПМК   442148 . ПМИД   15231748 .