Скваленмонооксигеназа

SQLE
Идентификаторы
Псевдонимы	SQLE , entrez:6713, скваленэпоксидаза
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 602019 ; МГИ : 109296 ; Гомологен : 2355 ; Генные карты : SQLE ; OMA : SQLE — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 8 (human)
End	125,022,283 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 15 (mouse)
End	59,203,041 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; gingival epithelium; ; bronchial epithelial cell; ; cartilage tissue; ; nipple; ; C1 segment; ; inferior ganglion of vagus nerve; ; tibia; ; human penis;
	Top expressed in
	genital tubercle; ; hair follicle; ; ciliary body; ; corneal stroma; ; trigeminal ganglion; ; iris; ; choroid plexus of fourth ventricle; ; lip; ; ventricular zone; ; anterior horn of spinal cord;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	oxidoreductase activity; flavin adenine dinucleotide binding; squalene monooxygenase activity; FAD binding;
Cellular component	organelle membrane; integral component of membrane; endoplasmic reticulum membrane; membrane; intracellular membrane-bounded organelle; endoplasmic reticulum;
Biological process	cellular aromatic compound metabolic process; cholesterol biosynthetic process; response to organic substance; cholesterol metabolic process; sterol biosynthetic process; regulation of cholesterol biosynthetic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6713
	20775
	ENSG00000104549
	ENSMUSG00000022351
	Q14534
	P52019
	НМ_003129
	НМ_009270
	НП_003120
	НП_033296
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

показывать Поиск
PMC	articles
PubMed	articles
NCBI	proteins

Скваленэпоксидаза
Скваленэпоксидаза
	Химическая реакция, катализируемая скваленэпоксидазой.
Идентификаторы
Номер ЕС.	1.14.13.132
Номер CAS.	9029-62-3
Базы данных
ИнтЭнк	вид IntEnz
БРЕНДА	БРЕНДА запись
Экспаси	Просмотр NiceZyme
КЕГГ	КЕГГ запись
МетаЦик	метаболический путь
ПРЯМОЙ	профиль
PDB Структуры	RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтология	АмиГО / QuickGO
PMC
показывать Поиск
PMC	articles
PubMed	articles
NCBI	proteins

Скваленмонооксигеназа (также называемая скваленэпоксидазой ) представляет собой эукариотический фермент , который использует НАДФН и двухатомный кислород для окисления сквалена до 2,3-оксидосквалена (эпоксид сквалена). Скваленэпоксидаза катализирует первую стадию оксигенации в биосинтезе стеринов и считается одним из ферментов, лимитирующих скорость на этом пути. ^[5] У человека скваленэпоксидаза кодируется SQLE геном . ^[6] В геномах некоторых эукариот отсутствует ген, кодирующий скваленмонооксигеназу, но вместо этого кодируется альтернативная скваленэпоксидаза, которая выполняет ту же задачу. ^[7]

Механизм

Каноническая скваленмонооксигеназа представляет флавопротеинмонооксигеназу собой . Флавопротеинмонооксигеназа образует флавина гидроперекиси в фермента активном центре переносят концевой атом кислорода гидроперекиси , которые затем на субстрат . Скваленмонооксигеназа отличается от других флавинмонооксигеназ тем, что кислород вводится в субстрат в виде эпоксида, а не в виде гидроксильной группы. Этот фермент содержит слабосвязанный FAD флавин и получает электроны от НАДФН - редуктазы цитохрома Р450 , а не связывает НАДФН напрямую. Альтернативная скваленэпоксидаза принадлежит к суперсемейству гидроксилаз жирных кислот и получает электроны от цитохрома b5 . ^[7]

Ингибиторы

Ингибиторы скваленэпоксидазы нашли применение преимущественно как противогрибковые препараты : ^[8]

Поскольку скваленэпоксидаза участвует в биосинтетическом пути, ведущем к выработке холестерина , ингибиторы этого фермента могут также найти применение при лечении гиперхолестеринемии . ^[10]

Локализация

У пекарских дрожжей ( Saccharomyces cerevisiae ) скваленэпоксидаза локализуется как в эндоплазматическом ретикулуме, так и в липидных каплях. Активен только белок, локализованный в ЭР.

Дополнительные продукты

Скваленэпоксидаза также катализирует образование диэпоксисквалена (ДОС). DOS превращается в 24(S),25-эпоксиланостерин под действием ланостеринсинтазы.

См. также

Противогрибковый препарат#Аллиламины

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000104549 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022351 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Энтрез: скваленэпоксидаза SQLE» .
^ Нагай М., Сакакибара Дж., Вакуи К., Фукусима Ю., Игараси С., Цудзи С., Аракава М., Оно Т. (август 1997 г.). «Локализация гена скваленэпоксидазы (SQLE) в области хромосомы человека 8q24.1». Геномика . 44 (1): 141–3. дои : 10.1006/geno.1997.4825 . ПМИД 9286711 .
^ Jump up to: ^а ^б Поллиер Дж., Ванкестер Э., Кужиумпарамбил У., Викерс К.Э., Вандеполе К., Гуссенс А., Фабрис М. (2019). «Широко распространенная альтернативная скваленэпоксидаза участвует в биосинтезе стероидов эукариот» . Природная микробиология . 4 (2): 226–233. дои : 10.1038/s41564-018-0305-5 . hdl : 1854/LU-8587985 . ПМИД 30478288 . S2CID 53726187 .
^ Фавр Б., Райдер Н.С. (февраль 1996 г.). «Характеристика активности скваленэпоксидазы дерматофита Trichophyton Rubrum и ее ингибирование тербинафином и другими антимикотическими средствами» . Антимикробные средства и химиотерапия . 40 (2): 443–7. дои : 10.1128/AAC.40.2.443 . ПМК 163131 . ПМИД 8834895 .
^ Райдер Н.С. (февраль 1992 г.). «Тербинафин: механизм действия и свойства ингибирования скваленэпоксидазы». Британский журнал дерматологии . 126 (Приложение 39): 2–7. дои : 10.1111/j.1365-2133.1992.tb00001.x . ПМИД 1543672 . S2CID 19780957 .
^ Чу А., Рэй А., Гупта Дж. Б. (январь 2003 г.). «Скваленэпоксидаза как мишень для гипохолестеринемических препаратов». Прогресс в исследованиях липидов . 42 (1): 37–50. дои : 10.1016/S0163-7827(02)00029-2 . ПМИД 12467639 .

Дальнейшее чтение

Ма Дж., Демпси А.А., Стаматиу Д., Маршалл К.В., Лью CC (март 2007 г.). «Идентификация закономерностей экспрессии генов лейкоцитов, связанных с уровнями липидов в плазме у людей». Атеросклероз . 191 (1): 63–72. doi : 10.1016/j.atherosclerosis.2006.05.032 . ПМИД 16806233 .
Ладен Б.П., Тан И., Портер Т.Д. (февраль 2000 г.). «Клонирование, гетерологичная экспрессия и ферментологическая характеристика скваленмонооксигеназы человека». Архив биохимии и биофизики . 374 (2): 381–8. дои : 10.1006/abbi.1999.1629 . PMID 10666321 .
Хелмс М.В., Кемминг Д., Поспишил Х., Фогт У., Бюргер Х., Коршинг Э., Лидтке С., Шлоттер К.М., Ван А., Чан С.Ю., Брандт Б.Х. (сентябрь 2008 г.). «Скваленэпоксидаза, расположенная на хромосоме 8q24.1, активируется при 8q+ раке молочной железы и указывает на плохой клинический исход на стадиях I и II заболевания» . Британский журнал рака . 99 (5): 774–80. дои : 10.1038/sj.bjc.6604556 . ПМЦ 2528137 . ПМИД 18728668 .
Нагай М., Сакакибара Дж., Накамура Ю., Геджё Ф., Оно Т. (июль 2002 г.). «SREBP-2 и NF-Y участвуют в регуляции транскрипции скваленэпоксидазы». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 295 (1): 74–80. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00623-X . ПМИД 12083769 .
Лю Ю, Сунь В, Чжан К, Чжэн Х, Ма Ю, Линь Д, Чжан Икс, Фэн Л, Лей В, Чжан Цз, Го С, Хань Н, Тонг В, Фэн Икс, Гао Ю, Ченг С (июнь 2007 г.) ). «Идентификация генов, дифференциально экспрессирующихся при первичной плоскоклеточной карциноме легких человека». Рак легких . 56 (3): 307–17. дои : 10.1016/j.lungcan.2007.01.016 . ПМИД 17316888 .
Сузуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Лу Й, Долле М.Э., Имхольц С., Ван 'т Слот Р., Вершурен В.М., Вейменга С., Фескенс Э.Дж., Бур Дж.М. (декабрь 2008 г.). «Множественные генетические варианты на путях-кандидатах влияют на концентрацию холестерина липопротеинов высокой плотности в плазме» . Журнал исследований липидов . 49 (12): 2582–9. doi : 10.1194/jlr.M800232-JLR200 . ПМИД 18660489 .
Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И., Дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бехтель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К.Х., Хубер В., Пепперкок Р., Пустка А., Виманн С. (январь 2006 г.). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D415-8. дои : 10.1093/nar/gkj139 . ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Накамура Ю., Сакакибара Дж., Изуми Т., Сибата А., Оно Т. (апрель 1996 г.). «Регуляция транскрипции скваленэпоксидазы стеролами и ингибиторами в клетках HeLa» . Журнал биологической химии . 271 (14): 8053–6. дои : 10.1074/jbc.271.14.8053 . ПМИД 8626488 .
Нагай М., Сакакибара Дж., Вакуи К., Фукусима Ю., Игараси С., Цудзи С., Аракава М., Оно Т. (август 1997 г.). «Локализация гена скваленэпоксидазы (SQLE) в области хромосомы человека 8q24.1». Геномика . 44 (1): 141–3. дои : 10.1006/geno.1997.4825 . ПМИД 9286711 .
Виманн С., Арльт Д., Хубер В., Велленройтер Р., Шлигер С., Мерле А., Бектель С., Зауэрманн М., Корф У., Пепперкок Р., Зюльтманн Х., Пустка А. (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геномные исследования . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК 528930 . ПМИД 15489336 .

Внешние ссылки

Сквален + монооксигеназа в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000104549 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022351 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez_6713-5] «Ген Энтрез: скваленэпоксидаза SQLE» .

[pmid9286711-6] Нагай М., Сакакибара Дж., Вакуи К., Фукусима Ю., Игараси С., Цудзи С., Аракава М., Оно Т. (август 1997 г.). «Локализация гена скваленэпоксидазы (SQLE) в области хромосомы человека 8q24.1». Геномика . 44 (1): 141–3. дои : 10.1006/geno.1997.4825 . ПМИД 9286711 .

[pmid30478288-7] Jump up to: ^а ^б Поллиер Дж., Ванкестер Э., Кужиумпарамбил У., Викерс К.Э., Вандеполе К., Гуссенс А., Фабрис М. (2019). «Широко распространенная альтернативная скваленэпоксидаза участвует в биосинтезе стероидов эукариот» . Природная микробиология . 4 (2): 226–233. дои : 10.1038/s41564-018-0305-5 . hdl : 1854/LU-8587985 . ПМИД 30478288 . S2CID 53726187 .

[pmid8834895-8] Фавр Б., Райдер Н.С. (февраль 1996 г.). «Характеристика активности скваленэпоксидазы дерматофита Trichophyton Rubrum и ее ингибирование тербинафином и другими антимикотическими средствами» . Антимикробные средства и химиотерапия . 40 (2): 443–7. дои : 10.1128/AAC.40.2.443 . ПМК 163131 . ПМИД 8834895 .

[pmid1543672-9] Райдер Н.С. (февраль 1992 г.). «Тербинафин: механизм действия и свойства ингибирования скваленэпоксидазы». Британский журнал дерматологии . 126 (Приложение 39): 2–7. дои : 10.1111/j.1365-2133.1992.tb00001.x . ПМИД 1543672 . S2CID 19780957 .

[pmid12467639-10] Чу А., Рэй А., Гупта Дж. Б. (январь 2003 г.). «Скваленэпоксидаза как мишень для гипохолестеринемических препаратов». Прогресс в исследованиях липидов . 42 (1): 37–50. дои : 10.1016/S0163-7827(02)00029-2 . ПМИД 12467639 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

v т и Оксидоредуктазы : диоксигеназы , включая стероидные гидроксилазы ( EC 1.14)
1.14.11 : 2-оксоглутарат	Пролилгидроксилаза HIF-пролилгидроксилаза ЭГЛН1 ЭГЛН2 ЭГЛН3 P4HTM Лизилгидроксилаза АлкБ АЛКБХ1 ФТО
1.14.13 : НАДН или НАДФН.	Флавинсодержащая монооксигеназа ФМО1 ФМО2 ФМО3 ФМО4 ФМО5 Синтаза оксида азота НОС1 НОС2 НОС3 Холестерин 7 альфа-гидроксилаза Метанмонооксигеназа 3А4 14α-деметилаза 24-гидроксихолестерин-7α-гидроксилаза
1.14.14 : восстановленный флавин или флавопротеин	19А1 2D6 2Е1
1.14.15 : восстановленный железосерный белок	11Б1 11Б2 11А1
1.14.16 : восстановленный птеридин ( зависит от BH4 )	Фенилаланингидроксилаза Тирозингидроксилаза Триптофангидроксилаза
1.14.17 : восстановленный аскорбат	Дофамин-бета-гидроксилаза
14.1.18 - 19 : другое	Тирозиназа Стеароил-КоА-десатураза-1
14.1.99 - разное	Циклооксигеназа Гемоксигеназа ( HMOX1 ) Скваленмонооксигеназа 17А1 21А2 Экдизон-20-монооксигеназа Дезоксигипузинмонооксигеназа

v т и Ферменты
Активность	Активный сайт Связывающий сайт Каталитическая триада Оксианионная дырка Ферментная распущенность Фермент, ограниченный диффузией Кофактор Ферментативный катализ
Регулирование	Аллостерическая регуляция Кооперативность Ингибитор ферментов Активатор ферментов
Классификация	Номер ЕС Суперсемейство ферментов Семейство ферментов Список ферментов
Кинетика	Кинетика ферментов Диаграмма Иди – Хофсти Заговор Хейнса – Вульфа График Лайнуивера – Берка Кинетика Михаэлиса – Ментен
Типы	EC1 Оксидоредуктазы ( список ) EC2 Трансферазы ( список ) EC3 Гидролазы ( список ) EC4- лиазы ( список ) EC5 Изомеразы ( список ) EC6- лигазы ( список ) EC7 Транслоказы ( список )