Protein-coding gene in the species Homo sapiens
Arhgdia Доступные структуры PDB Поиск ортолога: PDBE RCSB show Список кодов идентификаторов PDB 1CC0 , 1FSO , 1FST , 1FT0 , 1FT3 , 1HH4 , 1KMT , 1QVY , 1RHO , 2BXW , 2JHS , 2JHT , 2JHU , 2JHV , 2JHW , 2JHX , 2JHY , 2JHZ , 2JI0 , 2N80
Идентификаторы Псевдонимы Arhgdia , GDIA1, HEL-S-47E, NPHS8, RHOGDI, RHOGDI-1, RHO GDP-ингибитор диссоциатора Альфа Альфа Внешние идентификаторы Омим : 601925 ; MGI : 2178103 ; Гомологен : 908 ; Genecards : arhgdia ; OMA : Arhgdia - ортологи show РНК -паттерн экспрессии Bgee Human Mouse (ortholog)Top expressed in granulocyte epithelium of colon mucosa of transverse colon left uterine tube upper lobe of left lung right lung ascending aorta left coronary artery tibial nerve anterior pituitary
Top expressed in tail of embryo yolk sac genital tubercle tibiofemoral joint lip lactiferous gland entorhinal cortex mesenteric lymph nodes perirhinal cortex molar
More reference expression data
BioGPS
Викидид
Ингибитор GDP-диссоциации Rho -это белок , который у людей кодируется Arhgdia геном . [ 5 ] [ 6 ]
Было показано, что Arhgdia взаимодействует :
^ Jump up to: а беременный в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000141522 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: а беременный в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000025132 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Вагнер Т., Томмеруп Н., Вирт Дж., Лефферс Х., Циммер Дж., Бэк Э, Вайссенбах Дж., Шерер Дж. (Июль 1997 г.). «Гибридная панель соматической ячейки для дистальных карт 17Q: GDIA1 до 17Q25.3». Cytogenet Cltle Genet . 76 (3–4): 172–5. doi : 10.1159/000134538 . PMID 9186513 .
^ «Ген Entrez: Arhgdia Rho GDP -ингибитор диссоциатора (GDI) Альфа» .
^ Jump up to: а беременный в Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х, Тейлор П., Клили С., МакБрум-Сираджевский Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарзее М., Хо Й., Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Ducewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). «Крупномасштабное картирование взаимодействия белка белка человека с помощью масс-спектрометрии» . Мол Система Биол . 3 : 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .
^ Jump up to: а беременный в дюймовый Gorvel JP, Chang TC, Boretto J, Azuma T, Chavrier P (январь 1998 г.). «Дифференциальные свойства D4/Lygdi против Rhogdi: фосфорилирование и селективность Rho GTPase». Фебс Летт . 422 (2): 269–73. doi : 10.1016/s0014-5793 (98) 00020-9 . PMID 9490022 . S2CID 10817327 .
^ Jump up to: а беременный в дюймовый Fauré J, Dagher MC (май 2001 г.). «Взаимодействие между Rho GTPases и ингибитором диссоциации Rho GDP (Rho-GDI)». Биохими . 83 (5): 409–14. doi : 10.1016/s0300-9084 (01) 01263-9 . PMID 11368848 .
^ Grizot S, Fauré J, Fieschi F, Vignais PV, Dagher MC, Pebay-Peyroula E (август 2001 г.). «Кристаллическая структура комплекса Rac1-Rhogdi, участвующая в активации NADPH-оксидазы». Биохимия . 40 (34): 10007–13. doi : 10.1021/bi010288k . PMID 11513578 .
^ Лиан Ли, Барсуков I, Голованов А.П., Хокинс Д.И., Бадия Р., Сзе К.Х., Корп Н.Х., Бокоч Г.М., Робертс Г.К. (январь 2000). «Картирование сайта связывания для GTP-связывающего белка Rac-1 на его ингибиторе Rhogdi-1» . Структура 8 (1): 47–55. doi : 10.1016/s0969-2126 (00) 00080-0 . PMID 10673424 .
^ Di-Poï N, Fauré J, Grizot S, Molnár G, Pick E, Dagher MC (август 2001 г.). «Механизм активации NADPH-оксидазы комплексом RAC/RHO-GDI». Биохимия . 40 (34): 10014–22. doi : 10.1021/bi010289c . PMID 11513579 .
^ Gajate C, Mollino F (март 2005 г.). «Цитоскелет опосредованный рецептором смерти и концентрацией лигандов в липидных рафтах образует кластеры, способствующие апоптозу, при химиотерапии рака» . Дж. Биол. Химический 280 (12): 11641–7. doi : 10.1074/jbc.m411781200 . PMID 15659383 .
^ Майклсон Д., Силетти Дж., Мерфи Г., Д'Айдачио П, Раш М., Филипс М.Р. (январь 2001 г.). «Дифференциальная локализация Rho GTPases в живых клетках: регуляция гипервидными областями и связыванием Rhogdi» . J. Cell Biol . 152 (1): 111–26. doi : 10.1083/jcb.152.1.111 . PMC 2193662 . PMID 11149925 .
^ Li X, Bu X, Lu B, Avraham H, Flavell RA, Lim B (февраль 2002 г.). «GTP-связывающий белок, специфичный GTP-связывающий белок Rhoh, дефицит GTPase и модулирует активность других Rho GTPases с помощью ингибирующей функции» . Мол Клетка. Биол . 22 (4): 1158–71. doi : 10.1128/mcb.22.4.1158-1171.2002 . PMC 134637 . PMID 11809807 .
Лефферс Х., Нильсен М.С., Андерсен А.Х., Гононь Б., Мэдсен П., Вандереркхоув Дж., Селис Дж. (1994). «Идентификация двух белков ингибитора диссоциации RHO GRO человека, чья сверхэкспрессия приводит к нарушению актинового цитоскелета». Эксплуат Ячейка . 209 (2): 165–74. doi : 10.1006/excr.1993.1298 . PMID 8262133 .
Храните Н.Х., Барнс М., Барсуков И., Бадия Р., Лиан Ли, Сегал А.В., Муди ПК, Робертс Г.К. (1997). «Модулятор белков семейства Rho G, Rhogdi, связывает эти G-белки через иммуноглобулиноподобный домен и гибкую N-концевую руку» . Структура 5 (5): 623–33. doi : 10.1016/s0969-2126 (97) 00218-9 . PMID 9195882 .
Такахаши К., Сасаки Т., Маммото А., Такаиши К., Камеяма Т., Цукита С., Такай Ю. (1997). «Прямое взаимодействие ингибитора диссоциации Rho GDP с эзизрином/радиксином/мозином инициирует активацию малого G -белка Rho» . Дж. Биол. Химический 272 (37): 23371–5. doi : 10.1074/jbc.272.37.23371 . PMID 9287351 .
Gorvel JP, Chang TC, Boretto J, Azuma T, Chavrier P (1998). «Дифференциальные свойства D4/Lygdi против Rhogdi: фосфорилирование и селективность Rho GTPase». Фебс Летт . 422 (2): 269–73. doi : 10.1016/s0014-5793 (98) 00020-9 . PMID 9490022 . S2CID 10817327 .
Такахаши К., Сасаки Т., Маммото А., Хотта И., Такаиши К., Имамура Х, Накано К., Кодама А., Такай Ю. (1998). «Взаимодействие радиксина с малым G -белком GDP/GTP -белком DBL». Онкоген . 16 (25): 3279–84. doi : 10.1038/sj.onc.1201874 . PMID 9681826 . S2CID 21445282 .
Newcombe AR, Stockley RW, Hunter JL, Webb MR (1999). «Взаимодействие между RAC1 и его ингибитором диссоциации я нуклеотидов гуанина (GDI), контролируемое одним флуоресцентным кумарином, прикрепленным к GDI». Биохимия . 38 (21): 6879–86. doi : 10.1021/bi9829837 . PMID 10346909 .
Groysman M, Russek CS, Katzav S (2000). «VAV, коэффициент обмена нуклеотида GDP/GTP, взаимодействует с GDI, белками, которые ингибируют диссоциацию GDP/GTP» . Фебс Летт . 467 (1): 75–80. doi : 10.1016/s0014-5793 (00) 01121-2 . PMID 10664460 . S2CID 40103095 .
Лиан Ли, Барсуков I, Голованов А.П., Хокинс Д.И., Бадия Р., Сзе К.Х., Корп Н.Х., Бокоч Г.М., Робертс Г.К. (2000). «Картирование сайта связывания для GTP-связывающего белка Rac-1 на его ингибиторе Rhogdi-1» . Структура 8 (1): 47–55. doi : 10.1016/s0969-2126 (00) 00080-0 . PMID 10673424 .
Хоффман Г.Р., Нассар Н., Сераоне Р.А. (2000). «Структура семейства GTP-связывающего белка Rho CDC42 в комплексе с многофункциональным регулятором Rhogdi» . Клетка . 100 (3): 345–56. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 80670-4 . PMID 10676816 . S2CID 17115337 .
Матаррезе П., Конти Л., Варано Б., Гауцци М.К., Беларделли Ф., Гессани С., Малорни В. (2000). «Белок ВПР ВИЧ-1 индуцирует устойчивость к аноикису путем модуляции процесса клеточной адгезии и сборки системы микрофиламентов» . Клеточная гибель отличается . 7 (1): 25–36. doi : 10.1038/sj.cdd.4400616 . PMID 10713718 .
Майклсон Д., Силетти Дж., Мерфи Г., Д'Айдачио П, Раш М., Филипс М.Р. (2001). «Дифференциальная локализация Rho GTPases в живых клетках: регуляция гипервидными областями и связыванием Rhogdi» . J. Cell Biol . 152 (1): 111–26. doi : 10.1083/jcb.152.1.111 . PMC 2193662 . PMID 11149925 .
Longenecker KL, Garrard SM, Sheffield PJ, Derewenda ZS (2001). «Кристаллизация белка путем рационального мутагенеза поверхностных остатков: Lys для мутаций ALA способствуют кристаллизации Rhogdi» . Acta Crystallogr. Дюймовый 57 (Pt 5): 679–88. doi : 10.1107/s0907444901003122 . PMID 11320308 .
Grizot S, Fauré J, Fieschi F, Vignais PV, Dagher MC, Pebay-Peyroula E (2001). «Кристаллическая структура комплекса Rac1-Rhogdi, участвующая в активации NADPH-оксидазы». Биохимия . 40 (34): 10007–13. doi : 10.1021/bi010288k . PMID 11513578 .
Di-Poï N, Fauré J, Grizot S, Molnár G, Pick E, Dagher MC (2001). «Механизм активации NADPH-оксидазы комплексом RAC/RHO-GDI». Биохимия . 40 (34): 10014–22. doi : 10.1021/bi010289c . PMID 11513579 .
Bokchelzer A, Bokch GM (2004). PAK1-D- УСТАНОВКА Мол Смеситель 15 (1): 117–2 doi : 10.1016/j.mulcel . PMID 152225553 .
Dransart E, Morin A, Cherfils J, Olofsson B (2005). «Необеспечение ингибирующей и шаттлинг функций ингибиторов диссоциаторов Rho GDP» . Дж. Биол. Химический 280 (6): 4674–83. doi : 10.1074/jbc.m409741200 . PMID 15513926 .
Gajate C, Mollino F (2005). «Цитоскелет опосредованный рецептором смерти и концентрацией лигандов в липидных рафтах образует кластеры, способствующие апоптозу, при химиотерапии рака» . Дж. Биол. Химический 280 (12): 11641–7. doi : 10.1074/jbc.m411781200 . PMID 15659383 .
показывать PDB Галерея
1ajw : STRUCTURE OF RHOGDI: A C-TERMINAL BINDING DOMAIN TARGETS AN N-TERMINAL INHIBITORY PEPTIDE TO GTPASES, NMR, 20 STRUCTURES
1cc0 : CRYSTAL STRUCTURE OF THE RHOA.GDP-RHOGDI COMPLEX
1doa : STRUCTURE OF THE RHO FAMILY GTP-BINDING PROTEIN CDC42 IN COMPLEX WITH THE MULTIFUNCTIONAL REGULATOR RHOGDI
1fso : CRYSTAL STRUCTURE OF TRUNCATED HUMAN RHOGDI QUADRUPLE MUTANT
1fst : CRYSTAL STRUCTURE OF TRUNCATED HUMAN RHOGDI TRIPLE MUTANT
1ft0 : CRYSTAL STRUCTURE OF TRUNCATED HUMAN RHOGDI K113A MUTANT
1ft3 : CRYSTAL STRUCTURE OF TRUNCATED RHOGDI K141A MUTANT
1gdf : STRUCTURE OF RHOGDI: A C-TERMINAL BINDING DOMAIN TARGETS AN N-TERMINAL INHIBITORY PEPTIDE TO GTPASES, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE
1hh4 : RAC1-RHOGDI COMPLEX INVOLVED IN NADPH OXIDASE ACTIVATION
1kmt : Crystal structure of RhoGDI Glu(154,155)Ala mutant
1qvy : Crystal structure of RhoGDI K(199,200)R double mutant
1rho : STRUCTURE OF RHO GUANINE NUCLEOTIDE DISSOCIATION INHIBITOR
2bxw : CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI LYS(135,138,141)TYR MUTANT
2jhs : CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI K135H,K138H,K141H MUTANT
2jht : CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI K135T,K138T,K141T MUTANT
2jhu : CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI E154A,E155A MUTANT
2jhv : CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI E154A,E155A MUTANT
2jhw : CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI E155A, E157A MUTANT
2jhx : CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI E155H, E157H MUTANT
2jhy : CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI E155H, E157H MUTANT
2jhz : CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI E155S, E157S MUTANT
2ji0 : CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI K138Y, K141Y MUTANT