Jump to content

SAP30

SAP30
Доступные структуры
ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы SAP30 , белок 30, связанный с Sin3A
Внешние идентификаторы Опустить : 603378 ; МГИ : 1929129 ; Гомологен : 2869 ; Генные карты : SAP30 ; ОМА : SAP30 — ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_003864

НМ_021788

RefSeq (белок)

НП_003855

НП_068560.1

Местоположение (UCSC) Chr 4: 173,37 – 173,38 Мб Chr 8: 57,94 – 57,94 Мб
в PubMed Поиск [ 3 ] [ 4 ]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Sin3A-ассоциированный белок 30 кДа , также известный как SAP30 , представляет собой белок , который у человека кодируется геном SAP30 . [ 5 ]

гистонов Ацетилирование играет ключевую роль в регуляции экспрессии генов эукариот. Ацетилирование и деацетилирование гистонов катализируются мультисубъединичными комплексами. Белок, кодируемый этим геном, является компонентом гистондеацетилазного комплекса, в который входят SIN3A , SAP18 , HDAC1 , HDAC2 , RbAp46 , RbAp48 и другие полипептиды. Этот комплекс активен в деацетилировании основных октамеров гистонов, но неактивен в деацетилировании нуклеосомных гистонов. Псевдоген этого гена расположен на хромосоме 3. [ 5 ]

У млекопитающих есть один паралог SAP30, названный SAP30-подобным ( SAP30L ), который на 70% идентичн последовательности с SAP30. [ 6 ] SAP30 и SAP30L вместе составляют хорошо консервативное семейство белков SAP30. Также SAP30L взаимодействует с несколькими компонентами корепрессорного комплекса Sin3A и индуцирует репрессию транскрипции посредством рекрутирования Sin3A и деацетилаз гистонов. [ 7 ]

Белки семейства SAP30 (белки SAP30) обладают функциональным сигналом ядрышковой локализации и способны направлять Sin3A в ядрышко. [ 7 ] Белки SAP30 имеют независимый от последовательности контакт с ДНК посредством своего N-концевого цинк-зависимого модуля, а их кислая центральная область способствует взаимодействиям гистонов и нуклеосом. Связывание ДНК белков SAP30 регулируется ядерными сигнальными липидами, фосфоинозитидами (PI). [ 8 ] Белки SAP30 представляют собой первый пример, в котором ДНК и ИП, по-видимому, находятся во взаимно антагонистических взаимоотношениях в отношении их взаимодействия с белками цинковых пальцев , и, таким образом, иллюстрируют молекулярный механизм того, как эти липиды могут способствовать регуляции генов. [ 8 ] [ 9 ]

Взаимодействия

[ редактировать ]

Было показано, что SAP30 взаимодействует с:

  1. ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000164105 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031609 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Перейти обратно: а б «Ген Энтреза: белок SAP30 Sin3A, 30 кДа» .
  6. ^ Линдфорс К., Виири К.М., Нииттинен М., Хейнонен Т.Ю., Мяки М., Кайнулайнен Х. (декабрь 2003 г.). «TGF-бета индуцирует экспрессию SAP30L, нового ядерного белка» . БМК Геномика . 4 (1): 53. дои : 10.1186/1471-2164-4-53 . ПМК   319701 . ПМИД   14680513 .
  7. ^ Перейти обратно: а б Виири К.М., Коркеамяки Х., Кукконен М.К., Ниеминен Л.К., Линдфорс К., Петерсон П., Мяки М., Кайнулайнен Х., Лохи О (2006). «SAP30L взаимодействует с членами корепрессорного комплекса Sin3A и направляет Sin3A в ядрышко» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (11): 3288–98. дои : 10.1093/нар/gkl401 . ПМК   1500868 . ПМИД   16820529 .
  8. ^ Перейти обратно: а б Виири К.М., Янис Дж., Сиггерс Т., Хейнонен Т.Ю., Валякка Дж., Булык М.Л., Мяки М., Лохи О. (январь 2009 г.). «ДНК-связывающая и изгибающая активность SAP30L и SAP30 опосредуется цинк-зависимым модулем и монофосфоинозитидами» . Молекулярная и клеточная биология . 29 (2): 342–56. дои : 10.1128/MCB.01213-08 . ПМЦ   2612513 . ПМИД   19015240 .
  9. ^ «Поиск в базе данных диссертаций Университета Тампере» . Архивировано из оригинала 25 мая 2011 года . Проверено 24 апреля 2009 г.
  10. ^ Перейти обратно: а б Хуан Н.Э., Линь Ч., Линь Ю.С., Ю В.К. (июнь 2003 г.). «Модуляция активности YY1 с помощью SAP30». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 306 (1): 267–75. дои : 10.1016/s0006-291x(03)00966-5 . ПМИД   12788099 .
  11. ^ Перейти обратно: а б с д и Чжан Ю, Сунь З.В., Иратни Р., Эрджумент-Бромаж Х., Темпст П., Хэмпси М., Рейнберг Д. (июнь 1998 г.). «SAP30, новый белок, консервативный у человека и дрожжей, является компонентом комплекса гистондеацетилазы» . Молекулярная клетка . 1 (7): 1021–31. дои : 10.1016/s1097-2765(00)80102-1 . ПМИД   9651585 .
  12. ^ Перейти обратно: а б с д и Чжан Ю, Нг Х.Х., Эрджюмент-Бромаж Х., Темпст П., Бёрд А., Рейнберг Д. (август 1999 г.). «Анализ субъединиц NuRD выявил основной комплекс деацетилазы гистонов и связь с метилированием ДНК» . Гены и развитие . 13 (15): 1924–35. дои : 10.1101/гад.15.13.1924 . ПМК   316920 . ПМИД   10444591 .
  13. ^ Суонсон К.А., Нопфлер П.С., Хуанг К., Канг Р.С., Коули С.М., Лаэрти К.Д., Эйзенман Р.Н., Радхакришнан I (август 2004 г.). «Репрессоры HBP1 и Mad1 связывают домен корепрессора Sin3 PAH2 с противоположной спиральной ориентацией». Структурная и молекулярная биология природы . 11 (8): 738–46. дои : 10.1038/nsmb798 . ПМИД   15235594 . S2CID   44324333 .
  14. ^ Перейти обратно: а б Йохум Г.С., Айер Д.Э. (июль 2001 г.). «Pf1, новый белок цинковых пальцев PHD, который связывает корепрессор TLE с комплексом mSin3A-гистондеацетилазы» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (13): 4110–8. дои : 10.1128/MCB.21.13.4110-4118.2001 . ПМК   87072 . ПМИД   11390640 .
  15. ^ Перейти обратно: а б с д и ж Кузьмичев А, Чжан Й, Эрджюмент-Бромаж Х, Темпст П, Рейнберг Д (февраль 2002 г.). «Роль комплекса Sin3-гистон-деацетилазы в регуляции роста кандидатом-супрессором опухоли p33 (ING1)» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (3): 835–48. дои : 10.1128/mcb.22.3.835-848.2002 . ПМЦ   133546 . ПМИД   11784859 .
  16. ^ Перейти обратно: а б Лаэрти К.Д., Биллин А.Н., Лавински Р.М., Йохум Г.С., Буш А.С., Сан Дж.М., Маллен Т.М., Дэви Дж.Р., Роуз Д.В., Гласс С.К., Розенфельд М.Г., Айер Д.Е., Эйзенман Р.Н. (июль 1998 г.). «SAP30, компонент корепрессорного комплекса mSin3, участвующий в репрессии, опосредованной N-CoR, специфическими факторами транскрипции» . Молекулярная клетка . 2 (1): 33–42. дои : 10.1016/s1097-2765(00)80111-2 . ПМИД   9702189 .
  17. ^ Андерхилл С., Кутоб М.С., Йи С.П., Торчиа Дж. (декабрь 2000 г.). «Новый корепрессорный комплекс ядерного рецептора, N-CoR, содержит компоненты комплекса SWI/SNF млекопитающих и корепрессора KAP-1» . Журнал биологической химии . 275 (51): 40463–70. дои : 10.1074/jbc.M007864200 . ПМИД   11013263 .
  18. ^ Флейшер Т.С., Юн У.Дж., Айер Д.Э. (май 2003 г.). «Идентификация и характеристика трех новых компонентов корепрессорного комплекса mSin3A» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (10): 3456–67. дои : 10.1128/mcb.23.10.3456-3467.2003 . ПМК   164750 . ПМИД   12724404 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 5c91acad87140ec34848c128d4f3cb41__1701214980
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/5c/41/5c91acad87140ec34848c128d4f3cb41.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
SAP30 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)