SAP18

SAP18
Доступные структуры
PDB	Поиск UNIPROT человека: PDBE RCSB
показывать Список кодов идентификаторов PDB
	2HDE
Идентификаторы
Псевдонимы	SAP18 , 2HOR0202, SAP18P, SIN3A Associated Protein 18 кДа, SIN3A, ассоциированный белок 18
Внешние идентификаторы	Омим : 602949 ; MGI : 3704317 ; Гомологен : 4289 ; GeneCards : SAP18 ; OMA : SAP18 - ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 13 (human)
End	21,149,084 bp
показывать Местоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 8 (mouse)
End	96,552,762 bp
показывать РНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	internal globus pallidus; ; right ventricle; ; tendon; ; tendon of biceps brachii; ; corpus epididymis; ; Achilles tendon; ; caput epididymis; ; bronchial epithelial cell; ; biceps brachii; ; Skeletal muscle tissue of biceps brachii;
	Top expressed in
	primary oocyte; ; yolk sac; ; embryo; ; embryo; ; neural tube; ; stomach; ; lens; ; zygote; ; epiblast; ; proximal tubule;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
показывать Джин Онтология
Molecular function	transcription corepressor activity; protein binding; histone deacetylase activity; RNA binding;
Cellular component	histone deacetylase complex; nuclear speck; exon-exon junction complex; nucleoplasm; ASAP complex; nucleus; cytoplasm; cytosol; nuclear body;
Biological process	regulation of transcription, DNA-templated; regulation of transcription by RNA polymerase II; mRNA processing; regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome; transcription, DNA-templated; negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome; RNA splicing; positive regulation of apoptotic process; negative regulation of nucleic acid-templated transcription; histone deacetylation;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	10284
	100041953
	ENSG00000150459
	EMSMUSM00000000001104
	O00422
	n/a
	NM_005870 ; NM_001366643
	NM_001142441
	NP_005861 ; NP_001353572
	n/a
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Субъединица комплекса гистондеацетилазы SAP18 является ферментом , который у людей кодируется SAP18 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Ацетилирование гистона играет ключевую роль в регуляции экспрессии эукариотических генов. Мультисубнитные комплексы катализируют ацетилирование гистонов и деацетилирование. Белок, кодируемый этим геном, представляет собой компонент комплекса гистондеацетилазы, включая SIN3, SAP30, HDAC1, HDAC2, RBAP46, RBAP48 и другие полипептиды. Этот белок напрямую взаимодействует с SIN3 и усиливает SIN3-опосредованную транскрипционную репрессию при привязке к промотору. ^{[ 6 ]} Кроме того, варианты сплайсинга SAP18S участвуют в апоптотических циклах. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что SAP18 взаимодействует с

POLE2 , ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} и
RGS10 . ^{[ 10 ]}

Ссылки

^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000150459 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000061104 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Zhang Y, Iratni R, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Reinberg D (май 1997). «Гистон -деацетилазы и SAP18, новый полипептид, являются компонентами комплекса SIN3 человека» . Клетка . 89 (3): 357–64. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 80216-0 . PMID 9150135 .
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: SAP18 SIN3A-ассоциированный белок, 18 кДа» .
^ Мишель Л., Клутье А., Тутант Дж., Шкрета Л., Тибо П., Дюран М., Гарно Д., Гендрон Д., Лапойнте Е., Кутюр С., Ле Хир Х, Клинк Р., Элела С.А., Принс П., Чабот Б (март 2012 г.). «Белки, связанные с комплексом экзон -соединения, также контролируют альтернативный сплайсинг апоптотических регуляторов» . Молекулярная и клеточная биология . 32 (5): 954–67. doi : 10.1128/mcb.06130-11 . PMC 3295189 . PMID 22203037 .
^ Wada M, Miyazawa H, Wang RS, Mizuno T, Sato A, Asashima M, Hanaoka F (март 2002 г.). «Вторая по величине субъединица мышиной ДНК-полимеразы Epsilon, DPE2, взаимодействует с SAP18 и рекрутирует ко-репрессорный белок SIN3 в ДНК». Журнал биохимии . 131 (3): 307–11. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a003104 . PMID 11872158 .
^ Ченг Си, епископ Дж. М. (апрель 2002 г.). «Супрессор плавленого репрессии GLI-опосредованной транскрипции путем набора комплекса корепрессора SAP18-MSIN3» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (8): 5442–7. Bibcode : 2002pnas ... 99,5442c . doi : 10.1073/pnas.082096999 . PMC 122788 . PMID 11960000 .
^ Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х, Тейлор П., Клили С., МакБрум-Сираджевский Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарзее М., Хо Й., Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Ducewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). «Крупномасштабное картирование взаимодействия белка белка человека с помощью масс-спектрометрии» . Биология молекулярных систем . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .

Дальнейшее чтение

Koipally J, Renold A, Kim J, Georgopoulos K (июнь 1999 г.). «Репрессия икарос и айолос опосредована с помощью гистондеацетилазных комплексов» . Embo Journal . 18 (11): 3090–100. doi : 10.1093/emboj/18.11.3090 . PMC 1171390 . PMID 10357820 .
Wada M, Miyazawa H, Wang RS, Mizuno T, Sato A, Asashima M, Hanaoka F (март 2002 г.). «Вторая по величине субъединица мышиной ДНК-полимеразы Epsilon, DPE2, взаимодействует с SAP18 и рекрутирует ко-репрессорный белок SIN3 в ДНК». Журнал биохимии . 131 (3): 307–11. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a003104 . PMID 11872158 .
Ченг Си, епископ Дж. М. (апрель 2002 г.). «Супрессор плавленого репрессии GLI-опосредованной транскрипции путем набора комплекса корепрессора SAP18-MSIN3» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (8): 5442–7. Bibcode : 2002pnas ... 99,5442c . doi : 10.1073/pnas.082096999 . PMC 122788 . PMID 11960000 .
Paces-Fessy M, Boucher D, Petit E, Paute-Briand S, Blanchet-Tournier MF (март 2004 г.). «Отрицательный регулятор GLI, супрессор слитого (SUFU), взаимодействует с SAP18, галектином3 и другими ядерными белками» . Биохимический журнал . 378 (Pt 2): 353–62. doi : 10.1042/bj20030786 . PMC 1223961 . PMID 14611647 .
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (январь 2005 г.). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Bibcode : 2005natur.433 ... 77a . doi : 10.1038/nature03207 . PMID 15635413 . S2CID 4344740 .

Внешние ссылки

SAP18 Местоположение человеческого гена в браузере генома UCSC .
SAP18 Человеческие детали гена в браузере генома UCSC .

Эта статья о гене о хромосоме человека 13 представляет собой заглушку . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000150459 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000061104 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid9150135-5] Zhang Y, Iratni R, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Reinberg D (май 1997). «Гистон -деацетилазы и SAP18, новый полипептид, являются компонентами комплекса SIN3 человека» . Клетка . 89 (3): 357–64. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 80216-0 . PMID 9150135 .

[entrez-6] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: SAP18 SIN3A-ассоциированный белок, 18 кДа» .

[pmid22203037-7] Мишель Л., Клутье А., Тутант Дж., Шкрета Л., Тибо П., Дюран М., Гарно Д., Гендрон Д., Лапойнте Е., Кутюр С., Ле Хир Х, Клинк Р., Элела С.А., Принс П., Чабот Б (март 2012 г.). «Белки, связанные с комплексом экзон -соединения, также контролируют альтернативный сплайсинг апоптотических регуляторов» . Молекулярная и клеточная биология . 32 (5): 954–67. doi : 10.1128/mcb.06130-11 . PMC 3295189 . PMID 22203037 .

[pmid11872158-8] Wada M, Miyazawa H, Wang RS, Mizuno T, Sato A, Asashima M, Hanaoka F (март 2002 г.). «Вторая по величине субъединица мышиной ДНК-полимеразы Epsilon, DPE2, взаимодействует с SAP18 и рекрутирует ко-репрессорный белок SIN3 в ДНК». Журнал биохимии . 131 (3): 307–11. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a003104 . PMID 11872158 .

[pmid11960000-9] Ченг Си, епископ Дж. М. (апрель 2002 г.). «Супрессор плавленого репрессии GLI-опосредованной транскрипции путем набора комплекса корепрессора SAP18-MSIN3» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (8): 5442–7. Bibcode : 2002pnas ... 99,5442c . doi : 10.1073/pnas.082096999 . PMC 122788 . PMID 11960000 .

[pmid17353931-10] Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х, Тейлор П., Клили С., МакБрум-Сираджевский Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарзее М., Хо Й., Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Ducewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). «Крупномасштабное картирование взаимодействия белка белка человека с помощью масс-спектрометрии» . Биология молекулярных систем . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]