СИН3Б

СИН3Б
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1E91, 1PD7, 2CR7, 2CZY, 2F05
Идентификаторы
Псевдонимы	SIN3B , белок парной амфипатической спирали Sin3b, член семейства B регулятора транскрипции SIN3.
Внешние идентификаторы	Опустить : 607777 ; МГИ : 107158 ; Гомологен : 81810 ; Генные карты : SIN3B ; ОМА : SIN3B — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	16,880,353 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 8 (mouse)
End	73,484,829 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	body of uterus; ; right uterine tube; ; right ovary; ; left ovary; ; canal of the cervix; ; right lung; ; gastric mucosa; ; left uterine tube; ; left testis; ; sural nerve;
	Top expressed in
	Gonadal ridge; ; Paneth cell; ; internal carotid artery; ; external carotid artery; ; fossa; ; renal corpuscle; ; epithelium of lens; ; condyle; ; endocardial cushion; ; medullary collecting duct;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	transcription corepressor activity; histone deacetylase activity; chromatin binding; protein binding;
Cellular component	cytoplasm; X chromosome; Y chromosome; autosome; Sin3 complex; nucleoplasm; XY body; nucleus; chromatin;
Biological process	regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; negative regulation of transcription, DNA-templated; histone deacetylation; regulation of lipid metabolic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	23309
	20467
	ENSG00000127511
	ENSMUSG00000031622
	О75182
	Q62141
	НМ_001297595 ; НМ_001297597 ; НМ_015260
	НМ_001113248 ; НМ_009188
	НП_001284524 ; НП_001284526 ; НП_056075
	НП_001106719 ; НП_033214
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок парной амфипатической спирали Sin3b представляет собой белок , который у человека кодируется SIN3B геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что SIN3B взаимодействует с HDAC1 , ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Белок, содержащий цинковый палец и домен BTB 16 , ^{[ 9 ]} СУДС3 ^{[ 10 ]} и ИКЗФ1 . ^{[ 8 ]}^{[ 11 ]}

См. также

Корегулятор транскрипции

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000127511 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000031622 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Исикава К., Нагасе Т., Суяма М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (июнь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. X. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro» . Исследование ДНК . 5 (3): 169–76. дои : 10.1093/dnares/5.3.169 . ПМИД 9734811 .
^ «Ген Энтрез: SIN3B гомолог B SIN3, регулятор транскрипции (дрожжи)» .
^ Чжан Ю, Нг Х.Х., Эрджумент-Бромаж Х., Темпст П., Бёрд А., Рейнберг Д. (август 1999 г.). «Анализ субъединиц NuRD выявил основной комплекс деацетилазы гистонов и связь с метилированием ДНК» . Гены и развитие . 13 (15): 1924–35. дои : 10.1101/гад.15.13.1924 . ПМК 316920 . ПМИД 10444591 .
^ Jump up to: ^а ^б Койпалли Дж., Ренольд А., Ким Дж., Георгопулос К. (июнь 1999 г.). «Репрессия Икароса и Айолоса опосредована комплексами деацетилазы гистонов» . Журнал ЭМБО . 18 (11): 3090–100. дои : 10.1093/emboj/18.11.3090 . ПМЦ 1171390 . ПМИД 10357820 .
^ Дэвид Дж., Алланд Л., Хонг С.Х., Вонг К.В., ДеПиньо Р.А., Дежан А. (май 1998 г.). «Гистондеацетилаза, связанная с mSin3A, опосредует репрессию белком PLZF, связанным с острым промиелоцитарным лейкозом». Онкоген . 16 (19): 2549–56. дои : 10.1038/sj.onc.1202043 . ПМИД 9627120 . S2CID 655636 .
^ Алланд Л., Дэвид Г., Шен-Ли Х., Потес Дж., Мюле Р., Ли ХК, Хоу Х., Чен К., ДеПиньо Р.А. (апрель 2002 г.). «Идентификация Sds3 млекопитающих как неотъемлемого компонента корепрессорного комплекса Sin3/гистондеацетилазы» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (8): 2743–50. дои : 10.1128/MCB.22.8.2743-2750.2002 . ПМЦ 133736 . ПМИД 11909966 .
^ Койпалли Дж., Георгопулос К. (август 2002 г.). «Молекулярное вскрытие схемы подавления Икароса» . Журнал биологической химии . 277 (31): 27697–705. дои : 10.1074/jbc.M201694200 . ПМИД 12015313 .

Дальнейшее чтение

Айер Д.Э., Лоуренс QA, Эйзенман Р.Н. (март 1995 г.). «Репрессия транскрипции Mad-Max опосредуется образованием тройного комплекса с гомологами дрожжевого репрессора Sin3 млекопитающих» . Клетка . 80 (5): 767–76. дои : 10.1016/0092-8674(95)90355-0 . ПМИД 7889570 . S2CID 8749951 .
Дэвид Дж., Алланд Л., Хонг С.Х., Вонг К.В., ДеПиньо Р.А., Дежан А. (май 1998 г.). «Гистондеацетилаза, связанная с mSin3A, опосредует репрессию белком PLZF, связанным с острым промиелоцитарным лейкозом». Онкоген . 16 (19): 2549–56. дои : 10.1038/sj.onc.1202043 . ПМИД 9627120 . S2CID 655636 .
Койпалли Дж., Ренольд А., Ким Дж., Георгопулос К. (июнь 1999 г.). «Репрессия Икароса и Айолоса опосредована комплексами деацетилазы гистонов» . Журнал ЭМБО . 18 (11): 3090–100. дои : 10.1093/emboj/18.11.3090 . ПМЦ 1171390 . ПМИД 10357820 .
Нарусэ Ю., Аоки Т., Кодзима Т., Мори Н. (ноябрь 1999 г.). «Нейральный рестриктивный фактор сайленсера рекрутирует mSin3 и комплекс гистондеацетилазы для подавления нейрон-специфичных генов-мишеней» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (24): 13691–6. Бибкод : 1999PNAS...9613691N . дои : 10.1073/pnas.96.24.13691 . ПМК 24126 . ПМИД 10570134 .
Спронк К.А., Тессари М., Каан А.М., Янсен Дж.Ф., Вермюлен М., Стунненберг Х.Г., Вуистер Г.В. (декабрь 2000 г.). «Взаимодействие Mad1-Sin3B включает в себя новую спиральную складку». Структурная биология природы . 7 (12): 1100–4. дои : 10.1038/81944 . ПМИД 11101889 . S2CID 12451972 .
Спронк К.А., Янсен Дж.Ф., Тессари М., Каан А.М., Элен Дж., Ласондер Э., Стунненберг Х.Г., Вуистер Г.В. (апрель 2001 г.). «Специфическое для последовательности назначение домена PAH2 Sin3B, свободного и связанного с Mad1». Журнал биомолекулярного ЯМР . 19 (4): 377–8. дои : 10.1023/А:1011262214741 . hdl : 2066/79476 . ПМИД 11370785 . S2CID 31789681 .
Алланд Л., Дэвид Г., Шен-Ли Х., Потес Дж., Мюле Р., Ли ХК, Хоу Х., Чен К., ДеПиньо Р.А. (апрель 2002 г.). «Идентификация Sds3 млекопитающих как неотъемлемого компонента корепрессорного комплекса Sin3/гистондеацетилазы» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (8): 2743–50. дои : 10.1128/MCB.22.8.2743-2750.2002 . ПМЦ 133736 . ПМИД 11909966 .
Рэйман Дж.Б., Такахаши Ю., Инджеян В.Б., Данненберг Дж.Х., Кэтчпол С., Уотсон Р.Дж., Те Риле Х., Динлахт Б.Д. (апрель 2002 г.). «E2F опосредует зависимую от клеточного цикла репрессию транскрипции in vivo путем рекрутирования корепрессорного комплекса HDAC1/mSin3B» . Гены и развитие . 16 (8): 933–47. дои : 10.1101/gad.969202 . ПМК 152357 . ПМИД 11959842 .
Койпалли Дж., Георгопулос К. (август 2002 г.). «Молекулярное вскрытие схемы подавления Икароса» . Журнал биологической химии . 277 (31): 27697–705. дои : 10.1074/jbc.M201694200 . ПМИД 12015313 .
Ян Л., Мэй К., Зелинска-Квятковска А., Мацуи Ю., Блэкберн М.Л., Бенедетти Д., Крамм А.А., Таборски Г.Дж., Чански Х.А. (февраль 2003 г.). «Гистон-метилтрансфераза, связанная с ERG (ets-связанным геном), взаимодействует с гистондеацетилазами 1/2 и ко-репрессорами транскрипции mSin3A/B» . Биохимический журнал . 369 (Часть 3): 651–7. дои : 10.1042/BJ20020854 . ПМЦ 1223118 . ПМИД 12398767 .
Петри К., Гидес Ф., Хауэлл Л., Хили Л., Ваксман С., Гривз М., Зелент А. (май 2003 г.). «Ген гистондеацетилазы 9 кодирует несколько изоформ белка» . Журнал биологической химии . 278 (18): 16059–72. дои : 10.1074/jbc.M212935200 . ПМИД 12590135 .
Высоцка Дж., Майерс, член парламента, Лаэрти К.Д., Эйзенман Р.Н., Герр В. (апрель 2003 г.). «Человеческая деацетилаза Sin3 и связанная с тритораксом гистоновая метилтрансфераза Set1/Ash2 H3-K4 избирательно связаны вместе фактором клеточной пролиферации HCF-1» . Гены и развитие . 17 (7): 896–911. дои : 10.1101/gad.252103 . ЧВК 196026 . ПМИД 12670868 .
Дюгаст-Дарзак С., Пирити М., Бланк Дж.К., Шерл А., Шрайбер-Агус Н. (ноябрь 2004 г.). «Mxi1-SRalpha: новая изоформа Mxi1 с повышенным потенциалом репрессии транскрипции». Онкоген . 23 (55): 8887–99. дои : 10.1038/sj.onc.1208107 . ПМИД 15467743 . S2CID 30045920 .
Рампалли С., Павитра Л., Бхатт А., Кунду Т.К., Чаттопадхьяй С. (октябрь 2005 г.). «Опухолевый супрессор SMAR1 опосредует репрессию циклина D1 путем привлечения комплекса SIN3/гистондеацетилаза 1» . Молекулярная и клеточная биология . 25 (19): 8415–29. дои : 10.1128/MCB.25.19.8415-8429.2005 . ПМК 1265755 . ПМИД 16166625 .
Сюй Ю, Сенгупта П.К., Сето Э., Смит Б.Д. (апрель 2006 г.). «Регуляторный фактор для белков семейства X-box дифференциально взаимодействует с деацетилазами гистонов, подавляя экспрессию гена коллагена альфа2 (I) (COL1A2)» . Журнал биологической химии . 281 (14): 9260–70. дои : 10.1074/jbc.M511724200 . ПМЦ 1434794 . ПМИД 16464847 .

Внешние ссылки

SIN3B + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 19 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000127511 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000031622 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9734811-5] Исикава К., Нагасе Т., Суяма М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (июнь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. X. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro» . Исследование ДНК . 5 (3): 169–76. дои : 10.1093/dnares/5.3.169 . ПМИД 9734811 .

[entrez-6] «Ген Энтрез: SIN3B гомолог B SIN3, регулятор транскрипции (дрожжи)» .

[pmid10444591-7] Чжан Ю, Нг Х.Х., Эрджумент-Бромаж Х., Темпст П., Бёрд А., Рейнберг Д. (август 1999 г.). «Анализ субъединиц NuRD выявил основной комплекс деацетилазы гистонов и связь с метилированием ДНК» . Гены и развитие . 13 (15): 1924–35. дои : 10.1101/гад.15.13.1924 . ПМК 316920 . ПМИД 10444591 .

[pmid10357820-8] Jump up to: ^а ^б Койпалли Дж., Ренольд А., Ким Дж., Георгопулос К. (июнь 1999 г.). «Репрессия Икароса и Айолоса опосредована комплексами деацетилазы гистонов» . Журнал ЭМБО . 18 (11): 3090–100. дои : 10.1093/emboj/18.11.3090 . ПМЦ 1171390 . ПМИД 10357820 .

[pmid9627120-9] Дэвид Дж., Алланд Л., Хонг С.Х., Вонг К.В., ДеПиньо Р.А., Дежан А. (май 1998 г.). «Гистондеацетилаза, связанная с mSin3A, опосредует репрессию белком PLZF, связанным с острым промиелоцитарным лейкозом». Онкоген . 16 (19): 2549–56. дои : 10.1038/sj.onc.1202043 . ПМИД 9627120 . S2CID 655636 .

[pmid11909966-10] Алланд Л., Дэвид Г., Шен-Ли Х., Потес Дж., Мюле Р., Ли ХК, Хоу Х., Чен К., ДеПиньо Р.А. (апрель 2002 г.). «Идентификация Sds3 млекопитающих как неотъемлемого компонента корепрессорного комплекса Sin3/гистондеацетилазы» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (8): 2743–50. дои : 10.1128/MCB.22.8.2743-2750.2002 . ПМЦ 133736 . ПМИД 11909966 .

[pmid12015313-11] Койпалли Дж., Георгопулос К. (август 2002 г.). «Молекулярное вскрытие схемы подавления Икароса» . Журнал биологической химии . 277 (31): 27697–705. дои : 10.1074/jbc.M201694200 . ПМИД 12015313 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

v т и Корегуляторы транскрипции
Коактиваторы	ТЕЛО ( 54 , 55 , 70 ) BCAS3 КАРМ1 p300-CBP ( EP300 , CREBBP ) CRTC ( 1 , 2 , 3 ) КАПЕЛЬНАЯ/ЛОВУШКА ( MED1 Капельная205/Ловушка220) МН1 ПКАФ ПНРК ( 1 , 2 ) ППАРГК ( 1А , 1Б ) ТГФБ1И1 НКОА1 ( SRC-1 ) НКОА2 ( GRIP1/SRC-2/TIF2 ) NCOA3 ( АИБ/SRC-3/ТРАМ-1 ) НКОА4 ( АРА70 ) NCOA5 ( ЦРУ ) НКОА6 ( РАП250 ) НКОА7 ( ЕРАП140 )
Корепрессоры	CTBP ( 1 , 2 ) Безволосый гомолог ЛКОР НРИП1 ( РИП140 ) ПЭЛП-1 РЦОР1 руб. СИН3А СИН3Б Семейство трехсторонних мотивов TRIM ( 24 , 28 , 33 ) НКОР1 NCOR2 ( СМЕРТЬ )
АТФ-зависимые факторы ремоделирования	Комплекс ремоделирования структуры хроматина (RSC) СВИ/СНФ