HMBOX1

HMBOX1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2CUF, 4J19
Идентификаторы
Псевдонимы	HMBOX1 , HNF1LA, HOT1, PBHNF, гомеобокс, содержащий 1, TAH1
Внешние идентификаторы	МГИ : 2445066 ; Гомологен : 11589 ; Генные карты : HMBOX1 ; OMA : HMBOX1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 8 (human)
End	29,064,764 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 14 (mouse)
End	65,187,320 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	epithelium of colon; ; spinal ganglia; ; right adrenal cortex; ; olfactory bulb; ; secondary oocyte; ; cardia; ; left adrenal cortex; ; pars reticulata; ; ventral tegmental area; ; trigeminal ganglion;
	Top expressed in
	genital tubercle; ; neural layer of retina; ; superior frontal gyrus; ; ventricular zone; ; tail of embryo; ; Rostral migratory stream; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; gastrula; ; cerebellar cortex; ; lumbar spinal ganglion;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; telomerase activity; double-stranded telomeric DNA binding; protein binding; identical protein binding; telomeric DNA binding; DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; sequence-specific DNA binding; protein-containing complex binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	cytoplasm; nucleus; telomerase holoenzyme complex; nucleoplasm; cytosol; nuclear body; telomere; chromosome; Cajal body; PML body;
Biological process	positive regulation of transcription, DNA-templated; positive regulation of telomere maintenance via telomerase; negative regulation of transcription, DNA-templated; regulation of transcription, DNA-templated; positive regulation of telomerase activity; transcription, DNA-templated; RNA-dependent DNA biosynthetic process; positive regulation of chromatin binding; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; regulation of telomerase activity;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	79618
	219150
	ENSG00000147421
	ENSMUSG00000021972
	Q6NT76
	Q8BJA3
showНМ_001135726 ; НМ_024567 ; НМ_001324382 ; НМ_001324383 ; НМ_001324384 ;
	NM_001324385; NM_001324386; NM_001324387; NM_001324388; NM_001324389; NM_001324390; NM_001324391; NM_001324392; NM_001324393; NM_001324394; NM_001324395; NM_001330498
	НМ_177338 ; НМ_001347626 ; НМ_001347627
showНП_001129198 ; НП_001311311 ; НП_001311312 ; НП_001311313 ; НП_001311314 ;
	NP_001311315; NP_001311316; NP_001311317; NP_001311318; NP_001311319; NP_001311320; NP_001311321; NP_001311322; NP_001311323; NP_001311324; NP_001317427; NP_078843
	НП_001334555 ; НП_001334556 ; НП_796312
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гомеобокс, содержащий 1 , также известный как гомеобокс-связывающий теломерный белок 1 ( HOT1 ), представляет собой белок , который у людей кодируется геном HMBOX1 . ^{[ 5 ]} HMBOX1 напрямую связывается с двухцепочечной повторяющейся последовательностью теломер . ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Первоначально было идентифицировано, что HMBOX1 связывается с теломерным хроматином в теломеразо-положительных раковых клетках и раковых клетках, которые поддерживают свои теломеры на основе механизма альтернативного удлинения теломер (ALT) с помощью метода «обратного ChIP » PICh (протеомика изолированных сегментов хроматина). ^{[ 6 ]} Впоследствии прямое связывание с теломерной ДНК было продемонстрировано через сокристаллическую структуру ДНК -связывающего домена HMBOX1 с теломерной ДНК. ^{[ 7 ]} Эксперименты по потере и приобретению функции классифицируют HMBOX1 как положительный регулятор длины теломер. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} HMBOX1 первоначально был описан как репрессор транскрипции на основе анализа репортерного гена . ^{[ 9 ]} но полногеномные подходы с использованием RNA-seq и ChIP-seq практически не наблюдают такого эффекта, по крайней мере, в нескольких линиях раковых клеток. ^{[ 10 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000147421 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021972 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Энтрез Ген: Гомеобокс, содержащий 1» .
^ Jump up to: ^а ^б Дежарден Дж., Кингстон Р.Э. (январь 2009 г.). «Очистка белков, связанных со специфическими геномными локусами» . Клетка . 136 (1): 175–86. дои : 10.1016/j.cell.2008.11.045 . ПМЦ 3395431 . ПМИД 19135898 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Каппей Д, Баттер Ф, Бенда С, Шайбе М, Драшкович И, Стивенс М, Ново КЛ, Басквин С, Араки М, Араки К, Крастев Д.Б., Киттлер Р., Джессбергер Р., Лондоньо-Валлехо Х.А., Манн М., Буххольц Ф ( июнь 2013 г.). «HOT1 представляет собой белок млекопитающих, напрямую связывающий теломерные повторы, способствующий рекрутированию теломеразы» . Журнал ЭМБО . 32 (12): 1681–701. дои : 10.1038/emboj.2013.105 . ПМЦ 3680732 . ПМИД 23685356 .
^ Чжоу С, Сяо Ю, Чжуан Ю, Лю Ю, Чжао Х, Ян Х, Се С, Чжоу Ф, Чжоу Ю (июль 2017 г.). «Нокдаун гомеобокса, содержащего 1, увеличивает радиочувствительность клеток рака шейки матки за счет укорочения теломер» . Отчеты онкологии . 38 (1): 515–521. дои : 10.3892/или.2017.5707 . ПМИД 28628186 .
^ Чен С., Сайинь Х., Цзэн Икс, Си Дж, Лю Икс, Ли Икс, Ю Л (2006). «Выделение и функциональный анализ человеческого HMBOX1, гомеобокс-содержащего белка с репрессорной транскрипционной активностью». Цитогенетические и геномные исследования . 114 (2): 131–6. дои : 10.1159/000093328 . ПМИД 16825764 . S2CID 21067536 .
^ Ян А., Ране Г., Пашковски-Рогач М., Сайолс С., Блюм А., Хан К.Т., Драшкович И., Лондоньо-Валлехо Х.А., Кумар А.П., Буххольц Ф., Баттер Ф., Каппей Д. (июнь 2017 г.). «ZBTB48 является одновременно белком, связывающим теломеры позвоночных, и активатором транскрипции» . Отчеты ЭМБО . 18 (6): 929–946. дои : 10.15252/эмбр.201744095 . ПМК 5452029 . ПМИД 28500257 .

Дальнейшее чтение

Эта статья о гене человека й хромосомы незавершена 8 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000147421 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021972 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Энтрез Ген: Гомеобокс, содержащий 1» .

[Déjardin_2009-6] Jump up to: ^а ^б Дежарден Дж., Кингстон Р.Э. (январь 2009 г.). «Очистка белков, связанных со специфическими геномными локусами» . Клетка . 136 (1): 175–86. дои : 10.1016/j.cell.2008.11.045 . ПМЦ 3395431 . ПМИД 19135898 .

[Kappei_2013-7] Jump up to: ^а ^б ^с Каппей Д, Баттер Ф, Бенда С, Шайбе М, Драшкович И, Стивенс М, Ново КЛ, Басквин С, Араки М, Араки К, Крастев Д.Б., Киттлер Р., Джессбергер Р., Лондоньо-Валлехо Х.А., Манн М., Буххольц Ф ( июнь 2013 г.). «HOT1 представляет собой белок млекопитающих, напрямую связывающий теломерные повторы, способствующий рекрутированию теломеразы» . Журнал ЭМБО . 32 (12): 1681–701. дои : 10.1038/emboj.2013.105 . ПМЦ 3680732 . ПМИД 23685356 .

[8] Чжоу С, Сяо Ю, Чжуан Ю, Лю Ю, Чжао Х, Ян Х, Се С, Чжоу Ф, Чжоу Ю (июль 2017 г.). «Нокдаун гомеобокса, содержащего 1, увеличивает радиочувствительность клеток рака шейки матки за счет укорочения теломер» . Отчеты онкологии . 38 (1): 515–521. дои : 10.3892/или.2017.5707 . ПМИД 28628186 .

[9] Чен С., Сайинь Х., Цзэн Икс, Си Дж, Лю Икс, Ли Икс, Ю Л (2006). «Выделение и функциональный анализ человеческого HMBOX1, гомеобокс-содержащего белка с репрессорной транскрипционной активностью». Цитогенетические и геномные исследования . 114 (2): 131–6. дои : 10.1159/000093328 . ПМИД 16825764 . S2CID 21067536 .

[10] Ян А., Ране Г., Пашковски-Рогач М., Сайолс С., Блюм А., Хан К.Т., Драшкович И., Лондоньо-Валлехо Х.А., Кумар А.П., Буххольц Ф., Баттер Ф., Каппей Д. (июнь 2017 г.). «ZBTB48 является одновременно белком, связывающим теломеры позвоночных, и активатором транскрипции» . Отчеты ЭМБО . 18 (6): 929–946. дои : 10.15252/эмбр.201744095 . ПМК 5452029 . ПМИД 28500257 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]