LHX3

LHX3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	2JTN, 2RGT
Идентификаторы
Псевдонимы	LHX3 , CPHD3, LIM3, гомеобокс M2-LIM 3
Внешние идентификаторы	Опустить : 600577 ; МГИ : 102673 ; Гомологен : 7814 ; Генные карты : LHX3 ; OMA : LHX3 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 9 (human)
End	136,205,128 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	26,098,301 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	pituitary gland; ; anterior pituitary; ; pancreatic ductal cell; ; tibialis anterior muscle; ; popliteal artery; ; testicle; ; Epithelium of choroid plexus; ; optic nerve; ; islet of Langerhans; ; nucleus of brain;
	Top expressed in
	Rathke's pouch; ; pituitary gland; ; pars intermedia; ; vestibular sensory epithelium; ; pineal gland; ; pars distalis of adenohypophysis; ; embryo; ; neural layer of retina; ; utricle; ; pretectal area;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	DNA binding; metal ion binding; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding;
Cellular component	transcription regulator complex; intracellular anatomical structure; nucleus;
Biological process	ventral spinal cord interneuron specification; cell differentiation; pituitary gland development; regulation of transcription, DNA-templated; spinal cord association neuron differentiation; spinal cord motor neuron cell fate specification; placenta development; lung development; negative regulation of apoptotic process; transcription, DNA-templated; positive regulation of transcription, DNA-templated; animal organ morphogenesis; inner ear development; medial motor column neuron differentiation; motor neuron axon guidance; dorsal/ventral pattern formation; transcription by RNA polymerase II; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; neuron differentiation;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	8022
	16871
	ENSG00000107187
	ENSMUSG00000026934
	Q9UBR4
	P50481
	НМ_014564 ; НМ_178138 ; НМ_001363746
	НМ_001039653 ; НМ_010711
	НП_055379 ; НП_835258 ; НП_001350675
	НП_001034742 ; НП_034841
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок LIM/гомеобокс Lhx3 представляет собой белок , который у человека кодируется LHX3 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

LHX3 кодирует белок большого семейства белков, члены которого несут домен LIM , уникальный богатый цистеином цинк-связывающий домен. Кодируемый белок является фактором транскрипции, который необходим для развития гипофиза и спецификации мотонейронов . Для этого гена были идентифицированы два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. ^{[ 7 ]}

Клиническое значение

Мутации в этом гене связаны с синдромом комбинированной недостаточности гормонов гипофиза и ригидностью шейного отдела позвоночника. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что LHX3 взаимодействует с Ldb1 . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000107187 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026934 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Слуп К.В., Мейер Б.С., Бридвелл Дж.Л., Паркер Дж.Е., Шиллер А.М., Роудс С.Дж. (январь 2000 г.). «Дифференциальная активация генов гормонов гипофиза изоформами Lhx3 человека с различными свойствами связывания ДНК». Мол Эндокринол . 13 (12): 2212–25. дои : 10.1210/me.13.12.2212 . ПМИД 10598593 .
^ Шлюп К.В., Шоуолтер А.Д., Фон Кап-Герр С., Петтенати М.Дж., Роудс С.Дж. (май 2000 г.). «Анализ гена нейроэндокринного транскрипционного фактора человека LHX3 и картирование субтеломерной области хромосомы 9». Джин . 245 (2): 237–43. дои : 10.1016/S0378-1119(00)00025-1 . ПМИД 10717474 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с «Энтрез Ген: LHX3 LIM гомеобокс 3» .
^ Юрата Л.В., Пфафф С.Л., Гилл Г.Н. (февраль 1998 г.). «Ядерный интерактор домена LIM NLI опосредует гомо- и гетеродимеризацию факторов транскрипции домена LIM» . Ж. Биол. Хим . 273 (6): 3152–7. дои : 10.1074/jbc.273.6.3152 . ПМИД 9452425 .

Дальнейшее чтение

Жаданов А.Б., Бертуцци С., Тайра М., Давид И.Б., Вестфаль Х. (1995). «Характер экспрессии мышиного гомеобоксного гена Lhx3 класса LIM в подмножествах нервных и нейроэндокринных тканей». Дев. Дин . 202 (4): 354–64. дои : 10.1002/aja.1002020405 . ПМИД 7626792 . S2CID 36677316 .
Жаданов А.Б., Коупленд Н.Г., Гилберт Д.Д., Дженкинс Н.А., Вестфаль Х. (1995). «Геномная структура и хромосомная локализация мышиного гена LIM/гомеобокса Lhx3» . Геномика . 27 (1): 27–32. дои : 10.1006/geno.1995.1004 . ПМИД 7665181 .
Юрата Л.В., Пфафф С.Л., Гилл Г.Н. (1998). «Ядерный интерактор домена LIM NLI опосредует гомо- и гетеродимеризацию факторов транскрипции домена LIM» . Ж. Биол. Хим . 273 (6): 3152–7. дои : 10.1074/jbc.273.6.3152 . ПМИД 9452425 .
Бах I, Родригес-Эстебан С, Карьер С, Родригес-Эстебан С, Карьер С, Бхушан А, Кронес А, Роуз Д.В., Гласс С.К. (1999). «RLIM ингибирует функциональную активность факторов транскрипции гомеодомена LIM посредством рекрутирования комплекса гистондеацетилазы». Нат. Жене . 22 (4): 394–9. дои : 10.1038/11970 . ПМИД 10431247 . S2CID 22326394 .
Гленн DJ, Маурер Р.А. (2000). «MRG1 связывается с доменом LIM Lhx2 и может действовать как коактиватор, стимулируя экспрессию гена альфа-субъединицы гликопротеинового гормона» . Ж. Биол. Хим . 274 (51): 36159–67. дои : 10.1074/jbc.274.51.36159 . ПМИД 10593900 .
Ховард П.В., Маурер Р.А. (2000). «Идентификация консервативного белка, который взаимодействует со специфическими факторами транскрипции гомеодомена LIM» . Ж. Биол. Хим . 275 (18): 13336–42. дои : 10.1074/jbc.275.18.13336 . ПМИД 10788441 .
Паркер Дж.Е., Сандовал Р.М., Фейстер Х.А., Бидвелл Дж.П., Роудс С.Дж. (2000). «Гомеодомен координирует вход в ядро нейроэндокринного транскрипционного фактора Lhx3 и его ассоциацию с ядерным матриксом» . Ж. Биол. Хим . 275 (31): 23891–8. дои : 10.1074/jbc.M000377200 . ПМИД 10818088 .
Нетчин И, Собриер МЛ, Круд Х, Круд Х, Шнабель Д, Магни М, Маркос Э, Дюрье Б, Каше В (2000). «Мутации в LHX3 приводят к новому синдрому, обусловленному комбинированной недостаточностью гормонов гипофиза». Нат. Жене . 25 (2): 182–6. дои : 10.1038/76041 . ПМИД 10835633 . S2CID 12358307 .
Шмитт С., Биазон-Лаубер А., Беттс Д., Шенле Э.Дж. (2000). «Геномная структура, хромосомная локализация и характер экспрессии человеческого гена LIM-гомеобокс3 (LHX 3)». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 274 (1): 49–56. дои : 10.1006/bbrc.2000.3038 . ПМИД 10903894 .
Шлюп KW, Дуайер CJ, Роудс SJ (2001). «Специфический для изоформы ингибирующий домен регулирует голопротеин гомеодоменного фактора LHX3 LIM и выработку функциональной альтернативной формы трансляции» . Ж. Биол. Хим . 276 (39): 36311–9. дои : 10.1074/jbc.M103888200 . ПМИД 11470784 .
Остендорф Х.П., Пейрано Р.И., Петерс М.А., Шлютер А., Боссенц М., Шеффнер М., Бах I (2002). «Убиквитин-зависимый обмен кофакторов на факторах транскрипции гомеодомена LIM». Природа . 416 (6876): 99–103. Бибкод : 2002Natur.416...99O . дои : 10.1038/416099а . ПМИД 11882901 . S2CID 4426785 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Э.А., Гроуз Л.Х., Дерге Дж.Г., Клаузнер Р.Д., Коллинз Ф.С., Вагнер Л., Шенмен К.М., Шулер Г.Д. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
ван Мейел DJ, Томас Дж. Б., Агульник А.Д. (2003). «Белки Ssdp связываются с LIM-взаимодействующими кофакторами и регулируют активность белковых комплексов LIM-гомеодомен in vivo». Разработка . 130 (9): 1915–25. дои : 10.1242/dev.00389 . ПМИД 12642495 . S2CID 6211268 .
Ким СС, Ким Й, Шин ЙЛ, Ким ГХ, Ким ТУ, Ю ХВ (2004). «Клинические характеристики и молекулярный анализ PIT1, PROP1, LHX3 и HESX1 у пациентов с комбинированной недостаточностью гормонов гипофиза и аномальной МРТ гипофиза». Горм. Рез . 60 (6): 277–83. дои : 10.1159/000074245 . ПМИД 14646405 . S2CID 31256955 .
Даттани М.Т. (2004). «Синдром Боржесона-Форссмана-Лемана: новый фенотип гипофиза, обусловленный мутацией нового гена». Ж. Педиатр. Эндокринол. Метаб . 16 (9): 1207–9. дои : 10.1515/jpem.2003.16.9.1207 . ПМИД 14714741 . S2CID 45542882 .
Уэст Б.Э., Паркер Дж.Э., Сэвидж Дж.Дж., Киратипранон П., Туми К.С., Бич Л.Р., Колвин СК, Слуп К.В., Роудс С.Дж. (2004). «Регуляция гена бета-фолликулостимулирующего гормона с помощью транскрипционного фактора LHX3 LIM-гомеодомена» . Эндокринология . 145 (11): 4866–79. дои : 10.1210/en.2004-0598 . ПМИД 15271874 .
Паркер Дж.Э., Вест Б.Е., Витцманн Ф.А., Роудс С.Дж. (2005). «Серин/треонин/тирозин фосфорилирование транскрипционного фактора LHX3 LIM-гомеодомена». Дж. Селл. Биохим . 94 (1): 67–80. дои : 10.1002/jcb.20287 . ПМИД 15517599 . S2CID 41303062 .
Собриер М.Л., Аттье-Битач Т., Нетчин И., Энча-Разави Ф., Векеманс М., Амселем С. (2006). «Патофизиология синдромального комбинированного дефицита гормонов гипофиза из-за дефекта LHX3 в свете экспрессии LHX3 и LHX4 на ранних этапах развития человека». Джин Экспр. Узоры . 5 (2): 279–84. дои : 10.1016/j.modgep.2004.07.003 . ПМИД 15567726 .

Внешние ссылки

LHX3 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 9 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000107187 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026934 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10598593-5] Слуп К.В., Мейер Б.С., Бридвелл Дж.Л., Паркер Дж.Е., Шиллер А.М., Роудс С.Дж. (январь 2000 г.). «Дифференциальная активация генов гормонов гипофиза изоформами Lhx3 человека с различными свойствами связывания ДНК». Мол Эндокринол . 13 (12): 2212–25. дои : 10.1210/me.13.12.2212 . ПМИД 10598593 .

[pmid10717474-6] Шлюп К.В., Шоуолтер А.Д., Фон Кап-Герр С., Петтенати М.Дж., Роудс С.Дж. (май 2000 г.). «Анализ гена нейроэндокринного транскрипционного фактора человека LHX3 и картирование субтеломерной области хромосомы 9». Джин . 245 (2): 237–43. дои : 10.1016/S0378-1119(00)00025-1 . ПМИД 10717474 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б ^с «Энтрез Ген: LHX3 LIM гомеобокс 3» .

[pmid9452425-8] Юрата Л.В., Пфафф С.Л., Гилл Г.Н. (февраль 1998 г.). «Ядерный интерактор домена LIM NLI опосредует гомо- и гетеродимеризацию факторов транскрипции домена LIM» . Ж. Биол. Хим . 273 (6): 3152–7. дои : 10.1074/jbc.273.6.3152 . ПМИД 9452425 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]