ZHX1

ZHX1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	2ECB, 2GHF, 2LY9, 3NAR
Идентификаторы
Псевдонимы	ZHX1 , цинковые пальцы и гомеобоксы 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 604764 ; МГИ : 109271 ; Гомологен : 5225 ; Генные карты : ZHX1 ; ОМА : ZHX1 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 8 (human)
End	123,275,541 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 15 (mouse)
End	57,939,937 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	skin of arm; ; secondary oocyte; ; Achilles tendon; ; epithelium of lactiferous gland; ; lactiferous duct; ; pars reticulata; ; cerebellar vermis; ; internal globus pallidus; ; medulla oblongata; ; superior vestibular nucleus;
	Top expressed in
	genital tubercle; ; spermatocyte; ; white adipose tissue; ; uterus; ; hippocampus proper; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; tail of embryo; ; ovary; ; quadriceps femoris muscle; ; muscle of thigh;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; DNA binding; protein binding; transcription corepressor activity; metal ion binding; protein heterodimerization activity; nucleic acid binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	nucleus; nucleoplasm;
Biological process	cell differentiation; negative regulation of transcription, DNA-templated; regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	11244
	22770
	ENSG00000165156
	ENSMUSG00000022361
	Q9UKY1
	P70121
	НМ_001017926 ; НМ_007222
	НМ_001042438 ; НМ_009572
	НП_001017926 ; НП_009153
	НП_001035903 ; НП_033598
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 1 «цинковые пальцы и гомеобоксы» — это белок , который у человека кодируется ZHX1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Члены семейства генов цинковых пальцев и гомеобоксов представляют собой ядерные гомодимерные репрессоры транскрипции, которые взаимодействуют с субъединицей A ядерного фактора-Y (NF-YA) и содержат два цинковых пальца типа C2H2 и пять гомеобоксных ДНК-связывающих доменов. Этот ген кодирует члена 1 этого семейства генов. Помимо образования гомодимеров, этот белок гетеродимеризуется с членами 2 и 3 семейства цинковых пальцев и гомеобоксов. Альтернативный сплайсинг приводит к образованию нескольких вариантов транскриптов, кодирующих один и тот же белок. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что ZHX1 взаимодействует с NFYA . ^{[ 5 ]}^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000165156 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022361 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: ^а ^б Ямада К., Принц Р.Л., Осава Х., Граннер Д.К. (август 1999 г.). «Человеческий ZHX1: клонирование, хромосомное расположение и взаимодействие с фактором транскрипции NF-Y». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 261 (3): 614–21. дои : 10.1006/bbrc.1999.1087 . ПМИД 10441475 . S2CID 35415109 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: цинковые пальцы ZHX1 и гомеобоксы 1» .
^ Ямада К., Осава Х., Граннер Д.К. (октябрь 1999 г.). «Идентификация белков, взаимодействующих с NF-YA». Письма ФЭБС . 460 (1): 41–5. дои : 10.1016/S0014-5793(99)01311-3 . ПМИД 10571058 . S2CID 28576187 .

Дальнейшее чтение

Ямада К., Осава Х., Граннер Д.К. (октябрь 1999 г.). «Идентификация белков, взаимодействующих с NF-YA». Письма ФЭБС . 460 (1): 41–5. дои : 10.1016/S0014-5793(99)01311-3 . ПМИД 10571058 . S2CID 28576187 .
Хирано С., Ямада К., Кавата Х., Шоу З., Мизутани Т., Ядзава Т. и др. (май 2002 г.). «Цинковые пальцы крысы и гомеобоксы 1 (ZHX1), ядерный белок, взаимодействующий с ядерным фактором-YA, образуют гомодимер». Джин . 290 (1–2): 107–14. дои : 10.1016/S0378-1119(02)00553-X . ПМИД 12062805 .
Ямада К., Кавата Х., Мацуура К., Шоу З., Хирано С., Мизутани Т. и др. (сентябрь 2002 г.). «Функциональный анализ и молекулярное рассечение цинковых пальцев и гомеобоксов 1 (ZHX1)». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 297 (2): 368–74. дои : 10.1016/S0006-291X(02)02203-9 . ПМИД 12237128 .
Ямада К., Кавата Х., Шоу З., Хирано С., Мизутани Т., Ядзава Т. и др. (июль 2003 г.). «Анализ белков, взаимодействующих с цинковыми пальцами и гомеобоксами (ZHX)-1: молекулярное клонирование и характеристика члена семейства ZHX, ZHX3» . Биохимический журнал . 373 (Часть 1): 167–78. дои : 10.1042/BJ20021866 . ПМЦ 1223464 . ПМИД 12659632 .
Кавата Х., Ямада К., Шоу З., Мизутани Т., Ядзава Т., Ёсино М. и др. (август 2003 г.). «Цинковые пальцы и гомеобоксы (ZHX) 2, новый член семейства ZHX, действуют как репрессор транскрипции» . Биохимический журнал . 373 (Часть 3): 747–57. дои : 10.1042/BJ20030171 . ПМЦ 1223552 . ПМИД 12741956 .
Ленер Б., Семпл Дж.И., Браун С.Е., Адвокат Д., Кэмпбелл Р.Д., Сандерсон К.М. (январь 2004 г.). «Анализ высокопроизводительной дрожжевой двухгибридной системы и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области III класса MHC человека». Геномика . 83 (1): 153–67. дои : 10.1016/S0888-7543(03)00235-0 . ПМИД 14667819 .
Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С., Лей С., Мурадж Дж., Фиск Г.Дж. и др. (июнь 2004 г.). «Описание характеристик транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Природная биотехнология . 22 (6): 707–16. дои : 10.1038/nbt971 . ПМИД 15146197 . S2CID 27764390 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж.Е., Виллен Дж., Ли Дж. и др. (август 2004 г.). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .
Гёлер Х., Лаловски М., Стельцль У., Вельтер С., Стродике М., Ворм У. и др. (сентябрь 2004 г.). «Сеть взаимодействия белков связывает GIT1, усилитель агрегации хантингтина, с болезнью Хантингтона» . Молекулярная клетка . 15 (6): 853–65. doi : 10.1016/j.molcel.2004.09.016 . ПМИД 15383276 .
Стельцль У., Ворм У., Лаловски М., Хениг С., Брембек Ф.Х., Гёлер Х. и др. (сентябрь 2005 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома» . Клетка . 122 (6): 957–68. дои : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . ПМИД 16169070 .
Лим Дж., Хао Т., Шоу С., Патель А.Дж., Сабо Г., Руал Дж.Ф. и др. (май 2006 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия при наследственных атаксиях человека и нарушениях дегенерации клеток Пуркинье» . Клетка . 125 (4): 801–14. дои : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . ПМИД 16713569 .
Лю Дж., Клемент Л.К., Канвар Ю.С., Авила-Касадо С., Чух С.С. (декабрь 2006 г.). «Белки ZHX регулируют экспрессию генов подоцитов во время развития нефротического синдрома» . Журнал биологической химии . 281 (51): 39681–92. дои : 10.1074/jbc.M606664200 . ПМИД 17056598 .
Ким Ш., Пак Дж., Чхве М.К., Ким Х.П., Пак Дж.Х., Юнг Ю. и др. (апрель 2007 г.). «Цинковые пальцы и гомеобоксы 1 (ZHX1) связывают ДНК-метилтрансферазу (DNMT) 3B, усиливая DNMT3B-опосредованную репрессию транскрипции». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 355 (2): 318–23. дои : 10.1016/j.bbrc.2007.01.187 . ПМИД 17303076 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9UKY1 (белок 1 «Цинковые пальцы и гомеобоксы») на PDBe-KB .

Эта статья о гене человека й хромосомы незавершена 8 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000165156 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022361 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10441475-5] Перейти обратно: ^а ^б Ямада К., Принц Р.Л., Осава Х., Граннер Д.К. (август 1999 г.). «Человеческий ZHX1: клонирование, хромосомное расположение и взаимодействие с фактором транскрипции NF-Y». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 261 (3): 614–21. дои : 10.1006/bbrc.1999.1087 . ПМИД 10441475 . S2CID 35415109 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: цинковые пальцы ZHX1 и гомеобоксы 1» .

[pmid10571058-7] Ямада К., Осава Х., Граннер Д.К. (октябрь 1999 г.). «Идентификация белков, взаимодействующих с NF-YA». Письма ФЭБС . 460 (1): 41–5. дои : 10.1016/S0014-5793(99)01311-3 . ПМИД 10571058 . S2CID 28576187 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]