Открытая рамка считывания вверх по течению

Вышестоящая открытая рамка считывания ( uORF ) представляет собой открытую рамку считывания (ORF) внутри 5'-нетранслируемой области (5'UTR) мРНК . uORFs могут регулировать эукариот экспрессию генов . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} Трансляция uORF обычно ингибирует нижестоящую экспрессию первичной ORF. Однако в некоторых генах, таких как дрожжевой GCN4, трансляция специфических uORF может усиливать трансляцию основной ORF. ^{[ 3 ]} У бактерий uORF называются лидерными пептидами и первоначально были открыты на основании их влияния на регуляцию генов, участвующих в синтезе или транспорте аминокислот .

Примерно 50% генов человека содержат uORF в своей 5'UTR, и когда они присутствуют, они вызывают снижение экспрессии белка. ^{[ 4 ]} Человеческие пептиды, полученные из транслированных uORF, можно обнаружить в клеточном материале с помощью масс-спектрометра . ^{[ 5 ]}

См. также

Ссылки

^ Вилела С., Маккарти Дж. Э. (август 2003 г.). «Регуляция экспрессии грибковых генов с помощью коротких открытых рамок считывания в 5'-нетранслируемой области мРНК» . Молекулярная микробиология . 49 (4): 859–67. дои : 10.1046/j.1365-2958.2003.03622.x . ПМИД 12890013 .
^ Ловетт П.С., Роджерс Э.Дж. (июнь 1996 г.). «Регуляция рибосом с помощью возникающего пептида» . Микробиологические обзоры . 60 (2): 366–85. дои : 10.1128/MMBR.60.2.366-385.1996 . ПМК 239448 . ПМИД 8801438 .
^ Хиннебуш, Алан Г. (29 августа 1997 г.). «Регуляция трансляции дрожжей GCN4: взгляд на факторы, которые контролируют связывание инициатора-тРНК с рибосомой *» . Журнал биологической химии . 272 (35): 21661–21664. дои : 10.1074/jbc.272.35.21661 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 9268289 .
^ Кальво С.Е., Пальярини DJ, Mootha VK (май 2009 г.). «Вышестоящие открытые рамки считывания вызывают повсеместное снижение экспрессии белков и являются полиморфными у людей» (PDF) . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (18): 7507–12. Бибкод : 2009PNAS..106.7507C . дои : 10.1073/pnas.0810916106 . ПМЦ 2669787 . ПМИД 19372376 . Архивировано из оригинала 3 декабря 2023 г. - через MIT Libraries.
^ Славофф С.А., Митчелл А.Дж., Швайд А.Г., Кабили М.Н., Ма Дж., Левин Дж.З., Каргер А.Д., Будник Б.А., Ринн Дж.Л., Сагателян А. (январь 2013 г.). «Пептидомное открытие коротких пептидов, кодируемых открытой рамкой считывания, в клетках человека» . Химическая биология природы . 9 (1): 59–64. дои : 10.1038/nchembio.1120 . ПМЦ 3625679 . ПМИД 23160002 .

Эта о генетике статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] Вилела С., Маккарти Дж. Э. (август 2003 г.). «Регуляция экспрессии грибковых генов с помощью коротких открытых рамок считывания в 5'-нетранслируемой области мРНК» . Молекулярная микробиология . 49 (4): 859–67. дои : 10.1046/j.1365-2958.2003.03622.x . ПМИД 12890013 .

[2] Ловетт П.С., Роджерс Э.Дж. (июнь 1996 г.). «Регуляция рибосом с помощью возникающего пептида» . Микробиологические обзоры . 60 (2): 366–85. дои : 10.1128/MMBR.60.2.366-385.1996 . ПМК 239448 . ПМИД 8801438 .

[3] Хиннебуш, Алан Г. (29 августа 1997 г.). «Регуляция трансляции дрожжей GCN4: взгляд на факторы, которые контролируют связывание инициатора-тРНК с рибосомой *» . Журнал биологической химии . 272 (35): 21661–21664. дои : 10.1074/jbc.272.35.21661 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 9268289 .

[Calvo_Pagliarini_Mootha_pp._7507–7512-4] Кальво С.Е., Пальярини DJ, Mootha VK (май 2009 г.). «Вышестоящие открытые рамки считывания вызывают повсеместное снижение экспрессии белков и являются полиморфными у людей» (PDF) . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (18): 7507–12. Бибкод : 2009PNAS..106.7507C . дои : 10.1073/pnas.0810916106 . ПМЦ 2669787 . ПМИД 19372376 . Архивировано из оригинала 3 декабря 2023 г. - через MIT Libraries.

[5] Славофф С.А., Митчелл А.Дж., Швайд А.Г., Кабили М.Н., Ма Дж., Левин Дж.З., Каргер А.Д., Будник Б.А., Ринн Дж.Л., Сагателян А. (январь 2013 г.). «Пептидомное открытие коротких пептидов, кодируемых открытой рамкой считывания, в клетках человека» . Химическая биология природы . 9 (1): 59–64. дои : 10.1038/nchembio.1120 . ПМЦ 3625679 . ПМИД 23160002 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]