НОЧНОЙ домен

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

НОЧНОЙ домен
НОЧНОЙ домен
Идентификаторы
Символ	НОЧЬ
Пфам	PF05729
ИнтерПро	ИПР007111
PROSITE	ПС50837
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Домен NACHT представляет собой эволюционно консервативный белковый домен . Этот домен NTPase обнаружен в апоптоза белках , а также в белках, участвующих в MHC транскрипции . ^[1] Его название отражает некоторые белки, которые его содержат: NAIP ( белок-ингибитор апоптоза семейства NLP ), CIITA (то есть активатор транскрипции C2TA или MHC класса II ), HET-E (белок локуса несовместимости из Podospora anserina ) и TEP1 (то есть активатор транскрипции C2TA или MHC класса II). , TP1 или белок, ассоциированный с теломеразой).

Домен NACHT содержит от 300 до 400 аминокислот . Это предполагаемый домен нуклеозид-трифосфатазы (NTPase), который содержится в животных , грибковых и бактериальных белках. Он обнаружен в ассоциации с другими доменами, такими как домен рекрутирования каспазы ( InterPro : IPR001315 ), пириновый домен ( InterPro : IPR004020 ), домен повтора HEAT ( InterPro : IPR004155 ), повтор WD40 ( InterPro : IPR001680 ), богатый лейцином повтор (LRR) или повтор BIR ( InterPro : IPR001370 ). ^[1]

Домен NACHT состоит из семи различных консервативных мотивов, включая специфичную для АТФ/ГТФазы P-петлю, Mg ²⁺-сайт связывания ( мотивы Уокера A и B соответственно) и еще пять специфических мотивов. Уникальные особенности домена NACHT включают преобладание «крошечных» остатков (глицин, аланин или серин) непосредственно на С-конце Mg. ²⁺-координирующий аспартат в мотиве Уокера B вместо второго кислотного остатка, преобладающего в других НТФазах. Второй кислотный остаток обычно обнаруживается в белках, содержащих NACHT, на два положения ниже. Более того, дистальный мотив VII содержит консервативный набор полярных, ароматических и гидрофобных остатков, который не наблюдается ни в одном другом семействе NTPase. ^[1]

Примеры

Белки человека, содержащие этот домен, включают:

ЦИТИРОВАНО
НАИП
НЛРК3 , НЛРК4 , НЛРК5
НЛРП1 , НЛРП2 , НЛРП3 , НЛРП4 , НЛРП5 , НЛРП6 , НЛРП7 , НЛРП8 , НЛРП9 , НЛРП10 , НЛРП11 , НЛРП13 , НЛРП14 , , НЛРХ1 НЛРП12
НОД1 , НОД2
NWD1
ТЭП1

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с Кунин Е.В., Аравинд Л. (май 2000 г.). «Семейство NACHT - новая группа предсказанных НТФаз, участвующих в апоптозе и активации транскрипции MHC». Тенденции биохимических наук . 25 (5): 223–4. дои : 10.1016/S0968-0004(00)01577-2 . ПМИД 10782090 .

Эта белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR007111.

[pmid10782090-1] Jump up to: ^а ^б ^с Кунин Е.В., Аравинд Л. (май 2000 г.). «Семейство NACHT - новая группа предсказанных НТФаз, участвующих в апоптозе и активации транскрипции MHC». Тенденции биохимических наук . 25 (5): 223–4. дои : 10.1016/S0968-0004(00)01577-2 . ПМИД 10782090 .

[1]