Крингл домен
 Фрагмент бычьего протромбина в комплексе с кальцием и лизофосфатидилсерином . Белок связывается с мембраной через альфа-спиральный домен GLA . Соседний домен крингла является бета-структурным (желтый). | |||
| Идентификаторы | |||
|---|---|---|---|
| Символ | Крингл | ||
| Пфам | PF00051 | ||
| ИнтерПро | IPR000001 | ||
| УМНЫЙ | НОК | ||
| PROSITE | PDOC00020 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1пк4 / СКОПе / СУПФАМ | ||
| Суперсемейство OPM | 115 | ||
| белок OPM | 1ч8р | ||
| CDD | cd00108 | ||
| |||
Домены Крингла представляют собой автономные белковые домены , которые складываются в большие петли , стабилизированные тремя дисульфидными связями. Они важны для белок -белковых взаимодействий с факторами свертывания крови . Их название отсылает к кринглу , скандинавской выпечке, на которую они чем-то похожи.
Домены Крингла были обнаружены в плазминогене , гепатоцитов факторах роста , протромбине и аполипопротеине(а) .
Кринглы обнаруживаются во всех белках свертывания крови и фибринолитических белках. Считается, что домены Крингла играют роль в связывании медиаторов (например, мембран, других белков или фосфолипидов), а также в регуляции протеолитической активности. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] Крингл-домены [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] характеризуются тройной петлей, 3-дисульфидной мостиковой структурой, конформация которой определяется множеством водородных связей и небольшими кусочками антипараллельного бета-листа. Они обнаруживаются в различном количестве копий в некоторых белках плазмы, включая протромбин и плазминоген урокиназного типа. активатором, которым являются сериновые протеазы, принадлежащие к семейству пептидаз MEROPS S1A.
Белки человека, содержащие этот домен
[ редактировать ]АТФ ; Ф12 ; Ф2 ; НАБП2 ; ХГФ ; ХГФАК ; КРЕМЕН1 ; КРЕМЕН2 ; ЛПА ; ЛПАЛ2 ; МСТ1 ; ПИК3ИП1 ; ПЛАТ ; ПЛАУ ; ПЛГ ; ПРСС12 ; РОР1 ; РОР2 ;
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Фудзикава К., МакМаллен Б.А. (1985). «Аминокислотная последовательность тяжелой цепи человеческого альфа-фактора XIIa (активированного фактора Хагемана)» . Ж. Биол. Хим . 260 (9): 5328–5341. дои : 10.1016/S0021-9258(18)89026-3 . ПМИД 3886654 .
- ^ Пэтти Л., Трекслер М., Баньяи Л., Варади А., Вали З. (1984). «Кринглы: модули, специализированные для связывания белков. Гомология желатинсвязывающей области фибронектина со структурами крингла протеаз» . ФЭБС Летт . 171 (1): 131–136. дои : 10.1016/0014-5793(84)80473-1 . ПМИД 6373375 . S2CID 12669742 .
- ^ Аткинсон Р.А., Уильямс Р.Дж. (1990). «Структура раствора домена крингла 4 из человеческого плазминогена с помощью спектроскопии ядерного магнитного резонанса 1H и геометрии расстояния». Дж. Мол. Биол . 212 (3): 541–552. дои : 10.1016/0022-2836(90)90330-О . ПМИД 2157850 .
- ^ Кастеллино Ф.Дж., Билс Дж.М. (1987). «Генетические взаимоотношения между крингл-доменами человеческого плазминогена, протромбина, тканевого активатора плазминогена, урокиназы и фактора свертывания крови XII». Дж. Мол. Эвол . 26 (4): 358–369. Бибкод : 1987JMolE..26..358C . дои : 10.1007/BF02101155 . ПМИД 3131537 . S2CID 22249781 .
- ^ Пэтти Л. (1985). «Эволюция протеаз свертывания крови и фибринолиза путем сборки из модулей». Клетка . 41 (3): 657–663. дои : 10.1016/S0092-8674(85)80046-5 . ПМИД 3891096 . S2CID 32104232 .
- ^ Такахаши К., Икео К., Годобори Т. (1991). «Эволюционное происхождение многочисленных кринглов в аполипопротеине (а) человека и обезьян» . ФЭБС Летт . 287 (1): 146–148. дои : 10.1016/0014-5793(91)80036-3 . ПМИД 1879523 . S2CID 13366195 .